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嗜水气单胞菌拮抗芽孢杆菌抗菌素相关基因分析
被引量：
2
1
作者
曹海鹏
何珊
+1 位作者
王会聪
吕利群
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期171-174,共4页
分别对抗鲟源嗜水气单胞菌的解淀粉芽孢杆菌G1的抗菌素相关基因进行PCR扩增与测序,并对其编码产物的氨基酸序列、跨膜螺旋信号、结构域与二级结构等进行预测与分析。结果表明:菌株G1仅含有伊枯草菌素合成必需基因,该基因与GenBank基因...
分别对抗鲟源嗜水气单胞菌的解淀粉芽孢杆菌G1的抗菌素相关基因进行PCR扩增与测序,并对其编码产物的氨基酸序列、跨膜螺旋信号、结构域与二级结构等进行预测与分析。结果表明:菌株G1仅含有伊枯草菌素合成必需基因,该基因与GenBank基因库中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素A、杆菌抗霉素D、抗霉枯草菌素等伊枯草菌素家族基因自然聚类,与枯草芽孢杆菌MH25株和RB14株的伊枯草菌素A基因16S rRNA序列有98%的高度同源性,而且其编码产物的氨基酸序列与GenBank中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素、伊枯草菌素A、脂肽类化合物Bacillorin、芽孢菌素D等抗菌物质的氨基酸序列有高度同源性,与枯草芽孢杆菌MH25的伊枯草菌素A合成酶B(GenBank登录号:ABY89499)的亲缘关系最近。此外,菌株G1伊枯草菌素合成必需基因的编码产物不具有明显的跨膜结构,但其结构域中存在AMP结合位点和PP结合位点,二级结构中存在α螺旋、伸展链、β转角和无规则卷曲。
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关键词
解淀粉芽孢杆菌
抗菌素相关基因
伊枯草
菌素
合成必需
基因
系统发育分析
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题名
嗜水气单胞菌拮抗芽孢杆菌抗菌素相关基因分析
被引量：
2
1
作者
曹海鹏
何珊
王会聪
吕利群
机构
上海海洋大学国家水生动物病原库
江苏农林职业技术学院畜牧兽医系
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期171-174,共4页
基金
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-46-12)
国家"863"计划项目(2011AA10A216)
文摘
分别对抗鲟源嗜水气单胞菌的解淀粉芽孢杆菌G1的抗菌素相关基因进行PCR扩增与测序,并对其编码产物的氨基酸序列、跨膜螺旋信号、结构域与二级结构等进行预测与分析。结果表明:菌株G1仅含有伊枯草菌素合成必需基因,该基因与GenBank基因库中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素A、杆菌抗霉素D、抗霉枯草菌素等伊枯草菌素家族基因自然聚类,与枯草芽孢杆菌MH25株和RB14株的伊枯草菌素A基因16S rRNA序列有98%的高度同源性,而且其编码产物的氨基酸序列与GenBank中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素、伊枯草菌素A、脂肽类化合物Bacillorin、芽孢菌素D等抗菌物质的氨基酸序列有高度同源性,与枯草芽孢杆菌MH25的伊枯草菌素A合成酶B(GenBank登录号:ABY89499)的亲缘关系最近。此外,菌株G1伊枯草菌素合成必需基因的编码产物不具有明显的跨膜结构,但其结构域中存在AMP结合位点和PP结合位点,二级结构中存在α螺旋、伸展链、β转角和无规则卷曲。
关键词
解淀粉芽孢杆菌
抗菌素相关基因
伊枯草
菌素
合成必需
基因
系统发育分析
Keywords
Bacillus amyloliquefaciens
antibiotics related gene
iturin synthetase essential gene
phylogenetic analysis
分类号
Q939.97 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
嗜水气单胞菌拮抗芽孢杆菌抗菌素相关基因分析
曹海鹏
何珊
王会聪
吕利群
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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