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细粒棘球蚴原头蚴包囊和原头蚴成虫抑制差减杂交文库中差异表达基因的筛选及分析 被引量:3
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作者 赵莉 石保新 +6 位作者 李军 张壮志 马正海 张旭 薛晶 金映红 张文宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1215-1223,共9页
细粒棘球绦虫原头蚴(PSC)具有双向发育的特点,本文旨在利用SSH和生物信息学方法筛选原头蚴包囊(CW)和成虫(AW)特异性的基因。将PSC-CW和PSC-AW双相发育差减cDNA文库的差减PCR产物克隆入pGEM-T载体并测序,利用CAP3sequence assembly在线... 细粒棘球绦虫原头蚴(PSC)具有双向发育的特点,本文旨在利用SSH和生物信息学方法筛选原头蚴包囊(CW)和成虫(AW)特异性的基因。将PSC-CW和PSC-AW双相发育差减cDNA文库的差减PCR产物克隆入pGEM-T载体并测序,利用CAP3sequence assembly在线软件、Blast2GO软件与GenBank数据库对测序结果进行分析,筛选原头蚴成囊和成虫特异性的基因,并探讨这些基因的功能。结果显示:对PSC-CW和PSC-AW文库进行扩增,分别得到280和200个阳性克隆,菌落PCR鉴定结果表明,这些克隆均插入200~1 000bp片段。测序结果显示从PSC-CW和PSC-AW SSH文库中分别得到16和10个特异性基因。其中PSC-CW SSH文库中得到4个出现频率较高的基因,其余12个基因仅出现1次,其中5个为未知基因,已知基因分别编码细胞色素C氧化酶Ⅰ、热休克蛋白70和铁蛋白等功能蛋白质。PSC-AW SSH文库中得到10个基因,其中2个出现频率较高基因,8个基因仅出现1次,4个为未知基因,6个已知基因分别编码基质蛋白1、延伸因子1α和脂肪酸结合蛋白等功能蛋白质。本研究筛选获得原头蚴成囊和成虫发育时差异表达的基因,对这些基因的功能进行分析表明,PSC-CW SSH文库中多是与营养和能量转运功能的相关基因,而PSC-AW SSH文库中多为发育与分化相关的基因,这些基因的差异表达可能与原头蚴处于不同的生长环境和发育方向有关,同时也为棘球蚴病免疫诊断、药物筛选和疫苗研制提供候选基因。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 抑制差减杂交 特异性基因
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抑制差减杂交法克隆小麦抗病基因相关片段研究 被引量:1
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作者 刘志祥 曾超珍 张增艳 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第26期8128-8129,共2页
以YW642/中8601的F2代纯合的抗病和感病单株各10株提取DNA构建成近等基因池,以抗病池为试验方,以感病池为驱动方,进行抑制差减杂交(SSH),构建差减文库。结果表明,用差异筛选排除假阳性,得到8个阳性克隆;Southern杂交表明,克隆TSH-1具有... 以YW642/中8601的F2代纯合的抗病和感病单株各10株提取DNA构建成近等基因池,以抗病池为试验方,以感病池为驱动方,进行抑制差减杂交(SSH),构建差减文库。结果表明,用差异筛选排除假阳性,得到8个阳性克隆;Southern杂交表明,克隆TSH-1具有抗病池特异性,且为寡拷贝或单拷贝序列;经测序,TSH-1长388bp,提交GenBank进行Blast比对,没有找到与之同源的序列。 展开更多
关键词 抑制差减杂交 小麦 抗病基因
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利用抑制差减杂交分离芝麻耐湿性相关基因 被引量:14
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作者 王林海 吕再萍 +4 位作者 张艳欣 黎冬华 吕海霞 张晓燕 张秀荣 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期485-490,共6页
为分离芝麻耐湿性相关基因,以敏感品种鄂芝2号和耐湿品种2541为实验材料,通过抑制差减杂交(SSH)构建了芝麻湿害胁迫的差减cDNA文库。在随机挑取的162个阳性克隆中,测序获得146条高质量的EST,含有106条非重复序列(Unigenes)。其中82条非... 为分离芝麻耐湿性相关基因,以敏感品种鄂芝2号和耐湿品种2541为实验材料,通过抑制差减杂交(SSH)构建了芝麻湿害胁迫的差减cDNA文库。在随机挑取的162个阳性克隆中,测序获得146条高质量的EST,含有106条非重复序列(Unigenes)。其中82条非重复序列与GenBank中的基因或蛋白具有较高的同源性,占全部序列的77.36%。对有功能注释的39条同源序列分析发现,其涉及植物的基础物质、能量代谢、信号转导、转录调控和解毒防御等方面,说明这些基因很可能参与到芝麻的耐湿性反应中。 展开更多
关键词 芝麻 耐湿性 抑制杂交(SSH) CDNA文库
