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猪ACADL基因单核苷酸多态性及其与脂肪沉积性状的关联分析 被引量：2
1
作者 乔木 郭咪咪 +5 位作者 武华玉 吴俊静 王德才 刘贵生 梅书棋 彭先文 《湖北农业科学》 2018年第A02期161-163,共3页
分离、克隆了猪ACADL基因(Acyl-CoA dehydrogenase,long chain,长链酰基辅酶A脱氢酶),测序发现在猪ACADL基因内含子10存在两处单核苷酸多态(SNPs),并进行了单倍型分析,采用直接测序法在大白猪、长白猪和梅山猪群体中进行了基因分型,并... 分离、克隆了猪ACADL基因(Acyl-CoA dehydrogenase,long chain,长链酰基辅酶A脱氢酶),测序发现在猪ACADL基因内含子10存在两处单核苷酸多态(SNPs),并进行了单倍型分析,采用直接测序法在大白猪、长白猪和梅山猪群体中进行了基因分型,并与脂肪沉积性状进行了关联分析。结果表明,该单倍型与肩部膘厚、6-7腰椎间膘厚、臀部膘厚和背最长肌肌内脂肪含量等性状存在显著相关(P<0.05),与平均背膘厚存在极显著相关(P<0.01)。 展开更多
关键词 猪 ACADL基因 单核苷酸多态性 性状关联分析
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猪USF1基因的多态性及与生产性状的关联分析 被引量：1
2
作者 武华玉 乔木 +5 位作者 黄京书 刘贵生 彭先文 李良华 吴俊静 梅书棋 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第24期6064-6067,共4页
分离克隆了猪USF1基因第10内含子的序列,测序发现在130 bp处存在一T-C突变,引起Alu I酶切多态。利用PCR-RFLP方法对国内外4个猪种USF1基因第10内含子的多态性进行分析,在国外猪种中等位基因T的频率占优势;而在中国猪种中C等位基因的频... 分离克隆了猪USF1基因第10内含子的序列,测序发现在130 bp处存在一T-C突变,引起Alu I酶切多态。利用PCR-RFLP方法对国内外4个猪种USF1基因第10内含子的多态性进行分析,在国外猪种中等位基因T的频率占优势;而在中国猪种中C等位基因的频率占优势;在421头大梅F2代资源家系中进行性状关联分析发现该多态与瘦肥肉比例、屠宰率、平均背膘厚、眼肌宽、眼肌面积、背最长肌含水量显著相关(P<0.05),与瘦肉率、眼肌高极显著相关(P<0.01)。 展开更多
关键词 猪USF1基因 PCR—PFLP 性状关联分析
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猪MBF1基因的多态性及与生产性状的关联分析 被引量：1
3
作者 武华玉 程碧军 +5 位作者 乔木 刘贵生 吴俊静 李良华 彭先文 梅书棋 《湖北农业科学》 2016年第23期6192-6194,6287,共4页
分离克隆了猪MBF1基因第4外显子的序列,测序发现在18 bp处存在T/C突变,引起Taq I酶切多态。利用PCR-RFLP方法对国内外4个猪种MBF1基因第4外显子的多态性进行分析发现,在国外猪种中等位基因T的的频率占优势;在中国猪种中C等位基因的频率... 分离克隆了猪MBF1基因第4外显子的序列,测序发现在18 bp处存在T/C突变,引起Taq I酶切多态。利用PCR-RFLP方法对国内外4个猪种MBF1基因第4外显子的多态性进行分析发现,在国外猪种中等位基因T的的频率占优势;在中国猪种中C等位基因的频率占优势;在437头大梅F2代资源家系中进行性状关联分析发现该多态与瘦肉率、板油重、肩部背膘厚、眼肌高、眼肌宽、眼肌面积显著相关(P<0.05)。 展开更多
关键词 猪MBF1基因 PCR-PFLP 多态性 性状关联分析
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猪RTL1基因多态性及其与胴体、肉质性状的关联分析 被引量：1
4
作者 乔木 程碧军 +5 位作者 武华玉 胡华 吴俊静 刘贵生 梅书棋 彭先文 《湖北农业科学》 2017年第20期3948-3951,共4页
旨在研究反转录转座子1基因(retrotransposon-like-1,RTL1)潜在的变异与猪胴体和肉质性状的相关性。测序发现在猪RTL1基因编码区1 209 bp处存在G/A突变,利用PCR-Fnu4H I-RFLP方法在9个猪种中进行了基因分型,并且在360头大白猪×梅山... 旨在研究反转录转座子1基因(retrotransposon-like-1,RTL1)潜在的变异与猪胴体和肉质性状的相关性。测序发现在猪RTL1基因编码区1 209 bp处存在G/A突变,利用PCR-Fnu4H I-RFLP方法在9个猪种中进行了基因分型,并且在360头大白猪×梅山猪F2代群体中进行性状关联分析。结果表明,该位点与皮率、内脂率、6-7腰椎间膘厚、胸腰椎间膘厚、背最长肌pH、股二头肌肌肉色值呈显著相关(P<0.05),与骨率、肩部膘厚、臀部膘厚、平均背膘厚、背最长肌失水率、背最长肌系水力、背最长肌肌肉色值呈极显著相关(P<0.01)。 展开更多
关键词 猪 RTL1基因 单核苷酸多态性 性状关联分析
