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萱草种质资源扩增片段长度多态性鉴别与分类的研究 Ⅱ.5个萱草材料的AFLP分析 被引量:11
1
作者 于晓英 吴铁明 +3 位作者 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期76-77,共2页
为了快速准确地进行萱草种质鉴定 ,从 6 4对AFLP引物中随机选出了 3对引物组合 (即EcoRⅠAAC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAG) ,构建了 5个萱草种质的指纹图谱 .3对引物在 5个萱草材料中 2 0 5个位点上扩增出了条带 ... 为了快速准确地进行萱草种质鉴定 ,从 6 4对AFLP引物中随机选出了 3对引物组合 (即EcoRⅠAAC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAG) ,构建了 5个萱草种质的指纹图谱 .3对引物在 5个萱草材料中 2 0 5个位点上扩增出了条带 ,其中多态性条带 12 8个 ,占扩增条带总数的 6 2 .9% ,5个萱草材料具有较高的遗传多样性 ,并初步认为其中野生重瓣萱草可能来自于萱草H . 展开更多
关键词 萱草 种质资源 片段长度 多态性鉴别 鉴别分类
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序列特异性引物扩增和限制性片段长度多态性分析检定HLA Ⅱ类抗原
2
作者 吴红瑛 《中国小儿血液》 1996年第6期272-274,共3页
序列特异性引物扩增和限制性片段长度多态性分析检定HLA Ⅱ类抗原吴红瑛综述兰炯采黄志光审校广州市第一军医大学南方医院儿科HLA基因位于人体第6对染色体短臂,是由一组密切连锁的复等位基因位点组成,是人类最高度多态性的遗... 序列特异性引物扩增和限制性片段长度多态性分析检定HLA Ⅱ类抗原吴红瑛综述兰炯采黄志光审校广州市第一军医大学南方医院儿科HLA基因位于人体第6对染色体短臂,是由一组密切连锁的复等位基因位点组成,是人类最高度多态性的遗传系统,其基因产物能在各种细胞表面... 展开更多
关键词 HLA 抗原 引物 限制片段长度 多态性
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利用扩增片段长度多态性(AFLP)研究坛紫菜的遗传变异 被引量:42
3
作者 杨锐 刘必谦 +3 位作者 骆其君 王亚军 周湘池 戴继勋 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2002年第1期83-86,共4页
应用AFLP技术对浙江普陀列岛、渔山列岛和南麂列岛野生坛紫菜、福建野生厚型及薄型以及栽培坛紫菜的两个表型分化类型进行了研究。结果表明 :坛紫菜的遗传变异较为丰富 ,共记录了 5 2 8个位点 ,其中 16个为单态位点 ,其余的为多态位点 ... 应用AFLP技术对浙江普陀列岛、渔山列岛和南麂列岛野生坛紫菜、福建野生厚型及薄型以及栽培坛紫菜的两个表型分化类型进行了研究。结果表明 :坛紫菜的遗传变异较为丰富 ,共记录了 5 2 8个位点 ,其中 16个为单态位点 ,其余的为多态位点 ,多态位点比例达到 96 97%。其遗传距离与地域分布正相关 ,说明不同的环境因素可能是造成坛紫菜遗传变异的主要因素。对遗传距离进行UPGMA和Neighbor joining聚类分析表明具有薄型叶片性状的浙江野生坛紫菜和福建野生薄型坛紫菜聚合 ,而福建野生厚型与栽培具厚型叶片 ,当地俗称为木耳菜的样本聚合。该结果基本清楚地反映了坛紫菜表型特征的分化。栽培薄型叶片俗称鸡毛菜样本在不同聚类方法中分别于外侧并入不同的分支。在福建野生坛紫菜与养殖坛紫菜的AFLP图谱中仅发现了三条与叶片性状相关的谱带 :具有厚型叶片性状的坛紫菜共有的ACC CAA(10 0 )和ACT CAG(2 32 ) ,具有薄型叶性状的坛紫菜共有的ACC CAA(490 )。 展开更多
关键词 坛紫菜 AFLP 片段多态性 遗传变异 遗传距离 聚类分析 表型分化类型
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香蕉种质资源的扩增片段长度多态性鉴定与分类 被引量:17
4
作者 于晓英 张秋明 +3 位作者 易干军 霍合强 谭卫萍 李典范 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期206-210,共5页