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干旱胁迫下黄花苜蓿与蒺藜苜蓿两个抑制性差减杂交文库的构建及分析 被引量:8
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作者 王天佐 赵敏桂 张文浩 《草业学报》 CSCD 北大核心 2012年第6期175-181,共7页
水分胁迫是植物面临的最主要的非生物胁迫之一,研究植物的抗旱机理以提高植物的抗旱能力具有重大的意义。抑制性差减杂交是一种筛选特异表达基因的良好手段,使用该方法成功构建了豆科植物黄花苜蓿和蒺藜苜蓿2个差减文库并进行测序。通... 水分胁迫是植物面临的最主要的非生物胁迫之一,研究植物的抗旱机理以提高植物的抗旱能力具有重大的意义。抑制性差减杂交是一种筛选特异表达基因的良好手段,使用该方法成功构建了豆科植物黄花苜蓿和蒺藜苜蓿2个差减文库并进行测序。通过GO分类和KEGG分析等手段对文库中序列进行分类,并分析表达序列的差异,发现黄花苜蓿文库中对抵抗水分胁迫起积极作用的基因表达序列明显多于蒺藜苜蓿。此外,还对筛选到的2个基因在2种苜蓿中的干旱响应表达模式进行了分析,结果表明,在黄花苜蓿中这2个基因的表达更加有利于响应和抵抗干旱。这些结果在分子层面上一定程度的解释了黄花苜蓿较蒺藜苜蓿更加抗旱的原因。 展开更多
关键词 黄花苜蓿 蒺藜苜蓿 干旱 抑制杂交(SSH)
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应用抑制性差减杂交技术构建副猪嗜血杆菌基因组差减文库 被引量:3
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作者 李淼 李春玲 +1 位作者 宋帅 杨冬霞 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第13期128-130,共3页
为构建副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,HPS)有毒力菌株SW124(血清4型)和无毒力菌株H465(血清11型)间的差异表达基因文库,采用抑制性差减杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH)分析SW124和H465菌株细菌基因组的表达差... 为构建副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,HPS)有毒力菌株SW124(血清4型)和无毒力菌株H465(血清11型)间的差异表达基因文库,采用抑制性差减杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH)分析SW124和H465菌株细菌基因组的表达差异,并进行两轮差减杂交和两次PCR扩增,将第2次PCR产物与pMD19-T载体相连,转化大肠杆菌E.coli DH5α感受态细胞并进行文库扩增和蓝白斑筛选,RT-PCR鉴定差异表达文库。结果共获得327个阳性克隆,筛选100个克隆制备质粒进行PCR检测,均扩增出100~2 000 bp大小的片段。差异DNA差减文库的构建为进一步筛选、克隆HPS特异的未知新基因、建立分子鉴别新体系奠定了基础。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 抑制杂交 异基因文库
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抑制性差减杂交(SSH)技术在柑桔逆境胁迫研究中的应用 被引量:2
6
作者 程春振 阳佳位 钟广炎 《中国南方果树》 北大核心 2010年第2期11-14,共4页
抑制性差减杂交(SSH)技术作为一种稳定、高效、简单的富集和分离差异表达基因方法,为研究植物生长发育及病虫害和其他一些生物或非生物逆境胁迫下的特异基因的表达和相关基因的分子克隆提供了有力的工具。介绍了SSH技术的基本原理、技... 抑制性差减杂交(SSH)技术作为一种稳定、高效、简单的富集和分离差异表达基因方法,为研究植物生长发育及病虫害和其他一些生物或非生物逆境胁迫下的特异基因的表达和相关基因的分子克隆提供了有力的工具。介绍了SSH技术的基本原理、技术要点,并对SSH技术在其他植物和柑桔逆境生理研究中的应用现状和前景进行了探讨。 展开更多
关键词 抑制杂交 柑桔 胁迫 异表达基因克隆
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用差减抑制杂交方法鉴定太谷核不育小麦花药败育过程中的特异表达基因 被引量:5
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作者 常青山 周荣华 +1 位作者 余增亮 贾继增 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2003年第3期30-33,共4页
以太谷核不育小麦败育花药为对照群体 ,可育花药为目标群体 ,进行抑制差减杂交。用经过败育花药差减的可育花药cDNA群体构建了一个差减抑制杂交文库。结果显示 ,插入片段的大小主要集中在 30 0~ 5 0 0bp之间。随机选取 8个克隆进行Nort... 以太谷核不育小麦败育花药为对照群体 ,可育花药为目标群体 ,进行抑制差减杂交。用经过败育花药差减的可育花药cDNA群体构建了一个差减抑制杂交文库。结果显示 ,插入片段的大小主要集中在 30 0~ 5 0 0bp之间。随机选取 8个克隆进行Northern杂交分析 ,结果其中 7个克隆在可育花药和不育花药之间的表达存在差异。对其中 16个插入cDNA片段测序后与GenBank同源性比较表明 ,共获得未重复序列 13条 ,占81% ,其中与已知功能基因同源的 3条 ,与EST库中的序列同源的 7条 ,新的cDNA片段 3条。 展开更多
