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TPPP2基因在保山猪睾丸中的表达、转录调控及潜在的生物学作用机制
1
作者
翟兰
席学敏
+6 位作者
常勇诚
赵加鼎
富国文
徐世雄
龚绍荣
赵桂英
霍金龙
《福建农林大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第3期325-334,共10页
【目的】研究保山猪睾丸组织TPPP2基因的基本生物学特性及多个组织TPPP2基因的表达水平,为进一步解析TPPP2基因在保山猪中的作用机制提供依据。【方法】通过全转录组测序分析不同月龄保山猪睾丸TPPP2基因的表达量,构建TPPP2 mRNA与miRNA...
【目的】研究保山猪睾丸组织TPPP2基因的基本生物学特性及多个组织TPPP2基因的表达水平,为进一步解析TPPP2基因在保山猪中的作用机制提供依据。【方法】通过全转录组测序分析不同月龄保山猪睾丸TPPP2基因的表达量,构建TPPP2 mRNA与miRNA、lncRNA的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,分析TPPP2的氨基酸同源性及蛋白互作网络,对TPPP2的互作蛋白进行GO、KEGG富集分析,并将获得的互作蛋白与转录组测序所获得的基因表达量进行关联性分析。【结果】TPPP2基因编码序列(CDS)全长516 bp,位于猪第7号染色体上,有4个外显子和3个内含子;蛋白质功能分析发现,TPPP2有171个氨基酸,具有疏水性,含有磷酸化位点;系统进化、同源性和临近基因分析显示,保山猪的TPPP2与多个物种的聚类符合分类学标准,相似度均超过80%,且具有较高保守性的相邻基因。蛋白互作分析显示,TPPP2与OAZ3、NME8蛋白的互作较为密切。KEGG富集分析显示,这些互作蛋白主要富集在T细胞受体信号、鞘脂信号和mRNA监视等通路上。GO富集分析发现,这些蛋白主要富集在精子鞭毛运动、精子DNA凝结、精子能动性、精子核分化等条目上。TPPP2基因受3个miRNA(ssc-miR-150、ssc-miR-205、ssc-miR-222)靶向调控。qPCR检测显示:TPPP2基因在保山猪15个组织中呈现差异表达现象,且在睾丸中的表达量最高;睾丸中TPPP2基因的表达量随着保山猪月龄的增大逐渐上调。【结论】获得了保山猪睾丸组织TPPP2基因的分子特征、蛋白质结构及相互作用转录调控网络,揭示了TPPP2在睾丸中的高表达水平,表明TPPP2基因在猪精子发生中发挥着重要作用。
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关键词
微管蛋白聚合促进蛋白家族成员2
猪
分子结构
蛋白
特征
转录调控
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题名
TPPP2基因在保山猪睾丸中的表达、转录调控及潜在的生物学作用机制
1
作者
翟兰
席学敏
常勇诚
赵加鼎
富国文
徐世雄
龚绍荣
赵桂英
霍金龙
机构
云南农业大学动物科学技术学院
云南省保山市保山猪研究所
云南农业大学动物医学院
出处
《福建农林大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第3期325-334,共10页
基金
云南省科技厅重大科技专项(202302AE090016)
云南省科技厅重点研发项目(2018BB003)
+1 种基金
云南省施甸县保山猪产业科技特派团项目(202304BI090010)
云南省财政厅科教文化专项(A3032022211)。
文摘
【目的】研究保山猪睾丸组织TPPP2基因的基本生物学特性及多个组织TPPP2基因的表达水平,为进一步解析TPPP2基因在保山猪中的作用机制提供依据。【方法】通过全转录组测序分析不同月龄保山猪睾丸TPPP2基因的表达量,构建TPPP2 mRNA与miRNA、lncRNA的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,分析TPPP2的氨基酸同源性及蛋白互作网络,对TPPP2的互作蛋白进行GO、KEGG富集分析,并将获得的互作蛋白与转录组测序所获得的基因表达量进行关联性分析。【结果】TPPP2基因编码序列(CDS)全长516 bp,位于猪第7号染色体上,有4个外显子和3个内含子;蛋白质功能分析发现,TPPP2有171个氨基酸,具有疏水性,含有磷酸化位点;系统进化、同源性和临近基因分析显示,保山猪的TPPP2与多个物种的聚类符合分类学标准,相似度均超过80%,且具有较高保守性的相邻基因。蛋白互作分析显示,TPPP2与OAZ3、NME8蛋白的互作较为密切。KEGG富集分析显示,这些互作蛋白主要富集在T细胞受体信号、鞘脂信号和mRNA监视等通路上。GO富集分析发现,这些蛋白主要富集在精子鞭毛运动、精子DNA凝结、精子能动性、精子核分化等条目上。TPPP2基因受3个miRNA(ssc-miR-150、ssc-miR-205、ssc-miR-222)靶向调控。qPCR检测显示:TPPP2基因在保山猪15个组织中呈现差异表达现象,且在睾丸中的表达量最高;睾丸中TPPP2基因的表达量随着保山猪月龄的增大逐渐上调。【结论】获得了保山猪睾丸组织TPPP2基因的分子特征、蛋白质结构及相互作用转录调控网络,揭示了TPPP2在睾丸中的高表达水平,表明TPPP2基因在猪精子发生中发挥着重要作用。
关键词
微管蛋白聚合促进蛋白家族成员2
猪
分子结构
蛋白
特征
转录调控
Keywords
tubulin polymerization promoting protein family member
2
swine
molecular structure
protein characteristics
transcriptional regulation
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
TPPP2基因在保山猪睾丸中的表达、转录调控及潜在的生物学作用机制
翟兰
席学敏
常勇诚
赵加鼎
富国文
徐世雄
龚绍荣
赵桂英
霍金龙
《福建农林大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
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