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节瓜抗镰刀菌酸突变体内切几丁质酶基因的克隆与植物表达载体构建
被引量：
3
1
作者
赵芹
谢大森
+3 位作者
何晓明
彭庆务
罗少波
陈俊秋
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2016年第3期539-547,共9页
根据节瓜与枯萎病菌互作构建抑制消减文库获得的内切几丁质酶基因EST序列,以节瓜抗镰刀菌酸突变体＂LT3＂为试材,通过RT-PCR与RACE相结合的方法,获得了该基因全长c DNA序列,命名为Cq Chi I。序列测定和生物信息学分析结果表明,该基因c ...
根据节瓜与枯萎病菌互作构建抑制消减文库获得的内切几丁质酶基因EST序列,以节瓜抗镰刀菌酸突变体＂LT3＂为试材,通过RT-PCR与RACE相结合的方法,获得了该基因全长c DNA序列,命名为Cq Chi I。序列测定和生物信息学分析结果表明,该基因c DNA序列全长1 139 bp,编码区在38~982 bp之间,编码314个氨基酸,蛋白质分子量为33.94 ku,等电点为8.43,具有chitinase_gluco_hydro_19及lysozome_like superfamily功能域,推测该蛋白可能兼具几丁质酶与溶菌酶活性。结构分析表明,该蛋白二级结构中α螺旋、延伸链、β转角与无规则卷曲分别占24.20%、18.15%、7.96%和49.68%,该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,1~23氨基酸预测为信号肽。其三级结构高度保守,为class I碱性几丁质酶,属于几丁质酶第19家族,为分泌细胞外蛋白。序列比对与系统进化分析结果显示,Cq Chi I与黄瓜、甜瓜、葫芦、苦瓜等植物几丁质酶基因亲缘关系紧密,与黄瓜碱性内切几丁质酶（XP004134833）相似性最高为85%。进一步构建了植物表达载体p Cambia1300并转化农杆菌EHA105,通过蘸花法转化拟南芥,为后续开展基因功能研究奠定基础。
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关键词
节瓜
抗镰刀菌酸突变体
内切几丁质酶基因
c
DNA克隆
植物表达载体
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题名
节瓜抗镰刀菌酸突变体内切几丁质酶基因的克隆与植物表达载体构建
被引量：
3
1
作者
赵芹
谢大森
何晓明
彭庆务
罗少波
陈俊秋
机构
广东省农业科学院蔬菜研究所
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2016年第3期539-547,共9页
基金
国家自然科学青年基金(No.31311643)
广东省自然科学基金(No.10451064001006063)
广州市珠江科技新星项目(No.2013086)
文摘
根据节瓜与枯萎病菌互作构建抑制消减文库获得的内切几丁质酶基因EST序列,以节瓜抗镰刀菌酸突变体＂LT3＂为试材,通过RT-PCR与RACE相结合的方法,获得了该基因全长c DNA序列,命名为Cq Chi I。序列测定和生物信息学分析结果表明,该基因c DNA序列全长1 139 bp,编码区在38~982 bp之间,编码314个氨基酸,蛋白质分子量为33.94 ku,等电点为8.43,具有chitinase_gluco_hydro_19及lysozome_like superfamily功能域,推测该蛋白可能兼具几丁质酶与溶菌酶活性。结构分析表明,该蛋白二级结构中α螺旋、延伸链、β转角与无规则卷曲分别占24.20%、18.15%、7.96%和49.68%,该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,1~23氨基酸预测为信号肽。其三级结构高度保守,为class I碱性几丁质酶,属于几丁质酶第19家族,为分泌细胞外蛋白。序列比对与系统进化分析结果显示,Cq Chi I与黄瓜、甜瓜、葫芦、苦瓜等植物几丁质酶基因亲缘关系紧密,与黄瓜碱性内切几丁质酶（XP004134833）相似性最高为85%。进一步构建了植物表达载体p Cambia1300并转化农杆菌EHA105,通过蘸花法转化拟南芥,为后续开展基因功能研究奠定基础。
关键词
节瓜
抗镰刀菌酸突变体
内切几丁质酶基因
c
DNA克隆
植物表达载体
Keywords
Chieh-qua
Mutant against fusaric acid
Endochinitase
cDNA cloning
Plant expression vector
分类号
S642 [农业科学—蔬菜学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
节瓜抗镰刀菌酸突变体内切几丁质酶基因的克隆与植物表达载体构建
赵芹
谢大森
何晓明
彭庆务
罗少波
陈俊秋
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2016
3
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参考文献
引证文献
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