关键词 抑制杂交方法 鉴定 太谷核不育小麦 花药 败育过程 特异表达基因 SSH技术 Northern杂交
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与按蚊唾液腺抗疟原虫子孢子入侵相关的差异表达cDNA文库构建 被引量:1
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作者 张健 王英 +1 位作者 李振伦 黄复生 《成都医学院学报》 CAS 2011年第2期104-106,共3页
目的构建与按蚊唾液腺抗疟原虫子孢子入侵相关的差异表达cDNA文库,为进一步筛选、克隆按蚊唾液腺抗疟原虫子孢子入侵差异新基因奠定基础。方法以大劣按蚊-约氏疟原虫为实验模型,分别将饱吸约氏疟原虫感染鼠血和正常鼠血后14 d的大劣按... 目的构建与按蚊唾液腺抗疟原虫子孢子入侵相关的差异表达cDNA文库,为进一步筛选、克隆按蚊唾液腺抗疟原虫子孢子入侵差异新基因奠定基础。方法以大劣按蚊-约氏疟原虫为实验模型,分别将饱吸约氏疟原虫感染鼠血和正常鼠血后14 d的大劣按蚊作为T组和D组,采用抑制差减杂交方法和T/A克隆技术构建按蚊唾液腺抗疟原虫子孢子入侵相关cDNA文库。结果扩增差减cDNA文库获得2 670个阳性克隆,随机挑取克隆测序显示有与冈比亚按蚊未知功能基因同源的克隆。结论成功构建与按蚊唾液腺抗疟原虫子孢子入侵相关的差异表达cDNA文库。 展开更多
关键词 按蚊 约氏疟原虫 抑制差减杂交 基因文库
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转“全鱼”GH基因鲤鱼胸腺发育差异表达基因的筛选与鉴定 被引量:1
9
作者 孙晓凤 黄容 +3 位作者 胡炜 肖梦颖 汪亚平 郭琼林 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1184-1191,共8页
采用显微注射方法,获得了转“全鱼”生长激素(GH)基因鲤鱼(转基因鱼),应用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了4月龄F3转基因鱼胸腺发育差减cDNA文库,筛选并鉴定了与胸腺发育相关的81个与已知基因同源的表达序列标签(EST)。这些EST... 采用显微注射方法,获得了转“全鱼”生长激素(GH)基因鲤鱼(转基因鱼),应用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了4月龄F3转基因鱼胸腺发育差减cDNA文库,筛选并鉴定了与胸腺发育相关的81个与已知基因同源的表达序列标签(EST)。这些EST至少代表69个基因。根据基因的作用将其分为5类:18个与免疫和细胞防御有关;23个参与细胞生长、发育和分化等代谢过程;3个参与细胞信号传导和周期调控;8个在转录和表达调节中发挥作用;17个为核糖体蛋白基因,表明转基因鱼胸腺细胞处于活跃的蛋白合成状态。应用RT-PCR和虚拟Northern杂交技术进一步证实其中的若干基因在转基因鱼胸腺组织中的表达量增加。实验结果为阐明转植GH基因促进鲤鱼胸腺发育的相关分子机制提供了依据。 展开更多
关键词 “全鱼”生长激素基因 转基因鲤鱼 胸腺发育 抑制杂交(SSH) 表达序列标签(EST)
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蛹虫草中虫草素差异表达基因cDNA的克隆 被引量:6
10
作者 莫红丽 叶小舟 +1 位作者 吴继明 邹爱国 《广东蚕业》 2010年第2期38-46,共9页
采用抑制差减杂交技术(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)分离与虫草素合成相关的差异表达基因的cDNA片段,为克隆相关基因提供研究基础。对虫草素表达产生的差异进行基因水平的分析,做了双向调控的分析,即以高表达虫草素的突... 采用抑制差减杂交技术(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)分离与虫草素合成相关的差异表达基因的cDNA片段,为克隆相关基因提供研究基础。对虫草素表达产生的差异进行基因水平的分析,做了双向调控的分析,即以高表达虫草素的突变型菌株作为检测子,以未作移码诱变处理的出发野生型菌株作为驱动子,同时,以未作移码诱变处理的出发野生型菌株作为检测子,以高表达虫草素的突变型菌株作为驱动子。经过消减杂交后得到一组正调控基因片段的克隆,并对该组克隆进行了序列测定。 展开更多
关键词 蛹虫草 虫草素 抑制杂交
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松材线虫虫体特异表达cDNA文库的构建与分析
11
作者 黄麟 徐旭凌 +2 位作者 李超 叶建仁 吴小芹 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第10期98-103,共6页
