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饮用水环境中抗生素耐药基因消除方法的研究进展
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作者 杜萌 闫妍 +2 位作者 康欣 张雨晨 路旺达 《净水技术》 CAS 2024年第8期40-44,159,共6页
抗生素耐药基因(antibiotics resistance genes,ARGs)是一类存在于细菌或其他微生物基因组中的基因,它赋予微生物对特定抗生素的抵抗能力。ARGs作为一种新污染物,它目前已成为全球公共健康的巨大威胁。ARGs可通过多种途径进入饮用水环境... 抗生素耐药基因(antibiotics resistance genes,ARGs)是一类存在于细菌或其他微生物基因组中的基因,它赋予微生物对特定抗生素的抵抗能力。ARGs作为一种新污染物,它目前已成为全球公共健康的巨大威胁。ARGs可通过多种途径进入饮用水环境,包括污水处理不当、农业径流、医院及工业排放等。利用ARGs消除方法防控饮用水环境中的ARGs,对于饮用水安全具有非常重要的意义。饮用水环境中ARGs消除方法主要包括传统消除方法和新兴的消除方法。传统的消除方法主要是在饮用水处理工艺过程中,如絮凝、沉淀、消毒、过滤等,利用常规工艺对ARGs进行消除,从而达到防控ARGs的目的。新兴的消除方法尚未在饮用水处理过程中广泛应用,但具有积极的应用前景。紫外线/过氧乙酸消毒剂的应用,可以提高消毒过程中ARGs的消除效率,是一种很有前景的消除方法。高级氧化技术也是一种有效的ARGs消除方法,在高级氧化技术过程中,氧化剂从分子水平上与ARGs相互作用并发生表面氧化反应,从而实现对ARGs的消除。辅助消毒剂是ARGs消除方法研究的一个重要方向,主要利用天然来源的活性物质,提高饮用水消毒过程中的ARGs消除效率。此外,开发ARGs特异性吸附材料,是ARGs消除方法的发展趋势,尽管这种方法目前尚未在饮用水处理过程中使用,但其前景不容小觑。随着消除方法的不断发展,对ARGs的研究也提出了新的方向和内容,主要包括ARGs检测技术和方法的创新、ARGs分布和迁移的深入研究,从而推动ARGs消除方法的创新发展。鉴于此,文章总结了ARGs在饮用水环境的消除方法,对未来ARGs研究的焦点和趋势提出建议及展望,旨在为探索ARGs的有效防控策略提供科学依据和技术支持。 展开更多
关键词 抗生素耐药基因 饮用水环境 消除方法 水处理工艺 高级氧化技术
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大肠杆菌磺胺类抗生素耐药基因二重PCR技术的建立 被引量:4
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作者 曹冶 于吉峰 +10 位作者 谢晶 康润敏 叶勇刚 肖璐 李兴玉 魏勇 戴卓建 林毅 叶建强 潘梦 廖党金 《中国动物检疫》 CAS 2020年第1期91-93,99,共4页
为建立一种一次性检测多个磺胺类抗生素耐药基因的检测方法,用磺胺类抗生素耐药大肠杆菌作为受试生物,根据磺胺类抗生素耐药基因Sul1和dfrA1设计一对引物进行二重PCR检测。结果发现:本方法能有效检测出大肠杆菌Sul1和dfrA1两种磺胺类抗... 为建立一种一次性检测多个磺胺类抗生素耐药基因的检测方法,用磺胺类抗生素耐药大肠杆菌作为受试生物,根据磺胺类抗生素耐药基因Sul1和dfrA1设计一对引物进行二重PCR检测。结果发现:本方法能有效检测出大肠杆菌Sul1和dfrA1两种磺胺类抗生素耐药基因,检出限为4.5 cfu/μL,对于Sul1和dfrA1两种磺胺类抗生素耐药基因具有较强的检出特异性。此方法对检测大肠杆菌磺胺类抗生素耐药基因提供了有力的技术支撑。 展开更多
关键词 大肠杆菌 磺胺类抗生素耐药基因 二重PCR
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肉鸽肠道微生物菌群差异分析和抗生素耐药基因预测
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作者 陶洁 李本强 +3 位作者 程靖华 石迎 刘佩红 刘惠莉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期5293-5300,共8页
