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芋扩展蛋白基因家族的全基因组鉴定及其在球茎膨大中的表达分析
被引量：
2
1
作者
李必聪
李慧英
+4 位作者
肖遥
罗莎
周庆红
黄英金
朱强龙
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第7期1604-1616,共13页
扩展蛋白是一类具有促进细胞壁伸长和增加细胞壁柔韧性作用的蛋白。本研究基于芋全基因组范围鉴定扩展蛋白基因,并分析该家族基因结构特征、系统发育及其在芋球茎膨大中的表达模式。结果表明,芋全基因组包含31个扩展蛋白基因,分布在芋8...
扩展蛋白是一类具有促进细胞壁伸长和增加细胞壁柔韧性作用的蛋白。本研究基于芋全基因组范围鉴定扩展蛋白基因,并分析该家族基因结构特征、系统发育及其在芋球茎膨大中的表达模式。结果表明,芋全基因组包含31个扩展蛋白基因,分布在芋8条染色体及2个重叠群上。在芋和拟南芥、水稻、马铃薯等4个物种中的扩展蛋白基因进行系统发育树分析中,所有的扩展蛋白基因划分到4个亚家族中,其中EXPA有23个,EXPB有5个,EXLA有1个,EXLB有2个。共线性分析表明,芋和拟南芥之间存在7对共线性扩展蛋白基因。基因表达分析发现,芋扩展蛋白基因家族不同成员在不同组织中有不同的表达模式,其中CeEXPA 2、CeEXPA 11、CeEXPA 13、CeEXPA 23和CeEXLA 1等5个基因在球茎膨大过程中高表达且差异显著,表明它们可能对芋球茎的膨大发挥了重要的调控作用。本研究结果将有助于了解芋扩展蛋白基因家族的特征及其在球茎膨大中的分子功能,为揭示芋球茎生长发育的分子调控机理提供理论依据。
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关键词
芋
扩展蛋白基因家族
球茎膨大
基因
表达分析
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职称材料
题名
芋扩展蛋白基因家族的全基因组鉴定及其在球茎膨大中的表达分析
被引量：
2
1
作者
李必聪
李慧英
肖遥
罗莎
周庆红
黄英金
朱强龙
机构
江西农业大学农学院
江西省薯芋生物学重点实验室
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第7期1604-1616,共13页
基金
国家自然科学基金(32060683)
江西省自然科学基金(20202ACBL215006)
+1 种基金
江西重点研发计划(20212BBF61001)
江西省人力资源和计会保障厅博士后科研择优资助项目(2021KY38)。
文摘
扩展蛋白是一类具有促进细胞壁伸长和增加细胞壁柔韧性作用的蛋白。本研究基于芋全基因组范围鉴定扩展蛋白基因,并分析该家族基因结构特征、系统发育及其在芋球茎膨大中的表达模式。结果表明,芋全基因组包含31个扩展蛋白基因,分布在芋8条染色体及2个重叠群上。在芋和拟南芥、水稻、马铃薯等4个物种中的扩展蛋白基因进行系统发育树分析中,所有的扩展蛋白基因划分到4个亚家族中,其中EXPA有23个,EXPB有5个,EXLA有1个,EXLB有2个。共线性分析表明,芋和拟南芥之间存在7对共线性扩展蛋白基因。基因表达分析发现,芋扩展蛋白基因家族不同成员在不同组织中有不同的表达模式,其中CeEXPA 2、CeEXPA 11、CeEXPA 13、CeEXPA 23和CeEXLA 1等5个基因在球茎膨大过程中高表达且差异显著,表明它们可能对芋球茎的膨大发挥了重要的调控作用。本研究结果将有助于了解芋扩展蛋白基因家族的特征及其在球茎膨大中的分子功能,为揭示芋球茎生长发育的分子调控机理提供理论依据。
关键词
芋
扩展蛋白基因家族
球茎膨大
基因
表达分析
Keywords
Colocasia esculenta
expansin gene family
corm expansion
gene expression analysis
分类号
S632.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芋扩展蛋白基因家族的全基因组鉴定及其在球茎膨大中的表达分析
李必聪
李慧英
肖遥
罗莎
周庆红
黄英金
朱强龙
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023
2
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