松材线虫取食和致病相关基因的鉴定是揭示松材线虫病致病机制的重要研究内容。以松材线虫混合虫体为测试方,线虫卵为驱动方,构建二者差减cDNA文库。文库测序结果经序列拼接、功能注释,共获得松材线虫虫体特异表达的有效EST序列354个,拼... 松材线虫取食和致病相关基因的鉴定是揭示松材线虫病致病机制的重要研究内容。以松材线虫混合虫体为测试方,线虫卵为驱动方,构建二者差减cDNA文库。文库测序结果经序列拼接、功能注释,共获得松材线虫虫体特异表达的有效EST序列354个,拼接后获得34个重叠群,其中15个重叠群获得明确的功能注释,其中MixC12、MixC25、MixC33分别与过氧化物酶、β-1,4内切葡聚糖酶、锌指家族蛋白有较高的同源性,这些基因被认为与植物线虫的取食和致病性密切相关。RT-PCR分析验证了所获得的差减cDNA的代表性。 展开更多
关键词 松材线虫 混合虫体 致病相关基因 抑制差减杂交
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氯酸钾促龙眼成花机理的研究进展
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作者 林建忠 《安徽农业科学》 CAS 2014年第22期7329-7331,共3页
"KClO3-longan model system"除了具有生产应用上的意义,更具有重要的科研潜力和科研价值。对氯酸钾促龙眼成花的植物生理学及分子生物学机理研究进行简介。
关键词 龙眼 氯酸钾 抑制差减杂交
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LR型微囊藻毒素对鲢鱼PEPCK基因表达的影响 被引量:1
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作者 徐育强 张开岳 +4 位作者 张勇 蒋骄云 冯龙 许世杰 曲宪成 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第17期124-128,144,共6页
在前期经LR型微囊藻毒素(MC-LR)处理后建立鲢鱼肝脏组织抑制差减杂交文库的基础上,利用RACE方法克隆了经MC-LR处理后差异表达明显的鲢鱼磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶PEPCK基因cDNA全长,并对其进行了序列分析,然后通过半定量分析了经MC-LR投与... 在前期经LR型微囊藻毒素(MC-LR)处理后建立鲢鱼肝脏组织抑制差减杂交文库的基础上,利用RACE方法克隆了经MC-LR处理后差异表达明显的鲢鱼磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶PEPCK基因cDNA全长,并对其进行了序列分析,然后通过半定量分析了经MC-LR投与1、5、10 h鲢鱼肝脏组织PEPCK表达水平。结果显示:鲢鱼PEPCK基因cDNA全长2 605 bp,包括101 bp的5'端非翻译区、564 bp的3'端非翻译区、1 911 bp的开放阅读框,编码636个氨基酸。将鲢鱼PEPCK基因cDNA核酸及氨基酸序列与GenBank中已发表的其他几种鱼类的相应序列进行比对,表明鲢鱼PEPCK与翘嘴红鲌的同源性最高,其核酸及氨基酸序列的相似性分别达到97%和99%;其次为斑马鱼,同源性均达到90%以上;与星斑川鲽的同源性最差,但核酸及氨基酸序列的相似性也分别达到77%和84%,说明鱼类PEPCK在长期的进化过程中具有很高的保守性。鲢鱼PEPCK具有与草酰乙酯结合的特有结构域以及与GTP三磷酸链结合的激酶1和激酶2基序。另外,鲢鱼投予MC-LR后,肝脏组织PEPCK经过1、5、10 h的表达量均有显著升高,说明鲢鱼投予MC-LR 1 h内该基因即被诱导表达,且在10 h内皆维持较高的表达水平。这与微囊藻毒素作用有关,推测与微囊藻毒素解毒过程相关。 展开更多
关键词 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶 抑制差减杂交 快速扩增CDNA末端 LR型微囊藻毒素
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干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片SSH文库构建及CkWRKY1基因克隆 被引量:20
14
作者 杨杞 张涛 +6 位作者 王颖 李高 尹佳佳 韩晓敏 齐力旺 李国婧 王瑞刚 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第7期62-68,共7页
为研究柠条锦鸡儿抗旱的分子机制,挖掘干旱响应相关基因,成功构建干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片的抑制性差减杂交(SSH)文库,获得1286条高质量的EST序列,平均长度475bp,拼接得到Unigenes645条。对这些Unigenes进行Blast比对注释后发现很多抗... 为研究柠条锦鸡儿抗旱的分子机制,挖掘干旱响应相关基因,成功构建干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片的抑制性差减杂交(SSH)文库,获得1286条高质量的EST序列,平均长度475bp,拼接得到Unigenes645条。对这些Unigenes进行Blast比对注释后发现很多抗旱相关基因,例如LEA蛋白、DHN蛋白编码基因,MYB、bZIP、WRKY、NAC和bHLH转录因子等。通过RACE技术克隆其中1个WRKY转录因子的cDNA全长,命名为CkWRKY1,GenBank登录号为JX987095。CkWRKY1编码330个氨基酸的蛋白质,氨基酸序列中有1个"WRKYGQK"的WRKY转录因子家族保守序列,属于第Ⅱ类WRKY转录因子。利用实时荧光定量PCR技术检测发现,CkWRKY1基因在干旱处理后mRNA的表达水平明显上升,预示该转录因子可能与柠条锦鸡儿抗旱的分子机制相关。 展开更多
