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改进的CTAB法提取胡杨(Populus euphratica)总DNA 被引量:11
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作者 肖智样 白冠章 +1 位作者 张玲 李志军 《塔里木大学学报》 2009年第2期29-32,共4页
以胡杨幼叶为材料,对影响胡杨DNA提取质量的主要因子进行研究,以期建立适宜胡杨DNA提取的优化反应体系,结果表明,在胡杨基因组DNA提取过程中,CTAB缓冲液中增加EDTA的用量及添加完异丙醇沉淀时间是影响胡杨基因组DNA提取的最主要因子。
关键词 胡杨 改进ctab DNA提取
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改进的CTAB法提取盐生植物基因组DNA 被引量:5
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作者 王彦芹 罗晓霞 +3 位作者 刘陈 李霞 陈良 杨剑 《塔里木大学学报》 2007年第2期60-62,共3页
用改进的CTAB法提取猪毛菜、碱蓬、骆驼蓬、骆驼蹄瓣和柽柳5种盐生植物基因组DNA,通过与常规的CTAB法提取结果相比发现,改进的CTAB法从提取速度、得率、质量上都优于常规的CTAB法,并总结出一套适用于盐生植物的快速高质量基因组DNA的提... 用改进的CTAB法提取猪毛菜、碱蓬、骆驼蓬、骆驼蹄瓣和柽柳5种盐生植物基因组DNA,通过与常规的CTAB法提取结果相比发现,改进的CTAB法从提取速度、得率、质量上都优于常规的CTAB法,并总结出一套适用于盐生植物的快速高质量基因组DNA的提取方法。 展开更多
关键词 改进ctab 盐生植物 DNA提取
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板桥党参基因组DNA提取方法的改进及其18S rRNA基因序列分析 被引量:1
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作者 罗洪斌 袁德培 《辽宁中医杂志》 CAS 北大核心 2010年第9期1778-1781,共4页
目的:为研究道地药材板桥党参Codonopsis tangshen Oliv.的遗传多样性、种类鉴定等,提取高质量的基因组DNA;探讨板桥党参18S rRNA基因的序列特征,为板桥党参分子鉴定提供分子依据。方法:以板桥党参鲜嫩叶片为材料,采用自行改进的CTAB法... 目的:为研究道地药材板桥党参Codonopsis tangshen Oliv.的遗传多样性、种类鉴定等,提取高质量的基因组DNA;探讨板桥党参18S rRNA基因的序列特征,为板桥党参分子鉴定提供分子依据。方法:以板桥党参鲜嫩叶片为材料,采用自行改进的CTAB法提取出基因组DNA;采用PCR直接测序技术测定板桥党参的18S rRNA基因序列,并分析其序列组成。结果:使用改进的CTAB法从鲜叶中提取板桥党参的基因组DNA浓度较高;以其基因组DNA为模板对18S rRNA基因进行PCR克隆并测序,获得了板桥党参18S rRNA基因序列特征。结论:改进的CTAB法提取板桥党参基因组DNA效果较好;DNA测序技术可作为板桥党参基原鉴定准确而有效的分子鉴定方法。 展开更多
关键词 板桥党参 DNA提取 改进ctab 18S RRNA基因 序列分析
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8种柱花草属牧草SSR-PCR反应体系优化及引物筛选 被引量:20
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作者 张龙 丁西朋 +2 位作者 严琳玲 胡珊娜 白昌军 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期232-242,共11页
柱花草(Stylosanthes)是优良的豆科牧草,叶片中含有大量的多糖多酚,本研究利用改良CTAB法抽提柱花草叶片中总DNA。通过正交试验设计L16(45),确立了柱花草SSR-PCR最佳反应体系:20μL体系中1μL 50ng·μL-1模板DNA,1.6μL 5μmol... 柱花草(Stylosanthes)是优良的豆科牧草,叶片中含有大量的多糖多酚,本研究利用改良CTAB法抽提柱花草叶片中总DNA。通过正交试验设计L16(45),确立了柱花草SSR-PCR最佳反应体系:20μL体系中1μL 50ng·μL-1模板DNA,1.6μL 5μmol·L-1引物,1.6μL 10mol·L-1dNTPs,1.2μL 25mol·L-1 Mg2+,0.3μL 5U·μL-1 Taq聚合酶,2μL 10×PCR Buffer(Mg2+free),剩余用ddH2O补足。扩增反应程序为94℃变性40s,Tm(不同退火温度)退火时间40s,72℃延伸45s,循环数35个。利用优化体系对来自7种柱花草的123对SSR引物在8个不同种柱花草中进行转移,共筛选出44对引物在8种柱花草中都能有效扩增,并从中筛选出26对在8个不同种柱花草中富含多态性引物,为今后利用SSR标记对柱花草属的指纹图谱构建、遗传多样性分析、分子育种和品种鉴定与保护等工作提供重要依据。 展开更多
