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萱草种质资源扩增片段长度多态性鉴别与分类的研究 Ⅱ.5个萱草材料的AFLP分析 被引量:11
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作者 于晓英 吴铁明 +3 位作者 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期76-77,共2页
为了快速准确地进行萱草种质鉴定 ,从 6 4对AFLP引物中随机选出了 3对引物组合 (即EcoRⅠAAC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAG) ,构建了 5个萱草种质的指纹图谱 .3对引物在 5个萱草材料中 2 0 5个位点上扩增出了条带 ... 为了快速准确地进行萱草种质鉴定 ,从 6 4对AFLP引物中随机选出了 3对引物组合 (即EcoRⅠAAC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAG) ,构建了 5个萱草种质的指纹图谱 .3对引物在 5个萱草材料中 2 0 5个位点上扩增出了条带 ,其中多态性条带 12 8个 ,占扩增条带总数的 6 2 .9% ,5个萱草材料具有较高的遗传多样性 ,并初步认为其中野生重瓣萱草可能来自于萱草H . 展开更多
关键词 萱草 种质资源 片段长度 多态性鉴别 鉴别分类
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四川地区鸡场产气荚膜梭菌的扩增片段长度多态性分析 被引量:3
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作者 曾东 郑晓丽 +1 位作者 倪学勤 Joshua Gong 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1103-1106,1123,共5页
目的了解四川部分地区10个规模化鸡场产气荚膜梭菌的基因型及遗传学关系。方法采用EcoRI、MseI酶对34株不同地区鸡场的产气荚膜梭菌分离株进行扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)分析。结果AFLP能全部区... 目的了解四川部分地区10个规模化鸡场产气荚膜梭菌的基因型及遗传学关系。方法采用EcoRI、MseI酶对34株不同地区鸡场的产气荚膜梭菌分离株进行扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)分析。结果AFLP能全部区别34株产气荚膜梭菌,辨别力指数为100%,其不同来源菌株呈现多态性分布。按Dice系数≥0.8,可分为19个AFLP基因亚型,AFLP-14为优势基因型,占总菌株数的20.59%。分析亚型分布情况表明,产气荚膜梭菌的流行特点与地区差异相关:不同鸡场产气荚膜梭菌的亚型差异明显;而同一鸡场的亚型较单一,以一种亚型为主,交叉有少数其他亚型。结论四川地区鸡场产气荚膜梭菌的基因型十分丰富,AFLP技术是其分子流行病学研究的有效手段。 展开更多
关键词 产气荚膜梭菌 基因分型 片段长度多态性
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谈扩增片段长度多态性分子标记技术 被引量:2
3
作者 刘广雷 瓮巧云 +1 位作者 姚志刚 王晓涛 《河北农业科学》 2010年第8期157-158,161,共3页
扩增片段长度多态性是1种在PCR技术和RFLP标记技术基础上产生的新的分子标记技术。简述了该分子标记技术的原理和优缺点,综述了该技术在遗传连锁图谱构建、遗传多样性研究、基因定位、分子辅助育种等方面的应用情况,并对其发展前景进行... 扩增片段长度多态性是1种在PCR技术和RFLP标记技术基础上产生的新的分子标记技术。简述了该分子标记技术的原理和优缺点,综述了该技术在遗传连锁图谱构建、遗传多样性研究、基因定位、分子辅助育种等方面的应用情况,并对其发展前景进行了展望。 展开更多
关键词 片段长度多态性 分子标记 应用
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利用扩增片段长度多态性(AFLP)研究坛紫菜的遗传变异 被引量:42
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作者 杨锐 刘必谦 +3 位作者 骆其君 王亚军 周湘池 戴继勋 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2002年第1期83-86,共4页
