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梨小食心虫微卫星标记的扩增稳定性及多态性分析
被引量：
3
1
作者
郑燕
王康
+2 位作者
李玉婷
乔宪凤
陈茂华
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1335-1342,共8页
【目的】筛选适合我国梨小食心虫Grapholita molesta种群遗传学研究的微卫星位点,并依据所筛选的微卫星位点进行梨小食心虫地理种群的遗传多样性分析。【方法】利用欧洲梨小食心虫和苹果蠹蛾Cydia pomonella种群中已报道的11个微卫星位...
【目的】筛选适合我国梨小食心虫Grapholita molesta种群遗传学研究的微卫星位点,并依据所筛选的微卫星位点进行梨小食心虫地理种群的遗传多样性分析。【方法】利用欧洲梨小食心虫和苹果蠹蛾Cydia pomonella种群中已报道的11个微卫星位点,分析各位点在我国12个种群257头梨小食心虫样本中的扩增稳定性,再进行其多态性分析,筛选适合的位点,然后进行种群遗传多态性分析。【结果】在分析的11个微卫星位点中,位点Gm01,Gm03,Gm04和Cyd15无法稳定扩增;位点Gm05扩增成功率较低,位点Gm07遗传多态性较低;而位点Gm02,Gm06,Gm08,Gm09和Gm10等扩增效果稳定且遗传多态性丰富。这5个稳定扩增的微卫星位点平均等位基因数量（NA）为7.417~12.500,平均观察杂合度（Ho）为0.366~0.655,平均期望杂合度（He）为0.642~0.846,多态信息含量（PIC）为0.800~0.935。【结论】本研究成功筛选出位点Gm02,Gm06,Gm08,Gm09和Gm10等5个微卫星位点。基于这5个微卫星位点标记的结果显示,山东和陕西不同梨小食心虫地理种群均具有丰富的遗传多样性。这5个位点可以适用于我国梨小食心虫种群的进一步遗传分析研究。
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关键词
梨小食心虫
地理种群
微卫星位点
扩增稳定性
遗传多态性
无效等位基因
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职称材料
人类神经退行性疾病相关的三核苷酸重复DNA序列不稳定性机制研究进展
2
作者
吕柯孬
潘学峰
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期835-848,共14页
三核苷酸重复DNA序列扩增或缺失不稳定性与50多种人类神经退行性疾病有关。与疾病相关的三核苷酸重复拷贝数的增加或减少,影响了特定基因的表达,或因之产生具有细胞毒性的RNA和蛋白质已成为相关疾病的共有病理机制。现有的研究表明,疾...
三核苷酸重复DNA序列扩增或缺失不稳定性与50多种人类神经退行性疾病有关。与疾病相关的三核苷酸重复拷贝数的增加或减少,影响了特定基因的表达,或因之产生具有细胞毒性的RNA和蛋白质已成为相关疾病的共有病理机制。现有的研究表明,疾病相关的三核苷酸重复拷贝数的改变有可能起因于相关三核苷酸重复DNA序列的异常DNA复制、修复、重组以及基因转录。有关人类遗传学研究也提示,发生在疾病相关的三核苷酸重复DNA部位的异常DNA复制、修复、重组或基因转录确有可能在三核苷酸重复DNA不稳定过程中发挥着关键作用。本文根据本课题组的研究经验,综述了近年来有关疾病相关三核苷酸重复不稳定性机制的研究进展,包括碱基突变不稳定、重复单元的扩增和缺失不稳定,以助更好地理解疾病相关三核苷酸重复DNA序列不稳定性的分子机制。
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关键词
三核苷酸重复
不
稳定性
扩
增
R-环
非B型DNA二级结构
神经退行性疾病
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职称材料
我国粘虫种群的微卫星位点筛选及遗传多样性分析
被引量：
4
3
作者
李梅梅
李伯辽
+1 位作者
仵均祥
许向利
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期712-720,共9页
【目的】筛选适用于我国粘虫Mythimna separata种群遗传学研究的微卫星位点,从分子水平揭示粘虫种群的遗传多样性。【方法】利用已报道的微卫星标记及本实验室粘虫转录组测序的SSR序列,采用PCR产物荧光标记与自动扫描分型方法,分析各位...