本研究旨在利用宏基因组学深入分析上海某鸽场青年鸽(RP)和产鸽(LP)粪便样品的微生物菌群差异。结果显示,肉鸽肠道菌群的优势菌门为厚壁菌(Firmicutes)、变形菌(Proteobacteria)和放线菌(Actinobacteria)。RP组中双歧杆菌(Bifidobacteri... 本研究旨在利用宏基因组学深入分析上海某鸽场青年鸽(RP)和产鸽(LP)粪便样品的微生物菌群差异。结果显示,肉鸽肠道菌群的优势菌门为厚壁菌(Firmicutes)、变形菌(Proteobacteria)和放线菌(Actinobacteria)。RP组中双歧杆菌(Bifidobacterium)、棒状杆菌(Corynebacteriun)、嗜冷杆菌(Psychrobacter)、链球菌属(Streptococcus)含量显著高于LP组,而LP组金黄色葡萄球菌属(Staphyloccus)、短状杆菌属(Brachybacterium)、库特氏菌属(Kurthia)和埃希氏菌属(Escherichia)含量显著高于RP组。LEfSe分析显示,LP和RP组的差异表达基因主要富集于5个KEGG通路。抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)鉴定显示,肉鸽体内存在198种ARGs,其中多重耐药类ARGs流行率40%以上,说明该场肉鸽抗生素耐药情况较严重。本研究为后续深入研究肠道菌群与健康养殖、抗生素耐药机制等提供了科学数据。 展开更多
关键词 肉鸽 基因组学 肠道菌群 抗生素耐药基因
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鸡粪-堆肥中重金属残留、抗生素耐药基因及细菌群落变化研究 被引量:15
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作者 邓雯文 陈姝娟 +5 位作者 何雪萍 晋蕾 杨盛智 余秀梅 刘书亮 邹立扣 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期439-450,共12页
研究鸡粪及其堆肥过程中养分变化、重金属残留、抗生素耐药基因消减情况以及细菌群落演替规律,探讨细菌菌群与养分、重金属、抗生素耐药基因之间的相关性。采集鸡粪及其堆肥过程样品,测定样品中养分、重金属含量,检测抗生素耐药基因相... 研究鸡粪及其堆肥过程中养分变化、重金属残留、抗生素耐药基因消减情况以及细菌群落演替规律,探讨细菌菌群与养分、重金属、抗生素耐药基因之间的相关性。采集鸡粪及其堆肥过程样品,测定样品中养分、重金属含量,检测抗生素耐药基因相对丰度,采用16S rRNA高通量测序技术研究鸡粪堆肥过程细菌群落变化。从鲜鸡粪(组FM)到二次发酵(组SC),样品中有机质含量下降,全氮和全磷含量有不同程度增加,全钾及pH值显著升高(P<0.05)。重金属在不同组中的浓度呈波动变化,与组FM相比,在组SC中砷(As)、镉(Cd)浓度升高,铜(Cu)、锰(Mn)、铅(Pb)浓度下降,其中锌(Zn)下降显著(P<0.05)。堆肥后,抗生素耐药基因aac(6′)-Ib-cr、tet M(P<0.05)、erm B(P<0.05)和bla CTX-M(P<0.05)的相对丰度呈现不同程度的下降,而基因sul1相对丰度增加。高通量测序结果表明,在门水平,各组均以Firmicutes、Proteobacteria和Bacteroidetes 3个菌门为主。在属水平,各组具有不同的优势物种,同时潜在病原菌属的相对丰度均随堆肥过程降低。通过相关性分析发现,大部分优势菌属与全磷、pH值、重金属Cr及耐药基因sul1、tet M、erm B和bla CTX-M有显著相关性(P<0.05)。鸡粪经堆肥后可降低病原菌及抗生素耐药基因相对丰度,但仍存在一定风险,该研究可为实际生产中鸡粪的高效、安全堆肥处理提供参考。 展开更多
关键词 鸡粪 堆肥 细菌群落 重金属 抗生素耐药基因
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发酵用鲜辣椒中乳酸菌抗生素耐药性与耐药基因 被引量:7
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作者 蔡婷 徐顾榕 +6 位作者 林凯 宋菲菲 张其圣 陈功 蔡义民 张庆 向文良 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期941-949,共9页