应用AFLP技术对浙江普陀列岛、渔山列岛和南麂列岛野生坛紫菜、福建野生厚型及薄型以及栽培坛紫菜的两个表型分化类型进行了研究。结果表明 :坛紫菜的遗传变异较为丰富 ,共记录了 5 2 8个位点 ,其中 16个为单态位点 ,其余的为多态位点 ... 应用AFLP技术对浙江普陀列岛、渔山列岛和南麂列岛野生坛紫菜、福建野生厚型及薄型以及栽培坛紫菜的两个表型分化类型进行了研究。结果表明 :坛紫菜的遗传变异较为丰富 ,共记录了 5 2 8个位点 ,其中 16个为单态位点 ,其余的为多态位点 ,多态位点比例达到 96 97%。其遗传距离与地域分布正相关 ,说明不同的环境因素可能是造成坛紫菜遗传变异的主要因素。对遗传距离进行UPGMA和Neighbor joining聚类分析表明具有薄型叶片性状的浙江野生坛紫菜和福建野生薄型坛紫菜聚合 ,而福建野生厚型与栽培具厚型叶片 ,当地俗称为木耳菜的样本聚合。该结果基本清楚地反映了坛紫菜表型特征的分化。栽培薄型叶片俗称鸡毛菜样本在不同聚类方法中分别于外侧并入不同的分支。在福建野生坛紫菜与养殖坛紫菜的AFLP图谱中仅发现了三条与叶片性状相关的谱带 :具有厚型叶片性状的坛紫菜共有的ACC CAA(10 0 )和ACT CAG(2 32 ) ,具有薄型叶性状的坛紫菜共有的ACC CAA(490 )。 展开更多
关键词 坛紫菜 AFLP 片段多态性 遗传变异 遗传距离 聚类分析 表型分化类型
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香蕉种质资源的扩增片段长度多态性鉴定与分类 被引量:17
5
作者 于晓英 张秋明 +3 位作者 易干军 霍合强 谭卫萍 李典范 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期206-210,共5页
为了建立一个准确、完善、统一的香蕉鉴别分类标准 ,促进香蕉种质资源的合理利用及新品种的选育与推广 ,于 2 0 0 0年 2至 12月在广东省农科院果树研究所对广州国家种质香蕉圃的 35份香蕉种质材料进行了AFLP分子标记 .结果表明 :1)引物E... 为了建立一个准确、完善、统一的香蕉鉴别分类标准 ,促进香蕉种质资源的合理利用及新品种的选育与推广 ,于 2 0 0 0年 2至 12月在广东省农科院果树研究所对广州国家种质香蕉圃的 35份香蕉种质材料进行了AFLP分子标记 .结果表明 :1)引物EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG对 35个香蕉材料进行选择性扩增后 ,共得到扩增位点 10 7个 ,其中多态性位点 84个 ,多态性位点比例达到 78.5 % ,对 35个材料的区分率达到10 0 % .2 )在引物对EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG构建的香蕉AFLP指纹图谱中 ,供试的35个香蕉材料都有差异带或特异带 ,滑蕉 ,龙选 ,东S 1,海红 ,泰国蕉等品种的特征带尤为明显 .3)根据基因组指纹图谱聚类分析 ,当相似系数达到 0 .88的水平 ,可将供试的 35个香蕉材料分为 7类 .4)几内亚、苹果以及阳江矮 3份种质材料实际上为同一个品种 . 展开更多
关键词 香蕉 种质资源 鉴别 片段长度多态性
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萱草种质资源扩增片段长度多态性鉴别与分类的研究Ⅰ.萱草DNA模板的制备 被引量:19
6
作者 于晓英 吴铁明 +3 位作者 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期41-43,共3页
为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获... 为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获得高分子量基因组 DNA和 AFL P指纹图谱 ,其中以幼叶的 DNA产量和品质最好 ,CTAB法提取的 展开更多
关键词 萱草 片段长度多态性 脱氧核糖核酸 种质资源 DNA模板
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大豆DNA扩增片段长度多态性(AFLP)研究 被引量:26
7
作者 田清震 盖钧镒 +1 位作者 喻德跃 贾继增 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期210-217,共8页
本文研究 AFLP技术在大豆上的应用 ,在改进大豆种子 DNA提取方法的基础上 ,比较同位素与银染检测方法的效果 ,筛选适宜于大豆 AFLP分析的酶切和引物组合 ,从而建立了适用于大豆指纹图谱快速鉴定的 AFL P操作程序 ,并对我国野生大豆和栽... 本文研究 AFLP技术在大豆上的应用 ,在改进大豆种子 DNA提取方法的基础上 ,比较同位素与银染检测方法的效果 ,筛选适宜于大豆 AFLP分析的酶切和引物组合 ,从而建立了适用于大豆指纹图谱快速鉴定的 AFL P操作程序 ,并对我国野生大豆和栽培大豆代表性材料进行了 展开更多
关键词 大豆 DNA提取 片段长度多态性(AFLP) 银染检测
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云南汉族人群D17S30位点扩增片段长度多态性 被引量:4
8
作者 欧炯文 邹浪萍 +3 位作者 李建京 申滨 韩晓华 赵永和 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1997年第2期11-14,共4页
