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基于MapReduce的拷贝数变异测序数据并行处理方案
1
作者 何亨 程凯莉 +1 位作者 张葵 成淑君 《计算机工程》 北大核心 2025年第5期177-187,共11页
拷贝数变异(CNV)作为一种遗传变异,广泛存在于人类基因组的基因分布中。CNV检测效率的提升不仅可以为更多的病患提供更加快速精确的CNV检测结果,大幅降低医疗成本,同时又有利于药物的研发和临床应用。基于读段深度(RD)的方法是目前最为... 拷贝数变异(CNV)作为一种遗传变异,广泛存在于人类基因组的基因分布中。CNV检测效率的提升不仅可以为更多的病患提供更加快速精确的CNV检测结果,大幅降低医疗成本,同时又有利于药物的研发和临床应用。基于读段深度(RD)的方法是目前最为常用的CNV检测方法,对RD相关信息的处理时间较长,在CNV检测中时间占比较高。现有方法无法有效应用于全基因组分析,存在计算效率较低、检测精度下降的问题。基于RD的CNV检测方法,提出一种高效的测序数据并行处理方案EPPCNV。在EPPCNV中,设计2个MapReduce作业串行执行的方法,实现高效全基因组测序数据的并行处理,精准地完成RD相关信息的提取;为充分考虑到GC含量偏差对CNV检测结果的影响,对测序数据的RDs进行校正处理,保证最终检测结果的高灵敏度与高精确度;采用独立于具体CNV检测方法的高适配性数据处理方式,其最终生成的RD相关信息能够与多种主流CNV检测方法直接结合,在不改变原方法对CNV区域判定的基础上,实现方法整体性能的大幅提升。实验结果表明,EPPCNV的综合准确率高,分别与CNV-LOF、HBOS-CNV以及CNVnator 3种方法直接结合,能够显著提升原方法的计算效率,并保证检测结果的高灵敏度与高精确度。对于覆盖深度越高、数据量越大的测序数据,CNV检测方法与EPPCNV结合后计算效率的提升更为显著。 展开更多
关键词 拷贝数变异检测 MapReduce作业 测序数据处理 读段深度 全基因组
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基于视觉感知的时空联合视频拷贝检测方法 被引量：11
2
作者 潘雪峰 李锦涛 +3 位作者 张勇东 唐胜 余乐军 夏添 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2009年第1期107-114,共8页
视频拷贝检测在视频信息检索和版权保护等方面有着重要意义.文中依据视觉感知特性,认为现有的基于单帧的拷贝检测方法未充分利用视频的时空相关性,进而在利用这一重要特性进行拷贝检测方面进行了探讨.依据自然图像序列的时空相关性以及... 视频拷贝检测在视频信息检索和版权保护等方面有着重要意义.文中依据视觉感知特性,认为现有的基于单帧的拷贝检测方法未充分利用视频的时空相关性,进而在利用这一重要特性进行拷贝检测方面进行了探讨.依据自然图像序列的时空相关性以及视觉系统对时空信息的感知特性,通过对时空切片单元块Sub进行DCT分析得到与视频内容相关的时空联合特征,并基于该特征提出视频拷贝检测算法.实验表明,文中所提出的视频拷贝检测方法对视频内容变化敏感而对相同内容视频格式上的变化鲁棒,表现出优于现有方法的性能. 展开更多
关键词 视频拷贝检测 视觉感知 时空相关 时空切片 DCT
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抗旋转和等比缩放失真的图像拷贝检测技术 被引量：9
3
作者 邹复好 李晓威 +2 位作者 许治华 凌贺飞 李平 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2009年第8期1349-1356,共8页
