目的:应用生物信息学技术探索肾移植术后抗体介导排斥反应(antibody-mediated rejection,AMR)的差异表达基因,筛选出miRNA参与肾移植术后AMR的可能发生机制及潜在治疗靶点,以期为移植后AMR靶向治疗提供新思路。方法:从基因表达数据库(G...目的:应用生物信息学技术探索肾移植术后抗体介导排斥反应(antibody-mediated rejection,AMR)的差异表达基因,筛选出miRNA参与肾移植术后AMR的可能发生机制及潜在治疗靶点,以期为移植后AMR靶向治疗提供新思路。方法:从基因表达数据库(GEO)中下载数据集GSE115816,使用DESeq2R包在线分析肾移植术后移植肾功能稳定(SGF)组和AMR组的差异表达miRNAs,Targetscan软件预测miRNA的相关作用靶点,差异性表达基因(DEGs)进行基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;利用String数据库cytohubba进行关键基因(Hub基因)筛选,最后TargetScan在线分析进行验证。结果:与SGF组相比,AMR组共发现10个差异性表达的miRNA,其中miR-144-5p的表达差异最具有显著性。使用Targetscan软件预测miR-144-5p的相关作用靶点,共143个。GO分析表明,DEGs主要参与血管生成、突触信号传递、转录共激活因子调控。KEGG通路富集分析表明,DEGs主要富集于甲状腺激素信号通路、人类乳头瘤病毒感染、PI3K-AKT信号通路。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络筛选出10个Hug基因。基于cytoHubba中的6种算法,取各个算法的前10个Hug基因取交集后得到5个关键基因,分别是NCOA2、NCOA1、FOXO1、PAX3、PPARGC1A。经过文献调研发现FoxO1在免疫系统疾病及肾脏疾病中发挥重要作用,本研究选择FoxO1作为miR-144-5P的潜在作用靶点蛋白。最终,TargetScan在线分析结果显示,miR-144-5p与FoxO1的3'UTR区有靶向结合的位点。结论:miR-144-5p是参与肾移植术后AMR的关键miRNA,miR-144-5p靶向FoxO1可能作为AMR的潜在治疗靶点及预后生物标志物。展开更多
目的建立小鼠心脏移植急性抗体介导的排斥反应(AMR)模型并分析其特点。方法建立小鼠皮肤移植和心脏移植模型。根据处理方法不同分为同系对照组、非致敏组、预致敏组和预致敏+环孢素组(每组供、受体各9只)。观察各组移植物存活时间、供...目的建立小鼠心脏移植急性抗体介导的排斥反应(AMR)模型并分析其特点。方法建立小鼠皮肤移植和心脏移植模型。根据处理方法不同分为同系对照组、非致敏组、预致敏组和预致敏+环孢素组(每组供、受体各9只)。观察各组移植物存活时间、供体特异性抗体(DSA)水平和病理学表现,分析其排斥反应的特点。结果同系对照组小鼠心脏移植物在3个月观察期内均长期存活,非致敏组、预致敏组和预致敏+环孢素组心脏移植物存活时间分别为(7.0±0.7)d、(2.6±0.5)d和(5.0±0.7)d,组间比较差异均有统计学意义(均为P<0.01)。预致敏组在心脏移植术后3 d、预致敏+环孢素组在心脏移植术后5 d DSA水平均较基础值显著升高,差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。非致敏组病理学表现为心肌细胞破坏,形成间质炎,C4d少量沉积,CD3细胞大量浸润;预致敏组和预致敏+环孢素组病理学表现为心肌细胞破坏,形成毛细血管炎,C4d大量沉积,但是前者CD3细胞浸润多于后者。结论利用不同品系间小鼠皮肤移植和心脏移植的基础上加用环孢素可成功建立实用性强的小鼠心脏移植急性AMR模型,为后续AMR的发病机制和干预研究提供基础。展开更多
文摘目的:应用生物信息学技术探索肾移植术后抗体介导排斥反应(antibody-mediated rejection,AMR)的差异表达基因,筛选出miRNA参与肾移植术后AMR的可能发生机制及潜在治疗靶点,以期为移植后AMR靶向治疗提供新思路。方法:从基因表达数据库(GEO)中下载数据集GSE115816,使用DESeq2R包在线分析肾移植术后移植肾功能稳定(SGF)组和AMR组的差异表达miRNAs,Targetscan软件预测miRNA的相关作用靶点,差异性表达基因(DEGs)进行基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;利用String数据库cytohubba进行关键基因(Hub基因)筛选,最后TargetScan在线分析进行验证。结果:与SGF组相比,AMR组共发现10个差异性表达的miRNA,其中miR-144-5p的表达差异最具有显著性。使用Targetscan软件预测miR-144-5p的相关作用靶点,共143个。GO分析表明,DEGs主要参与血管生成、突触信号传递、转录共激活因子调控。KEGG通路富集分析表明,DEGs主要富集于甲状腺激素信号通路、人类乳头瘤病毒感染、PI3K-AKT信号通路。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络筛选出10个Hug基因。基于cytoHubba中的6种算法,取各个算法的前10个Hug基因取交集后得到5个关键基因,分别是NCOA2、NCOA1、FOXO1、PAX3、PPARGC1A。经过文献调研发现FoxO1在免疫系统疾病及肾脏疾病中发挥重要作用,本研究选择FoxO1作为miR-144-5P的潜在作用靶点蛋白。最终,TargetScan在线分析结果显示,miR-144-5p与FoxO1的3'UTR区有靶向结合的位点。结论:miR-144-5p是参与肾移植术后AMR的关键miRNA,miR-144-5p靶向FoxO1可能作为AMR的潜在治疗靶点及预后生物标志物。
文摘目的建立小鼠心脏移植急性抗体介导的排斥反应(AMR)模型并分析其特点。方法建立小鼠皮肤移植和心脏移植模型。根据处理方法不同分为同系对照组、非致敏组、预致敏组和预致敏+环孢素组(每组供、受体各9只)。观察各组移植物存活时间、供体特异性抗体(DSA)水平和病理学表现,分析其排斥反应的特点。结果同系对照组小鼠心脏移植物在3个月观察期内均长期存活,非致敏组、预致敏组和预致敏+环孢素组心脏移植物存活时间分别为(7.0±0.7)d、(2.6±0.5)d和(5.0±0.7)d,组间比较差异均有统计学意义(均为P<0.01)。预致敏组在心脏移植术后3 d、预致敏+环孢素组在心脏移植术后5 d DSA水平均较基础值显著升高,差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。非致敏组病理学表现为心肌细胞破坏,形成间质炎,C4d少量沉积,CD3细胞大量浸润;预致敏组和预致敏+环孢素组病理学表现为心肌细胞破坏,形成毛细血管炎,C4d大量沉积,但是前者CD3细胞浸润多于后者。结论利用不同品系间小鼠皮肤移植和心脏移植的基础上加用环孢素可成功建立实用性强的小鼠心脏移植急性AMR模型,为后续AMR的发病机制和干预研究提供基础。