应用PCR技术和小型聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法,对云南汉族人群D17S30位点扩增片段长度多态性进行了分析。在被检的105名无关个体中,共检出12个等位基因,41种基因型。等位基因频率范围在00048~02190之... 应用PCR技术和小型聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法,对云南汉族人群D17S30位点扩增片段长度多态性进行了分析。在被检的105名无关个体中,共检出12个等位基因,41种基因型。等位基因频率范围在00048~02190之间,杂合度为8381%,DP值为09647。观察的基因型分布符合Hardy-Weinberg定律。 展开更多
关键词 人类遗传学 D17S30位点 片段长度 多态性
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红花基因组扩增片段长度多态性反应体系的建立和优化 被引量:4
9
作者 张阵阵 郭美丽 张军东 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期327-330,共4页
目的:探讨影响红花扩增片段长度多态性(amp lified fragm ent length polymorph ism,AFLP)的各种因素,建立并优化红花AFLP反应体系,为研究红花品质性状的遗传基础及建立分子辅助标记育种的技术平台奠定基础。方法:CTAB法提取红花基因组D... 目的:探讨影响红花扩增片段长度多态性(amp lified fragm ent length polymorph ism,AFLP)的各种因素,建立并优化红花AFLP反应体系,为研究红花品质性状的遗传基础及建立分子辅助标记育种的技术平台奠定基础。方法:CTAB法提取红花基因组DNA,用Beckm an紫外可见分光光度计测定样品DNA浓度与纯度质量(D值);检测后分别进行一步法酶切与连接,或两步法酶切与连接,以检测哪种方法更适合;酶切连接产物设置不同的稀释倍数(5倍、10倍、15倍、20倍、25倍和30倍)进行预扩增,预扩增产物设置不同稀释倍数(10倍、25倍、50倍、75倍、100倍、150倍和200倍)进行选择性扩增;选择性扩增产物95℃变性8 m in后,用6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染检测。结果:本研究建立适用于红花的AFLP体系:用乙醇沉淀DNA,建立的模板不含PCR反应抑制剂及其他酶反应抑制剂,可被限制性内切酶M seⅠ和EcoRⅠ完全酶切;确定两步法进行酶切、连接,酶切时间为37℃3 h,连接16℃过夜,缓冲液采用NEB公司Buffer 2;预扩增产物最佳稀释倍数为25倍;选择性扩增最佳稀释倍数为75倍;上述建立的AFLP反应体系,PAGE电泳中主带清晰,没有降解。结论:本研究建立的反应体系适用于红花基因组DNA的AFLP研究。 展开更多
关键词 红花 基因组 植物 片段长度多态性
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中华鲟性别相关的扩增片段长度多态性分子标记筛选 被引量:3
10
作者 刘雪清 李莎 +4 位作者 肖衎 赵珣 郭柏福 陈磊 杜合军 《四川动物》 北大核心 2015年第5期714-718,共5页
性别鉴定是生产养殖和物种保护中常用的技术。中华鲟Acipenser sinensis是我国特有的一种大型海河洄游性鱼类,已极度濒危。由于中华鲟性成熟时间长,缺乏第二性征,基于外部特征难以进行性别鉴定,因此,筛选中华鲟性别特异性分子标记具有... 性别鉴定是生产养殖和物种保护中常用的技术。中华鲟Acipenser sinensis是我国特有的一种大型海河洄游性鱼类,已极度濒危。由于中华鲟性成熟时间长,缺乏第二性征,基于外部特征难以进行性别鉴定,因此,筛选中华鲟性别特异性分子标记具有重要意义。利用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记,用10条Eco R I-ANN引物和8条Mse I-CNN引物组成的80对引物,对9尾雄性和15尾雌性中华鲟个体进行PCR扩增和毛细管电泳荧光分型,检测其基因组DNA多态性,寻找与其性别相关的分子标记。在100~500 bp范围,共获得864个位点,其中具有多态性DNA位点411条,多态性位点比例为48.58%,并未发现雌雄特异性位点。但发现33个位点在雌雄个体中的比例存在较大差异,聚类分析显示大部分雄鱼聚为一支,雌鱼聚为一支,从而推断这些位点可能与中华鲟性别具有密切相关性。该研究首次尝试在中华鲟基因组中寻找性别特异性的AFLP分子标记,尽管未找到特异性标记,但这些数据为进一步研究中华鲟性别相关基因和性别决定机制奠定了基础。 展开更多
关键词 中华鲟 片段长度多态性 多态性位点 性别特异性标记
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扩增片段长度多态性的研究进展 被引量:4
11
作者 周晓梅 沈晋良 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2003年第3期185-190,共6页
扩增片段长度多态性(AFLP)是一种建立在PCR基础上的分子标记技术。近年来已广泛应用于遗传图谱构建、重要基因定位、遗传多样性分析、分子标记辅助育种及生物系统分类等方面的研究。本文对AFLP的原理、基本操作程序及其应用作了简要的... 扩增片段长度多态性(AFLP)是一种建立在PCR基础上的分子标记技术。近年来已广泛应用于遗传图谱构建、重要基因定位、遗传多样性分析、分子标记辅助育种及生物系统分类等方面的研究。本文对AFLP的原理、基本操作程序及其应用作了简要的描述。 展开更多