现有的图像拷贝检测方法中,多数对类似噪声的图像失真比较鲁棒,而对几何类失真则比较脆弱.在几何类失真中,旋转和等比缩放失真又是最为常见的.Wu等人在2005年和2007年提出基于椭圆圆环分区的图像拷贝检测方法,试图抵抗旋转、平移、等比... 现有的图像拷贝检测方法中,多数对类似噪声的图像失真比较鲁棒,而对几何类失真则比较脆弱.在几何类失真中,旋转和等比缩放失真又是最为常见的.Wu等人在2005年和2007年提出基于椭圆圆环分区的图像拷贝检测方法,试图抵抗旋转、平移、等比缩放和裁剪等几何失真.然而,椭圆形体并不具备旋转不变性,可见Wu的方法在解决旋转失真问题上并不彻底.针对旋转和等比缩放失真,提出基于圆环分区的顺序测度拷贝检测方法,由于圆环区域划分法可以保证旋转和等比缩放失真以后,圆环中的内容保持不变,因而该方法对上述2种失真具有较好的抵抗能力.同时,引入顺序测度提取圆环序列的特征,因而可以很好抵抗类似噪声失真.实验表明,在抵抗旋转和等比缩放失真方面,给出的方法均好于Wu的方法. 展开更多
关键词 顺序测度 基于内容的拷贝检测 几何失真 查全率 查准率
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压缩域快速视频拷贝检测算法 被引量：9
4
作者 张勇东 张冬明 +1 位作者 郭俊波 唐胜 《通信学报》 EI CSCD 北大核心 2009年第3期135-140,共6页
为了在大规模数据下有效提升拷贝检测速度,提出了一种压缩域视频拷贝检测算法,采用2级匹配框架,利用压缩域上DCT系数顺序度量特征进行相似度匹配,显著减少了查询视频解码操作;并为DCT系数顺序度量特征建立倒排索引,以加快第一级匹配的... 为了在大规模数据下有效提升拷贝检测速度,提出了一种压缩域视频拷贝检测算法,采用2级匹配框架,利用压缩域上DCT系数顺序度量特征进行相似度匹配,显著减少了查询视频解码操作;并为DCT系数顺序度量特征建立倒排索引,以加快第一级匹配的速度。实验结果表明,与已有的算法相比,所提出算法在保持相当的检测精度条件的同时,大幅提升了检测速度。 展开更多
关键词 视频拷贝检测 压缩域 DCT系数 顺序度量
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基于时空轨迹行为特征的视频拷贝检测方法 被引量：8
5
作者 吴潇 李锦涛 +1 位作者 唐胜 郭俊波 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2010年第11期1871-1877,共7页
互联网环境中大规模的视频拷贝检测面临拷贝变化多样性问题和数据量大的问题,需要使用鲁棒、精简的视觉特征.提出以视频连续帧中关键点的轨迹行为作为内容匹配的特征.关键点轨迹的运动行为不受拷贝变化的影响,利用其特征可以实现鲁棒性... 互联网环境中大规模的视频拷贝检测面临拷贝变化多样性问题和数据量大的问题,需要使用鲁棒、精简的视觉特征.提出以视频连续帧中关键点的轨迹行为作为内容匹配的特征.关键点轨迹的运动行为不受拷贝变化的影响,利用其特征可以实现鲁棒性匹配.采用马尔可夫链模型建模轨迹的行为过程,将每条轨迹表示为一个25维的精简向量特征.使用时序一致性匹配方法定位视频拷贝的段落.在标准数据集上的对比实验证明:提出的算法在各种常见的拷贝变化下可以得到较高的检测精度,特征匹配的时空消耗低,对大规模的视频拷贝检测行之有效. 展开更多
关键词 视频拷贝检测 时空视觉轨迹 局部关键点检测 时序一致性匹配 马尔可夫链模型
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基于局部线性嵌入的视频拷贝检测方法 被引量：6
6
作者 聂秀山 刘琚 +1 位作者 孙建德 秦丰林 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2011年第5期1030-1034,共5页
该文提出了基于局部线性嵌入(LLE)的视频哈希方法,该方法首先利用一个图模型选取代表帧,然后以四阶累积量作为视频在高维空间的特征并利用LLE对视频进行降维,利用视频在3维空间中投影点的范数构造视频哈希序列来实现视频拷贝检测。实验... 该文提出了基于局部线性嵌入(LLE)的视频哈希方法,该方法首先利用一个图模型选取代表帧,然后以四阶累积量作为视频在高维空间的特征并利用LLE对视频进行降维,利用视频在3维空间中投影点的范数构造视频哈希序列来实现视频拷贝检测。实验证明该方法具有较好的鲁棒性和区分性。 展开更多
关键词 视频哈希 拷贝检测 鲁棒性 局部线性嵌入
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基于局部排序的视频拷贝检测 被引量：8