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马铃薯Y病毒多基因系统发育分析及其在株系鉴定中的应用 被引量：6
5
作者 邹文超 沈林林 +3 位作者 沈建国 蔡伟 詹家绥 高芳銮 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期918-929,共12页
为实现马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)常见株系的快速鉴定,本文以PVY的P1、HC-pro、VPg和CP 4个基因为研究对象建立了快速准确的多基因联合体系。根据基因的不同组合建立5个不同数据集,分别进行系统发育分析,并通过贝叶斯标签关联显著... 为实现马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)常见株系的快速鉴定,本文以PVY的P1、HC-pro、VPg和CP 4个基因为研究对象建立了快速准确的多基因联合体系。根据基因的不同组合建立5个不同数据集,分别进行系统发育分析,并通过贝叶斯标签关联显著性(Bayesian tip-association significance,Ba TS)分析各数据集中代表分离物与株系的关联性,以确定实现PVY快速鉴定的最佳组合。不同数据集的系统发育及Ba TS分析结果显示,除了联合P1、VPg和CP 3个基因数据集外,其他4个数据集均无法实现PVY常见株系的准确鉴定。采用不同建树方法对联合P1、VPg和CP 3个基因数据集比较分析显示,基于ML法和NJ法的系统发育树在拓扑结构上基本一致,均优于基于贝叶斯算法的最大分支置信(maximum clade credibility,MCC)树。同时,以HLJ26分离物为研究对象,对建立的多基因联合体系进行实际应用,结果显示该分离物与PVY^(NTN-NW)株系的3个分离物SYR-Ⅱ-2-8、SYR-Ⅱ-Be1和SYR-Ⅱ-Dr H以高置信值聚为一亚簇,表明该分离物可能属于PVY^(NTN-NW)株系(SYR-Ⅱ型)。重组分析显示,HLJ26基因组存在4个潜在的重组信号,分别位于P1、HC-pro/P3、VPg和CP的5￠-末端,与PVY^(NTN-NW)株系(SYR-Ⅱ型)的重组位点相一致,表明其属于PVYNTN-NW株系(SYR-Ⅱ型)。同时,应用多重RT-PCR成功扩增出约为1000 bp和400 bp的2个特异性片段,与PVY^(NTN-NW)株系(SYR-Ⅱ型)的特异条带大小相一致。这些结果进一步支持了多基因联合体系的鉴定结果。联合P1、VPg和CP 3个基因数据集系统发育分析,可以实现PVY常见株系的准确鉴定。 展开更多
关键词 马铃薯Y病毒 多基因系统发育分析 系统发育与性状关联分析 SYR-Ⅱ型
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SSR分子标记在杜鹃花属植物中的研究进展 被引量：1
6
作者 姚姚 张浩 +2 位作者 王秀云 夏宜平 周泓 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第3期405-418,共14页
杜鹃花是中国十大名花之一,观赏价值极高,深受人们喜爱。杜鹃花属内物种数量多、种间自然杂交频繁、部分种类园艺化程度很高,且品种命名不统一,使得国家和地区间的品种交流受到一定影响。SSR标记在种质鉴定、遗传多样性分析、分子标记... 杜鹃花是中国十大名花之一,观赏价值极高,深受人们喜爱。杜鹃花属内物种数量多、种间自然杂交频繁、部分种类园艺化程度很高,且品种命名不统一,使得国家和地区间的品种交流受到一定影响。SSR标记在种质鉴定、遗传多样性分析、分子标记辅助育种等方面具有优势。本文综述了近20年来SSR标记在杜鹃花属植物中的研究进展。目前,利用各类生物数据库信息、二代测序技术,及其他方法开发杜鹃花属SSR标记共约509对,部分标记在近缘物种中的引物通用性在50%到100%不等。在杜鹃花属物种保护方面,SSR标记被应用于物种保护策略研究、交配系统研究和基因交流研究,为物种遗传多样性保护提供科学依据。SSR标记还被应用于杜鹃花属杂交后代真实性鉴定和性状-标记关联分析等方面,在叶片褪绿和花色等性状上展开研究。对未来SSR标记的应用前景进行了展望,在以杜鹃花属濒危物种为重点大力开发属内SSR标记、开展重要性状关联辅助育种、构建DNA指纹图谱加强品种鉴定等方面深入研究,以期为杜鹃花属植物的研究、保护和遗传育种提供参考。 展开更多
关键词 微卫星 物种保护 遗传多样性 杂交后代鉴定 性状-标记关联分析
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加工番茄品质性状的鉴定指标和筛选方法 被引量：4
7
作者 韩泽群 姜波 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第16期3812-3816,共5页