关键词 片段长度多态性 AFLP 分子标记 原理 操作程序 应用
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扩增片段长度多态性(AFLP)研究进展 被引量:11
12
作者 郭雄明 薛霞 陈华 《中国比较医学杂志》 CAS 2006年第6期369-372,共4页
扩增片段长度多态性(AFLP)是一种新的分子标记,被广泛应用于遗传结构、遗传距离测定、个体识别、纯度测定等领域,近年来其研究对象不断扩展,研究方法和检测技术不断改进,其在遗传多样性、种质鉴定、遗传图谱构建、基因定位和标记辅助育... 扩增片段长度多态性(AFLP)是一种新的分子标记,被广泛应用于遗传结构、遗传距离测定、个体识别、纯度测定等领域,近年来其研究对象不断扩展,研究方法和检测技术不断改进,其在遗传多样性、种质鉴定、遗传图谱构建、基因定位和标记辅助育种等研究中也得到了广泛的应用。 展开更多
关键词 多态性 片段长度
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扩增片段长度多态性(AFLP)在动物遗传育种中的应用进展 被引量:3
13
作者 赵静 单雪松 《家畜生态》 2004年第4期177-178,182,共3页
 AFLP是一种新的分子遗传标记技术,它结合了RFLP和PCR技术的优点,具有RFLP的稳定性和PCR的高效性,被称为"最有威力的分子遗传标记"或"下一代分子标记"。相对于国外而言,我国在这方面的研究还比较少。本文综述了扩...  AFLP是一种新的分子遗传标记技术,它结合了RFLP和PCR技术的优点,具有RFLP的稳定性和PCR的高效性,被称为"最有威力的分子遗传标记"或"下一代分子标记"。相对于国外而言,我国在这方面的研究还比较少。本文综述了扩增片段长度多态性(AFLP)这种遗传标记的原理、技术特点、技术发展及其在动物遗传多样性、种质鉴定、遗传图谱构建、基因定位和标记辅助育种等研究中的应用。 展开更多
关键词 AFLP 动物遗传育种 片段长度多态性 分子遗传标记 遗传图谱构建 标记辅助育种 种质鉴定 RFLP 遗传多样性 基因定位
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扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)技术基本涵义
14
作者 新博 《现代渔业信息》 2007年第6期30-30,共1页
本刊讯:扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)技术,该技术是由Vos等1995年建立的一项分子标记技术,其基本原理是选择性扩增带有人工接头的DNA酶切片段。因不同个体的DNA的酶切片段存在差异,从而产... 本刊讯:扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)技术,该技术是由Vos等1995年建立的一项分子标记技术,其基本原理是选择性扩增带有人工接头的DNA酶切片段。因不同个体的DNA的酶切片段存在差异,从而产生扩增片段的长度多态性。AFLP技术具有不需要预先知道被研究物种的基因组DNA序列信息, 展开更多
关键词 片段长度多态性 分子标记技术 基因组DNA 涵义 AFLP技术 酶切片段 选择性 人工接头
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扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术在鱼类遗传学研究中的应用
15
作者 天塔 《现代渔业信息》 2007年第2期31-31,共1页
随着扩增片段长度多态性分子标记技术的不断改进和深入研究,在鱼类遗传学研究中将会得到更广泛的应用,主要表现在以下几个方面:
关键词 片段长度多态性 分子标记技术 遗传学 应用 鱼类
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烟草品种识别方法──扩增片段长度多态性(AFLP~) 被引量:2
16
作者 LucaRossi 赵百东 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 1999年第4期5-5,共1页
关键词 烟草品种 长度多态性 识别方法 片段 AFLP 烤后烟叶 多态性标记 聚丙烯酰胺 遗传多型性 限制性内切酶
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扩增片段长度多态(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)是一种十分理想的分子标记技术
17
作者 钱治 《现代渔业信息》 2007年第2期31-31,共1页
扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)标记技术是Zabean和Vos等科学家发展起来的一种新的分子标记技术。于1993年获得欧洲专利局专利。它是继限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymo... 扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)标记技术是Zabean和Vos等科学家发展起来的一种新的分子标记技术。于1993年获得欧洲专利局专利。它是继限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)、随机扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)之后的第三代标记技术。 展开更多