为了建立一个准确、完善、统一的香蕉鉴别分类标准 ,促进香蕉种质资源的合理利用及新品种的选育与推广 ,于 2 0 0 0年 2至 12月在广东省农科院果树研究所对广州国家种质香蕉圃的 35份香蕉种质材料进行了AFLP分子标记 .结果表明 :1)引物E... 为了建立一个准确、完善、统一的香蕉鉴别分类标准 ,促进香蕉种质资源的合理利用及新品种的选育与推广 ,于 2 0 0 0年 2至 12月在广东省农科院果树研究所对广州国家种质香蕉圃的 35份香蕉种质材料进行了AFLP分子标记 .结果表明 :1)引物EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG对 35个香蕉材料进行选择性扩增后 ,共得到扩增位点 10 7个 ,其中多态性位点 84个 ,多态性位点比例达到 78.5 % ,对 35个材料的区分率达到10 0 % .2 )在引物对EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG构建的香蕉AFLP指纹图谱中 ,供试的35个香蕉材料都有差异带或特异带 ,滑蕉 ,龙选 ,东S 1,海红 ,泰国蕉等品种的特征带尤为明显 .3)根据基因组指纹图谱聚类分析 ,当相似系数达到 0 .88的水平 ,可将供试的 35个香蕉材料分为 7类 .4)几内亚、苹果以及阳江矮 3份种质材料实际上为同一个品种 . 展开更多
关键词 香蕉 种质资源 鉴别 片段长度多态性
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萱草种质资源扩增片段长度多态性鉴别与分类的研究Ⅰ.萱草DNA模板的制备 被引量:19
5
作者 于晓英 吴铁明 +3 位作者 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期41-43,共3页
为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获... 为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获得高分子量基因组 DNA和 AFL P指纹图谱 ,其中以幼叶的 DNA产量和品质最好 ,CTAB法提取的 展开更多
关键词 萱草 片段长度多态性 脱氧核糖核酸 种质资源 DNA模板
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细胞色素P450酶1A2和2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联分析 被引量:11
6
作者 陈静 陆峥 +3 位作者 江三多 蔡军 钱伊萍 李霞 《上海精神医学》 2005年第2期95-98,共4页
目的探讨细胞色素P450酶(cytochromeP450enzymes,CYP)1A2、2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增技术及限制性片段长度多态性(RFLP)测定79例难治性抑郁症患者及107名正常对照者CYP1A2C163A、CYP2C19G681... 目的探讨细胞色素P450酶(cytochromeP450enzymes,CYP)1A2、2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增技术及限制性片段长度多态性(RFLP)测定79例难治性抑郁症患者及107名正常对照者CYP1A2C163A、CYP2C19G681A基因多态性。结果两组间基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=3.605,P>0.05;χ2=3.154,P>0.05)。难治性抑郁症患者对照组间基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=0.853,P>0.05;χ2=0.568,P>0.05)。79名患者中46名接受氟西汀合并小剂量利培酮(0.5~2.0mg/d)治疗,将其分为治疗有效组和无效组,两组间CYP1A2C163A(χ2=0.785,P>0.05;χ2=7.142,P>0.05)CYP2C19G681A(χ2=3.008,P>0.05;χ2=2.722,P>0.05)基因型及等位基因分布差异均无显著性。根据CYP2C19G681A基因多态性将患者分为无突变组(G/G型)和突变组(G/A型和A/A型),两组患者CYP1A2C163A基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=0.252,P>0.05;χ2=0.682,P>0.05)。结论CYP1A2C163A和CYP2C19G681A基因多态性与难治性抑郁症无显著关联,不是影响利培酮对氟西汀增效作用的主要因素。 展开更多
关键词 细胞色素P450酶 难治性抑郁症 基因多态性 关联分析 聚合酶链反应(PCR) CYP2C19 限制性片段长度多态性 P〉0.05 CYP1A2 抑郁症患者 分布差异 等位基因 显著性 基因型 正常对照 技术 方法应用 效作用 利培酮 氟西汀