以四川泡菜发酵用的新鲜二荆条辣椒表面上附着的乳酸菌为研究对象,分析其对四环素(TET)、链霉素(STR)和红霉素(ERY)的耐药性与耐药基因。研究表明:用于发酵的鲜辣椒中,乳酸菌的含量约为2.18×104CFU/g,属于Weissella cibaria(61.93%... 以四川泡菜发酵用的新鲜二荆条辣椒表面上附着的乳酸菌为研究对象,分析其对四环素(TET)、链霉素(STR)和红霉素(ERY)的耐药性与耐药基因。研究表明:用于发酵的鲜辣椒中,乳酸菌的含量约为2.18×104CFU/g,属于Weissella cibaria(61.93%)、Lactococcus lactis(16.06%)、Enterococcus mundtii(5.50%)、Enterococcus faecalis(3.67%)、Enterococcus hirae(3.67%)、Leuconostoc mesenteroides(6.88%)和Leuconostoc holzapfelii(2.29%)。所有218株分离株均无ERY耐药,但其中30株(13.76%)表现出TET和STR耐药,包括10株W.cibaria(4.59%)、2株Lac.lactis(0.92%)、1株E.mundtii(0.46%)、2株Leu.mesenteroide(0.92%)和1株Leu.holzapfelii(0.46%)STR耐药菌株,9株W.cibaria(4.12%)、2株Lac.lactis(0.92%)、1株E.faecalis(0.46%)和2株E.hirae(0.92%)TET和STR二重耐药菌株;除TET和STR二重耐药菌株W.cibaria CT024中未检出任何TET被检基因外,其它耐药株都有相应1个或多个被检基因被检出。其中,在5种STR被检耐药基因中,str B的检出率最高,达60.00%;aad6的检出率最低,为16.67%。11种TET被检耐药基因中,tet B和tet C的检出率最高,达到85.71%;tet Z的检出率最低,为7.14%。同时,同种内的不同菌株对STR或TET的耐药性高低与耐药基因的种类和数量多少无相关性。 展开更多
关键词 鲜辣椒 乳酸菌 抗生素 抗生素耐药基因
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堆肥过程中抗生素和耐药基因消减研究进展 被引量:7
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作者 王晓醒 郭雪琦 +3 位作者 冯瑶 冀拯宇 刘聪 李兆君 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期2383-2394,共12页
堆肥是常用的有机固废处理技术,能够快速实现有机固废资源化利用,但传统工业化堆肥对于抗生素及其耐药基因(Antibioticresistancegenes,ARGs)消减重视不足。事实上,近年来畜禽粪污等堆肥原料中抗生素及ARGs残留问题日益凸显,抗生素及ARG... 堆肥是常用的有机固废处理技术,能够快速实现有机固废资源化利用,但传统工业化堆肥对于抗生素及其耐药基因(Antibioticresistancegenes,ARGs)消减重视不足。事实上,近年来畜禽粪污等堆肥原料中抗生素及ARGs残留问题日益凸显,抗生素及ARGs消减已经成为堆肥过程中不容忽视的部分和亟待解决的问题。本文综述了近年来抗生素及ARGs在堆肥过程中消减的研究现状和一般特点,以及影响消减效果的理化和生物学因素、相关优化技术措施的效果和瓶颈等,以期为最大限度降低ARGs传播风险提供参考。 展开更多
关键词 堆肥 抗生素耐药基因 消减
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生牛乳中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌全基因组序列分析
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作者 蔡丽娜 尚伟 +1 位作者 陆琼 李超敏 《食品安全质量检测学报》 CAS 2024年第20期103-110,共8页