关键词 片段长度多态性 分子标记技术 限制性片段长度多态性 随机多态性 理想 欧洲专利 科学家 DNA
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扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)基本原理和特点
18
作者 纳新 《现代渔业信息》 2007年第2期31-31,共1页
扩增片段长度多态性(AFLP)是建立在RFLP基础上的选择性聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction.PCR),它的基本原理是对基因组DNA进行限制性内切酶酶切,将人工合成的特定双链接头连在这些片段的两端,形成一个带接头的特异片段... 扩增片段长度多态性(AFLP)是建立在RFLP基础上的选择性聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction.PCR),它的基本原理是对基因组DNA进行限制性内切酶酶切,将人工合成的特定双链接头连在这些片段的两端,形成一个带接头的特异片段,用这些特异片段为扩增反应模板,通过接头序列和PCR引物3’一端选择性碱基的识别, 展开更多
关键词 片段长度多态性 原理 限制性内切酶酶切 聚合酶链反应 基因组DNA 特异片段 PCR引物 RFLP
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DNA多态性分析技术及其在蚕业上的应用 被引量:1
19
作者 周泽扬 鲁成 +1 位作者 夏庆友 向仲怀 《蚕学通讯》 1996年第4期16-20,共5页
现代分子生物学的迅猛发展,使整个生命科学研究发生了深刻的革命.由之而孕育出的以基因组DNA多态性分析为核心的分子标记(molecular marker)技术,使人们对于生物遗传差异的认识,由表型(产物)特征深入到了分子水平,产生了由现象到本质的... 现代分子生物学的迅猛发展,使整个生命科学研究发生了深刻的革命.由之而孕育出的以基因组DNA多态性分析为核心的分子标记(molecular marker)技术,使人们对于生物遗传差异的认识,由表型(产物)特征深入到了分子水平,产生了由现象到本质的飞跃.DNA多态性是指基因组DNA在漫长的生命繁演历程中所发生的自然突变(DNA片断的插入、缺失、重排或碱基置换)状况的差异性.这种差异反映了基因组的本质特征。 展开更多
关键词 DNA多态性 分析技术 基因组DNA 分子标记 多态性分析 限制性片段长度多态性(RFLP) 模板DNA 蚕业 限制性内切酶 遗传标记
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藻类rDNA特异性片段长度多态性在溺死鉴定中的应用 被引量:4
20
作者 袁文勇 汤晓蕙 +1 位作者 周顺平 俞卫东 《法医学杂志》 CAS CSCD 2018年第5期516-519,共4页
目的通过检验水体和人体器官中硅藻核糖体DNA(rDNA) 5.8S部分序列、第二内转录间隔区(second internal transcribed spacer,ITS2)序列(5.8S+ITS2)的长度多态性差异,判断溺水死亡案件中受害人的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被... 目的通过检验水体和人体器官中硅藻核糖体DNA(rDNA) 5.8S部分序列、第二内转录间隔区(second internal transcribed spacer,ITS2)序列(5.8S+ITS2)的长度多态性差异,判断溺水死亡案件中受害人的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水。方法以南京市公安局法医中心受理的2例硅藻检验鉴定案例为对象,利用5.8S+ITS2分子标记的长度多态性,分析藻类生物在水体、人体组织中种群结构的差异。结果案例1中,在受害人肺、肝组织和水体样本中均检出种类相近的硅藻,利用5.8S+ITS2分子标记在死者肺组织和水体样本中均检出330 bp和376 bp两种DNA片段,确定受害人系生前溺水。案例2中,在死者肺、肝组织中均未检出硅藻,利用5.8S+ITS2分子标记在死者肺组织中仅获得1条DNA片段,长度为331 bp,相对荧光单位值非常低,确定受害人系死后抛尸入水。结论本方法检验两案例的实验结果符合实际案情和硅藻镜检的结论,利用5.8S+ITS2分子标记研究水体和人体组织中特定微生物的种群结构差异,从而判断溺水死亡的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水等问题具有可行性。 展开更多
关键词 法医病理学 法医遗传学 硅藻类 DNA 核糖体 第二内转录间隔区 片段长度多态性分析 溺死
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