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HTCLOSE:快速挖掘微阵列数据集中的频繁闭合模式
1
作者
缪裕青
金波
陈国良
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2008年第2期274-278,共5页
由于微阵列数据集行(样本)少列(基因)多的特征,使得采用传统列枚举方法对其进行频繁闭合模式挖掘较为困难.基于行枚举方法,提出超链接结构HT-struct,并基于该结构提出频繁闭合模式挖掘新算法HTCLOSE.算法采用深度优先搜索策略,结合高效...
由于微阵列数据集行(样本)少列(基因)多的特征,使得采用传统列枚举方法对其进行频繁闭合模式挖掘较为困难.基于行枚举方法,提出超链接结构HT-struct,并基于该结构提出频繁闭合模式挖掘新算法HTCLOSE.算法采用深度优先搜索策略,结合高效的修剪技术和巧妙的链表组织技术,在时间和空间上均得到了优化.实验表明,HTCLOSE算法通常快于行枚举算法CARPENTER.
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关键词
数据
挖掘
关联规则
频繁闭合模式
微阵列数据集
生物信息学
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职称材料
MFCPLG:微阵列数据中频繁闭合模式挖掘
被引量:
1
2
作者
金波
缪裕青
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第16期50-52,55,共4页
微阵列数据集行少列多的特征,使得传统基于列枚举空间的算法应用于其中进行频繁闭合模式挖掘时其复杂性迅速增长。基于行枚举的CARPENTER算法较好解决了该问题。但CARPENTER算法使用映射转置表(TT)来完成频繁闭合模式完全集的挖掘效率...
微阵列数据集行少列多的特征,使得传统基于列枚举空间的算法应用于其中进行频繁闭合模式挖掘时其复杂性迅速增长。基于行枚举的CARPENTER算法较好解决了该问题。但CARPENTER算法使用映射转置表(TT)来完成频繁闭合模式完全集的挖掘效率不高。该文在CARPENTER算法基础上,提出LG-tree数据结构,并基于此结构提出挖掘频繁闭合模式的新算法MFCPLG。真实数据集的实验表明,MFCPLG算法的时间性能优于CARPENTER算法。
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关键词
微阵列数据集
频繁闭合模式
MFCPLG
LG-tree
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职称材料
题名
HTCLOSE:快速挖掘微阵列数据集中的频繁闭合模式
1
作者
缪裕青
金波
陈国良
机构
中国科学技术大学计算机科学与技术系
桂林电子科技大学计算机系
出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2008年第2期274-278,共5页
基金
国家自然科学基金重点项目(60533020)资助
文摘
由于微阵列数据集行(样本)少列(基因)多的特征,使得采用传统列枚举方法对其进行频繁闭合模式挖掘较为困难.基于行枚举方法,提出超链接结构HT-struct,并基于该结构提出频繁闭合模式挖掘新算法HTCLOSE.算法采用深度优先搜索策略,结合高效的修剪技术和巧妙的链表组织技术,在时间和空间上均得到了优化.实验表明,HTCLOSE算法通常快于行枚举算法CARPENTER.
关键词
数据
挖掘
关联规则
频繁闭合模式
微阵列数据集
生物信息学
Keywords
data mining
association rules
frequent closed pattern
microarray dataset
bioinformatics
分类号
TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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职称材料
题名
MFCPLG:微阵列数据中频繁闭合模式挖掘
被引量:
1
2
作者
金波
缪裕青
机构
桂林电子科技大学计算机系
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第16期50-52,55,共4页
文摘
微阵列数据集行少列多的特征,使得传统基于列枚举空间的算法应用于其中进行频繁闭合模式挖掘时其复杂性迅速增长。基于行枚举的CARPENTER算法较好解决了该问题。但CARPENTER算法使用映射转置表(TT)来完成频繁闭合模式完全集的挖掘效率不高。该文在CARPENTER算法基础上,提出LG-tree数据结构,并基于此结构提出挖掘频繁闭合模式的新算法MFCPLG。真实数据集的实验表明,MFCPLG算法的时间性能优于CARPENTER算法。
关键词
微阵列数据集
频繁闭合模式
MFCPLG
LG-tree
Keywords
microarray dataset
frequent closed patterns
MFCPLG
LG-tree
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HTCLOSE:快速挖掘微阵列数据集中的频繁闭合模式
缪裕青
金波
陈国良
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2008
0
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职称材料
2
MFCPLG:微阵列数据中频繁闭合模式挖掘
金波
缪裕青
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2007
1
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职称材料
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参考文献
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