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分子伴侣、蛋白质聚集和大分子拥挤环境对蛋白质折叠的影响(英)
1
作者
李剑
王志珍
《中国科学院研究生院学报》
CAS
CSCD
2002年第2期215-218,共4页
研究了细胞内存在的分子伴侣、蛋白质聚集和大分子拥挤环境对蛋白质折叠的影响.首先,发现分子伴侣GroEL与底物蛋白的结合有 半位 "和 全位"两种模式,它是由底物蛋白的分子形状、分子大小以及与GroEL的相互作用性质决定的.接着...
研究了细胞内存在的分子伴侣、蛋白质聚集和大分子拥挤环境对蛋白质折叠的影响.首先,发现分子伴侣GroEL与底物蛋白的结合有 半位 "和 全位"两种模式,它是由底物蛋白的分子形状、分子大小以及与GroEL的相互作用性质决定的.接着,发现两种不同的蛋白质一起复性时相互不干扰,提示细胞内蛋白质折叠可能不受其他蛋白聚集的影响;后又发现α 乳清蛋白的前熔球态不仅是分子伴侣也是蛋白质聚集体的作用对象.最后,研究大分子拥挤环境对蛋白质折叠热力学和动力学的影响,揭示了这种影响的复杂性和多样性.
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关键词
蛋白质
折叠
分子伴侣
蛋白质聚集
大分子拥挤
折叠热力学
折叠
动
力学
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职称材料
极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的高温分子动力学模拟研究
2
作者
李毅
李爽
+3 位作者
张晓玲
曾新
桑鹏
杨力权
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2022年第1期95-102,共8页
作为HIV侵染细胞的蛋白质机器,包膜蛋白gp120利用序列变异和结构柔性等策略逃避宿主免疫识别,是病毒呈现出不同中和表型的主要原因.尽管HIV中和表型的分子机制已被初步探索,但其热力学相关的分子基础仍待进一步阐明.本研究利用同源模建...
作为HIV侵染细胞的蛋白质机器,包膜蛋白gp120利用序列变异和结构柔性等策略逃避宿主免疫识别,是病毒呈现出不同中和表型的主要原因.尽管HIV中和表型的分子机制已被初步探索,但其热力学相关的分子基础仍待进一步阐明.本研究利用同源模建的方法构建了极端中和表型HIV毒株(中和抵抗毒株H061.14与中和敏感毒株R2)的gp120结构模型,在逐渐升高的温度梯度下进行了高温分子动力学模拟,以研究二者在结构稳定性、解折叠和构象柔性上的差异.结果表明,HIV中和表型与gp120的热力学性质呈正相关,与解折叠程度无必然关联.各温度下gp120的结构偏差、天然接触含量、构象群体分布,以及单残基柔性的比较清楚地说明,中和敏感比中和抵抗gp120表现出更大的结构偏差、更多的构象状态和更高的构象柔性,但两者具有相似的解折叠程度.由极端中和表型HIV包膜蛋白gp120显著不同的热力学性质可以推断,HIV很可能利用gp120的热力学性质来调节其构象,进而平衡病毒侵染和免疫逃避之间的矛盾.我们的研究不仅揭示了极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的在构象柔性和结构稳定性上的差异,同时还从高温解折叠热力学的角度明确了极端中和表型HIV背后的分子基础.
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关键词
HIV中和表型
HIV包膜蛋白
解
折叠热力学
动态性
高温分子动
力学
模拟
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职称材料
题名
分子伴侣、蛋白质聚集和大分子拥挤环境对蛋白质折叠的影响(英)
1
作者
李剑
王志珍
机构
中国科学院生物物理研究所
出处
《中国科学院研究生院学报》
CAS
CSCD
2002年第2期215-218,共4页
基金
supportedbyPandengProjectoftheChineseMinistryofScienecandTechnology
973 project(G19990 75 60 8)
文摘
研究了细胞内存在的分子伴侣、蛋白质聚集和大分子拥挤环境对蛋白质折叠的影响.首先,发现分子伴侣GroEL与底物蛋白的结合有 半位 "和 全位"两种模式,它是由底物蛋白的分子形状、分子大小以及与GroEL的相互作用性质决定的.接着,发现两种不同的蛋白质一起复性时相互不干扰,提示细胞内蛋白质折叠可能不受其他蛋白聚集的影响;后又发现α 乳清蛋白的前熔球态不仅是分子伴侣也是蛋白质聚集体的作用对象.最后,研究大分子拥挤环境对蛋白质折叠热力学和动力学的影响,揭示了这种影响的复杂性和多样性.
关键词
蛋白质
折叠
分子伴侣
蛋白质聚集
大分子拥挤
折叠热力学
折叠
动
力学
Keywords
protein folding, molecular chaperone, protein aggregation, macromolecular crowding
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的高温分子动力学模拟研究
2
作者
李毅
李爽
张晓玲
曾新
桑鹏
杨力权
机构
大理大学数学与计算机学院
大理大学农学与生物科学学院
出处
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2022年第1期95-102,共8页
基金
国家自然科学基金(62003068,31960198)
云南省基础研究计划(2019FB021,2019FD014,2019FH001-103,2018FH001-062)。
文摘
作为HIV侵染细胞的蛋白质机器,包膜蛋白gp120利用序列变异和结构柔性等策略逃避宿主免疫识别,是病毒呈现出不同中和表型的主要原因.尽管HIV中和表型的分子机制已被初步探索,但其热力学相关的分子基础仍待进一步阐明.本研究利用同源模建的方法构建了极端中和表型HIV毒株(中和抵抗毒株H061.14与中和敏感毒株R2)的gp120结构模型,在逐渐升高的温度梯度下进行了高温分子动力学模拟,以研究二者在结构稳定性、解折叠和构象柔性上的差异.结果表明,HIV中和表型与gp120的热力学性质呈正相关,与解折叠程度无必然关联.各温度下gp120的结构偏差、天然接触含量、构象群体分布,以及单残基柔性的比较清楚地说明,中和敏感比中和抵抗gp120表现出更大的结构偏差、更多的构象状态和更高的构象柔性,但两者具有相似的解折叠程度.由极端中和表型HIV包膜蛋白gp120显著不同的热力学性质可以推断,HIV很可能利用gp120的热力学性质来调节其构象,进而平衡病毒侵染和免疫逃避之间的矛盾.我们的研究不仅揭示了极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的在构象柔性和结构稳定性上的差异,同时还从高温解折叠热力学的角度明确了极端中和表型HIV背后的分子基础.
关键词
HIV中和表型
HIV包膜蛋白
解
折叠热力学
动态性
高温分子动
力学
模拟
Keywords
HIV neutralization phenotype
HIV envelope glycoprotein
Unfolding thermodynamics
Flexibility
High temperature molecular dynamics simulation
分类号
O64 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
分子伴侣、蛋白质聚集和大分子拥挤环境对蛋白质折叠的影响(英)
李剑
王志珍
《中国科学院研究生院学报》
CAS
CSCD
2002
0
在线阅读
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职称材料
2
极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的高温分子动力学模拟研究
李毅
李爽
张晓玲
曾新
桑鹏
杨力权
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2022
0
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职称材料
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