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条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)线粒体全基因组测序及虾蛄科系统发育分析
1
作者
张千钰
马家乐
+1 位作者
叶莹莹
李继姬
《海洋学报》
北大核心
2025年第9期129-144,共16页
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)属于虾蛄科Squillidae(Latreille,1802)。在本研究中,通过二代测序技术得到了条尾近虾蛄的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有37个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个rRNA,2...
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)属于虾蛄科Squillidae(Latreille,1802)。在本研究中,通过二代测序技术得到了条尾近虾蛄的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有37个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个rRNA,22个tRNA。对碱基含量分析发现A碱基含量最高为35.42%,G碱基最低为12.83%,选择了虾蛄科11个物种的线粒体基因组进行选择压力分析发现所有PCGs都受到纯化选择。另外通过结合软甲纲下2个亚纲的线粒体基因组的13个PCGs构建了系统发育树,结果发现虾蛄科为单系群,科内物种能够形成一个独立的分支,与其他相关的掠虾亚纲动物(如琴虾蛄科等)有明显的分化。对软甲纲的线粒体基因重排进行比较发现口足目未表现出重排现象。从重建的掠虾亚纲的分歧时间的年代图谱,得到现存物种的分化最早发生在中生代白垩纪期,在新生代物种大量分化。这些结果将更好地帮助人们理解不同虾蛄科物种的亲缘关系,以及软甲纲内各亚纲之间的进化地位与关系。
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关键词
虾
蛄科
掠虾亚纲
线粒体基因组
系统发育分析
分歧时间
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职称材料
口足目系统分类学研究进展
被引量：
1
2
作者
程娇
王永良
沙忠利
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期173-177,共5页
口足目Stomatopoda隶属甲壳动物亚门Crustacea软甲纲Malacostraca掠虾亚纲Hoplocarida。掠虾亚纲是软甲纲三个亚纲中形态构造最为特殊的一个类群,仅含口足目1目,现生种超过450种,分隶于7总科17科[1]。口足类在世界各大海域广泛分布,但...
口足目Stomatopoda隶属甲壳动物亚门Crustacea软甲纲Malacostraca掠虾亚纲Hoplocarida。掠虾亚纲是软甲纲三个亚纲中形态构造最为特殊的一个类群,仅含口足目1目,现生种超过450种,分隶于7总科17科[1]。口足类在世界各大海域广泛分布,但主要分布于热带和亚热带水域,其中在印度-西太平洋热带海域种类最为丰富[1]。口足类是十分重要的海洋底栖甲壳动物,在海洋底栖生物和海岸软泥沙底质群落食物链中占据重要地位。
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关键词
口足类
足目
掠虾亚纲
甲壳动物
亚
门
软甲
纲
海洋底栖生物
真软甲
亚
纲
总科
现生种
CRUSTACEA
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职称材料
题名
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)线粒体全基因组测序及虾蛄科系统发育分析
1
作者
张千钰
马家乐
叶莹莹
李继姬
机构
浙江海洋大学海洋科学与技术学院
浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心
出处
《海洋学报》
北大核心
2025年第9期129-144,共16页
基金
国家自然科学基金(42107301)。
文摘
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)属于虾蛄科Squillidae(Latreille,1802)。在本研究中,通过二代测序技术得到了条尾近虾蛄的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有37个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个rRNA,22个tRNA。对碱基含量分析发现A碱基含量最高为35.42%,G碱基最低为12.83%,选择了虾蛄科11个物种的线粒体基因组进行选择压力分析发现所有PCGs都受到纯化选择。另外通过结合软甲纲下2个亚纲的线粒体基因组的13个PCGs构建了系统发育树,结果发现虾蛄科为单系群,科内物种能够形成一个独立的分支,与其他相关的掠虾亚纲动物(如琴虾蛄科等)有明显的分化。对软甲纲的线粒体基因重排进行比较发现口足目未表现出重排现象。从重建的掠虾亚纲的分歧时间的年代图谱,得到现存物种的分化最早发生在中生代白垩纪期,在新生代物种大量分化。这些结果将更好地帮助人们理解不同虾蛄科物种的亲缘关系,以及软甲纲内各亚纲之间的进化地位与关系。
关键词
虾
蛄科
掠虾亚纲
线粒体基因组
系统发育分析
分歧时间
Keywords
Squillidae
Stomatopod
mitochondrial genome
phylogenetic analysis
divergence time
分类号
Q951.3 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
口足目系统分类学研究进展
被引量：
1
2
作者
程娇
王永良
沙忠利
机构
中国科学院海洋研究所
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期173-177,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31401955)
文摘
口足目Stomatopoda隶属甲壳动物亚门Crustacea软甲纲Malacostraca掠虾亚纲Hoplocarida。掠虾亚纲是软甲纲三个亚纲中形态构造最为特殊的一个类群,仅含口足目1目,现生种超过450种,分隶于7总科17科[1]。口足类在世界各大海域广泛分布,但主要分布于热带和亚热带水域,其中在印度-西太平洋热带海域种类最为丰富[1]。口足类是十分重要的海洋底栖甲壳动物,在海洋底栖生物和海岸软泥沙底质群落食物链中占据重要地位。
关键词
口足类
足目
掠虾亚纲
甲壳动物
亚
门
软甲
纲
海洋底栖生物
真软甲
亚
纲
总科
现生种
CRUSTACEA
分类号
Q959.223 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)线粒体全基因组测序及虾蛄科系统发育分析
张千钰
马家乐
叶莹莹
李继姬
《海洋学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
口足目系统分类学研究进展
程娇
王永良
沙忠利
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
在线阅读
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职称材料
已选择
0
条
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引证文献
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