-
题名扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析
被引量：5
- 1
-
-
作者
田浩楷
张帅
柳小龙
张志伟
赵莉蔺
-
机构
山西农业大学林学院
中国科学院动物研究所
中国农业科学院植物保护研究所
-
出处
《生物安全学报》
2017年第2期111-121,共11页
-
基金
林业公益性行业科研专项(201204501)
国家自然科学基金(31572272,31272323)
+2 种基金
中国科学院创新工程项目(KSCX2-EW-J-2)
中国科学院前沿科学重点研究项目(QYZDB-SSW-SMC014)
国家高技术研究发展计划(“863”计划:2014AA020529)
-
文摘
【目的】松材线虫作为林业重大外来入侵种,扩散型幼虫的形成对其传播扩散起着非常重要的作用,但扩散虫态的形成与维持机制尚未阐明。【方法】通过构建松材线虫数字基因表达谱(DGE),从滞育状态的维持、化学感受、代谢途径等方面分析松材线虫不同虫态的基因表达差异。【结果】参考松材线虫基因组数据,鉴定出2种扩散型幼虫(LⅢ,LⅣ)和繁殖型幼虫(Ln)各有11184、8533和10781个基因。相对于繁殖型虫态,大多数基因在LⅣ中下调表达,该虫态中特异上调表达的基因有化感受体基因、核受体基因以及一些代谢相关基因。推测这可能与扩散型线虫滞育状态的维持相关,并在其生理功能如化学感受和媒介/寄主互作中发挥作用。GO和Pathway富集分析显示,多数代谢相关通路在LⅣ中下调表达,而在LⅢ中的表达均活跃。【结论】以上结果与LⅣ处于不进食、总体代谢水平较低等生理状态的表型相一致。
-
关键词
松材线虫
扩散型虫态
数字基因表达谱
差异表达基因
-
Keywords
pinewood nematode
dispersal larva
digital gene expression
differential gene expression
-
分类号
S763.18
[农业科学—森林保护学]
-