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环介导恒温扩增技术研究进展 被引量:11
7
作者 郄春花 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期520-522,共3页
环介导恒温扩增技术(LAMP)是2000年由日本学者开发的一种新型核酸体外扩增技术。LAMP不仅广泛应用于细菌、病毒、寄生虫等病原微生物检测,而且可以进行单核苷酸多态性分析。LAMP具有灵敏度高、特异性好、可定量分析、反应时间短、操作... 环介导恒温扩增技术(LAMP)是2000年由日本学者开发的一种新型核酸体外扩增技术。LAMP不仅广泛应用于细菌、病毒、寄生虫等病原微生物检测,而且可以进行单核苷酸多态性分析。LAMP具有灵敏度高、特异性好、可定量分析、反应时间短、操作简单等优点,特别适合在基层实验室推广应用。随着LAMP技术的不断进展,其在标本前处理、引物设计、产物的特异性可视化检测方面也日臻完善。 展开更多
关键词 环介导恒温技术 即时检验 DNA芯片 单核苷酸多态性分析
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药物代谢酶CYP3A在中国肾移植人群的遗传多态性 被引量:8
8
作者 储小曼 闵佩清 +2 位作者 张静 孔诚 蔡卫民 《医学研究生学报》 CAS 2005年第2期107-111,共5页
目的:建立药物代谢酶CYP3A4、CYP3A5的多个等位基因分型方法,为进一步从基因水平研究CYP3A与机 体对药物反应的个体差异本质及其与药物代谢的相关性提供分子生物学实验方法;探讨药物代谢酶CYP3A在中 国肾移植人群的遗传多态性。 方... 目的:建立药物代谢酶CYP3A4、CYP3A5的多个等位基因分型方法,为进一步从基因水平研究CYP3A与机 体对药物反应的个体差异本质及其与药物代谢的相关性提供分子生物学实验方法;探讨药物代谢酶CYP3A在中 国肾移植人群的遗传多态性。 方法:用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性(PCR RFLP)法及特异性等位基因 扩增(PCR ASA)法分别建立了CYP3A的CYP3A4亚型三个新突变点(CYP3A4 4、 5、 6)及CYP3A5亚型的 CYP3A5 3基因分型方法,并对中国肾移植人群进行基因分型。 结果:CYP3A4 4、 5、 6、CYP3A5 3在中 国肾移植人群的基因频率分别为0.75%、0.76%、0.75%和27.83%;个体突变率分别为2/133、3/197、3/200和 55/115。 结论:研究结果提示,中国肾移植人群中CYP3A4 4、 5、 6、CYP3A5 3的存在可能使其表达的药 物代谢酶活性改变,从而影响药物在体内的代谢过程。 展开更多
关键词 CYP3A 基因多态性 药物代谢 特异性等位基因 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性
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西农萨能奶山羊CSN1S2基因多态与产奶量、体尺指标的相关分析 被引量:5
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作者 蓝贤勇 陈宏 +6 位作者 张润锋 田炎炎 张永德 房兴唐 孙维斌 雷初朝 胡沈荣 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期318-322,共5页
利用PCR2RFLP技术对69只西农萨能奶山羊的CSN1S2基因进行多态性分析。扩增产物为310bp的CSN1S2F基因片段,被Alw26I限制性内切酶消化后表现多态性。F等位基因为310bp,N等位基因为179和131bp,相应地,FF基因型为310bp,NF基因型为310,179和1... 利用PCR2RFLP技术对69只西农萨能奶山羊的CSN1S2基因进行多态性分析。扩增产物为310bp的CSN1S2F基因片段,被Alw26I限制性内切酶消化后表现多态性。F等位基因为310bp,N等位基因为179和131bp,相应地,FF基因型为310bp,NF基因型为310,179和131bp,NN基因型为179和131bp。在该群体中,F等位基因频率为010870,N等位基因频率为019130,处于Hardy2Weinberg平衡状态。将西农萨能奶山羊CSN1S2F基因座不同基因型与平均产奶量进行相关分析,结果表明:CSN1S2的不同基因型对平均产奶量有显著影响,NN基因型个体产奶量最高,FF基因型个体产奶量最低,且FF基因型个体平均产奶量显著低于NN基因型个体(P<0105)。将西农萨能奶山羊CSN1S2F基因座不同基因型与体尺指标进行相关分析,结果表明:在初生重和体高指标上,NF基因型个体显著优于NN基因型个体(P<0105);在体斜长和管围指标上,NF基因型个体略优于NN基因型个体,但差异不显著(P>0105);在成年体重和胸围指标上,不同的基因型个体间无差异。 展开更多
