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一个拮抗灰葡萄孢菌的AMP核苷酶基因的生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
贾立君
李凤霞
马汇泉
《黑龙江八一农垦大学学报》
2013年第1期32-36,49,共6页
运用生物信息学工具和软件对一个从土壤宏基因组文库中获得的AMP核苷酶基因进行初步预测和分析,该基因的最大开放阅读框为612 bp,编码203个氨基酸,预测的蛋白质分子量为22.186 7 kDa,是一个小分子量疏水性脂溶蛋白,含有5个蛋白激酶C磷...
运用生物信息学工具和软件对一个从土壤宏基因组文库中获得的AMP核苷酶基因进行初步预测和分析,该基因的最大开放阅读框为612 bp,编码203个氨基酸,预测的蛋白质分子量为22.186 7 kDa,是一个小分子量疏水性脂溶蛋白,含有5个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶磷酸化位点,3个N-豆蔻酰化位点,这些位点均与细胞内信号传导、蛋白定位以及黏附等过程有关,推测该基因可能在拮抗灰葡萄孢菌过程的信号转导和分子识别中发挥重要作用。
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关键词
宏
基因
组文库
灰葡萄孢菌
拮抗基因
生物信息学分析
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职称材料
转座子标签法对阴沟肠杆菌B8拮抗水稻白叶枯病菌相关基因片段的克隆与检测
被引量：
3
2
作者
黄海宁
余旭平
+2 位作者
陈卫良
龚鸿飞
李德葆
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第3期265-269,共5页
阴沟肠杆菌B8是从水稻叶面分离获得的具有拮抗水稻白叶枯病菌等多种病原细菌的广谱拮抗菌.为研究其拮抗机理,我们应用转座子标签法对阴沟肠杆菌B8中与抗水稻白叶枯病菌拮抗活性相关的DNA片段进行了克隆.通过自杀性质粒pZJ25介导,将Tn5...
阴沟肠杆菌B8是从水稻叶面分离获得的具有拮抗水稻白叶枯病菌等多种病原细菌的广谱拮抗菌.为研究其拮抗机理,我们应用转座子标签法对阴沟肠杆菌B8中与抗水稻白叶枯病菌拮抗活性相关的DNA片段进行了克隆.通过自杀性质粒pZJ25介导,将Tn5转座到B8的染色体上,从而筛选到2株拮抗活性丧失的菌株B8B和B8F;用Tn5片段为探针,分别对B8、B8B、B8F进行Southern杂交,结果在B8中无特异条带,而在B8B和B8F中各有一条约20 kb和9 kb的EcoRⅠ特异条带;分别提取二株突变菌株的基因组DNA,BamHⅠ酶切,克隆于pBS的BamHⅠ位点上,利用Tn5上的Kan抗性,分别筛选到质粒pTLB和pTLF,获得包含Tn5部分序列的B和F二个基因片段,大小约为6 kb和7 kb;应用pTLB全质粒和pTLF中约0.8 kb的BamHⅠ+HpaⅠ外源F片段为探针,对B8、B8B、B8F进行Southern杂交,证实我们克隆到Tn5转座位点周围的二个片段,且他们分别位于B8菌株染色体DNA的二个不同位置.
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关键词
阴沟肠杆菌B8
水稻白叶枯病
拮
抗
相关
基因
克隆
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职称材料
中国安徽地区白血病患者与HLA-A、B、DRB1基因关联性研究
3
作者
廖艳秋
朱梅红
+2 位作者
王敏
蒋光明
王保龙
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
2010年第4期1055-1058,共4页
本研究旨在探讨中国安徽地区人群中白血病的易感性与HLA-A、B、DRB1基因多态性之间的关联。采用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR-SSP)方法对安徽地区140例慢性髓系白血病(CML)、84例急性淋巴细胞性白血病(ALL)、90例急性非淋巴细胞性白...