7
作者 赵玉鑫 刘光杰 +1 位作者 戴跃伟 王执铨 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2009年第9期1339-1343,共5页
排序法是一种常用的视频拷贝检测方法,为获得更佳的检测性能,提出一种基于排序特征的视频拷贝检测方案.该方案将帧进行分块,并按照Hilbert曲线顺序分别计算曲线上相邻块的灰度关系排序特征,生成用于检测的哈希码;为了准确地在目标视频... 排序法是一种常用的视频拷贝检测方法,为获得更佳的检测性能,提出一种基于排序特征的视频拷贝检测方案.该方案将帧进行分块,并按照Hilbert曲线顺序分别计算曲线上相邻块的灰度关系排序特征,生成用于检测的哈希码;为了准确地在目标视频中定位可疑内容,提出了哈希匹配方案,将序列相似度作为匹配的依据,并引入动态规划的方法提高匹配精度;最后构造了拷贝测试样本,并与传统的排序签名检测方案进行性能对比实验.结果表明,文中方案拥有较好的检测性能,适用于视频内容的拷贝检测. 展开更多
关键词 排序特征 拷贝检测 视频哈希
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基于多特征匹配的视频拷贝检测算法 被引量：5
8
作者 吴潇 高科 +2 位作者 郭俊波 李锦涛 张勇东 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第11期1856-1865,共10页
针对已有的视频拷贝检测算法仅使用单一特征进行视频内容匹配,难以应对多种不同形式的拷贝变化的问题,提出一种基于多种视觉特征的视频拷贝检测算法.该算法采用级联式检测过滤框架,在提取视频帧图像的全局特征用于检测画面轻微变化的重... 针对已有的视频拷贝检测算法仅使用单一特征进行视频内容匹配,难以应对多种不同形式的拷贝变化的问题,提出一种基于多种视觉特征的视频拷贝检测算法.该算法采用级联式检测过滤框架,在提取视频帧图像的全局特征用于检测画面轻微变化的重复视频片段后,使用更精准的局部特征等来检测各种复杂变化后的拷贝内容.为在大规模数据库中实现快速检测,使用kd树型索引结构实现特征近邻检索.在标准评测数据集上的实验结果表明,文中算法对多种拷贝变化具有鲁棒性,并具有较高的检测效率. 展开更多
关键词 视频拷贝检测 图像特征提取 视觉信息检索 树型索引结构
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基于整体DCT系数顺序测度的鲁棒图像拷贝检测算法 被引量：4
9
作者 凌贺飞 许治华 +2 位作者 邹复好 卢正鼎 李平 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2010年第10期1812-1822,共11页
能有效检测经过信号处理和几何攻击之后的版权图像是当今拷贝检测研究的热点和难点之一.现有基于图像分块的拷贝检测算法在图像经过旋转和缩放变换后分块内容变换较大,检测效果较差.针对上述问题,提出一种基于整体DCT系数顺序测度的鲁... 能有效检测经过信号处理和几何攻击之后的版权图像是当今拷贝检测研究的热点和难点之一.现有基于图像分块的拷贝检测算法在图像经过旋转和缩放变换后分块内容变换较大,检测效果较差.针对上述问题,提出一种基于整体DCT系数顺序测度的鲁棒图像拷贝检测方法,选取彩色图像YCbCr颜色空间Y平面整体DCT变换后的中低频系数,计算其顺序测度作为图像特征矢量.由于整体DCT中低频系数随着图像缩放有规律的变化,引入顺序测度提取中低频系数的序列作为图像特征,因而对缩放失真具有较好的抵抗力,同时能很好地抵抗信号处理攻击;提出旋转补偿策略,使本算法能抵抗30°以内的旋转变换攻击.实验结果证明在抗拉伸和旋转攻击方面,给出的算法相对于已有算法具有较高的查全率和查准率. 展开更多
关键词 基于内容的拷贝检测 顺序测度 几何攻击 查准率 查全率
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基于轨迹行为模式特征的视频拷贝检测算法 被引量：4
10
作者 郭俊波 李锦涛 +2 位作者 张勇东 张冬明 吴潇 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第6期943-948,958,共7页
