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西农萨能羊泌乳高峰期和初期乳腺组织差异表达基因研究
被引量：
2
1
作者
武会娟
罗军
+3 位作者
张丽娟
韩雪峰
杨宝进
王海滨
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期136-142,共7页
利用抑制性削减杂交和实时定量PCR研究西农萨能羊泌乳高峰期差异表达基因，结果表明成功构建泌乳高峰期和泌乳初期乳腺组织差异表达削减eDNA文库，以GAPDH为指标检测文库削减效率为2^5倍，共获得78个阳性克隆，PCR检测插入片段主要分布...
利用抑制性削减杂交和实时定量PCR研究西农萨能羊泌乳高峰期差异表达基因，结果表明成功构建泌乳高峰期和泌乳初期乳腺组织差异表达削减eDNA文库，以GAPDH为指标检测文库削减效率为2^5倍，共获得78个阳性克隆，PCR检测插入片段主要分布在150～1000bp，挑选插入片段不等的30个克隆测序，获得25个有效序列，代表18个基因。对文库中所包含的血清淀粉样蛋白A3（SAA3），ATP结合盒亚家族G成员2（ABCG2），心脏型脂肪酸结合蛋白（H-FABP）和黄嘌呤脱氢酶（XDH）进行实时定量PCR检测，发现上述4个基因在泌乳高峰期乳腺组织中的表达水平分别是泌乳初期的17．0，7．7，16．3和1．7倍。结论：构建的消减文库可用于筛选泌乳高峰期差异基因，已鉴定的4个基因很可能是调控产奶量和乳成分变化的候选基因。
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关键词
西农萨能羊
乳腺组织
抑制性削减杂交
基因差异表达
实时定量PCR
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职称材料
西农萨能奶山羊泌乳中期和后期乳腺组织差异基因的筛选
被引量：
1
2
作者
武会娟
罗军
+1 位作者
赵旺生
王伟
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期16-21,共6页
旨在利用抑制性削减杂交（SSH）技术筛选西农萨能奶山羊泌乳中期和后期的差异表达基因,并用实时定量PCR（Q-PCR）分析差异基因的表达丰度,探讨奶山羊不同泌乳阶段乳腺组织的基因表达规律。本研究以西农萨能奶山羊泌乳中期和后期乳腺组织...
旨在利用抑制性削减杂交（SSH）技术筛选西农萨能奶山羊泌乳中期和后期的差异表达基因,并用实时定量PCR（Q-PCR）分析差异基因的表达丰度,探讨奶山羊不同泌乳阶段乳腺组织的基因表达规律。本研究以西农萨能奶山羊泌乳中期和后期乳腺组织的mRNA互为检测子（Tester）和驱动子（Driver）构建cDNA消减文库（M-L和L-M）,随机挑选克隆测序,进行序列比对分析,并检测部分差异基因在乳腺组织中的表达丰度。结果,成功构建了泌乳中期和后期的cDNA文库,随机挑选30个克隆测序,得到M-L和L-M文库中与细胞凋亡、抗氧化、脂类代谢、能量代谢等生理过程相关的差异基因,对其中的6个基因进行实时定量分析,发现5个均为阳性克隆,表达水平增加了1.3~5.5倍不等。结果表明,利用SSH技术成功构建了泌乳中期和后期乳腺组织正反向消减cDNA文库,筛选出24个差异基因,为进一步研究奶山羊乳腺组织基因调控机理奠定了基础。
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关键词
西农萨能羊
乳腺组织
抑制性削减杂交
差异表达基因
实时定量PCR
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职称材料
西农萨能羊两个泌乳阶段差异表达基因SAA3的克隆和序列分析
3
作者
武会娟
罗军
+6 位作者
张丽娟
韩雪峰
杨宝进
王海滨
单翠燕
张宁
余刚
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期110-114,共5页
为了研究不同泌乳期乳腺组织中差异表达基因,利用抑制性削减杂交技术构建西农萨能羊泌乳60 d乳腺组织及泌乳28 d乳腺组织中差异表达基因文库,用Real-Time PCR技术验证阳性克隆血清淀粉样蛋白A 3(SAA3)基因,通过RT-PCR方法克隆西农萨能...