关键词 柱花草 改进ctab SSR-PCR 体系优化 引物筛选
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适于核桃的RAPD-PCR反应体系的建立 被引量:16
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作者 王国安 张虎平 +2 位作者 虎海防 牛建新 李西萍 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2004年第1期61-64,共4页
采用CTAB法和改进的CTAB法,从叶片中提取核桃基因组DNA,比较其分离效果。结果表明,改进的CTAB法可有效去除细胞内多糖和多酚等杂质对模板DNA的污染。并以此为模板进行RAPD反应,对RAPD反应程序中的一些重要参数进行摸索和优化试验,建立... 采用CTAB法和改进的CTAB法,从叶片中提取核桃基因组DNA,比较其分离效果。结果表明,改进的CTAB法可有效去除细胞内多糖和多酚等杂质对模板DNA的污染。并以此为模板进行RAPD反应,对RAPD反应程序中的一些重要参数进行摸索和优化试验,建立适合于核桃的RAPD-PCR反应体系,以进行该树种的分子标记研究。 展开更多
关键词 核桃 RAPD—PCR反应体系 改进ctab 分子标记 DNA提取
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适于SSR分析的不同生长型桃幼叶基因组DNA提取方法 被引量:2
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作者 连晓东 谭彬 +2 位作者 郑先波 叶霞 冯建灿 《江苏农业科学》 北大核心 2013年第5期30-32,共3页
以6种不同生长型桃幼叶为材料,为适应SSR分析要求,对常规CTAB法、改进CTAB法、常规SDS法以及SDS-CTAB结合法4种基因组DNA提取方法的效果进行了比较研究。结果表明:常规CTAB法所提取的DNA呈黏稠状的浅褐色沉淀,难以溶解;常规SDS法和SDS-C... 以6种不同生长型桃幼叶为材料,为适应SSR分析要求,对常规CTAB法、改进CTAB法、常规SDS法以及SDS-CTAB结合法4种基因组DNA提取方法的效果进行了比较研究。结果表明:常规CTAB法所提取的DNA呈黏稠状的浅褐色沉淀,难以溶解;常规SDS法和SDS-CTAB结合法提取的桃基因组DNA浓度较低,在品种间差异较大;而改进CTAB法提取DNA完整性较好,D260 nm/D280 nm值介于1.8~2.0,RNA去除干净,其SSR分析(引物CPPCT26)条带清晰,多态性好,表明此方法提取的不同生长型桃幼叶基因组DNA完全适于SSR分析。 展开更多
关键词 生长型 幼嫩叶片 DNA提取 改进ctab
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杜仲叶和树皮总RNA的快速提取法 被引量:15
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作者 周明兵 王红珍 赵德刚 《山地农业生物学报》 2003年第5期430-431,共2页
文中提出了一种适用于杜仲Eucommia ulmoides Olive树皮和树叶总RNA快速提取的方法,用本方法提取的杜仲树皮树叶的总RNA具有正常的光谱吸收,OD_(260)/OD_(280)为1.930。琼脂糖电泳后,28S RNA的亮度基本为18S RNA的亮度的2倍,说明提取的... 文中提出了一种适用于杜仲Eucommia ulmoides Olive树皮和树叶总RNA快速提取的方法,用本方法提取的杜仲树皮树叶的总RNA具有正常的光谱吸收,OD_(260)/OD_(280)为1.930。琼脂糖电泳后,28S RNA的亮度基本为18S RNA的亮度的2倍,说明提取的RNA完整,并未降解。同其它的方法比较,该法提取的RNA质量高、简便、快速、经济,可用于RT-PCR、Northern杂交、cDNA文库的构建。 展开更多
关键词 杜仲叶 杜仲树皮 总RNA 快速提取法 改进ctab
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半夏叶片总RNA的提取研究 被引量:3
