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Bromodomain-like折叠类型模板的设计
被引量：
1
1
作者
李晓琴
张春城
《北京工业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期1572-1580,共9页
针对折叠类型分类中所选天然模板普适性不足的问题,提出了Bromodomain-like折叠类型模板的设计方法.选SCOPe Astral 2.03序列相似度小于40%并且分辨率高于0.25 nm的52个可用Bromodomain-like折叠样本,基于多结构比对结果及数据分析,建...
针对折叠类型分类中所选天然模板普适性不足的问题,提出了Bromodomain-like折叠类型模板的设计方法.选SCOPe Astral 2.03序列相似度小于40%并且分辨率高于0.25 nm的52个可用Bromodomain-like折叠样本,基于多结构比对结果及数据分析,建立了折叠类型家族模板的设计方法.利用系统聚类方法构建了家族模板的系统聚类图,提出了蛋白质折叠类型模板的设计方法,并用于该折叠类型的模板设计.结果表明:设计模板具有普适性,可用于蛋白质折叠类型分类.
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关键词
折叠类型分类
模板设计
结构比对
系统聚类
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职称材料
题名
Bromodomain-like折叠类型模板的设计
被引量：
1
1
作者
李晓琴
张春城
机构
北京工业大学生命科学与生物工程学院
出处
《北京工业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期1572-1580,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(21173014)
北京市自然科学基金资助项目(4112010)
文摘
针对折叠类型分类中所选天然模板普适性不足的问题,提出了Bromodomain-like折叠类型模板的设计方法.选SCOPe Astral 2.03序列相似度小于40%并且分辨率高于0.25 nm的52个可用Bromodomain-like折叠样本,基于多结构比对结果及数据分析,建立了折叠类型家族模板的设计方法.利用系统聚类方法构建了家族模板的系统聚类图,提出了蛋白质折叠类型模板的设计方法,并用于该折叠类型的模板设计.结果表明:设计模板具有普适性,可用于蛋白质折叠类型分类.
关键词
折叠类型分类
模板设计
结构比对
系统聚类
Keywords
folding type classification
template design
structure comparison
system clustering
分类号
O641 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Bromodomain-like折叠类型模板的设计
李晓琴
张春城
《北京工业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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