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基于生物信息学研究性别决定区Y框4在肝细胞癌中的表达及临床意义
被引量：
4
1
作者
汪宇
谢燕婷
+1 位作者
王毅州
夏勇
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期975-980,共6页
目的研究性别决定区Y框4(SOX4)在肝细胞癌组织中的表达及其与肝细胞癌临床病理特征和预后的关系。方法采用生物信息学方法分析、挖掘肿瘤基因公共数据库,研究SOX4基因在肝细胞癌中的差异表达,分析SOX4基因表达与肝细胞癌临床病理特征的...
目的研究性别决定区Y框4(SOX4)在肝细胞癌组织中的表达及其与肝细胞癌临床病理特征和预后的关系。方法采用生物信息学方法分析、挖掘肿瘤基因公共数据库,研究SOX4基因在肝细胞癌中的差异表达,分析SOX4基因表达与肝细胞癌临床病理特征的关系;采用Kaplan-Meier法分析SOX4基因表达与肝细胞癌患者预后的关系;通过基因集富集分析(GSEA)探索肝细胞癌中SOX4基因相关的生物学过程和信号通路。结果SOX4 mRNA在肝细胞癌组织中的表达水平高于癌旁组织(P<0.01),且与肝细胞癌的肿瘤分期和肿瘤大小有关(P<0.01,P<0.05)。SOX4低表达组肝细胞癌患者的总生存期和无复发生存期均长于SOX4高表达组患者(P均<0.01),且在不同的肝细胞癌分期亚组中均呈现相同的预后趋势。多因素Cox回归分析结果表明SOX4基因表达水平是肝细胞癌患者的独立预后因素(P<0.01)。SOX4基因主要通过调控DNA复制、肌醇需求酶1介导的未折叠蛋白反应、有丝分裂细胞周期阻滞、肿瘤蛋白p53活性和Wnt信号通路等在肝细胞癌中发挥致癌基因作用。结论SOX4基因在肝细胞癌组织中表达增加,与肝细胞癌患者的不良预后有关。
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关键词
肝细胞癌
性别决定区y框4
生物信息学
预后
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职称材料
转录因子SOX4调控Beclin1介导的自噬对小细胞肺癌细胞行为的影响
2
作者
韩忠诚
马丽丽
+1 位作者
苏莹
柳江
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025年第4期684-691,共8页
目的探究性别决定区Y框转录因子4(SOX4)调控自噬对小细胞肺癌(SCLC)细胞的影响及机制。方法小干扰RNA(siRNA)介导敲低人SCLC细胞系NCI-H446细胞中的SOX4。RT-qPCR和Western blot检测转染siRNA后NCI-H446细胞中SOX4的表达。细胞实验分为...
目的探究性别决定区Y框转录因子4(SOX4)调控自噬对小细胞肺癌(SCLC)细胞的影响及机制。方法小干扰RNA(siRNA)介导敲低人SCLC细胞系NCI-H446细胞中的SOX4。RT-qPCR和Western blot检测转染siRNA后NCI-H446细胞中SOX4的表达。细胞实验分为对照组、si-SOX4组、si-SOX4+oe-Beclin1组、oe-Beclin1组。Western blot检测各分组细胞中微管相关蛋白1轻链3(LC3)-II/LC3-Ⅰ的表达之比、Beclin1及p62的表达。荧光素酶报告基因实验和染色质免疫共沉淀PCR(ChIP-PCR)实验检测SOX4对Beclin1的转录调控作用。CCK-8法检测各分组细胞增殖能力。流式细胞术检测各分组细胞凋亡率。Transwell实验检测分组细胞迁移与侵袭能力。结果与对照组或si-NC组比较,si-SOX4组NCI-H446细胞中SOX4 mRNA和蛋白表达下调(P<0.05),LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ蛋白表达比率和Beclin1蛋白表达下降(P<0.05),p62蛋白表达升高(P<0.05)。si-SOX4组的Beclin1 WT相对荧光素酶活性低于si-NC组(P<0.05);Anti-SOX4组中Beclin1启动子相对富集程度高于Anti-IgG组(P<0.05)。与对照组比较,si-SOX4组NCI-H446细胞增殖活性降低、细胞凋亡率增加、迁移数目和侵袭数目也减少(P<0.05);与si-SOX4组比较,si-SOX4+oe-Beclin1组NCI-H446细胞中LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ蛋白表达比率和Beclin1蛋白表达升高、p62蛋白表达下降,同时NCI-H446细胞增殖活性升高、细胞凋亡率减少、迁移数目和侵袭数目也增加(P<0.05)。结论下调SOX4通过抑制Beclin1表达来抑制自噬,降低NCI-H446细胞增殖活性,抑制细胞迁移与侵袭。
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关键词
小细胞肺癌
性别
决定
区
y
框
转录因子4
自噬
增殖
迁移
侵袭
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职称材料
题名
基于生物信息学研究性别决定区Y框4在肝细胞癌中的表达及临床意义
被引量：
4
1
作者
汪宇
谢燕婷
王毅州
夏勇
机构
海军军医大学(第二军医大学)东方肝胆外科医院肝外四科
出处
