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突变在基因组进化中的意义
被引量:
17
1
作者
陈玲玲
彭贵子
+1 位作者
张伟丽
田大成
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期631-638,共8页
在漫长的进化历史中,各物种间和物种内基因组的差异是如何形成、积累乃至保留下来的,不仅是进化生物学中需要解决的核心问题,也是整个生命科学面临的基本问题之一。对该问题的探求必然要通过对突变的深入了解,因为突变不仅是基因组进化...
在漫长的进化历史中,各物种间和物种内基因组的差异是如何形成、积累乃至保留下来的,不仅是进化生物学中需要解决的核心问题,也是整个生命科学面临的基本问题之一。对该问题的探求必然要通过对突变的深入了解,因为突变不仅是基因组进化的重要驱动力,还是基因组进化研究的基础。文章围绕突变的性质及其在基因组进化中的深远意义,系统介绍了国际上相关研究的发展历程,所获得的成果和最新动向。
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关键词
碱基
突变
插入/缺失突变
基因组
进化
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职称材料
大白菜光周期调控因子CCA1的差异分析及功能标记开发
被引量:
3
2
作者
张志刚
刘栓桃
+7 位作者
李巧云
王晓
王立华
赵智中
王淑芬
徐文玲
刘贤娴
刘辰
《山东农业科学》
2016年第6期1-6,181,共6页
本研究利用春季和秋季条件下光周期的变化趋势,对两个大白菜自交系06-247与He102的光周期敏感性进行了鉴定,结果是06-247对长日照敏感,而He102对长日照不敏感。采用同源克隆技术,比较分析两材料光周期响应关键调控因子CCA1的全长c DNA序...
本研究利用春季和秋季条件下光周期的变化趋势,对两个大白菜自交系06-247与He102的光周期敏感性进行了鉴定,结果是06-247对长日照敏感,而He102对长日照不敏感。采用同源克隆技术,比较分析两材料光周期响应关键调控因子CCA1的全长c DNA序列,发现二者编码区存在两处6 bp插入/缺失和14处非同义SNPs差异;二者编码产物分别包含552、556个氨基酸残基;其非同义SNPs造成不同氨基酸的替换;二者间氨基酸序列差异主要位于CCA1蛋白中间区域的蛋白-蛋白相互作用结构域和C端的磷酸化修饰结构域。本研究开发出区分两处6 bp插入/缺失的共显性分子标记。该结果为深入研究CCA1在大白菜光周期响应调节过程中的功能奠定了基础。
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关键词
大白菜
依赖/不依赖长日照开花型
BraCCA1
插入/缺失突变
功能标记
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职称材料
利用比较基因组学开发山羊草属InDel分子标记
被引量:
14
3
作者
吴磊
王丹
+2 位作者
苏文悦
郭长虹
束永俊
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期1334-1338,共5页
为开发和利用小麦野生近缘种的优异基因,采用比较基因组学方法,通过拟斯卑尔脱山羊草EST(expressed sequencetag)与小麦UniGene序列的比对分析,发现山羊草插入/缺失(InDel)位点137个,在这些位点两端序列设计引物24对,通过在15个小麦野...
