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功能拓扑的理性设计及其在合成生物学中的应用被引量：1: 1; 作者孙智杨宁 +2 位作者娄春波汤超杨晓静《合成生物学》 CSCD 2023年第3期444-463,共20页; 生物网络以超乎寻常的精度、可靠性和鲁棒性执行着各种各样复杂的功能。网络的拓扑结构、动力学性质与功能之间密切相关。如何定量刻画这种关系,找到复杂多样的生物网络的底层设计规律是系统生物学和合成生物学的巨大挑战。本文对功能... 展开更多; 关键词合成生物学系统生物学功能拓扑基因回路; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于功能微拓扑结构的细胞定位培养芯片: 2; 作者撒成花薛艳 +3 位作者魏晨梁浩彬谢丽叶芳《西北工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期139-146,共8页; 提出了一种功能微拓扑结构细胞培养芯片,芯片结构由具有细胞粘附特异性的微平台和微柱阵列交替排布而成,并采用具有良好生物相容性和化学稳定性的聚合物制备,因此该芯片具有对细胞规约能力强和定位稳定性好的优点。芯片性能验证结果表明... 展开更多; 关键词细胞定位培养芯片功能微拓扑结构图形化; 在线阅读下载PDF 职称材料

一种拓扑与生物功能一致的多网络比对算法: 3; 作者夏金芳陈璟《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2020年第10期2146-2151,共6页; 生物网络比对是一种常用的研究生物分子间相互作用的方法,也是分析物种间功能差异的重要手段,有助于更好地理解生物进程及功能.本文提出的ConAlign是一种快速且有效的多对多的多网络全局比对算法.首先,利用网络节点间的拓扑相似性补充... 展开更多; 关键词复杂网络 PPI网络多网络比对拓扑与生物功能一致性图匹配; 在线阅读下载PDF 职称材料

知识化制造系统中知识网的结构研究被引量：5: 4; 作者杨人子严洪森《计算机集成制造系统》 EI CSCD 北大核心 2008年第3期595-601,共7页; 针对知识化制造系统自重构后的新知识网合理性问题,研究了知识网的内在结构机理。首先利用等价关系对知识点集进行分类,构造知识点集的功能拓扑空间;通过真集建立知识点集和功能拓扑空间之间的联系;给出关于功能拓扑空间的基的相关结论... 展开更多; 关键词知识网等价关系功能拓扑空间基基本知识点约简传递闭包; 在线阅读下载PDF 职称材料