本研究旨在探讨中国安徽地区人群中白血病的易感性与HLA-A、B、DRB1基因多态性之间的关联。采用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR-SSP)方法对安徽地区140例慢性髓系白血病(CML)、84例急性淋巴细胞性白血病(ALL)、90例急性非淋巴细胞性白血病(ANLL)患者以及916名健康的非血缘造血干细胞捐献者作为正常对照组进行了HLA基因分型,分别比较了病人组及正常对照组的HLA-A、B、DRB1位点的基因频率,通过χ2检验进行统计学分析。结果表明,CML患者A2、A11、B58、DR9基因频率较对照组明显升高,DR7基因频率较对照组明显降低;ALL患者A11、B13基因频率明显高于对照组;ANLL患者A24、B58、DR9基因频率较对照组明显升高。结论:HLA-A2、A11、B58、DR9是CML的易感基因,DR7是其拮抗基因;HLA-A11、B13是ALL的易感基因;HLA-A24、B58、DR9是ANLL的易感基因。
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关键词
白血病
HIA
基因
基因
频率
易感
基因
拮抗基因
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职称材料
题名
一个拮抗灰葡萄孢菌的AMP核苷酶基因的生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
贾立君
李凤霞
马汇泉
机构
黑龙江省农业科学院佳木斯分院
山东理工大学生命科学学院
出处
《黑龙江八一农垦大学学报》
2013年第1期32-36,49,共6页
基金
山东省自然科学基金项目(ZR2011CL006)
文摘
运用生物信息学工具和软件对一个从土壤宏基因组文库中获得的AMP核苷酶基因进行初步预测和分析,该基因的最大开放阅读框为612 bp,编码203个氨基酸,预测的蛋白质分子量为22.186 7 kDa,是一个小分子量疏水性脂溶蛋白,含有5个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶磷酸化位点,3个N-豆蔻酰化位点,这些位点均与细胞内信号传导、蛋白定位以及黏附等过程有关,推测该基因可能在拮抗灰葡萄孢菌过程的信号转导和分子识别中发挥重要作用。
关键词
宏
基因
组文库
灰葡萄孢菌
拮抗基因
生物信息学分析
Keywords
metagenomic library
Botrytis cinerea
antagonist gene
Bioinformatics analysis
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
转座子标签法对阴沟肠杆菌B8拮抗水稻白叶枯病菌相关基因片段的克隆与检测
被引量：
3
2
作者
黄海宁
余旭平
陈卫良
龚鸿飞
李德葆
机构
浙江大学生物技术研究所
出处
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第3期265-269,共5页
基金
国家863"基金资助项目(104-04-01-01)
文摘
阴沟肠杆菌B8是从水稻叶面分离获得的具有拮抗水稻白叶枯病菌等多种病原细菌的广谱拮抗菌.为研究其拮抗机理,我们应用转座子标签法对阴沟肠杆菌B8中与抗水稻白叶枯病菌拮抗活性相关的DNA片段进行了克隆.通过自杀性质粒pZJ25介导,将Tn5转座到B8的染色体上,从而筛选到2株拮抗活性丧失的菌株B8B和B8F;用Tn5片段为探针,分别对B8、B8B、B8F进行Southern杂交,结果在B8中无特异条带,而在B8B和B8F中各有一条约20 kb和9 kb的EcoRⅠ特异条带;分别提取二株突变菌株的基因组DNA,BamHⅠ酶切,克隆于pBS的BamHⅠ位点上,利用Tn5上的Kan抗性,分别筛选到质粒pTLB和pTLF,获得包含Tn5部分序列的B和F二个基因片段,大小约为6 kb和7 kb;应用pTLB全质粒和pTLF中约0.8 kb的BamHⅠ+HpaⅠ外源F片段为探针,对B8、B8B、B8F进行Southern杂交,证实我们克隆到Tn5转座位点周围的二个片段,且他们分别位于B8菌株染色体DNA的二个不同位置.
关键词
阴沟肠杆菌B8
水稻白叶枯病
拮
抗
相关
基因
克隆
Keywords
enterobacter cloacae B8
Xanthomonas oryzae pv. oryzae
antagonistic related genes
cloning
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
中国安徽地区白血病患者与HLA-A、B、DRB1基因关联性研究
3
作者
廖艳秋
朱梅红
王敏
蒋光明
王保龙
机构
安徽医科大学附属省立医院输血科
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
2010年第4期1055-1058,共4页
文摘
本研究旨在探讨中国安徽地区人群中白血病的易感性与HLA-A、B、DRB1基因多态性之间的关联。采用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR-SSP)方法对安徽地区140例慢性髓系白血病(CML)、84例急性淋巴细胞性白血病(ALL)、90例急性非淋巴细胞性白血病(ANLL)患者以及916名健康的非血缘造血干细胞捐献者作为正常对照组进行了HLA基因分型,分别比较了病人组及正常对照组的HLA-A、B、DRB1位点的基因频率,通过χ2检验进行统计学分析。结果表明,CML患者A2、A11、B58、DR9基因频率较对照组明显升高,DR7基因频率较对照组明显降低;ALL患者A11、B13基因频率明显高于对照组;ANLL患者A24、B58、DR9基因频率较对照组明显升高。结论:HLA-A2、A11、B58、DR9是CML的易感基因,DR7是其拮抗基因;HLA-A11、B13是ALL的易感基因;HLA-A24、B58、DR9是ANLL的易感基因。
关键词
白血病
HIA
基因
基因
频率
易感
基因
拮抗基因
Keywords
leukemia
HLA gene
gene frequency
predisposing gene
antagonistic gene
分类号
R733.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一个拮抗灰葡萄孢菌的AMP核苷酶基因的生物信息学分析
贾立君
李凤霞
马汇泉
《黑龙江八一农垦大学学报》
2013
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
转座子标签法对阴沟肠杆菌B8拮抗水稻白叶枯病菌相关基因片段的克隆与检测
黄海宁
余旭平
陈卫良
龚鸿飞
李德葆
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2006
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
中国安徽地区白血病患者与HLA-A、B、DRB1基因关联性研究
廖艳秋
朱梅红
王敏
蒋光明
王保龙
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
2010
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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