为了有效地利用视频的时域运动信息来提高视频拷贝检测的精度和鲁棒性,提出一种基于特征点轨迹行为模式的拷贝检测算法.首先从视频连续帧中提取特征点轨迹的行为模式特征,然后采用视觉关键词典技术构造视频的运动特征,最后基于运动特征... 为了有效地利用视频的时域运动信息来提高视频拷贝检测的精度和鲁棒性,提出一种基于特征点轨迹行为模式的拷贝检测算法.首先从视频连续帧中提取特征点轨迹的行为模式特征,然后采用视觉关键词典技术构造视频的运动特征,最后基于运动特征的相似度进行视频拷贝检测.该算法在TRECVID标准数据集上取得了较高的检测精度.实验分析表明,基于轨迹的运动特征具有较强的描述区分能力,对各种常见的拷贝变化具有鲁棒性. 展开更多
关键词 视频拷贝检测 局部特征点检测 特征点轨迹 视觉关键词
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GPU加速的基于增量式聚类的视频拷贝检测方法 被引量：5
11
作者 任化敏 张勇东 林守勋 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第3期449-456,共8页
为有效地保护版权,提高大规模视频集的拷贝检测速度,提出一种完全实现在GPU上的基于增量式聚类的拷贝检测方法.对数据库中新增加的视频,首先调用GPU上的硬件解码单元对视频流解码,以实时的速度提取高维SIFT特征点;然后对特征点进行增量K... 为有效地保护版权,提高大规模视频集的拷贝检测速度,提出一种完全实现在GPU上的基于增量式聚类的拷贝检测方法.对数据库中新增加的视频,首先调用GPU上的硬件解码单元对视频流解码,以实时的速度提取高维SIFT特征点;然后对特征点进行增量K-means聚类,以动态地反映数据库的变化,并根据聚类结果更新视觉关键词词典;再将每帧表示成归一化的词频向量;最后使用基于帧级别词频向量的时空顺序匹配法来判定查询视频是否为数据库中视频的拷贝.实验结果表明,该方法比原有的CPU实现方法整体提速最高达63倍. 展开更多
关键词 拷贝检测 增量聚类 视觉关键词 图形处理器 计算统一设备架构
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基于改进的近邻传播学习算法的视频拷贝检测 被引量：4
12
作者 许喆 薛智锋 陈福才 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2014年第9期3185-3189,共5页
为解决传统的基于k-means聚类的视觉词典法存在检索精度差、时间效率低等问题,提出基于近邻传播学习算法且适用于大规模视频数据集的视觉词典改进生成方法。在此基础上采用局部敏感哈希方法实现视频帧直方图的相似性匹配,采用投票方法... 为解决传统的基于k-means聚类的视觉词典法存在检索精度差、时间效率低等问题,提出基于近邻传播学习算法且适用于大规模视频数据集的视觉词典改进生成方法。在此基础上采用局部敏感哈希方法实现视频帧直方图的相似性匹配,采用投票方法完成视频拷贝检测;通过引入LAP(landmark affinity propagation,LAP)算法实现视觉词典的动态扩充。实验结果表明,相比于传统方法,该方法提高了视频拷贝检测精度,对大规模数据集具有更好的扩展性。 展开更多
关键词 视频拷贝检测 近邻传播聚类 视觉词典法 tf-idf算法 局部敏感哈希
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运用边缘方向直方图进行图像拷贝检测 被引量：3
13
作者 刘炜 欧阳建权 +1 位作者 李泽洲 张敏 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第31期184-187,共4页
基于内容的图像拷贝检测已经成为图像版权保护的重要手段之一。提出一种基于图像边缘直方图的拷贝检测方法:采用小波模极大值算法提取源图像和待认证图像边缘,然后结合边缘点梯度主方向重新计算其区域点的梯度方向并生成直方图,最后根... 基于内容的图像拷贝检测已经成为图像版权保护的重要手段之一。提出一种基于图像边缘直方图的拷贝检测方法:采用小波模极大值算法提取源图像和待认证图像边缘,然后结合边缘点梯度主方向重新计算其区域点的梯度方向并生成直方图,最后根据源图像与待认证图像所得边缘直方图间的相似性检测待认证图像是否为源图像的拷贝。实验表明:这种图像拷贝检测方法可有效检测出拷贝图像,并可容忍由缩放、旋转、噪声等操作引起的失真。 展开更多