目的了解生牛乳中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)的全基因组序列特征,分析其耐药基因和毒力基因的分子特征差异。方法采用全自动微生物鉴定药敏分析仪进行细菌鉴定;通过肉汤微量稀释法进... 目的了解生牛乳中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)的全基因组序列特征,分析其耐药基因和毒力基因的分子特征差异。方法采用全自动微生物鉴定药敏分析仪进行细菌鉴定;通过肉汤微量稀释法进行药物敏感性检测;利用生物信息学工具对全基因组测序结果进行分子特征分析。结果SJ23319菌株和SJ23506菌株经鉴定均为MRSA;SJ23319菌株耐药谱为OXA-PEN-FOX,SJ23506菌株耐药谱为OXA-PEN-FOX-CC,耐药基因分析结果显示两个菌株均携带耐药基因mecA和blaZ,这与耐药表型结果基本一致;2个菌株染色体基因组大小、结构和功能蛋白相似,SJ23319菌株为ST59-t437-SCCmecIVa型,SJ23506菌株为ST398-t034-SCCmecV(5C)型;2个菌株功能蛋白均分布于21个直系同源簇(cluster of orthologous group,COG)条目中,携带13种相同的耐药基因,SJ23319菌株还携带有四环素类耐药基因tet(K);2个菌株携带毒力基因多达67种,SJ23319菌株携带更多的细菌黏附相关基因(fnbA/B、sdrD/E)和外毒素基因(Seb、Selk、Selq、set16-26)。结论SJ23319(ST59)菌株比SJ23506(ST398)菌株携带更多的耐药基因和毒力基因,致病性更强,进一步证明在牲畜相关的MRSA(livestock-associated MRSA,LA-MRSA)菌株中,ST59型比ST398型更容易导致社区流行和感染,应当在MRSA流行监测中更加重视。 展开更多
关键词 甲氧西林金黄色葡萄球菌 基因组序列 抗生素耐药基因 毒力基因 生牛乳
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用于蔬菜残留耐药基因检测的DNA制备技术 被引量:2
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作者 李娟 陈倩 《食品安全质量检测学报》 CAS 2017年第8期3140-3145,共6页
目的建立用于蔬菜残留耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)检测的DNA制备技术。方法以樱桃萝卜、香菜为研究对象,对商业试剂盒Power Water?DNA Isolation kit和Power Plant?Pro DNA Isolation kit中的具体步骤进行改良,不经细... 目的建立用于蔬菜残留耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)检测的DNA制备技术。方法以樱桃萝卜、香菜为研究对象,对商业试剂盒Power Water?DNA Isolation kit和Power Plant?Pro DNA Isolation kit中的具体步骤进行改良,不经细菌分离培养等过程,提取其可食用部分残留微生物基因组DNA。利用Nano Drop?微量紫外-可见光分光光度计,检测DNA的纯度和产量,并以DNA为模板,对16S rRNA、ARGs(sulⅠ、tet M、mef)进行PCR扩增,以验证本研究建立的DNA制备方法对于后续ARGs检测抑制物的去除情况。结果本研究所制备的DNA(n=5),OD260/OD280值均在1.7~1.9之间,浓度均为10ng/μL以上。经电泳检测后,目的基因的PCR扩增条带清晰,且经过序列分析比对证实,目的基因与以往文献报道的同源性均达到97%以上。结论本研究建立的DNA制备方法,无需细菌分离培养,简单、省时,所获得的DNA纯净,为后续蔬菜残留ARGs检测等研究提供技术支持。 展开更多
关键词 蔬菜 DNA制备技术 抗生素耐药基因 微生物
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天津市家庭农场养殖粪污耐药基因赋存特征及风险评估 被引量:14
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作者 谷艳茹 韩秉君 +2 位作者 黄继元 杨凤霞 张克强 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期394-402,共9页
