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解淀粉芽胞杆菌BJ-6基因组测序与抗菌代谢产物合成基因分析 被引量:4
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作者 贾慧慧 王超男 +3 位作者 魏艳敏 赵晓燕 高坦坦 任争光 《北京农学院学报》 2020年第3期64-68,共5页
【目的】解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)是目前植物病害生物防治研究的热点之一。为了探索解淀粉芽胞杆菌BJ-6的生防机制,对该菌株的全基因组进行测序分析。【方法】利用二代测序技术对解淀粉芽胞杆菌BJ-6进行全基因组测序... 【目的】解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)是目前植物病害生物防治研究的热点之一。为了探索解淀粉芽胞杆菌BJ-6的生防机制,对该菌株的全基因组进行测序分析。【方法】利用二代测序技术对解淀粉芽胞杆菌BJ-6进行全基因组测序,使用Prodigal等软件进行基因预测与功能注释,并搜寻主要的抗菌次级代谢产物合成基因簇,转录分析这些抗菌代谢产物合成基因的表达。【结果】解淀粉芽胞杆菌BJ-6基因组大小为4175709 bp,有4261个基因,GC含量为46.12%,搜寻到7种抗菌次级代谢产物合成基因簇,其中表面活性素合成基因簇与模式菌株FZB42相比出现较大差异,这7种抗菌物质合成基因在12~60 h培养条件下均能正常表达。【结论】获得解淀粉芽胞杆菌BJ-6的全基因组序列信息,挖掘抗菌物质合成基因簇,为今后深入研究解淀粉芽胞杆菌BJ-6产生的抗菌物质及其抑菌机制提供保障。 展开更多
关键词 解淀粉芽胞杆 基因组测序 抗菌代谢产物 转录表达
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莫海威芽孢杆菌对革兰氏阳性菌的抑制活性及其抗菌次级代谢产物分析
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作者 李海利 张婉琪 +6 位作者 徐引弟 王治方 朱文豪 闫祥洲 冯丽丽 杨帆 马春江 《河南农业科学》 北大核心 2024年第12期149-158,共10页
为筛选对革兰氏阳性菌抗菌效果较好的药用植物内生菌,采用表面消毒法和平板对峙法分离筛选对丹毒杆菌、链球菌和葡萄球菌有拮抗作用的迷迭香内生菌,对其进行形态学和分子生物学鉴定,并通过全基因组学分析探究其抗菌活性物质。结果表明,... 为筛选对革兰氏阳性菌抗菌效果较好的药用植物内生菌,采用表面消毒法和平板对峙法分离筛选对丹毒杆菌、链球菌和葡萄球菌有拮抗作用的迷迭香内生菌,对其进行形态学和分子生物学鉴定,并通过全基因组学分析探究其抗菌活性物质。结果表明,从迷迭香根、茎、叶等不同组织中分离得到7株内生菌。采用平板对峙法抑菌试验,从7株内生菌中获得一株抗菌效果较好的革兰氏阳性内生菌HNYJJ2211C,经形态学鉴定和分子生物学鉴定为莫海威芽孢杆菌(Bacillus mojavensis,GCF000245335.1),该菌能有效抑制丹毒杆菌、链球菌和葡萄球菌。对HNYJJ2211C基因组进行测序分析,其基因组大小为4 147 805 bp,G+C含量为43.8%,预测编码基因4 075个。分别有3311、1453、2503、440、158个基因被COG、GO、KEGG、VFDB、CAZy数据库注释;通过antiSMASH软件预测到6个与次级代谢产物合成相关的基因簇;主要次级代谢产物有表面活性素(Surfactin)、杆菌烯(Bacillaene)、脂肽类丰霉素(Fengycin)、多肽类细菌素儿茶酚型杆菌巴汀/嗜铁素类(Bacillibactin)、细菌素(Subtilosin A)及抗真菌化合物的二肽化合物芽孢菌溶素(Bacilysin)等。在HNYJJ2211C基因组中发现含有TasA基因,位于2 480714—2 481499 bp,基因全长786 bp(gene2481),编码261个氨基酸。从其基因组中含有的抗菌活性物质相关的基因簇可以预测出,该菌株具有开发新药和作为可饲用微生物的潜力。 展开更多
关键词 莫海威芽孢杆 迷迭香 内生 效果 丹毒杆 链球 葡萄球 次级代谢产物
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一株硅酸盐细菌抗生代谢产物分离和特性 被引量:3
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作者 刘光烨 林洋 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2002年第3期21-23,共3页
对硅酸盐细菌CS2 9菌株的抗菌产物进行了分离、纯化 ,从其发酵液中得到的化合物FA对金黄色葡萄球菌等G+ 和G-菌具有显著抑制活性 ,对蜡样芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌的最低抑菌浓度 (MIC)达到 7μg/ml。经核磁共振波谱、红外光谱和质谱数据... 对硅酸盐细菌CS2 9菌株的抗菌产物进行了分离、纯化 ,从其发酵液中得到的化合物FA对金黄色葡萄球菌等G+ 和G-菌具有显著抑制活性 ,对蜡样芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌的最低抑菌浓度 (MIC)达到 7μg/ml。经核磁共振波谱、红外光谱和质谱数据分析 ,表明FA为多羟基黄酮类化合物 ,分子量30 2。 展开更多
关键词 硅酸盐细 抗菌代谢产物 特性
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杨怀文先生在中国昆虫病原线虫共生细菌早期研究中的贡献——追忆杨怀文先生
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作者 李广悦 杨秀芬 +2 位作者 曾洪梅 任杰 袁京京 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2022年第6期1374-1376,共3页
本文回顾了杨怀文先生在昆虫病原线虫共生细菌研究领域的主要工作,包括资源采集、保藏技术、资源评价以及挖掘利用等方面的研究,填补了我国昆虫病原线虫共生细菌研究领域的空白,为后续研究奠定了重要基础。本文还对昆虫病原线虫共生细... 本文回顾了杨怀文先生在昆虫病原线虫共生细菌研究领域的主要工作,包括资源采集、保藏技术、资源评价以及挖掘利用等方面的研究,填补了我国昆虫病原线虫共生细菌研究领域的空白,为后续研究奠定了重要基础。本文还对昆虫病原线虫共生细菌未来的研究重点和方向进行了展望。 展开更多
关键词 昆虫病原线虫共生细 杀虫蛋白 抗菌代谢产物
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