关键词 图像拷贝检测 边缘检测 主方向
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基于内容的视频拷贝检测研究 被引量：3
14
作者 刘红 文朝晖 王晔 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期227-229,共3页
提出基于图的视频拷贝检测方法,该方法将视频序列匹配结果转换为匹配结果图,进而将视频拷贝检测转换成在匹配结果图中查找最长路径的问题。实验结果显示基于图的序列匹配算法拷贝定位准确度高,可弥补图像底层特征描述力不足的缺陷,节约... 提出基于图的视频拷贝检测方法,该方法将视频序列匹配结果转换为匹配结果图,进而将视频拷贝检测转换成在匹配结果图中查找最长路径的问题。实验结果显示基于图的序列匹配算法拷贝定位准确度高,可弥补图像底层特征描述力不足的缺陷,节约检测时间,批量定位2段视频序列中可能存在的多段拷贝。 展开更多
关键词 视频拷贝检测 聚类 最长路径
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基于小波域奇异值分解的图像拷贝检测 被引量：4
15
作者 康晓兵 魏生民 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2010年第4期917-920,共4页
提出一种基于小波域奇异值分解(SVD)和早期融合技术的数字图像拷贝检测算法。这种基于内容的拷贝检测模式主要面向数字图像被动式取证和数字版权管理等领域。为了提高图像描述特征的效率,算法利用多尺度小波分析提取并融合具有图像全局... 提出一种基于小波域奇异值分解(SVD)和早期融合技术的数字图像拷贝检测算法。这种基于内容的拷贝检测模式主要面向数字图像被动式取证和数字版权管理等领域。为了提高图像描述特征的效率,算法利用多尺度小波分析提取并融合具有图像全局和局部特征的多尺度奇异值特征向量。实验结果表明,该算法不仅在识别几何变换、信号处理、图像操作处理及组合变换等不同攻击下的图像修改版本时具有较强的鲁棒性和内容辨识性,而且具有较高的检测率。算法可以用于数据库或网络环境下的数字图像盗版检测。 展开更多
关键词 基于内容的拷贝检测 数字图像取证 奇异值分解 数字版权管理 多尺度小波分析
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基于统计特征的鲁棒图像拷贝检测技术 被引量：3
16
作者 马晓普 刘妍 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2009年第8期2233-2235,共3页
抗几何攻击的拷贝检测技术是图像拷贝检测领域中的一个重要问题,现有的图像拷贝检测方法中,多数对类似噪声的图像失真比较鲁棒,而对于几何类失真则比较脆弱。因此,提出一种鲁棒图像拷贝检测技术,利用图像高斯过滤后的低频部分中的统计特... 抗几何攻击的拷贝检测技术是图像拷贝检测领域中的一个重要问题,现有的图像拷贝检测方法中,多数对类似噪声的图像失真比较鲁棒,而对于几何类失真则比较脆弱。因此,提出一种鲁棒图像拷贝检测技术,利用图像高斯过滤后的低频部分中的统计特征(直方图形状和均值)进行拷贝检测。实验结果表明该方法能较好地抵抗不改变内容的几何失真和图像处理攻击。 展开更多
关键词 几何攻击 高斯滤波 直方图 图像拷贝检测 顺序测度
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基于镜头时长和纹理信息的视频拷贝检测
17
作者 俞芳 崔少彬 高振彦 《计算机工程》 CAS CSCD 2013年第2期304-310,共7页