为了解家庭农场养殖粪污中抗生素耐药基因(ARGs)的赋存特征及潜在风险,本研究选取天津市蓟州区22家典型的家庭农场,采用实时荧光定量PCR方法,考察了不同种类畜禽粪污中ARGs的污染特征及其对周边农田土壤的影响。结果表明,磺胺类、四环... 为了解家庭农场养殖粪污中抗生素耐药基因(ARGs)的赋存特征及潜在风险,本研究选取天津市蓟州区22家典型的家庭农场,采用实时荧光定量PCR方法,考察了不同种类畜禽粪污中ARGs的污染特征及其对周边农田土壤的影响。结果表明,磺胺类、四环素类、喹诺酮类和大环内酯类耐药基因在家庭农场畜禽粪污中普遍存在,且四环素类耐药基因tetO、tetQ、tetW和大环内酯类耐药基因ermB含量最为丰富,同时检出了blaOXA-1、blaTEM-1和blaampC等与人类健康密切相关的β-内酰胺类抗生素耐药基因(bla基因)。此外,还发现如下规律:相比于猪场和牛场,鸡场粪污中的ARGs污染程度更为严重;在不同生育阶段的猪群中,母猪粪污中的多数耐药基因相对丰度要显著高于仔猪和育肥猪(P<0.05);畜禽粪肥施用可显著增加土壤环境中ARGs的丰度(约8~18倍)(P<0.05)。本研究表明,家庭农场畜禽养殖粪污中耐药基因污染严重且普遍,同时随着粪污还田进入土壤环境增大环境风险,最终可能会通过污染农作物危害人类健康,应引起高度重视。 展开更多
关键词 抗生素耐药基因 家庭农场 畜禽粪污 农田土壤
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不同施肥模式对洱海流域稻田土壤中耐药基因污染的影响 被引量:5
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作者 韩秉君 沈仕洲 +3 位作者 杨凤霞 高文萱 丁永祯 张克强 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期2503-2512,共10页
为探究不同施肥模式对洱海流域稻田土壤抗生素耐药基因(ARGs)和可移动遗传元件(MGEs)的影响,通过长期田间定位试验,采用高通量荧光定量PCR技术及实时荧光定量PCR技术相结合的方法,对不同施肥模式下稻田土壤中的144种ARGs和10种MGEs进行... 为探究不同施肥模式对洱海流域稻田土壤抗生素耐药基因(ARGs)和可移动遗传元件(MGEs)的影响,通过长期田间定位试验,采用高通量荧光定量PCR技术及实时荧光定量PCR技术相结合的方法,对不同施肥模式下稻田土壤中的144种ARGs和10种MGEs进行检测,全面解析了稻田ARGs的污染状况及空间分布规律。结果表明:不同施肥处理土壤中ARGs分布特征不同,其赋存绝对丰度水平整体呈现施用粪肥>施用缓控释肥>施用化肥>不施肥;施加粪肥土壤中的ARGs的赋存多样性和MGEs的种类显著高于其他处理土壤,不施肥模式则显著低于其他处理模式(P<0.05)。不同ARGs的相对丰度在稻田土壤柱中出现垂直迁移富集趋势,但其在不同土层中的富集程度存在差异。不同施肥模式稻田土壤各土层中的优势ARGs为多重耐药类(占比均值为60.3%)、氨基糖苷类(占比均值为10.5%)和四环素类(占比均值为7.5%),其水平多与MGEs丰度显著相关(P<0.05),表明MGEs促进了稻田土壤中ARGs的传播,加剧了土壤中ARGs的积累富集。研究表明,不同施肥模式对稻田土壤中ARGs和MGEs的分布规律有显著影响,不同深度土层中ARGs的富集程度各异。 展开更多
关键词 粪肥还田 施肥模式 抗生素耐药基因 污染谱图 分布模式
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凡纳滨对虾不同生长阶段肠道可培养细菌耐药性研究 被引量:3
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作者 杨泽禹 万夕和 +6 位作者 史文军 王李宝 黎慧 沈辉 乔毅 蒋葛 成婕 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2022年第2期175-184,共10页
在凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖过程中多使用微生态制剂来调节水质,为避免破坏池塘菌群结构,很少使用抗生素。为了解凡纳滨对虾肠道细菌耐药性与不同生长阶段的关系,本研究选取江苏地区4种主要养殖模式凡纳滨对虾成虾和虾苗作... 在凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖过程中多使用微生态制剂来调节水质,为避免破坏池塘菌群结构,很少使用抗生素。为了解凡纳滨对虾肠道细菌耐药性与不同生长阶段的关系,本研究选取江苏地区4种主要养殖模式凡纳滨对虾成虾和虾苗作为研究对象,利用K-B纸片法和qRT-PCR技术,研究对虾样本肠道可培养细菌对四环素等12种抗生素的耐药性和tetA等9种抗生素耐药基因(ARGs)的丰度。结果显示,不同养殖模式中的凡纳滨对虾肠道可培养细菌优势属为弧菌属(Vibrio);成虾肠道内可培养细菌种类和数量较虾苗显著上升(P<0.05),耐药菌(antibiotics resistant bacteria,ARB)占比降低,ARGs丰度显著下降(P<0.05);不同养殖模式之间规律不明显。研究表明,各模式下成虾肠道细菌耐药性和ARGs丰度均低于虾苗,提示,养殖过程中通过施用微生态制剂来减少抗生素使用量的方法能降低凡纳滨对虾肠道可培养细菌的耐药性。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 细菌 抗生素耐药基因(ARGs) QRT-PCR
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基于宏基因组分析鸡爪熟肉制品中微生物污染与基因信息
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作者 宋晟 郭焜鹏 +4 位作者 郝琴 王芳 严礼 李政 张继红 《肉类研究》 北大核心 2024年第11期1-11,共11页
采集10种鸡爪熟肉制品,用传统微生物培养法和宏基因组学方法分析鸡爪熟肉制品中微生物污染水平、群落组成及相关遗传信息。结果表明:7号样品菌落总数为1.3×10^(5) CFU/g,不符合GB 2726—2016《食品安全国家标准熟肉制品》限量要求... 采集10种鸡爪熟肉制品,用传统微生物培养法和宏基因组学方法分析鸡爪熟肉制品中微生物污染水平、群落组成及相关遗传信息。结果表明:7号样品菌落总数为1.3×10^(5) CFU/g,不符合GB 2726—2016《食品安全国家标准熟肉制品》限量要求,其他样品菌落总数结果均<10 CFU/g,微生物DNA浓度检测结果与菌落总数结果基本一致,可有效评估样品中微生物污染水平;1~6号和8~10号样品主要污染微生物为流产衣原体、大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌和鹦鹉衣原体,相对丰度分别为60.87%~75.49%、13.20%~18.41%、8.29%~16.41%和1.67%~3.67%,7号样品主要污染微生物为短乳杆菌、流产衣原体,相对丰度分别约为63%和8%,所有样品共检测到7种病毒,主要污染病毒为禽白血病病毒;共鉴定出12种抗生素耐药基因、10种BactMet基因,对四环素和吖啶橙等多种抗生素与化合物存在抗性;共鉴定出30种毒力因子基因,编码外膜受体、磷脂酶C等毒力因子;鲍氏不动杆菌携带7种抗生素耐药基因、5种BactMet基因及28种毒力因子基因,是超级耐药与致病菌。 展开更多
关键词 基因 鸡爪熟肉制品 毒力因子 抗生素耐药基因
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金属β-内酰胺酶GOB-54的发现与表征 被引量:1
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作者 章升霞 王绍琛 +1 位作者 吕云斌 冯治洋 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第24期44-50,共7页