关键词 萨能奶山羊 相关分析 体尺指标 产奶量 基因多态 等位基因频率 RFLP技术 限制性内切酶 基因型 多态性分析 Hardy 基因片段 产物 平衡状态 基因座 个体 PCR FF 平均 初生重 体斜长 消化 体高 胸围 体重
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AFLP技术在鱼类种群分析中的应用 被引量:5
10
作者 孙冬芳 李永振 董丽娜 《南方水产》 2009年第6期71-75,共5页
文章介绍了扩增性片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术的原理和应用程序,概述了AFLP技术在鱼类种质资源、种群鉴别和地理分化及种群自我恢复能力等分析研究中的应用现状和应用前景。并期望AFLP种群分析技... 文章介绍了扩增性片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术的原理和应用程序,概述了AFLP技术在鱼类种质资源、种群鉴别和地理分化及种群自我恢复能力等分析研究中的应用现状和应用前景。并期望AFLP种群分析技术也将在鱼类洄游、捕捞量配额分配及生态学等研究中有重要应用。 展开更多
关键词 片段长度多态性 鱼类种群分析
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T-RFLP技术在厌氧氨氧化菌群结构分析中的应用 被引量:4
11
作者 储昭瑞 李相昆 +1 位作者 孟令威 张杰 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第2期26-30,共5页
为实现对样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析,提出一种基于末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)分析环境样品中厌氧氨氧化菌群结构的方法.通过对SILVA(R108)SSU Ref数据库中已知厌氧氨氧化菌16S rD-NA序列的模拟PCR和酶切分析,选... 为实现对样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析,提出一种基于末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)分析环境样品中厌氧氨氧化菌群结构的方法.通过对SILVA(R108)SSU Ref数据库中已知厌氧氨氧化菌16S rD-NA序列的模拟PCR和酶切分析,选取合适的PCR引物(Amx368f-Amx820r)和限制性内切酶(MspI和RsaI),使得不同厌氧氨氧化菌属对应不同末端片段长度(T-RFs),从而完成对厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析.重复性和灵敏性检验结果表明,该方法能够有效、稳定地应用于环境样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析. 展开更多
关键词 厌氧氨氧化 末端限制性片段长度多态性技术 菌群结构分析 模拟聚合酶链式反应 环境样品
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广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性的关系 被引量:1
12
作者 李舜法 黄建锋 +2 位作者 曾莹 焦紫南 崔炳权 《中国医药科学》 2015年第15期9-11,50,共4页
目的探讨广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性的关系。方法提取番禺汉族人群中非糖尿病的正常人和2型糖尿病患者的DNA,采用PCR-RFLP,分析对照组和T2DM组Preproghrelin基因rs96217位点的基因型及... 目的探讨广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性的关系。方法提取番禺汉族人群中非糖尿病的正常人和2型糖尿病患者的DNA,采用PCR-RFLP,分析对照组和T2DM组Preproghrelin基因rs96217位点的基因型及组间基因型、等位基因频率分布的差异。结果对照组116例样本中,CC 96例、AC 20例,AA 0例;基因型频率分别为:82.8%、17.2%、0。T2DM组118例样本中,CC 89例、AC 24例、AA 5例,基因型频率分别为:75.4%、20.3%、4.3%。组间基因型和等位基因频率差异无统计学意义。结论广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性之间未见显著相关性。但T2DM组中发现AA基因型,而对照组未显,原因有待进一步研究。 展开更多
