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骤然低温下转录组测序揭示川百合抗寒通路与相关基因
被引量：
5
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作者
田雪慧
《江苏农业科学》
2020年第22期28-36,共9页
在没有参考基因组的情况下,为了揭示川百合(Lilium davidii)在4℃处理下基因表达谱的变化,为百合抗寒育种、引种及栽培提供理论支撑及技术支持。采用高通量Illumina Hiseq测序平台对川百合20℃(对照组)与4℃(处理组)温度条件下进行转录...
在没有参考基因组的情况下,为了揭示川百合(Lilium davidii)在4℃处理下基因表达谱的变化,为百合抗寒育种、引种及栽培提供理论支撑及技术支持。采用高通量Illumina Hiseq测序平台对川百合20℃(对照组)与4℃(处理组)温度条件下进行转录组测序,并对测序数据进行了分析研究,进一步探究川百合寒冷应答的分子机制。结果表明,经富集分析后得,与光合作用、光合作用-天线蛋白、光合生物体中的碳固定、叶绿素代谢等相关的基因可以作为研究川百合寒冷响应机制的主要研究对象。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析结果表明,随机选出的10个差异性表达基因的表达趋势与高通量测序结果一致。这为川百合响应低温相关基因的发掘与利用、川百合耐寒分子机制的揭示及百合种植资源遗传改良奠定了基础。
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关键词
川百合
骤然低温
转录组
分子机制
抗寒通路
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题名
骤然低温下转录组测序揭示川百合抗寒通路与相关基因
被引量：
5
1
作者
田雪慧
机构
杨凌职业技术学院生态环境工程分院
出处
《江苏农业科学》
2020年第22期28-36,共9页
基金
杨凌职业技术学院自然科学基金(编号:A2017027)。
文摘
在没有参考基因组的情况下,为了揭示川百合(Lilium davidii)在4℃处理下基因表达谱的变化,为百合抗寒育种、引种及栽培提供理论支撑及技术支持。采用高通量Illumina Hiseq测序平台对川百合20℃(对照组)与4℃(处理组)温度条件下进行转录组测序,并对测序数据进行了分析研究,进一步探究川百合寒冷应答的分子机制。结果表明,经富集分析后得,与光合作用、光合作用-天线蛋白、光合生物体中的碳固定、叶绿素代谢等相关的基因可以作为研究川百合寒冷响应机制的主要研究对象。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析结果表明,随机选出的10个差异性表达基因的表达趋势与高通量测序结果一致。这为川百合响应低温相关基因的发掘与利用、川百合耐寒分子机制的揭示及百合种植资源遗传改良奠定了基础。
关键词
川百合
骤然低温
转录组
分子机制
抗寒通路
分类号
S644.101 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
骤然低温下转录组测序揭示川百合抗寒通路与相关基因
田雪慧
《江苏农业科学》
2020
5
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