关键词 柠条锦鸡儿 干旱胁迫 抑制杂交(SSH)文库 WRKY 基因克隆
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雌核发育银鲫四种孵化酶基因全长cDNA的克隆及其特征分析 被引量:10
15
作者 刘军 石耀华 +1 位作者 尹隽 桂建芳 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2003年第7期38-45,共8页
用抑制性差减杂交结合SMARTcDNA合成和RACE PCR技术 ,克隆得到雌核发育银鲫 (Carassiusauratusgibelio) 4种孵化酶基因的全长cDNA。 4种孵化酶基因分别被命名为GHE1、GHE2、GHE3、GHE4。序列分析表明 ,4种孵化酶基因cDNA的开放阅读框均... 用抑制性差减杂交结合SMARTcDNA合成和RACE PCR技术 ,克隆得到雌核发育银鲫 (Carassiusauratusgibelio) 4种孵化酶基因的全长cDNA。 4种孵化酶基因分别被命名为GHE1、GHE2、GHE3、GHE4。序列分析表明 ,4种孵化酶基因cDNA的开放阅读框均为 795bp ,都编码 2 6 5个氨基酸。它们推断的编码氨基酸序列同源性在 79 6~95 1 %之间。种系分析表明 ,GHE1、GHE2、GHE3、GHE4的进化地位位于日本鳗鲡(Anguillajaponica)孵化酶和青 (Oryziaslatipes)孵化酶之间。不同发育时期胚胎的RT PCR分析表明 ,银鲫GHE1、GHE2、GHE3、GHE4 4种孵化酶基因从尾芽期到幼苗期都检测到表达 ,且GHE3和GHE4在神经胚期也检测到表达。各种组织的RT PCR表明 。 展开更多
关键词 银鲫 雌核 孵化酶基因 抑制杂交 SMARTcDNA RACE-PCR 克隆 开放阅读框 氨基酸序列同源性
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凡纳滨对虾烯醇酶基因Enolase的克隆及表达分析 被引量:3
16
作者 李文兰 高永华 +2 位作者 盛小伟 陈晓汉 熊建华 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期168-171,174,共5页
以生长性状分离的凡纳滨对虾家系的肌肉组织,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,斑点杂交筛选获得Enolase基因,克隆获得全长编码区序列。序列分析表明,序列包含1 305 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质含434个氨基酸,预测的分子量为47.... 以生长性状分离的凡纳滨对虾家系的肌肉组织,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,斑点杂交筛选获得Enolase基因,克隆获得全长编码区序列。序列分析表明,序列包含1 305 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质含434个氨基酸,预测的分子量为47.4 ku,等电点为5.67。通过荧光定量PCR法研究了Enolase基因在凡纳滨对虾的不同组织和不同生长期的肌肉组织中的表达情况,结果显示,Enolase基因在凡纳滨对虾的心脏、肝胰腺、肌肉、胃、肠、眼柄、鳃和血等组织或器官中都有表达;在肌肉组织中表达量最高,在肝胰腺中表达量最低;在日龄为125 d的对虾肌肉组织中表达量最高,在日龄为80 d的对虾肌肉组织中表达量最低。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 烯醇酶 抑制杂交 荧光定量PCR
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凡纳滨对虾内质网膜转运通道蛋白基因Sec61γ的克隆及表达分析 被引量:1
17
作者 熊建华 盛小伟 +3 位作者 高永华 李文兰 杨彦豪 陈晓汉 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期446-451,共6页