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作者 吴功庆 徐敏 刘意 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第8期3138-3138,3141,共2页
[目的]为了获得高产高质的半夏RNA,为半夏分子生物学方面的研究打下基础。[方法]采用改进的CTAB法提取半夏叶片RNA。用紫外分光光度计测定所提RNA样品的OD260、OD280和OD230的值,用RNA浓度计算公式:RNA(μg/μl)=OD260×40×稀... [目的]为了获得高产高质的半夏RNA,为半夏分子生物学方面的研究打下基础。[方法]采用改进的CTAB法提取半夏叶片RNA。用紫外分光光度计测定所提RNA样品的OD260、OD280和OD230的值,用RNA浓度计算公式:RNA(μg/μl)=OD260×40×稀释倍数/1000,求出RNA浓度。[结果]紫外分光光度计的测定结果表明:OD260/OD280介于1.7~2.0之间。用改进的CTAB法提取的半夏叶片RNA质量较好,经变性胶电泳后,有较明显的3条带,分别是28S、18S和5S,28S、18S清晰可见,5S稍有弥散,但在亮度上28S与18S差别不大。[结论]此方法简便易行,成本较低,适合于富含多糖、多酚植物材料的RNA提取。 展开更多
关键词 半夏 改进ctab RNA提取
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一种制备富含多糖丝状真菌基因组DNA的方法 被引量:9
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作者 周礼红 《湖北农业科学》 北大核心 2008年第4期379-381,共3页
采用改进CTAB法提取的红曲霉、镰刀菌和微小毛霉基因组DNA数量和质量都较为理想,DNA产量在90~130μg.g-1湿菌体,大小均在21kb。4℃可保存4~6个月。用该方法提取的基因组DNA为PCR扩增的模板,扩增结果稳定、准确。分别用限制性内切酶Sac... 采用改进CTAB法提取的红曲霉、镰刀菌和微小毛霉基因组DNA数量和质量都较为理想,DNA产量在90~130μg.g-1湿菌体,大小均在21kb。4℃可保存4~6个月。用该方法提取的基因组DNA为PCR扩增的模板,扩增结果稳定、准确。分别用限制性内切酶SacI、HindⅢ、BamHⅠ酶解红曲霉M34均能得到较为均一的完全酶切带。该方法快速、简便,成本低,适合富含色素和多糖的真菌的基因组DNA的提取。此外,还适合真菌分子育种等的筛选和样本量大的PCR检测。 展开更多
关键词 丝状真菌 DNA提取 改进ctab
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草坪草ctDNA提纯方法探讨 被引量:1
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作者 黄永莲 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期173-176,共4页
以4种草坪草高羊茅Festuca elata、黑麦草Lotium perenne、狗牙根Cynodon dactylon、中华结缕草Zoysia sinica为材料,用改进的差速离心法分离叶绿体,CTAB法提取叶绿体DNA(ctDNA),琼脂糖电泳检测ctDNA含量。结果显示,改进CTAB法提取ctDN... 以4种草坪草高羊茅Festuca elata、黑麦草Lotium perenne、狗牙根Cynodon dactylon、中华结缕草Zoysia sinica为材料,用改进的差速离心法分离叶绿体,CTAB法提取叶绿体DNA(ctDNA),琼脂糖电泳检测ctDNA含量。结果显示,改进CTAB法提取ctDNA的纯度高、谱带清晰、完整叶绿体比例高;且CTAB法与常用高等植物ctDNA的分离提纯方法相比,省去传统的密度梯度离心法耗材、耗时步骤,具有简便、快速、得率较高等优点。实验表明,改进CTAB法为禾本科植物ct DNA的提取提供参考,适于生物实验教学和科研活动。 展开更多
关键词 草坪草 改进ctab 叶绿体DNA(ctDNA)
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RAPD法研究穗花杉遗传多样性的反应条件优化
11
作者 朱柏芳 朱笃 +2 位作者 李思光 刘如龙 邓荣根 《江西师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2005年第2期142-145,共4页