关键词 Preproghrelin基因 单核苷酸多态性 2型糖尿病 聚合酶链反应-限制性片段长度多态分析技术
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中国葡萄酒产区酒酒球菌种质资源遗传多样性分析 被引量:2
13
作者 金刚 王华 +1 位作者 张昂 李华 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第17期134-139,共6页
为了解我国葡萄酒产区酒酒球菌种质资源遗传多样性,对22株筛选自我国不同葡萄酒产区的乳酸细菌进行了种特异性聚合酶链式反应(species-specific polymerase chain reaction,PCR)分析、16S r RNA序列分析和扩增片段长度多态性分析(amplif... 为了解我国葡萄酒产区酒酒球菌种质资源遗传多样性,对22株筛选自我国不同葡萄酒产区的乳酸细菌进行了种特异性聚合酶链式反应(species-specific polymerase chain reaction,PCR)分析、16S r RNA序列分析和扩增片段长度多态性分析(amplified fragment length polymorphism,AFLP)基因分型。种特异性PCR和16S r RNA序列分析表明22株分离株为酒酒球菌(Oenococcus oeni)。建立了O.oeni基于HindⅢ和MseⅠ为内切酶的AFLP分析体系,对16对引物组合进行了筛选,结果表明HT-MA、HT-MT、HT-MC、HG-MA、HG-MT、HC-MT为O.oeni AFLP分析的最佳引物组合,且实验重复性在98%以上。对O.oeni的AFLP分析结果显示:22株O.oeni分为3个簇群,且簇群间遗传相似性系数较小。所以,以HindⅢ和MseⅠ为内切酶的AFLP技术是研究O.oeni基因分型的有效方法,我国葡萄酒产区的O.oeni具有丰富的遗传多样性,O.oeni菌株间的遗传相似性系数不仅仅与其生态地理分布有关,可能还与其所处的微生态和其他因素有关。 展开更多
关键词 酒酒球菌 种特异性PCR 16S rRNA序列分析 扩增片段长度多态性分析技术
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68份国外甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析 被引量:11
14
作者 刘家勇 赵培方 +6 位作者 刘新龙 赵俊 杨昆 吴才文 应雄美 昝逢刚 陈学宽 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期466-470,共5页
采用10对扩增片段长度多态性标记(AFLP)引物,对近年来从澳大利亚、法国、美国和菲律宾引进,并保存于国家甘蔗种质资源圃的68份甘蔗种质资源进行遗传多样性研究。结果表明:68份种质间的遗传相似性系数较高,为0.497 5~0.887 9,平均为0.76... 采用10对扩增片段长度多态性标记(AFLP)引物,对近年来从澳大利亚、法国、美国和菲律宾引进,并保存于国家甘蔗种质资源圃的68份甘蔗种质资源进行遗传多样性研究。结果表明:68份种质间的遗传相似性系数较高,为0.497 5~0.887 9,平均为0.761 2,表明大部分种质之间亲缘关系相近,遗传基础相似,遗传多样性并不丰富;各类种质间的平均遗传相似性系数以VMC型(菲律宾)最大,为0.825,Q型(澳大利亚)和CP型(美国)次之,分别为0.802和0.752,FR型(法国)最小,为0.685;在相似性系数0.676处可将68份种质分为5组,A组含CP67–412,B组含FR94–515,C组含FR96–626,D组含FR94–126,其余64份种质构成E组,占全部种质数的94.1%,A、B、C、D组4份种质与E组种质相比,亲缘关系较远,显示了独特的遗传组成;来自法国的种质资源具有较高的分散度,包含了较多的遗传信息。 展开更多
关键词 甘蔗 国外种质 片段长度多态性 遗传多样性
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山核桃AFLP实验技术体系的建立 被引量:10
15
作者 郭金剑 池伟 +3 位作者 赵鑫珠 王丽 曾燕如 张秋月 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期532-537,共6页
