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藜麦ANT基因家族的鉴定及其在愈伤组织中的表达分析
1
作者
高爱红
张侠
+5 位作者
曹萌
安珂欣
尹海波
郭善利
张平
赵波
《山东农业科学》
北大核心
2025年第4期22-31,共10页
ANT/euANT(AINTEGUMENTA)是一类仅存在于植物中的APETALA2(AP2)型转录因子,隶属于AP2/EREBP家族。本研究利用藜麦基因组数据库,对藜麦ANT基因家族进行鉴定和生物信息学分析,并通过qRT-PCR分析藜麦ANT基因家族成员在不同愈伤组织与芽中...
ANT/euANT(AINTEGUMENTA)是一类仅存在于植物中的APETALA2(AP2)型转录因子,隶属于AP2/EREBP家族。本研究利用藜麦基因组数据库,对藜麦ANT基因家族进行鉴定和生物信息学分析,并通过qRT-PCR分析藜麦ANT基因家族成员在不同愈伤组织与芽中的表达。结果表明,在藜麦中共鉴定出13个含有两个AP2保守结构域的ANT基因家族成员,不均匀地分布在藜麦9条染色体上,根据在染色体上的位置将其分别命名为CqANT1—CqANT13。它们编码蛋白的氨基酸长度为244~710 aa,分子量为27.20~77.22 kDa,等电点为5.57~9.21,为不稳定的亲水蛋白,均定位于细胞核。基因共线性分析发现12个CqANT基因组成6对片段复制,未鉴定到串联复制事件。启动子顺式作用元件分析发现,藜麦ANT家族成员的启动子区含有多种激素和环境响应元件,暗示其参与调控藜麦的非生物胁迫及激素信号级联体调控应答等过程。其与双子叶植物拟南芥的ANT同源性较高;表达模式分析结果表明,藜麦ANT基因的表达具有组织特异性,并对非生物胁迫具有一定响应;藜麦ANT基因在发生芽和不同愈伤组织中均有一定的表达,说明其在芽与愈伤组织诱导和维持中发挥重要作用。本研究结果可为进一步揭示藜麦ANT基因的功能和调控机制提供依据。
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关键词
藜麦
ANT基因家族
生物信息学分析
愈伤组织表达
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职称材料
题名
藜麦ANT基因家族的鉴定及其在愈伤组织中的表达分析
1
作者
高爱红
张侠
曹萌
安珂欣
尹海波
郭善利
张平
赵波
机构
烟台大学生命科学学院
青岛农业大学草业学院
中藜盐地藜麦(东营)种业科技有限公司
出处
《山东农业科学》
北大核心
2025年第4期22-31,共10页
基金
山东省重点研发计划(农业良种工程品种培育)项目(2023LZGC011)
烟台市校地融合发展项目。
文摘
ANT/euANT(AINTEGUMENTA)是一类仅存在于植物中的APETALA2(AP2)型转录因子,隶属于AP2/EREBP家族。本研究利用藜麦基因组数据库,对藜麦ANT基因家族进行鉴定和生物信息学分析,并通过qRT-PCR分析藜麦ANT基因家族成员在不同愈伤组织与芽中的表达。结果表明,在藜麦中共鉴定出13个含有两个AP2保守结构域的ANT基因家族成员,不均匀地分布在藜麦9条染色体上,根据在染色体上的位置将其分别命名为CqANT1—CqANT13。它们编码蛋白的氨基酸长度为244~710 aa,分子量为27.20~77.22 kDa,等电点为5.57~9.21,为不稳定的亲水蛋白,均定位于细胞核。基因共线性分析发现12个CqANT基因组成6对片段复制,未鉴定到串联复制事件。启动子顺式作用元件分析发现,藜麦ANT家族成员的启动子区含有多种激素和环境响应元件,暗示其参与调控藜麦的非生物胁迫及激素信号级联体调控应答等过程。其与双子叶植物拟南芥的ANT同源性较高;表达模式分析结果表明,藜麦ANT基因的表达具有组织特异性,并对非生物胁迫具有一定响应;藜麦ANT基因在发生芽和不同愈伤组织中均有一定的表达,说明其在芽与愈伤组织诱导和维持中发挥重要作用。本研究结果可为进一步揭示藜麦ANT基因的功能和调控机制提供依据。
关键词
藜麦
ANT基因家族
生物信息学分析
愈伤组织表达
Keywords
Quinoa(Chenopodium quinoa)
ANT gene family
Bioinformatics analysis
Expression in callus tissue
分类号
S519 [农业科学—作物学]
Q781 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
藜麦ANT基因家族的鉴定及其在愈伤组织中的表达分析
高爱红
张侠
曹萌
安珂欣
尹海波
郭善利
张平
赵波
《山东农业科学》
北大核心
2025
0
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