应用cDNA微矩阵基因芯片筛选运动性心肌肥大相关基因的初步研究 被引量：23

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作者 田振军 张志琪 +2 位作者 唐量 郭进 刘健 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期122-126,共5页

目的 :应用cDNAchip(cDNA芯片或微矩阵基因芯片 )技术筛选运动性心肌肥大相关基因。方法 :摘取运动组和对照组小鼠心脏 ,按一步法抽提总RNA并纯化mRNA ,将 2 30 4个点包括10 3个阴性及对照基因和 2 2 0 1条小鼠靶基因的PCR扩增产物 ,按... 目的 :应用cDNAchip(cDNA芯片或微矩阵基因芯片 )技术筛选运动性心肌肥大相关基因。方法 :摘取运动组和对照组小鼠心脏 ,按一步法抽提总RNA并纯化mRNA ,将 2 30 4个点包括10 3个阴性及对照基因和 2 2 0 1条小鼠靶基因的PCR扩增产物 ,按微矩阵 (12× 12点× 16亚矩阵 ,点间距离 375 μm)点制于硅烷化玻片上 ,制备成cDNA芯片。将等量抽提纯化的运动组和对照组小鼠心肌组织mRNA ,分别与掺入的荧光分子Cy3和Cy5经逆转录合成cDNA荧光探针 ,混合后再与cD NA芯片杂交 ,通过芯片扫描仪对荧光信号图像进行扫描 ,经计算机分析比较运动组和安静对照组心肌组织中基因表达谱的变化。结果 :在 2 2 0 1条待研究基因中 ,两组小鼠心肌组织间存在差异表达的基因。具有显著表达差异的基因有 71条 ,其中上调基因有 37条 ,下调基因有 34条。结果显示 :cDNA芯片技术筛选运动性心肌肥大相关基因具有高通量、高敏度、高效率、大规模和并行性等优点。 展开更多

关键词 CDNA芯片 cDNA微矩阵基因芯片 基因 差异表达 运动性心肌肥大

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微矩阵基因芯片筛选喉鳞癌相关基因的研究 被引量：8

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作者 陈菊祥 范静平 +7 位作者 应康 廖建春 李瑶 唐榕 周水淼 孙爱华 谢毅 毛裕民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第9期823-826,I001,共5页

目的 :应用基因微矩阵方法筛选喉鳞癌相关基因。方法 :按一步法抽提喉鳞癌和对照喉正常组织的总 RNA并纯化m RNA;将 40 96种人类基因 PCR产物用 Cartesian Pixsys75 0 0点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上 ,制成基因芯片 ;将... 目的 :应用基因微矩阵方法筛选喉鳞癌相关基因。方法 :按一步法抽提喉鳞癌和对照喉正常组织的总 RNA并纯化m RNA;将 40 96种人类基因 PCR产物用 Cartesian Pixsys75 0 0点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上 ,制成基因芯片 ;将等量的对照组织和喉鳞癌组织 m RNA分别逆转录合成荧光分子掺入的 c DNA一链做探针 ,混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用 Scan Array30 0 0扫描仪扫描芯片荧光信号图像 ,计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因。结果 :在 40 96种基因中 ,喉鳞状细胞癌与喉正常组织间存在差异表达的基因。所检测的 4例临床标本中 ,2例共有的差异表达基因2 11～ 35 6条 (5 .15 %～ 8.87% ) ,3例共有的差异表达基因 36条 (0 .88% )。结论 :基因微矩阵芯片在筛选喉肿瘤发生相关基因的改变具有快速、高通量、高敏度等特点。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 基因差异表达 喉鳞癌

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基因芯片在抗肿瘤血管生成中草药相关基因筛选中的研究 被引量：30

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作者 托娅 苏秀兰 +4 位作者 路桂荣 辛学东 王文礼 柯杨 包文宇 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期273-275,共3页

目的 :利用基因芯片技术 ,从基因水平解释抗肿瘤血管生成中草药的有效组分 T3的分子机制。 方法 :( 1)采用两种细胞系 :人胃癌 BGC82 3细胞和血管内皮细胞 ( EC) ,每种细胞分两组 ,一组为对照 ,另一组为 T3药物刺激组 ;( 2 )抽提细胞总R... 目的 :利用基因芯片技术 ,从基因水平解释抗肿瘤血管生成中草药的有效组分 T3的分子机制。 方法 :( 1)采用两种细胞系 :人胃癌 BGC82 3细胞和血管内皮细胞 ( EC) ,每种细胞分两组 ,一组为对照 ,另一组为 T3药物刺激组 ;( 2 )抽提细胞总RNA ,经反转录制备 c DNA,对照组用 Cy3、药物刺激组用 Cy5荧光标记 ,获得 c DNA探针 ;( 3 ) c DNA探针与 Bio Door基因表达谱芯片杂交 ,结果由扫描仪扫描并用 Im a Gene3 .0软件进行分析统计。 结果 :( 1) BGC82 3细胞组有 2 .5 3 %基因表达谱发生明显的变化 ,其中 15 8条基因在经 T3刺激后表达量明显上升 ,4 4条明显下降 ;( 2 ) EC组有 0 .4 6%的基因表达谱发生明显的变化 ,其中 3 0条基因在经 T3刺激后表达量明显上升 ,7条基因表达量明显下降。结论 :利用基因芯片技术可从基因水平解释中药的作用机制 。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 基因表达谱 中草药 药物筛选 抗肿瘤血管生成