确定加工番茄(Lycopersicon esculentum Mill)果实特殊性状的鉴定指标,为筛选具有较好特殊性状番茄品种的亲本种质资源提供决策支持。通过2012年新疆吉木萨尔县庆阳湖乡试验田的22种(系)加工番茄的品比试验,分析、测定了17项农艺性状,... 确定加工番茄(Lycopersicon esculentum Mill)果实特殊性状的鉴定指标,为筛选具有较好特殊性状番茄品种的亲本种质资源提供决策支持。通过2012年新疆吉木萨尔县庆阳湖乡试验田的22种(系)加工番茄的品比试验,分析、测定了17项农艺性状,依据灰色育种理论,采用目标性状灰色关联分析法对加工番茄的产量性状、营养性状、风味品质、加工贮运品质这4个特殊目标性状进行分析。结果表明,可溶性固形物含量与其他农艺性状的关联序为平均分枝数>横径>平均产量>纵径>果形指数=生育期>总酸含量>色差>平均幅宽>单果重>糖酸比>平均株高>总糖含量>番茄红素含量>病毒病抗性>单果耐压力;番茄红素含量与其他农艺性状的关联序为平均株高>总糖含量>平均幅宽>总酸含量>色差>生育期>糖酸比>单果重>平均产量>平均分枝数>果形指数>横径>纵径>病毒病抗性>可溶性固形物含量>单果耐压力;糖酸比与其他农艺性状的关联序为总糖含量>平均幅宽>单果重>色差>生育期>平均株高>果形指数>纵径>平均产量>横径>总酸含量>番茄红素含量>平均分枝数>可溶性固形物含量>病毒病抗性>单果耐压力;单果耐压力与其他农艺性状的关联序为番茄红素含量>平均株高>病毒病抗性>总糖含量>糖酸比>平均幅宽>色差>生育期>总酸含量>单果重>平均产量>果形指数>纵径>平均分枝数>横径>可溶性固形物含量。在选育特殊性状(高产、营养佳、良好风味、耐贮运)的加工番茄品种时,应高度关注与这些特殊性状(可溶性固形物含量、番茄红素含量、糖酸比、单果耐压力)关联度大的农艺性状,并兼顾关联度低的其他农艺性状是否满足选种要求。 展开更多
关键词 加工番茄(Lycopersicon ESCULENTUM Mill) 特殊性状 目标性状灰色关联分析法 选种 育种
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团头鲂低氧耐受相关SNPs标记的开发 被引量：8
8
作者 陈柏湘 王伟峰 +1 位作者 王卫民 王焕岭 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期23-29,共7页
为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育,利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据,进行SNPs位点的开发和鉴定,获得52 623个可能的SNPs位点,其中碱基转换和颠换型位点分别占57.4%(30 192个)和31.9%(16 802个);同义SNPs... 为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育,利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据,进行SNPs位点的开发和鉴定,获得52 623个可能的SNPs位点,其中碱基转换和颠换型位点分别占57.4%(30 192个)和31.9%(16 802个);同义SNPs占编码区总SNPs的99.7%,非同义SNPs仅有32～35个;使用PCR-RFLP技术对筛选出的5个非同义的多态性SNPs进行耐低氧性状关联分析。结果显示,Plin2-A1157G和Hif-3α-A2917G位点的SNPs在团头鲂亲本群体中与低氧耐受性状显著相关,但在子代群体中却与低氧耐受性状无显著相关性。这说明亲代中筛选出的分子标记并不一定适用于子代群体,在利用分子标记辅助育种时需要考虑标记在子代中的有效性。 展开更多
关键词 团头鲂 低氧 SNP 性状关联分析
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作物灰色育种理论在杂交黑麦草新品系筛选中的应用 被引量：11
9
作者 陈奥 龙明秀 +1 位作者 张维 马文文 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期102-107,共6页
根据作物灰色育种学的理论和方法,对黑麦草(Loliumspp.)杂交F4代8个品系的单株产量、株高、分蘖数、有效分蘖率、茎粗、叶宽、叶长、茎叶比、生育期、初花期净光合作用速率进行目标性状灰色关联分析,并在此基础上,对黑麦草杂交F4代8个... 根据作物灰色育种学的理论和方法,对黑麦草(Loliumspp.)杂交F4代8个品系的单株产量、株高、分蘖数、有效分蘖率、茎粗、叶宽、叶长、茎叶比、生育期、初花期净光合作用速率进行目标性状灰色关联分析,并在此基础上,对黑麦草杂交F4代8个品系进行灰色多维综合评估。结果表明:黑麦草单株鲜重与分蘖数(r=0.7968)、茎粗(r=0.7472)、叶长(r=0.7116)关联度最高;茎叶比与有效分蘖率(r=0.7631)、株高(r=0.7468)关联度较高;而初花期净光合作用速率与叶宽(r=0.8431)和生育期(r=0.8264)关联最为密切。可根据育种目标,对与目标性状关联度较高的性状进行针对性选择。F4_5(卓越×百盛)、F4_6(多福×卓越)、F4_8(百盛×多福)3个杂交新品系综合性状最好,综合评估关联度分别为0.8582,0.7527和0.7340。 展开更多
关键词 杂交品系筛选 作物灰色育种 目标性状灰色关联分析 灰色多维综合评估 黑麦草
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