以生长性状为指标分离凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei家系的肌肉组织,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,进行斑点杂交筛选获得内质网膜转运通道蛋白基因Sec61γ基因,克隆获得cDNA全长编码序列及部分非编码序列。序列包含270 bp的开... 以生长性状为指标分离凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei家系的肌肉组织,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,进行斑点杂交筛选获得内质网膜转运通道蛋白基因Sec61γ基因,克隆获得cDNA全长编码序列及部分非编码序列。序列包含270 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为89个氨基酸,预测的相对分子质量为10 300,理论等电点为10.58。通过荧光定量PCR的方法研究了Sec61γ基因在对虾不同组织和不同生长期肌肉组织中的表达情况,结果表明:Sec61γ基因在对虾的血液以及心脏、肝胰腺、肌肉、胃、肠、眼柄等器官或组织中都有表达,其中在肌肉组织中表达量最高,在肠中表达量最低;在对虾不同生长期肌肉中的表达量各不相同,在10日龄的对虾肌肉组织中表达量最高,为45日龄的对虾肌肉组织中表达量的27.6倍。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 Sec61γ基因 抑制杂交 荧光定量PCR
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不育温度下油菜温敏雄性不育系SSH文库的构建 被引量:1
18
作者 叶晓明 彭少丹 +2 位作者 陈升位 陆娜 林良斌 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期6-10,共5页
以温敏雄性不育系K121S在可育温度(10℃)下和不育温度(26℃)下三核期花蕾为材料,以可育温度下的cDNA为驱动子,通过抑制性差减杂交技术构建了不育温度下抑制性差减杂交(SSH)文库,其插入片段长度分布在200~1 000 bp左右,并随机挑... 以温敏雄性不育系K121S在可育温度(10℃)下和不育温度(26℃)下三核期花蕾为材料,以可育温度下的cDNA为驱动子,通过抑制性差减杂交技术构建了不育温度下抑制性差减杂交(SSH)文库,其插入片段长度分布在200~1 000 bp左右,并随机挑选97个阳性菌落测序,得到20个表达序列标签(EST),包括与ATP合酶β亚基、Rubp羧化酶小亚基同源的EST等,为进一步获得育性转换相关基因和揭示K121S的育性转换分子机理奠定了基础. 展开更多
关键词 油菜 温敏雄性不育 抑制杂交 文库
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Screening and cloning of differentially expressed genes in placentas from patients of pregnancy-induced hypertension by suppression subtractive hybridization
19
作者 尹国武 姜锋 +1 位作者 李东红 姚元庆 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2003年第4期F002-F002,217,共2页
Suppresssion subtractive hybridization (SSH) was preformed to compare gene expression profiles of PIH patients and normal pregnancy placentas. The subtractive cDNA library of PIH placenta was set up and screedned. Dif... Suppresssion subtractive hybridization (SSH) was preformed to compare gene expression profiles of PIH patients and normal pregnancy placentas. The subtractive cDNA library of PIH placenta was set up and screedned. Differential cDNAs were cloned, and sequenced by T 7 primer methodology. One hundred and three differential cDNAs were isolated by SSH. Sequencing and BLAST analysis showed 90 inserts shared more than 95% homolog with sequences in the GenBank/EMBL database. We identified 36 putative genes including pregnancy-specific glycoprotein gene (BC005924), serine protease inhibitor gene(BC012868), VEGFR-1 gene(AF063657, etc. 展开更多
关键词 PREGNANCY COMPLICATIONS hypertension PLACENTA gene expression profile SSH
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