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基于SRAP分子标记的贵州5种忍冬属药用植物遗传多样性分析
被引量：
3
1
作者
潘绿昌
赵致
+4 位作者
何云
李园园
刘红昌
俸婷婷
周英
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第12期2349-2355,共7页
【目的】分析贵州5种忍冬属药用植物的遗传多样性,为忍冬属药用植物鉴定、良种筛选及开发利用提供理论依据。【方法】采集贵州6份忍冬属药用植物材料的嫩芽为试验材料,采用SRAP分子标记研究其遗传多样性,并利用NTSYS-pc2.1计算各材料间...
【目的】分析贵州5种忍冬属药用植物的遗传多样性,为忍冬属药用植物鉴定、良种筛选及开发利用提供理论依据。【方法】采集贵州6份忍冬属药用植物材料的嫩芽为试验材料,采用SRAP分子标记研究其遗传多样性,并利用NTSYS-pc2.1计算各材料间的遗传相似系数,利用UPGMA进行聚类分析。【结果】从154对SRAP引物组合中筛选出15对重复性好、条带清晰、多态性丰富,且扩增条带(100～1000 bp)数目≥5的引物组合。15对SRAP引物共扩增出197条带,其中178条为多态性条带,多态性条带比率为90.36%,平均每对引物扩增11.87条多态性条带。引物组合Me8-Em10扩增的多态性条带数最多(16条);引物组合Me2-Em2扩增的多态性条带最少(8条);引物组合Me4-Em2扩增条带数为15条,均为多态性条带,但从5种忍冬属药用植物的扩增条带数不同。聚类分析结果显示,6份忍冬属药用植物材料间遗传相似系数为0.4213～0.8477,平均0.5672;其中,野生忍冬与栽培忍冬间遗传相似系数最大(0.8477),二者亲缘关系最近,灰毡毛忍冬与野生忍冬遗传相似系数最小(0.4213),二者亲缘关系最远。在遗传相似系数0.4873处,6份忍冬属药用植物分为两大类,第Ⅰ类包括灰毡毛忍冬、红腺忍冬和黄褐毛忍冬,均为山银花的基源植物;第Ⅱ类包括野生忍冬、栽培忍冬和红白忍冬,均为金银花的基源植物。【结论】贵州5种忍冬属药用植物具有丰富的遗传多样性,SRAP分子标记能有效分析其遗传多样性及亲缘关系,其引物组合Me4-Em2可用于鉴别5种忍冬属药用植物。
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关键词
忍冬属药用植物
SRAP分子标记
遗传多样性
遗传相似系数
聚类分析
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题名
基于SRAP分子标记的贵州5种忍冬属药用植物遗传多样性分析
被引量：
3
1
作者
潘绿昌
赵致
何云
李园园
刘红昌
俸婷婷
周英
机构
贵州大学农学院/贵州省药用植物繁育与种植重点实验室
贵州省药食同源植物资源开发工程技术研究中心
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第12期2349-2355,共7页
基金
贵州省社会攻关计划项目(黔科合[2016]支撑2909)
贵州省药用植物繁育与种植人才基地项目(黔人领发[2013]15)
贵州省生物学一流学科建设项目(GNYL[2017]009)
文摘
【目的】分析贵州5种忍冬属药用植物的遗传多样性,为忍冬属药用植物鉴定、良种筛选及开发利用提供理论依据。【方法】采集贵州6份忍冬属药用植物材料的嫩芽为试验材料,采用SRAP分子标记研究其遗传多样性,并利用NTSYS-pc2.1计算各材料间的遗传相似系数,利用UPGMA进行聚类分析。【结果】从154对SRAP引物组合中筛选出15对重复性好、条带清晰、多态性丰富,且扩增条带(100～1000 bp)数目≥5的引物组合。15对SRAP引物共扩增出197条带,其中178条为多态性条带,多态性条带比率为90.36%,平均每对引物扩增11.87条多态性条带。引物组合Me8-Em10扩增的多态性条带数最多(16条);引物组合Me2-Em2扩增的多态性条带最少(8条);引物组合Me4-Em2扩增条带数为15条,均为多态性条带,但从5种忍冬属药用植物的扩增条带数不同。聚类分析结果显示,6份忍冬属药用植物材料间遗传相似系数为0.4213～0.8477,平均0.5672;其中,野生忍冬与栽培忍冬间遗传相似系数最大(0.8477),二者亲缘关系最近,灰毡毛忍冬与野生忍冬遗传相似系数最小(0.4213),二者亲缘关系最远。在遗传相似系数0.4873处,6份忍冬属药用植物分为两大类,第Ⅰ类包括灰毡毛忍冬、红腺忍冬和黄褐毛忍冬,均为山银花的基源植物;第Ⅱ类包括野生忍冬、栽培忍冬和红白忍冬,均为金银花的基源植物。【结论】贵州5种忍冬属药用植物具有丰富的遗传多样性,SRAP分子标记能有效分析其遗传多样性及亲缘关系,其引物组合Me4-Em2可用于鉴别5种忍冬属药用植物。
关键词
忍冬属药用植物
SRAP分子标记
遗传多样性
遗传相似系数
聚类分析
Keywords
medicinal plants of Lonicera L.
SRAP molecular marker
genetic diversity
genetic similarity coefficient
cluster analysis
分类号
S567.790.24 [农业科学—中草药栽培]
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作者
出处
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被引量
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1
基于SRAP分子标记的贵州5种忍冬属药用植物遗传多样性分析
潘绿昌
赵致
何云
李园园
刘红昌
俸婷婷
周英
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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