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基因组时代线粒体基因组拼装策略及软件应用现状
被引量：
7
1
作者
匡卫民
于黎
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期979-993,共15页
随着测序技术的不断发展,越来越多物种的全基因组数据被测定和广泛应用。在二代基因组数据爆发式增长的同时,除了核基因组数据,线粒体基因组数据也非常重要。高通量测序的全基因组序列中除了核基因组序列也包括线粒体基因组序列,如何从...
随着测序技术的不断发展,越来越多物种的全基因组数据被测定和广泛应用。在二代基因组数据爆发式增长的同时,除了核基因组数据,线粒体基因组数据也非常重要。高通量测序的全基因组序列中除了核基因组序列也包括线粒体基因组序列,如何从海量的全基因组数据中提取和拼装线粒体基因组序列并加以应用成为线粒体基因组在分子生物学、遗传学和医学等方面的研究方向之一。基于此,从全基因组数据中提取线粒体基因组序列的策略及相关的软件不断发展。根据从全基因组数据中锚定线粒体reads的方式和后续拼装策略的不同,可以分为有参考序列拼装方法和从头拼装方法,不同拼装策略及软件也表现出各自的优势和局限性。本文总结并比较了当前从全基因组数据中获得线粒体基因组数据的策略和软件应用,并对使用者在使用不同策略和相关软件方面给予建议,以期为线粒体基因组在生命科学的相关研究中提供方法上的参考。
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关键词
全基因组
线粒体基因组
有参考序列
拼装方法
从头
拼装方法
拼
装
软件
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职称材料
劲性支撑穹顶结构的施工方法与试验研究
被引量：
1
2
作者
薛素铎
高占远
+1 位作者
张超
王琼
《中南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期1219-1226,共8页
基于劲性支撑穹顶结构具有杆件定位容易、自身质量小及结构效率高等特点,提出中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法和地面拼装高空提升1次张拉成形的施工方法。将这2种施工方法对比分析,确定采用中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法,采用...
基于劲性支撑穹顶结构具有杆件定位容易、自身质量小及结构效率高等特点,提出中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法和地面拼装高空提升1次张拉成形的施工方法。将这2种施工方法对比分析,确定采用中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法,采用FEDR算法进行施工成形分析。设计1个直径为6 m的劲性支撑穹顶结构模型,采用中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法对试验模型进行施工,将试验结果与理论分析结果进行对比分析。分析试验过程中容易出现的关键问题并给出解决方案。研究研究表明:设计的试验模型是可行的;采用中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法施工时,各步的内力和位移试验值与理论值基本吻合。
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关键词
劲性支撑穹顶结构
中心场地
拼
装
逐步张拉提升施工
方法
模型试验
FEDR算法
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职称材料
题名
基因组时代线粒体基因组拼装策略及软件应用现状
被引量：
7
1
作者
匡卫民
于黎
机构
云南大学生命科学学院省部共建生物资源保护与利用国家重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期979-993,共15页
基金
国家自然科学基釐项目(编号：31872213)
云南省教育厅科学研究基釐产业化培育项目(编号：2016CYH02)
云南省研究生学术新人奖资助项目~~
文摘
随着测序技术的不断发展,越来越多物种的全基因组数据被测定和广泛应用。在二代基因组数据爆发式增长的同时,除了核基因组数据,线粒体基因组数据也非常重要。高通量测序的全基因组序列中除了核基因组序列也包括线粒体基因组序列,如何从海量的全基因组数据中提取和拼装线粒体基因组序列并加以应用成为线粒体基因组在分子生物学、遗传学和医学等方面的研究方向之一。基于此,从全基因组数据中提取线粒体基因组序列的策略及相关的软件不断发展。根据从全基因组数据中锚定线粒体reads的方式和后续拼装策略的不同,可以分为有参考序列拼装方法和从头拼装方法,不同拼装策略及软件也表现出各自的优势和局限性。本文总结并比较了当前从全基因组数据中获得线粒体基因组数据的策略和软件应用,并对使用者在使用不同策略和相关软件方面给予建议,以期为线粒体基因组在生命科学的相关研究中提供方法上的参考。
关键词
全基因组
线粒体基因组
有参考序列
拼装方法
从头
拼装方法
拼
装
软件
Keywords
whole-genome sequencing
mitogenome
mitogenome-reference assembly
de novo assembly
assembly software
分类号
TP3 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
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职称材料
题名
劲性支撑穹顶结构的施工方法与试验研究
被引量：
1
2
作者
薛素铎
高占远
张超
王琼
机构
北京工业大学工程抗震与结构诊治北京市重点实验室
清华大学土木工程系
河北农业大学理工学院
出处
《中南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期1219-1226,共8页
基金
国家自然科学基金项目资助(51378031)
北京市自然科学基金项目资助(8132022)
+1 种基金
城市与工程安全减灾教育部重点实验室&工程抗震与结构诊治北京市重点实验室重点项目(USDE201401)
教育部长江学者和创新团队发展计划项目(IRT13044)~~
文摘
基于劲性支撑穹顶结构具有杆件定位容易、自身质量小及结构效率高等特点,提出中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法和地面拼装高空提升1次张拉成形的施工方法。将这2种施工方法对比分析,确定采用中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法,采用FEDR算法进行施工成形分析。设计1个直径为6 m的劲性支撑穹顶结构模型,采用中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法对试验模型进行施工,将试验结果与理论分析结果进行对比分析。分析试验过程中容易出现的关键问题并给出解决方案。研究研究表明:设计的试验模型是可行的;采用中心场地拼装逐步张拉提升的施工方法施工时,各步的内力和位移试验值与理论值基本吻合。
关键词
劲性支撑穹顶结构
中心场地
拼
装
逐步张拉提升施工
方法
模型试验
FEDR算法
Keywords
rigid bracing dome
the node-by-node assembling and integral tension method
model experiment
FEDR algorithm
分类号
TU394 [建筑科学—结构工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基因组时代线粒体基因组拼装策略及软件应用现状
匡卫民
于黎
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2019
7
在线阅读
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职称材料
2
劲性支撑穹顶结构的施工方法与试验研究
薛素铎
高占远
张超
王琼
《中南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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职称材料
已选择
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