该文旨在从土壤中挖掘新型β-内酰胺类抗生素耐药基因,分析耐药机制,做好临床预警,为开发新型β-内酰胺类药物提供信息。利用功能筛选策略,从土壤宏基因组文库中筛选获得阳性克隆,通过亚克隆构建和序列测定,得到耐药基因序列。利用序列... 该文旨在从土壤中挖掘新型β-内酰胺类抗生素耐药基因,分析耐药机制,做好临床预警,为开发新型β-内酰胺类药物提供信息。利用功能筛选策略,从土壤宏基因组文库中筛选获得阳性克隆,通过亚克隆构建和序列测定,得到耐药基因序列。利用序列比对、系统发育树分析、三维结构建模等生物信息学方法对耐药基因进行分析。使用微量肉汤稀释法评估β-内酰胺酶的耐药活性,利用生化实验分析酶水解抗生素的能力。鉴定出一个β-内酰胺抗生素耐药基因,与已知的β-内酰胺酶基因最高只有52.30%氨基酸序列一致性,命名为gob-54,编码β-内酰胺酶GOB-54。SWISS-MODEL三维建模发现GOB-54与临床来源的GOB-18具有高度相似的结构。动力学参数表明在所测试的β-内酰胺抗生素中,GOB-54对哌拉西林具有最高的亲和力和催化活性,动力学参数Km和Kcat/Km分别为121.82μmol/L和49.15 L/(mmol·s)。该研究利用功能宏基因组学方法挖掘出土壤来源的β-内酰胺抗生素耐药基因gob-54,编码广谱β-内酰胺酶GOB-54,为临床上监测和防控β-内酰胺类抗生素耐药基因的传播提供借鉴。 展开更多
关键词 Β-内酰胺酶 土壤微生物 功能宏基因组学 抗生素耐药基因
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优化病原的控制方法
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作者 廖学文 陈琳 Nataliya Roth 《国外畜牧学(猪与禽)》 2015年第5期79-80,共2页
自1946年科学家首次发现抗生素生长促进剂(Antibiotic Growth Promotoers,AGPs)对动物生产具有促进作用以来,它在世界各地被广泛应用于动物生产中。AGPs是为控制病原菌而以亚治疗剂量加入饲料中的抗生素,从而可促进动物生长,降低发病率... 自1946年科学家首次发现抗生素生长促进剂(Antibiotic Growth Promotoers,AGPs)对动物生产具有促进作用以来,它在世界各地被广泛应用于动物生产中。AGPs是为控制病原菌而以亚治疗剂量加入饲料中的抗生素,从而可促进动物生长,降低发病率,提高饲料报酬。长期以来,抗生素在动物保健中的使用已经产生了抗这些药物的耐药菌。抗生素耐药基因从动物源性细菌向人源性细菌的转移较为常见。 展开更多
关键词 抗生素耐药基因 动物源性细菌 动物保健 人源性 饲料报酬 沙门氏杆菌 盲肠内容物 Antib
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稻米内生贝莱斯芽孢杆菌BR-1的安全性评估
15
作者 张鑫宇 赖泽萍 +4 位作者 石鸿辉 王婷 于雅君 朱军莉 赵艳 《食品与生物技术学报》 2025年第2期112-121,共10页
【目的】对从稻米中分离的一株稻米内生贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis,B.velezensis)BR-1进行安全性评估。【方法】在全基因组测序的基础上,应用综合抗生素耐药数据库(CARD)和毒力因子数据库(VFDB)对BR-1的抗生素耐药基因和毒力... 【目的】对从稻米中分离的一株稻米内生贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis,B.velezensis)BR-1进行安全性评估。【方法】在全基因组测序的基础上,应用综合抗生素耐药数据库(CARD)和毒力因子数据库(VFDB)对BR-1的抗生素耐药基因和毒力基因进行注释,同时对BR-1进行抗生素药敏试验和溶血试验,并利用KEGG数据库注释贝莱斯芽孢杆菌BR-1与益生菌相关的基因。【结果】该稻米内生贝莱斯芽孢杆菌BR-1总碱基对为1071550432 bp,平均GC占比46.3%,包含4027个蛋白质编码基因,含有14个CRISPR-Cas;不含有编码溶血素BL(Hbl)、非溶血性肠毒素(Nhe)、肠毒素(细胞毒素K)和催吐毒素(cereulide-Ces)等毒素基因;KEGG数据库注释到可耐酸、耐高温、耐胆盐等具有良好的胃肠耐受性、抗氧化活性和优异益生菌特性的基因;预测到菌株BR-1含有2个耐药基因vmlR和clbA,对9种抗生素高度敏感且不含有耐药质粒。【结论】贝莱斯芽孢杆菌BR-1不含有编码毒素的基因,不具有广谱耐药性,不具有溶血活性,含有益生菌特性相关的基因,符合GB/T 41728—2022《微生物肥料质量安全评价通用准则》的安全性要求,可以作为微生物肥料。 展开更多
关键词 稻米内生贝莱斯芽孢杆菌BR-1 基因组测序 毒力基因 抗生素耐药基因 抗生素敏试验 溶血试验
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