在视频拷贝检测中,检测速度和检测精度不能同时达到最优。为此,提出一种基于镜头时长和纹理信息的视频拷贝检测方法。以镜头时长作为特征建立倒排索引,并放入数据库,对查询视频进行分割,将其与数据库匹配,得到初次拷贝检测结果,分析关... 在视频拷贝检测中,检测速度和检测精度不能同时达到最优。为此,提出一种基于镜头时长和纹理信息的视频拷贝检测方法。以镜头时长作为特征建立倒排索引,并放入数据库,对查询视频进行分割,将其与数据库匹配,得到初次拷贝检测结果,分析关键帧序列的纹理复杂度得到最终的拷贝检测结果。实验结果表明,该方法的检测速度较快,查准率和查全率均为1。 展开更多
关键词 视频拷贝检测 镜头时长 倒排索引 纹理信息 拷贝检测结果
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面向三维辅助设计软件SolidWorks的学生作业防拷贝检测系统开发 被引量：4
18
作者 王淑侠 荆晓珂 高满屯 《图学学报》 CSCD 北大核心 2017年第4期603-609,共7页
为防止学生对三维CAD作业的互相拷贝,以SolidWorks文件防拷贝检测为例,首先探讨Solid Works文件的各种可能拷贝方式,将其分为特征属性改变拷贝与特征属性不变拷贝两种;然后对其分别提出对应的判断原理;最后,以C++为工具开发了一个针对... 为防止学生对三维CAD作业的互相拷贝,以SolidWorks文件防拷贝检测为例,首先探讨Solid Works文件的各种可能拷贝方式,将其分为特征属性改变拷贝与特征属性不变拷贝两种;然后对其分别提出对应的判断原理;最后,以C++为工具开发了一个针对多种拷贝方式的检测系统。该检测系统通过读取SolidWorks文件的特征信息,然后进行相关信息对比检测,筛选出存在拷贝可能性的文件,最终提供给教师进行人工判断。教学实践证明该方法可有效制止学生之间的CAD作业互相拷贝。 展开更多
关键词 拷贝检测 三维CAD文件 SOLIDWORKS
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基于内容的视频拷贝检测研究 被引量：8
19
作者 靳延安 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2008年第8期2021-2023,共3页
提出一种新的基于内容的视频拷贝检测方法,根据视频连续帧之间信息的冗余,提出关键帧提取算法,对提取的关键帧做DCT变换,并将AC系数的有序测度作为关键帧的特征,计算视频关键帧之间的L1距离作为视频之间的相似度度量。实验表明该方法对... 提出一种新的基于内容的视频拷贝检测方法,根据视频连续帧之间信息的冗余,提出关键帧提取算法,对提取的关键帧做DCT变换,并将AC系数的有序测度作为关键帧的特征,计算视频关键帧之间的L1距离作为视频之间的相似度度量。实验表明该方法对抗几种不同的几何攻击有较好的效果。 展开更多
关键词 版权保护 有序测度 视频拷贝检测 关键帧匹配
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梳状谱信号多拷贝快速匹配/相关检测技术 被引量：3
20
作者 刘贯领 凌国民 严琪 《信号处理》 CSCD 北大核心 2007年第6期888-890,共3页
在主动声纳信号波形中,梳状谱信号如调频脉冲传信号(PTFM)和正弦调频信号(SFM)等,因为其优良的抗混响以及速度分辨能力越来越受到人们的重视。然而,由于这类信号的多普勒容限很小,必须采用相当数量的拷贝才能够充分发挥其性能。常规的匹... 在主动声纳信号波形中,梳状谱信号如调频脉冲传信号(PTFM)和正弦调频信号(SFM)等,因为其优良的抗混响以及速度分辨能力越来越受到人们的重视。然而,由于这类信号的多普勒容限很小,必须采用相当数量的拷贝才能够充分发挥其性能。常规的匹配/相关技术实现多拷贝检测需要的计算量过大,工程上实现难度极大,从而限制了它们在实际工程中的应用。本文充分利用梳状谱信号匹配/相关输出的多峰结构和Parseval定理,提出了一种新的梳状谱信号检测方法以及相应的多拷贝快速算法,并通过实际湖试数据对这种检测方法的正确性进行了验证。该算法同时实现了梳状谱信号匹配滤波/相关输出端多峰的能量累积,有利于检测器输出信噪比的提高以及声纳系统整体性能的改善。 展开更多
关键词 主动声纳 梳状谱波形 拷贝匹配/相关检测 快速算法 性能改善
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