为了研究不同泌乳期乳腺组织中差异表达基因,利用抑制性削减杂交技术构建西农萨能羊泌乳60 d乳腺组织及泌乳28 d乳腺组织中差异表达基因文库,用Real-Time PCR技术验证阳性克隆血清淀粉样蛋白A 3(SAA3)基因,通过RT-PCR方法克隆西农萨能羊乳腺组织SAA3,并进行序列比对和功能预测。结果成功构建了西农萨能羊不同泌乳期乳腺组织中差异表达基因文库,筛选克隆了乳腺组织SAA3基因,GenBank登录号为:DQ839400,编码区长度为396 bp,含有131个氨基酸。西农萨能羊乳腺组织中SAA3与牛(GenBank:NM_181016)、兔(GenBank:M64696.1)、人(GenBank:BC020795)、鼠(GenBank:NM_011315)核苷酸同源性分别为95%、84.3%、81.3%和81.9%,氨基酸同源性为93%、76%、72%、72%;在编码区261-287位较人、兔、鼠SAA编码区多27个碱基,连续大于5个氨基酸的保守区域有6个,较人SAA多3个潜在功能基序。
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关键词
西农萨能羊
乳腺组织
血清淀粉样蛋白A3
抑制性削减杂交
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职称材料
题名
西农萨能羊泌乳高峰期和初期乳腺组织差异表达基因研究
被引量：
2
1
作者
武会娟
罗军
张丽娟
韩雪峰
杨宝进
王海滨
机构
西北农林科技大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期136-142,共7页
基金
教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-05-0857)
西北农林科技大学研究生教育创新计划项目(05YCH021)
文摘
利用抑制性削减杂交和实时定量PCR研究西农萨能羊泌乳高峰期差异表达基因，结果表明成功构建泌乳高峰期和泌乳初期乳腺组织差异表达削减eDNA文库，以GAPDH为指标检测文库削减效率为2^5倍，共获得78个阳性克隆，PCR检测插入片段主要分布在150～1000bp，挑选插入片段不等的30个克隆测序，获得25个有效序列，代表18个基因。对文库中所包含的血清淀粉样蛋白A3（SAA3），ATP结合盒亚家族G成员2（ABCG2），心脏型脂肪酸结合蛋白（H-FABP）和黄嘌呤脱氢酶（XDH）进行实时定量PCR检测，发现上述4个基因在泌乳高峰期乳腺组织中的表达水平分别是泌乳初期的17．0，7．7，16．3和1．7倍。结论：构建的消减文库可用于筛选泌乳高峰期差异基因，已鉴定的4个基因很可能是调控产奶量和乳成分变化的候选基因。
关键词
西农萨能羊
乳腺组织
抑制性削减杂交
基因差异表达
实时定量PCR
Keywords
Xinong Saanen goat
mammary gland
suppression subtractive hybridization
gene
分类号
S823.835 [农业科学—畜牧学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
西农萨能奶山羊泌乳中期和后期乳腺组织差异基因的筛选
被引量：
1
2
作者
武会娟
罗军
赵旺生
王伟
机构
西北农林科技大学动物科技学院
北京市理化分析测试中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期16-21,共6页
基金
国家863项目"奶山羊乳腺脂肪酸代谢基因网络分析"(2008AA10Z135)
国家科技支撑计划项目(2006BAD04A11)
北京市科学技术研究院创新团队计划
文摘
旨在利用抑制性削减杂交（SSH）技术筛选西农萨能奶山羊泌乳中期和后期的差异表达基因,并用实时定量PCR（Q-PCR）分析差异基因的表达丰度,探讨奶山羊不同泌乳阶段乳腺组织的基因表达规律。本研究以西农萨能奶山羊泌乳中期和后期乳腺组织的mRNA互为检测子（Tester）和驱动子（Driver）构建cDNA消减文库（M-L和L-M）,随机挑选克隆测序,进行序列比对分析,并检测部分差异基因在乳腺组织中的表达丰度。结果,成功构建了泌乳中期和后期的cDNA文库,随机挑选30个克隆测序,得到M-L和L-M文库中与细胞凋亡、抗氧化、脂类代谢、能量代谢等生理过程相关的差异基因,对其中的6个基因进行实时定量分析,发现5个均为阳性克隆,表达水平增加了1.3~5.5倍不等。结果表明,利用SSH技术成功构建了泌乳中期和后期乳腺组织正反向消减cDNA文库,筛选出24个差异基因,为进一步研究奶山羊乳腺组织基因调控机理奠定了基础。
关键词
西农萨能羊
乳腺组织
抑制性削减杂交
差异表达基因
实时定量PCR
Keywords
Xinong Saanen Dairy goat
mammary gland
suppression subtractive hybridization
differentially expressed gene
real-time quantitative PCR
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
S814.8 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
西农萨能羊两个泌乳阶段差异表达基因SAA3的克隆和序列分析
3
作者
武会娟
罗军
张丽娟
韩雪峰
杨宝进
王海滨
单翠燕
张宁
余刚
机构
西北农林科技大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期110-114,共5页
基金
教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-05-0857)
西北农林科技大学研究生教育创新计划项目(05YCH021)
文摘
为了研究不同泌乳期乳腺组织中差异表达基因,利用抑制性削减杂交技术构建西农萨能羊泌乳60 d乳腺组织及泌乳28 d乳腺组织中差异表达基因文库,用Real-Time PCR技术验证阳性克隆血清淀粉样蛋白A 3(SAA3)基因,通过RT-PCR方法克隆西农萨能羊乳腺组织SAA3,并进行序列比对和功能预测。结果成功构建了西农萨能羊不同泌乳期乳腺组织中差异表达基因文库,筛选克隆了乳腺组织SAA3基因,GenBank登录号为:DQ839400,编码区长度为396 bp,含有131个氨基酸。西农萨能羊乳腺组织中SAA3与牛(GenBank:NM_181016)、兔(GenBank:M64696.1)、人(GenBank:BC020795)、鼠(GenBank:NM_011315)核苷酸同源性分别为95%、84.3%、81.3%和81.9%,氨基酸同源性为93%、76%、72%、72%;在编码区261-287位较人、兔、鼠SAA编码区多27个碱基,连续大于5个氨基酸的保守区域有6个,较人SAA多3个潜在功能基序。
关键词
西农萨能羊
乳腺组织
血清淀粉样蛋白A3
抑制性削减杂交
Keywords
Xinong Saanen goat
mammary gland
serum amyloid A protein
suppression subtractive hybridization
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西农萨能羊泌乳高峰期和初期乳腺组织差异表达基因研究
武会娟
罗军
张丽娟
韩雪峰
杨宝进
王海滨
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
西农萨能奶山羊泌乳中期和后期乳腺组织差异基因的筛选
武会娟
罗军
赵旺生
王伟
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
西农萨能羊两个泌乳阶段差异表达基因SAA3的克隆和序列分析
武会娟
罗军
张丽娟
韩雪峰
杨宝进
王海滨
单翠燕
张宁
余刚
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
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