为开发和利用小麦野生近缘种的优异基因,采用比较基因组学方法,通过拟斯卑尔脱山羊草EST(expressed sequencetag)与小麦UniGene序列的比对分析,发现山羊草插入/缺失(InDel)位点137个,在这些位点两端序列设计引物24对,通过在15个小麦野生近缘属种基因组DNA的扩增分析,发现11对引物具多态性,可以作为InDel标记。这些包含突变位点的基因涉及亚细胞定位、蛋白质结合与催化以及代谢等过程。
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关键词
比较基因组学
插入/缺失突变
小麦
拟斯卑尔脱山羊草
功能分子标记
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职称材料
题名
突变在基因组进化中的意义
被引量:
17
1
作者
陈玲玲
彭贵子
张伟丽
田大成
机构
南京大学生命科学院医药生物技术国家重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期631-638,共8页
基金
江苏省博士后科研资助基金(编号:6208003402)~~
文摘
在漫长的进化历史中,各物种间和物种内基因组的差异是如何形成、积累乃至保留下来的,不仅是进化生物学中需要解决的核心问题,也是整个生命科学面临的基本问题之一。对该问题的探求必然要通过对突变的深入了解,因为突变不仅是基因组进化的重要驱动力,还是基因组进化研究的基础。文章围绕突变的性质及其在基因组进化中的深远意义,系统介绍了国际上相关研究的发展历程,所获得的成果和最新动向。
关键词
碱基
突变
插入/缺失突变
基因组
进化
Keywords
nucleotide substitution
insertion and deletion
genome
evolution
分类号
Q349 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
大白菜光周期调控因子CCA1的差异分析及功能标记开发
被引量:
3
2
作者
张志刚
刘栓桃
李巧云
王晓
王立华
赵智中
王淑芬
徐文玲
刘贤娴
刘辰
机构
山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心
出处
《山东农业科学》
2016年第6期1-6,181,共6页
基金
山东省自然科学基金项目(ZR2014CM021
ZR2015YL073)
+1 种基金
山东省农业科学院青年基金项目(2014QNM11)
山东省农业良种工程项目"十字花科名产蔬菜新品种选育"(2014LNK-96-PZTP-10)
文摘
本研究利用春季和秋季条件下光周期的变化趋势,对两个大白菜自交系06-247与He102的光周期敏感性进行了鉴定,结果是06-247对长日照敏感,而He102对长日照不敏感。采用同源克隆技术,比较分析两材料光周期响应关键调控因子CCA1的全长c DNA序列,发现二者编码区存在两处6 bp插入/缺失和14处非同义SNPs差异;二者编码产物分别包含552、556个氨基酸残基;其非同义SNPs造成不同氨基酸的替换;二者间氨基酸序列差异主要位于CCA1蛋白中间区域的蛋白-蛋白相互作用结构域和C端的磷酸化修饰结构域。本研究开发出区分两处6 bp插入/缺失的共显性分子标记。该结果为深入研究CCA1在大白菜光周期响应调节过程中的功能奠定了基础。
关键词
大白菜
依赖/不依赖长日照开花型
BraCCA1
插入/缺失突变
功能标记
Keywords
Chinese cabbage
Flowering relying(not) on long day
BraCCA1
Insertion/Deletion(In Del) mutation
Functional marker
分类号
S634.103.6 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
利用比较基因组学开发山羊草属InDel分子标记
被引量:
14
3
作者
吴磊
王丹
苏文悦
郭长虹
束永俊
机构
哈尔滨师范大学生命科学与技术学院/黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期1334-1338,共5页
基金
国家重点基础研究计划(973计划)前期项目(2011CB111505)
黑龙江省青年科学基金项目(QC2011C108)
+2 种基金
国际科技合作项目(2009DFA32470)
黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12521149)
哈尔滨师范大学科技创新团队(KJTD201102)资助
文摘
为开发和利用小麦野生近缘种的优异基因,采用比较基因组学方法,通过拟斯卑尔脱山羊草EST(expressed sequencetag)与小麦UniGene序列的比对分析,发现山羊草插入/缺失(InDel)位点137个,在这些位点两端序列设计引物24对,通过在15个小麦野生近缘属种基因组DNA的扩增分析,发现11对引物具多态性,可以作为InDel标记。这些包含突变位点的基因涉及亚细胞定位、蛋白质结合与催化以及代谢等过程。
关键词
比较基因组学
插入/缺失突变
小麦
拟斯卑尔脱山羊草
功能分子标记
Keywords
Comparative genomics
Insertion/deletion mutation (InDel)
Wheat
Aegilops speltoides
Functional molecular marker
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
突变在基因组进化中的意义
陈玲玲
彭贵子
张伟丽
田大成
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2006
17
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
大白菜光周期调控因子CCA1的差异分析及功能标记开发
张志刚
刘栓桃
李巧云
王晓
王立华
赵智中
王淑芬
徐文玲
刘贤娴
刘辰
《山东农业科学》
2016
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
利用比较基因组学开发山羊草属InDel分子标记
吴磊
王丹
苏文悦
郭长虹
束永俊
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
14
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职称材料
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