利用ArcGIS对森林资源数据纠错被引量：1: 5; 作者刘姝颖《辽宁林业科技》 2016年第1期74-75,共2页; 该文论述了利用Arc GIS中的拓扑功能对森林资源二类调查的小班资源数据进行纠错的方法和步骤,包括创建拓扑、拓扑验证、拓扑修改。同时,对应用的Arc GIS功能进行系统介绍。; 关键词森林资源拓扑功能数据纠错; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名功能拓扑的理性设计及其在合成生物学中的应用被引量：1: 1; 作者孙智杨宁娄春波汤超杨晓静; 机构北京大学定量生物学中心中国科学院深圳先进技术研究院; 出处《合成生物学》 CSCD 2023年第3期444-463,共20页; 基金国家重点研发计划(2018YFA0900700,2021YFF1200501) 北京大学-清华大学生命科学联合中心博士后基金。; 文摘生物网络以超乎寻常的精度、可靠性和鲁棒性执行着各种各样复杂的功能。网络的拓扑结构、动力学性质与功能之间密切相关。如何定量刻画这种关系,找到复杂多样的生物网络的底层设计规律是系统生物学和合成生物学的巨大挑战。本文对功能拓扑的理性设计及其在合成生物学中的应用进行了综述。生物网络在统计性质上不同于随机网络,其结构呈现出模块化的趋势,本文首先总结了自然生物系统中出现的高频模块及其功能,回顾了最近系统生物学对于功能拓扑设计原理的探索,包括目前搜索功能拓扑的两种常用计算方法,同时对理论获得的典型功能拓扑进行了总结。继而总结了近年来实际合成生物学系统中功能拓扑的设计和构建,以基于转录调控的基因回路为主,按照其内部调控节点的数目,系统地介绍了不同拓扑结构被用来实现的具体功能及其典型实例。最后,介绍了近期自动化设计集成基因线路的发展、非转录多层次调控机制以及网络鲁棒性的设计原理,并简单探讨了对于复杂功能拓扑设计的机遇和挑战。; 关键词合成生物学系统生物学功能拓扑基因回路; Keywords synthetic biology systems biology functional topology genetic circuit; 分类号 Q81 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于功能微拓扑结构的细胞定位培养芯片: 2; 作者撒成花薛艳魏晨梁浩彬谢丽叶芳; 机构西北工业大学机电学院空天微纳系统教育部重点实验室中国航空航天四川燃气轮机研究院中航陕西航空电气有限公司深圳市迈瑞生物医疗电子有限公司西北工业大学生命学院空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室; 出处《西北工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第1期139-146,共8页; 基金陕西省自然科学基础研究计划(2018JM5146) 111引智项目(B13044) 陕西省科技统筹创新工程重点实验室项目资助; 文摘提出了一种功能微拓扑结构细胞培养芯片,芯片结构由具有细胞粘附特异性的微平台和微柱阵列交替排布而成,并采用具有良好生物相容性和化学稳定性的聚合物制备,因此该芯片具有对细胞规约能力强和定位稳定性好的优点。芯片性能验证结果表明,所设计的功能微拓扑结构芯片细胞定位率达到90%,芯片结构及尺寸稳定性好,为需要长期细胞培养的干细胞研究提供了重要的支撑工具。; 关键词细胞定位培养芯片功能微拓扑结构图形化; Keywords cell positioning culture chip functional micro topology micro pattern; 分类号 Q658 [生物学—生物物理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一种拓扑与生物功能一致的多网络比对算法: 3; 作者夏金芳陈璟; 机构江南大学人工智能与计算机学院江南大学物联网技术应用教育部工程研究中心; 出处《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2020年第10期2146-2151,共6页; 基金江苏省青年科学基金项目(BK20150159)资助。; 文摘生物网络比对是一种常用的研究生物分子间相互作用的方法,也是分析物种间功能差异的重要手段,有助于更好地理解生物进程及功能.本文提出的ConAlign是一种快速且有效的多对多的多网络全局比对算法.首先,利用网络节点间的拓扑相似性补充序列相似性.然后,结合网络整体的拓扑相似性和指定约束条件将蛋白质相互作用网络进行比对.本算法分别在合成网络和真实网络上进行了实验,并与IsoRankN、BEAMS、SMETANA算法对比.实验结果表明,ConAlign算法识别出了更多的直系同源物,在生物和拓扑方面也表现优异,此外,在保证簇的拓扑与生物功能一致性的前提下,比对的效率也得到了提升.; 关键词复杂网络 PPI网络多网络比对拓扑与生物功能一致性图匹配; Keywords complex netw ork PPI netw ork multiple netw ork alignment topology and biological function consistency graph matching; 分类号 TP393 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名知识化制造系统中知识网的结构研究被引量：5: 4; 作者杨人子严洪森; 机构东南大学自动化研究所; 出处《计算机集成制造系统》 EI CSCD 北大核心 2008年第3期595-601,共7页; 基金国家自然科学基金资助项目(60574062) 江苏省高校"青蓝工程"第二期省级中青年学术带头人培养计划资助项目~~; 文摘针对知识化制造系统自重构后的新知识网合理性问题,研究了知识网的内在结构机理。首先利用等价关系对知识点集进行分类,构造知识点集的功能拓扑空间;通过真集建立知识点集和功能拓扑空间之间的联系;给出关于功能拓扑空间的基的相关结论,阐述了知识网、拓扑空间和基在本质上的对应关系。在明确这种结构原理的基础上,提出利用等价关系、基和基本知识点对知识网进行约简,利用传递闭包研究知识网复合联系的完备性,从而简化知识网的结构并增强知识网的合理性。最后,通过实例说明了该理论的有效性。; 关键词知识网等价关系功能拓扑空间基基本知识点约简传递闭包; Keywords knowledge mesh equivalent relation function topological space base basic knowledge point reduction transitive closure; 分类号 TP11 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程] TH165 [机械工程—机械制造及自动化]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名利用ArcGIS对森林资源数据纠错被引量：1: 5; 作者刘姝颖; 机构辽宁省林业调查规划院; 出处《辽宁林业科技》 2016年第1期74-75,共2页; 文摘该文论述了利用Arc GIS中的拓扑功能对森林资源二类调查的小班资源数据进行纠错的方法和步骤,包括创建拓扑、拓扑验证、拓扑修改。同时,对应用的Arc GIS功能进行系统介绍。; 关键词森林资源拓扑功能数据纠错; 分类号 S757.27 [农业科学—森林经理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	功能拓扑的理性设计及其在合成生物学中的应用	孙智杨宁娄春波汤超杨晓静	《合成生物学》 CSCD	2023	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于功能微拓扑结构的细胞定位培养芯片	撒成花薛艳魏晨梁浩彬谢丽叶芳	《西北工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心	2020	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	一种拓扑与生物功能一致的多网络比对算法	夏金芳陈璟	《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心	2020	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	知识化制造系统中知识网的结构研究	杨人子严洪森	《计算机集成制造系统》 EI CSCD 北大核心	2008	5	在线阅读下载PDF 职称材料
5	利用ArcGIS对森林资源数据纠错	刘姝颖	《辽宁林业科技》	2016	1	在线阅读下载PDF 职称材料