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一种用于基因调控网络建模的CGP-WPSO混合算法
被引量：
8
1
作者
蔡昕烨
牛耘
+1 位作者
黄志球
范大娟
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2012年第9期180-182,197,共4页
依靠基因调控网络来预测农作物的表现型,对于保障全球的粮食安全有着极其重要的意义。提出了一种基于笛卡尔遗传规划(Cartesian genetic programming)和线性递减惯性权重粒子群优化(linear decreasing inertia weightparticle swarm opt...
依靠基因调控网络来预测农作物的表现型,对于保障全球的粮食安全有着极其重要的意义。提出了一种基于笛卡尔遗传规划(Cartesian genetic programming)和线性递减惯性权重粒子群优化(linear decreasing inertia weightparticle swarm optimization)的混合算法,用于基因调控网络的建模。进一步,为了验证算法的有效性,将算法应用于拟南芥开花调控系统的模型重建问题。最后通过计算机仿真实验表明,该算法能够根据农作物的基因型和环境情况,重建出能够较精确地预测农作物表现型的基因调控网络模型。
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关键词
拟南芥开花调控系统
基因
调控
网络
基因编程
粒子群算法
CGP-WPSO混合算法
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职称材料
题名
一种用于基因调控网络建模的CGP-WPSO混合算法
被引量：
8
1
作者
蔡昕烨
牛耘
黄志球
范大娟
机构
南京航空航天大学计算机科学与技术学院
出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2012年第9期180-182,197,共4页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)(2009AA010307)资助
文摘
依靠基因调控网络来预测农作物的表现型,对于保障全球的粮食安全有着极其重要的意义。提出了一种基于笛卡尔遗传规划(Cartesian genetic programming)和线性递减惯性权重粒子群优化(linear decreasing inertia weightparticle swarm optimization)的混合算法,用于基因调控网络的建模。进一步,为了验证算法的有效性,将算法应用于拟南芥开花调控系统的模型重建问题。最后通过计算机仿真实验表明,该算法能够根据农作物的基因型和环境情况,重建出能够较精确地预测农作物表现型的基因调控网络模型。
关键词
拟南芥开花调控系统
基因
调控
网络
基因编程
粒子群算法
CGP-WPSO混合算法
Keywords
Flowering time control in arabidopsis
Gene regulatory network
Genetic programming
Particle swarm optimization
CGP-WPSO hybrid algorithm
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种用于基因调控网络建模的CGP-WPSO混合算法
蔡昕烨
牛耘
黄志球
范大娟
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2012
8
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