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期975-980,共6页
基金
上海市卫生健康委员会课题(2018BR34)。
文摘
目的研究性别决定区Y框4(SOX4)在肝细胞癌组织中的表达及其与肝细胞癌临床病理特征和预后的关系。方法采用生物信息学方法分析、挖掘肿瘤基因公共数据库,研究SOX4基因在肝细胞癌中的差异表达,分析SOX4基因表达与肝细胞癌临床病理特征的关系;采用Kaplan-Meier法分析SOX4基因表达与肝细胞癌患者预后的关系;通过基因集富集分析(GSEA)探索肝细胞癌中SOX4基因相关的生物学过程和信号通路。结果SOX4 mRNA在肝细胞癌组织中的表达水平高于癌旁组织(P<0.01),且与肝细胞癌的肿瘤分期和肿瘤大小有关(P<0.01,P<0.05)。SOX4低表达组肝细胞癌患者的总生存期和无复发生存期均长于SOX4高表达组患者(P均<0.01),且在不同的肝细胞癌分期亚组中均呈现相同的预后趋势。多因素Cox回归分析结果表明SOX4基因表达水平是肝细胞癌患者的独立预后因素(P<0.01)。SOX4基因主要通过调控DNA复制、肌醇需求酶1介导的未折叠蛋白反应、有丝分裂细胞周期阻滞、肿瘤蛋白p53活性和Wnt信号通路等在肝细胞癌中发挥致癌基因作用。结论SOX4基因在肝细胞癌组织中表达增加,与肝细胞癌患者的不良预后有关。
关键词
肝细胞癌
性别决定区y框4
生物信息学
预后
Keywords
hepatocellular carcinoma
sex-determining region
y
-box
4
bioinformatics
prognosis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
转录因子SOX4调控Beclin1介导的自噬对小细胞肺癌细胞行为的影响
2
作者
韩忠诚
马丽丽
苏莹
柳江
机构
新疆维吾尔自治区人民医院肿瘤科
出处
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025年第4期684-691,共8页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(编号:2023D01C67)。
文摘
目的探究性别决定区Y框转录因子4(SOX4)调控自噬对小细胞肺癌(SCLC)细胞的影响及机制。方法小干扰RNA(siRNA)介导敲低人SCLC细胞系NCI-H446细胞中的SOX4。RT-qPCR和Western blot检测转染siRNA后NCI-H446细胞中SOX4的表达。细胞实验分为对照组、si-SOX4组、si-SOX4+oe-Beclin1组、oe-Beclin1组。Western blot检测各分组细胞中微管相关蛋白1轻链3(LC3)-II/LC3-Ⅰ的表达之比、Beclin1及p62的表达。荧光素酶报告基因实验和染色质免疫共沉淀PCR(ChIP-PCR)实验检测SOX4对Beclin1的转录调控作用。CCK-8法检测各分组细胞增殖能力。流式细胞术检测各分组细胞凋亡率。Transwell实验检测分组细胞迁移与侵袭能力。结果与对照组或si-NC组比较,si-SOX4组NCI-H446细胞中SOX4 mRNA和蛋白表达下调(P<0.05),LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ蛋白表达比率和Beclin1蛋白表达下降(P<0.05),p62蛋白表达升高(P<0.05)。si-SOX4组的Beclin1 WT相对荧光素酶活性低于si-NC组(P<0.05);Anti-SOX4组中Beclin1启动子相对富集程度高于Anti-IgG组(P<0.05)。与对照组比较,si-SOX4组NCI-H446细胞增殖活性降低、细胞凋亡率增加、迁移数目和侵袭数目也减少(P<0.05);与si-SOX4组比较,si-SOX4+oe-Beclin1组NCI-H446细胞中LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ蛋白表达比率和Beclin1蛋白表达升高、p62蛋白表达下降,同时NCI-H446细胞增殖活性升高、细胞凋亡率减少、迁移数目和侵袭数目也增加(P<0.05)。结论下调SOX4通过抑制Beclin1表达来抑制自噬,降低NCI-H446细胞增殖活性,抑制细胞迁移与侵袭。
关键词
小细胞肺癌
性别
决定
区
y
框
转录因子4
自噬
增殖
迁移
侵袭
Keywords
small cell lung cancer
sex-determining region
y
-box transcription factor
4
autophag
y
proliferation
migration
invasion
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学研究性别决定区Y框4在肝细胞癌中的表达及临床意义
汪宇
谢燕婷
王毅州
夏勇
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
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下载PDF
职称材料
2
转录因子SOX4调控Beclin1介导的自噬对小细胞肺癌细胞行为的影响
韩忠诚
马丽丽
苏莹
柳江
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025
0
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