以充分展开的山核桃Carya cathayensis嫩叶为材料,利用改良CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法与CTAB裂解-硅珠吸附法提取山核桃总DNA,对适合于山核桃叶片的AFLP(扩增片段长度多态性)分析体系进行了摸索。结果表明:"!改良CTAB法适用于... 以充分展开的山核桃Carya cathayensis嫩叶为材料,利用改良CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法与CTAB裂解-硅珠吸附法提取山核桃总DNA,对适合于山核桃叶片的AFLP(扩增片段长度多态性)分析体系进行了摸索。结果表明:"!改良CTAB法适用于从山核桃叶中提取高质量的DNA,提取的DNA可用于AFLP的分析;#"采用EcoR I/MseⅠ酶切组合,酶切连接一步法与两步法的效果没有明显的差异,但一步法操作更为简便;&%适合于山核桃叶AFLP分析的引物组合为E-ACT+M-CAT,E-ACT+M-CTG,E-ACG+M-CAT,E-ACG+M-CTG。扩增产物经60 g.L-1变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后进行银染,条带信号强度一致性好,条带分布均匀、清晰,分辨率较高。 展开更多
关键词 植物学 山核桃 DNA提取 片段长度多态性(AFLP)
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梅根系丛枝菌根真菌AFLP分析 被引量:6
16
作者 蔡邦平 陈俊愉 +3 位作者 张启翔 郭良栋 黄耀坚 王增福 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第S1期82-87,共6页
为了解决梅根系共生的丛枝菌根(AM)真菌难以应用形态学鉴定的问题,以巢式PCR的AFLP方法研究梅根系AM真菌DNA多态性。试验采集梅花期的根系样品,应用改良CTAB法提取总DNA,经纯化处理后,应用巢式PCR扩增根系AM真菌基因片段,进行AFLP分析... 为了解决梅根系共生的丛枝菌根(AM)真菌难以应用形态学鉴定的问题,以巢式PCR的AFLP方法研究梅根系AM真菌DNA多态性。试验采集梅花期的根系样品,应用改良CTAB法提取总DNA,经纯化处理后,应用巢式PCR扩增根系AM真菌基因片段,进行AFLP分析。结果表明,18个梅品种的30个根系样品中,仅有8个样品经巢式PCR后获得纯化的DNA片段,占试验样品数的26.7%;8个样品共得到指纹图谱带24条,各样品平均多态性位点数为3.0个,Nei’s基因多样性为0.4097±0.0848,Shannon信息指数为0.5968±0.0955;利用Nei’s遗传相似性系数聚类,梅品种根系内AMF基因组DNA的聚类类别与梅"品种群"这一分类级别无相关性。该试验为植物根系共生AM真菌DNA多态性研究提供了一种简便的技术。 展开更多
关键词 丛枝菌根真菌 巢式PCR 片段长度多态性
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栉孔扇贝×虾夷扇贝子一代杂种优势的RAPD分析 被引量:16
17
作者 滕丽莉 杨爱国 +3 位作者 赵峰 刘志鸿 周丽青 王清印 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期97-101,共5页
应用RAPD技术对栉孔扇贝×虾夷扇贝子一代的杂种优势进行了研究,对栉孔扇贝(C)、虾夷扇贝(P)及其正交F1(C♀×P♂)、反交F1(P♀×C♂)共4个群体的RAPD扩增带谱进行了分析.从40个随机引物中筛选出16个扩增带丰富的引物进行扩... 应用RAPD技术对栉孔扇贝×虾夷扇贝子一代的杂种优势进行了研究,对栉孔扇贝(C)、虾夷扇贝(P)及其正交F1(C♀×P♂)、反交F1(P♀×C♂)共4个群体的RAPD扩增带谱进行了分析.从40个随机引物中筛选出16个扩增带丰富的引物进行扩增,共得到l15条清晰稳定的扩增带,扩增片段大小在200~2000bp之间,其中有82个扩增位点具有多态性,多态性位点比率为71.3%.栉孔扇贝与正反交子代的相对遗传距离分别为0.0852和0.2886;虾夷扇贝与正反交子代的相对遗传距离分别为0.2327和0.0559,杂种子代与两亲本的遗传差异不是对等的,而是偏向各自的母本,系统树、Shannon多样性指数同样证明了这一点.两亲本群体内相似性指数分别为0.8392和0.8451,均大于正交子代的群体内相似性指数,而小于反交子代的群体内相似性指数,表明正交子代群体的遗传多样性水平升高,产生杂种优势;反交降低,未产生明显的杂种优势,与4个群体Shannon遗传多样性指数计算分析结果一致. 展开更多
