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单细胞TCR测序分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征
1
作者
宁可
高建龙
+1 位作者
马恩泽
朱晓
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1096-1101,共6页
目的:采用单细胞测序的方法,分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征,探讨其可能的发病机制。方法:利用NCBI数据库获得数据,设置对照组、进展组和康复组。使用RStudio、Origin、Hipliot和Excel软件对单细胞测序数据进行分析。...
目的:采用单细胞测序的方法,分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征,探讨其可能的发病机制。方法:利用NCBI数据库获得数据,设置对照组、进展组和康复组。使用RStudio、Origin、Hipliot和Excel软件对单细胞测序数据进行分析。结果:TCR在识别抗原和清除病毒的过程中发挥重要作用,免疫组库特征在不同感染时期有很大差异。细胞的克隆数量均超过26.92%。α链CDR3长度分布集中在14个氨基酸上,而β链集中在15个氨基酸上。V和J区基因片段使用频率不同,TRAV13-1、TRAJ20、TRBV20-1、TRBJ2-1等基因的使用频率差异有统计学意义(P<0.05)。进一步V-J基因组合分析显示,对照组和进展组、对照组和康复组的单链V-J对使用频率差异均有统计学意义(P<0.05)。对照组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV19-J34-TRBV4-1-J2-1,进展组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV12-1-J30-TRBV19-1-J2-1,康复组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV12-2-J52-TRBV7-9-J1-5。结论:本研究分析免疫组库T细胞的全局特征,有助于理解SARSCoV-2感染患者的发病机制,使患者在感染初期及时得到有效的治疗。
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关键词
T细胞受体
免疫组库
感染时期
全局特征
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职称材料
旋毛虫Ts43基因在各感染时期的转录水平上差异表达
2
作者
宋铭忻
路义鑫
+3 位作者
王守育
张子群
畅丹
韩彩霞
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2010年第1期36-37,共2页
关键词
感染时期
旋毛虫
差异表达
转录水平
骨骼肌细胞
基因
保姆细胞
CELL
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职称材料
油菜直播技术
被引量:
5
3
作者
黄丽霞
《湖南农业》
2018年第9期16-16,共1页
油菜直播是直接将油菜种子播到大田的一种种植方式,尤其在土壤黏重板结、秋旱严重等移栽成活率低的地区,适宜采用油菜直播。因为直播油菜播种较晚,所以在一定程度上避免了油菜病毒病和菌核病的主要感染时期。同移栽油菜相比,直播油菜具...
油菜直播是直接将油菜种子播到大田的一种种植方式,尤其在土壤黏重板结、秋旱严重等移栽成活率低的地区,适宜采用油菜直播。因为直播油菜播种较晚,所以在一定程度上避免了油菜病毒病和菌核病的主要感染时期。同移栽油菜相比,直播油菜具有根系发达、抗寒、抗旱、耐瘠、抗逆性强、抗倒伏能力强等特点。
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关键词
油菜种子
直播技术
直播油菜
移栽成活率
油菜病毒病
抗倒伏能力
种植方式
感染时期
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职称材料
通过治虫防水稻黑条矮缩病的策略探讨
被引量:
1
4
作者
林凌伟
董国堃
汪恩国
《湖北植保》
2001年第1期12-13,共2页
关键词
水稻
黑条矮缩病
传毒昆虫
灰飞虱
传染途径
感染时期
防治策略
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职称材料
题名
单细胞TCR测序分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征
1
作者
宁可
高建龙
马恩泽
朱晓
机构
哈尔滨师范大学计算机科学与信息工程学院
烟台大学计算机与控制工程学院
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1096-1101,共6页
基金
国家自然科学基金(61902094)
黑龙江省自然科学基金(QC2018082)。
文摘
目的:采用单细胞测序的方法,分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征,探讨其可能的发病机制。方法:利用NCBI数据库获得数据,设置对照组、进展组和康复组。使用RStudio、Origin、Hipliot和Excel软件对单细胞测序数据进行分析。结果:TCR在识别抗原和清除病毒的过程中发挥重要作用,免疫组库特征在不同感染时期有很大差异。细胞的克隆数量均超过26.92%。α链CDR3长度分布集中在14个氨基酸上,而β链集中在15个氨基酸上。V和J区基因片段使用频率不同,TRAV13-1、TRAJ20、TRBV20-1、TRBJ2-1等基因的使用频率差异有统计学意义(P<0.05)。进一步V-J基因组合分析显示,对照组和进展组、对照组和康复组的单链V-J对使用频率差异均有统计学意义(P<0.05)。对照组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV19-J34-TRBV4-1-J2-1,进展组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV12-1-J30-TRBV19-1-J2-1,康复组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV12-2-J52-TRBV7-9-J1-5。结论:本研究分析免疫组库T细胞的全局特征,有助于理解SARSCoV-2感染患者的发病机制,使患者在感染初期及时得到有效的治疗。
关键词
T细胞受体
免疫组库
感染时期
全局特征
Keywords
TCR
Immune repertoire
Infected stages
Global characteristics
分类号
Q812 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
旋毛虫Ts43基因在各感染时期的转录水平上差异表达
2
作者
宋铭忻
路义鑫
王守育
张子群
畅丹
韩彩霞
机构
东北农业大学动物医学学院
黑龙江出入境检验检疫局
出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2010年第1期36-37,共2页
基金
黑龙江省普通高等学校青年学术骨干支持计划项目(1153G007)
东北农业大学科学研究基金
国家科技支撑计划项目(2006BAD06A09)
关键词
感染时期
旋毛虫
差异表达
转录水平
骨骼肌细胞
基因
保姆细胞
CELL
分类号
S884.21 [农业科学—特种经济动物饲养]
S852.731 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
油菜直播技术
被引量:
5
3
作者
黄丽霞
机构
汉寿县农业局
出处
《湖南农业》
2018年第9期16-16,共1页
文摘
油菜直播是直接将油菜种子播到大田的一种种植方式,尤其在土壤黏重板结、秋旱严重等移栽成活率低的地区,适宜采用油菜直播。因为直播油菜播种较晚,所以在一定程度上避免了油菜病毒病和菌核病的主要感染时期。同移栽油菜相比,直播油菜具有根系发达、抗寒、抗旱、耐瘠、抗逆性强、抗倒伏能力强等特点。
关键词
油菜种子
直播技术
直播油菜
移栽成活率
油菜病毒病
抗倒伏能力
种植方式
感染时期
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
在线阅读
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职称材料
题名
通过治虫防水稻黑条矮缩病的策略探讨
被引量:
1
4
作者
林凌伟
董国堃
汪恩国
机构
浙江省临海市农科所
浙江省台州市农科所
浙江省临海市农技总站
出处
《湖北植保》
2001年第1期12-13,共2页
关键词
水稻
黑条矮缩病
传毒昆虫
灰飞虱
传染途径
感染时期
防治策略
分类号
S435.111.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单细胞TCR测序分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征
宁可
高建龙
马恩泽
朱晓
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
旋毛虫Ts43基因在各感染时期的转录水平上差异表达
宋铭忻
路义鑫
王守育
张子群
畅丹
韩彩霞
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2010
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
油菜直播技术
黄丽霞
《湖南农业》
2018
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
通过治虫防水稻黑条矮缩病的策略探讨
林凌伟
董国堃
汪恩国
《湖北植保》
2001
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
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