【目的】筛选适用于我国粘虫Mythimna separata种群遗传学研究的微卫星位点,从分子水平揭示粘虫种群的遗传多样性。【方法】利用已报道的微卫星标记及本实验室粘虫转录组测序的SSR序列,采用PCR产物荧光标记与自动扫描分型方法,分析各位点在我国河南、陕西、山西3个省份的7个粘虫地理种群200头试虫中的扩增稳定性和多态性。【结果】7个粘虫地理种群有7个位点能稳定扩增且具有较高的多态性。这7个位点等位基因丰富度(Ar)为4.167~12.402,观测杂合度(Ho)平均为0.640,期望杂合度(He)平均为0.752,多态信息含量(PIC)为0.547~0.884;各位点均存在无效等位基因且偏离哈迪-温伯格平衡,所有成对位点不存在显著连锁不平衡情况。【结论】从来自河南、陕西、山西的7个不同粘虫地理种群中成功筛选了7个能稳定扩增的SSR位点,且在这7个不同的粘虫地理种群中均具有较高的多态性,可用于我国粘虫种群遗传结构研究。粘虫不同地理种群间基因交流频繁,基因交流阻止了由遗传漂变引起的群体间分化,不同地理种群间遗传分化很低甚至不存在遗传分化。
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关键词
粘虫
微卫星标记
扩增稳定性
遗传多样性
遗传分化
基因流
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职称材料
题名
梨小食心虫微卫星标记的扩增稳定性及多态性分析
被引量：
3
1
作者
郑燕
王康
李玉婷
乔宪凤
陈茂华
机构
西北农林科技大学植物保护学院
西北农林科技大学动物医学院
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1335-1342,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31071687)
瑞士联邦工学院和西北农林科技大学国际合作项目(317021101)
文摘
【目的】筛选适合我国梨小食心虫Grapholita molesta种群遗传学研究的微卫星位点,并依据所筛选的微卫星位点进行梨小食心虫地理种群的遗传多样性分析。【方法】利用欧洲梨小食心虫和苹果蠹蛾Cydia pomonella种群中已报道的11个微卫星位点,分析各位点在我国12个种群257头梨小食心虫样本中的扩增稳定性,再进行其多态性分析,筛选适合的位点,然后进行种群遗传多态性分析。【结果】在分析的11个微卫星位点中,位点Gm01,Gm03,Gm04和Cyd15无法稳定扩增;位点Gm05扩增成功率较低,位点Gm07遗传多态性较低;而位点Gm02,Gm06,Gm08,Gm09和Gm10等扩增效果稳定且遗传多态性丰富。这5个稳定扩增的微卫星位点平均等位基因数量（NA）为7.417~12.500,平均观察杂合度（Ho）为0.366~0.655,平均期望杂合度（He）为0.642~0.846,多态信息含量（PIC）为0.800~0.935。【结论】本研究成功筛选出位点Gm02,Gm06,Gm08,Gm09和Gm10等5个微卫星位点。基于这5个微卫星位点标记的结果显示,山东和陕西不同梨小食心虫地理种群均具有丰富的遗传多样性。这5个位点可以适用于我国梨小食心虫种群的进一步遗传分析研究。
关键词
梨小食心虫
地理种群
微卫星位点
扩增稳定性
遗传多态性
无效等位基因
Keywords
Grapholita molesta
geographic population
microsatellite loci
amplification stability
genetic polymorphism
null allele
分类号
Q969 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
人类神经退行性疾病相关的三核苷酸重复DNA序列不稳定性机制研究进展
2
作者
吕柯孬
潘学峰
机构
北京理工大学生命学院
河北大学医学院
河北大学化学与环境科学学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期835-848,共14页
基金
北京市自然科学基金(No.5132014)
河北省医学研究计划重点项目(No.20160051)资助。
文摘
三核苷酸重复DNA序列扩增或缺失不稳定性与50多种人类神经退行性疾病有关。与疾病相关的三核苷酸重复拷贝数的增加或减少,影响了特定基因的表达,或因之产生具有细胞毒性的RNA和蛋白质已成为相关疾病的共有病理机制。现有的研究表明,疾病相关的三核苷酸重复拷贝数的改变有可能起因于相关三核苷酸重复DNA序列的异常DNA复制、修复、重组以及基因转录。有关人类遗传学研究也提示,发生在疾病相关的三核苷酸重复DNA部位的异常DNA复制、修复、重组或基因转录确有可能在三核苷酸重复DNA不稳定过程中发挥着关键作用。本文根据本课题组的研究经验,综述了近年来有关疾病相关三核苷酸重复不稳定性机制的研究进展,包括碱基突变不稳定、重复单元的扩增和缺失不稳定,以助更好地理解疾病相关三核苷酸重复DNA序列不稳定性的分子机制。
关键词
三核苷酸重复
不
稳定性
扩
增
R-环
非B型DNA二级结构
神经退行性疾病
Keywords
trinucleotide repeats
expansion instability
RNA:DNA hybrids
non-B DNA secondary structure
neurode-generative disease
分类号
R741 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
我国粘虫种群的微卫星位点筛选及遗传多样性分析
被引量：
4
3
作者
李梅梅
李伯辽
仵均祥
许向利
机构
西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期712-720,共9页
基金
国家公益性行业(农业)科研专项(201403031)
国家"十三五"重点研发专项(2017YFD0201807)
文摘
【目的】筛选适用于我国粘虫Mythimna separata种群遗传学研究的微卫星位点,从分子水平揭示粘虫种群的遗传多样性。【方法】利用已报道的微卫星标记及本实验室粘虫转录组测序的SSR序列,采用PCR产物荧光标记与自动扫描分型方法,分析各位点在我国河南、陕西、山西3个省份的7个粘虫地理种群200头试虫中的扩增稳定性和多态性。【结果】7个粘虫地理种群有7个位点能稳定扩增且具有较高的多态性。这7个位点等位基因丰富度(Ar)为4.167~12.402,观测杂合度(Ho)平均为0.640,期望杂合度(He)平均为0.752,多态信息含量(PIC)为0.547~0.884;各位点均存在无效等位基因且偏离哈迪-温伯格平衡,所有成对位点不存在显著连锁不平衡情况。【结论】从来自河南、陕西、山西的7个不同粘虫地理种群中成功筛选了7个能稳定扩增的SSR位点,且在这7个不同的粘虫地理种群中均具有较高的多态性,可用于我国粘虫种群遗传结构研究。粘虫不同地理种群间基因交流频繁,基因交流阻止了由遗传漂变引起的群体间分化,不同地理种群间遗传分化很低甚至不存在遗传分化。
关键词
粘虫
微卫星标记
扩增稳定性
遗传多样性
遗传分化
基因流
Keywords
Mythimna separata
microsatellite marker
amplifying stability
genetic diversity
geneticdifferentiation
gene flow
分类号
Q969 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
梨小食心虫微卫星标记的扩增稳定性及多态性分析
郑燕
王康
李玉婷
乔宪凤
陈茂华
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
人类神经退行性疾病相关的三核苷酸重复DNA序列不稳定性机制研究进展
吕柯孬
潘学峰
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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下载PDF
职称材料
3
我国粘虫种群的微卫星位点筛选及遗传多样性分析
李梅梅
李伯辽
仵均祥
许向利
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
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