关键词 杂种优势 虾夷扇贝 栉孔扇贝 RAPD分析 子一代 SHANNON多样性指数 相似性指数 RAPD技术 RAPD 遗传距离 多态性位点 遗传多样性 随机引物 片段 位点 遗传差异 分析结果 正反交 子代 正交 群体 系统树 体内 亲本
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混合花粉授粉茶树杂交F_1代AFLP分析 被引量:6
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作者 曾贞 罗军武 +3 位作者 杨阳 晏嫦妤 王旭 赵洋 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期719-723,共5页
应用AFLP技术,使用E0/M0预扩引物及5对选扩引物(E41/M42,E41/M55,E42/M34,E43/M42,E44/M33),对以槠叶齐、福鼎大白茶、白毫早、龙井43为父本,湘波绿为母本的混合花粉授粉茶树杂交F1代79个单株进行分析.聚类结果将混合花粉授粉杂交的4个... 应用AFLP技术,使用E0/M0预扩引物及5对选扩引物(E41/M42,E41/M55,E42/M34,E43/M42,E44/M33),对以槠叶齐、福鼎大白茶、白毫早、龙井43为父本,湘波绿为母本的混合花粉授粉茶树杂交F1代79个单株进行分析.聚类结果将混合花粉授粉杂交的4个父本完全分开,其F1代79个单株分别归于4个父本所在的类群里;遗传距离为0.085~0.83,表明茶树是高度杂合的,混合花粉授粉杂交后代各单株间的遗传变异大;混合花粉授粉可以提高茶树杂交的可孕性,改变亲本间的亲和力;茶树混合花粉授粉杂交比单一父本杂交F1代的分离度更大. 展开更多
关键词 茶树 混合花粉授粉法 片段长度多态性
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泥东风螺4个群体遗传多样性的AFLP分析 被引量:6
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作者 秦溱 王晓清 +4 位作者 曾志南 朱丹丽 熊钢 巫旗生 宁岳 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期299-304,共6页
利用AFLP分子标记方法对4个群体(福建连江野生、连江养殖、长乐养殖、广西野生)的泥东风螺进行遗传多样性分析。结果:用11对引物共扩增出908条有效片段,其中684条(75.33%)为多态性片段,224条片段(24.67%)为4个群体所共有... 利用AFLP分子标记方法对4个群体(福建连江野生、连江养殖、长乐养殖、广西野生)的泥东风螺进行遗传多样性分析。结果:用11对引物共扩增出908条有效片段,其中684条(75.33%)为多态性片段,224条片段(24.67%)为4个群体所共有;遗传多样性指数分析显示,4个群体的有效等位基因数、平均等位基因数、Shannon’s多样性指数和平均杂合度依次为1.5006、1.9740、0.4647、0.3034,Nei’s遗传距离为0.1284~0.1806,遗传相似系数为0.8348~0.8795,表明4个泥东风螺群体具有较为丰富的遗传多样性,且群体间具有较高的遗传相似性;分子方差分析(AMOVA)结果显示,4个群体中83.49%的变异来源于群体内,14.65%的变异来源于地区间,而群体间的遗传变异仅为1.86%,且4个群体间的遗传分化(GST)为0.1954,基因流(NM)为2.0586,说明群体间的基因交流水平较低;UPGMA聚类分析和主坐标(PCA)分析结果表明,长乐养殖群体和广西野生群体遗传距离最近,而连江野生群体与其他3个群体的遗传距离最远。 展开更多
关键词 泥东风螺 遗传多样性 遗传距离 片段长度多态性(AFLP)
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茶树AFLP—银染技术体系与品种指纹图谱的建立 被引量:4
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作者 黄建安 黄意欢 +3 位作者 罗军武 龚志华 刘仲华 欧秋良 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期427-430,共4页
通过对影响茶树AFLP—银染技术体系的关键因素作对比研究,建立了一套优化的茶树AFLP分子标记体系.应用该体系研究不同茶树品种的AFLP指纹,结果同一引物对不同品种扩增及不同引物对同一品种扩增都呈现出十分丰富的多态性,图谱清晰,分辨率高.
关键词 茶树 片段长度多态性 体系优化 指纹图谱
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