以改进CTAB法抽提的中国特有濒危植物穗花杉嫩叶总DNA为模板,进行随机扩增多态性DNA(RAPD)最佳条件优化,结果表明:RAPD分析最佳反应体系为10×Buffer缓冲液2μL,模板70ng,Mg2+2.0mmol/L,dNTPs0.2mmol/L,引物0.60μmol/L,Taq酶1.5U,... 以改进CTAB法抽提的中国特有濒危植物穗花杉嫩叶总DNA为模板,进行随机扩增多态性DNA(RAPD)最佳条件优化,结果表明:RAPD分析最佳反应体系为10×Buffer缓冲液2μL,模板70ng,Mg2+2.0mmol/L,dNTPs0.2mmol/L,引物0.60μmol/L,Taq酶1.5U,PCR反应体积为20μL.最佳扩增程序为94℃5min,1个循环;94℃1min、37℃1min、72℃2min,40个循环;72℃10min,1个循环. 展开更多
关键词 反应条件优化 穗花杉 遗传多样性 RAPD法 改进ctab 随机扩增多态性 Buffer 最佳反应体系 RAPD分析 MG^2+ 总DNA 濒危植物 Taq酶 扩增程序 反应体积 缓冲液 mol PCR 循环 模板
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富含多糖的强旱生植物半日花基因组DNA提取方法 被引量:3
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作者 白沙如拉 庞磊 +1 位作者 史树德 魏磊 《天津农业科学》 CAS 2014年第3期1-4,共4页
半日花(Helianthemum soongoricum)属强旱生植物,其组织富含多糖和多酚等次生代谢物质,采用常规CTAB和SDS等方法提取的半日花基因组DNA由于含有多糖等杂质,无法进行PCR扩增和限制性酶切等试验,为此,在CTAB法的基础上进行了改进。第1步... 半日花(Helianthemum soongoricum)属强旱生植物,其组织富含多糖和多酚等次生代谢物质,采用常规CTAB和SDS等方法提取的半日花基因组DNA由于含有多糖等杂质,无法进行PCR扩增和限制性酶切等试验,为此,在CTAB法的基础上进行了改进。第1步通过向植物组织CTAB提取液中添加高盐和乙醇来沉淀部分多糖,第2步将获得的DNA粗提液,经过CTAB分离溶液沉淀、NaCl溶解、乙醇沉淀等方法,可有效去除半日花组织中的残余多糖等杂质,提取DNA的质量和纯度经凝胶电泳条带清晰、无降解、无多糖等杂质。PCR扩增和限制性内切酶的结果表明,通过改进的方法所获得的DNA,可以进行PCR扩增试验,扩增条带清晰,基因组DNA能被限制性内切酶完全酶切,该方法为后续半日花分子生物学研究奠定了重要基础。 展开更多
关键词 强旱生植物 半日花 多糖 改进ctab
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几种DNA提取方法对红树植物秋茄叶片DNA提取效果的比较 被引量:10
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作者 仇建标 丁文勇 陈少波 《浙江海洋学院学报(自然科学版)》 CAS 2012年第5期402-408,共7页
以红树植物秋茄叶片为实验材料,美人蕉叶片为对照材料,采用6种不同的DNA提取方法,比较不同方法的DNA提取效果。结果表明:针对红树植物优化的CTAB法(方法 6)通过PVP的除酚去多糖作用,利用CTAB提取液和氯仿-异戊醇强效除蛋白和脂类物质,... 以红树植物秋茄叶片为实验材料,美人蕉叶片为对照材料,采用6种不同的DNA提取方法,比较不同方法的DNA提取效果。结果表明:针对红树植物优化的CTAB法(方法 6)通过PVP的除酚去多糖作用,利用CTAB提取液和氯仿-异戊醇强效除蛋白和脂类物质,结合高盐环境下异丙醇高效沉淀DNA去除多糖,最终达到彻底去除杂质,得到高纯度的基因组DNA,是6种方法中最适合用于红树植物DNA的提取方法。 展开更多
关键词 红树植物 DNA提取 单宁 多糖 改进ctab
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菜心DNA质量对RAPD反应的影响
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作者 谭雪 林伟君 +2 位作者 程小会 林春华 郑少薇 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期33-35,共3页
采用改进的CTAB法,探讨了菜心DNA的提取质量及其对RAPD扩增效果的影响,结果表明,CTAB浓度为2%和EDTA浓度为15mmol/L时提取的DNA质量以及DNA模板量范围在20~30ng之间的RAPD扩增效果最好。
关键词 菜心 基因组DNA 改进ctab RAPD反应
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