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基因芯片的制备研究 被引量：20

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作者 李瑶 陈菊祥 +7 位作者 裘敏燕 应康 陈沁 符薇 王品 沈娴 谢毅 毛裕民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第9期812-814,I002,共4页

目的 :建立基因芯片的制备技术。 方法 :基因样本准备 ,将带荧光标记的 PCR产物用点样仪点于玻片介质上 ,并经过点样后处理制备成基因芯片 ,用扫描仪测定处理前后芯片上荧光强度的变化 ,计算 DNA固定率。分别设计了 5种玻片 3种固定条件... 目的 :建立基因芯片的制备技术。 方法 :基因样本准备 ,将带荧光标记的 PCR产物用点样仪点于玻片介质上 ,并经过点样后处理制备成基因芯片 ,用扫描仪测定处理前后芯片上荧光强度的变化 ,计算 DNA固定率。分别设计了 5种玻片 3种固定条件和 6种点样后处理方法的固定率测定。结果 :对芯片制备的各种条件和方法优化实验表明 ,c DNA的氨基修饰 ,点样后的 UV交联和芯片室温干燥处理能有效提高 DNA的固定率。结论 :本研究建立的基因芯片制备技术有较高的效率和可靠的实用性能。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 基因表达谱 DNA固定率 制备

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基因芯片对PMA激活的血管内皮细胞早期反应基因的研究 被引量：3

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作者 吴超群 应康 +7 位作者 戴建凉 李瑶 陈菊祥 和桂芬 金刚 倪小龙 谢毅 毛裕民 《第二军医大学学报》 CSCD 北大核心 2000年第9期815-818,I002,共4页

目的 :用基因芯片研究 PMA激活的血管内皮细胞的早期反应基因 (imm ediate early response gene,ERG)。方法 :以包含 40 96条人类基因的 DNA芯片检测血管内皮细胞受代谢增强剂 PMA(phorbol myristate acetate)激活后早期的基因表达谱 ,... 目的 :用基因芯片研究 PMA激活的血管内皮细胞的早期反应基因 (imm ediate early response gene,ERG)。方法 :以包含 40 96条人类基因的 DNA芯片检测血管内皮细胞受代谢增强剂 PMA(phorbol myristate acetate)激活后早期的基因表达谱 ,并从中筛查出 ERG。结果 :血管内皮细胞受 PMA作用 6 h后 ,17条基因上调 ,11条下调。数据处理聚类分析表明 17条上调基因中多数 (13/ 17)属蛋白质磷酸酶和转录调控因子基因 ,而下调基因中多数 (9/ 11)为细胞分裂相关基因。结论 :证明PMA激活的人血管内皮细胞早期反应基因主要是转录调控因子和蛋白质磷酸酶基因。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 血管内皮细胞 早期反应基因 PMA

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应用BiostarH-Ⅰ型基因芯片筛选肺鳞癌中细胞信号传导及免疫相关基因

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作者 白澎 张沪生 王毓洲 《首都医科大学学报》 CAS 2005年第6期729-732,共4页

目的利用基因芯片技术,寻找人类肺鳞癌组织和正常肺组织中与生物信号传导或免疫反应有关的差异表达基因。方法提取肺鳞癌和正常肺组织总RNA,反转录合成cDNA探针,混合后与BiostarH-Ⅰ型基因芯片杂交,ScanArray 4000扫描仪扫描杂交信号,... 目的利用基因芯片技术,寻找人类肺鳞癌组织和正常肺组织中与生物信号传导或免疫反应有关的差异表达基因。方法提取肺鳞癌和正常肺组织总RNA,反转录合成cDNA探针,混合后与BiostarH-Ⅰ型基因芯片杂交,ScanArray 4000扫描仪扫描杂交信号,计算机分析差异表达基因。结果筛选出差异表达的已知基因8条,其中5条表达上调(r>2.0),分别为METAP2、LIV-1、CUL2、CSE1L、RBBP2H1A;3条表达下调(r<0.5),分别为CX3CL1、HBB、CKB。结论利用基因芯片技术实现高通量筛选肺癌发病相关基因,发现8条在肺鳞癌中与细胞信号传导或免疫反应有关的差异表达基因,为今后更深入的研究指明了方向。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 肺肿瘤 免疫 生物信号传导

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基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究 被引量：28

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作者 金钢 胡先贵 +6 位作者 应康 李瑶 唐榕 唐岩 景在平 谢毅 毛裕民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第9期819-822,共4页

目的 :探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理学变化中的应用价值。方法 :应用含有 40 96条人类全长基因的 c DNA表达谱芯片 ,对 3例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。 结果 :在 ... 目的 :探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理学变化中的应用价值。方法 :应用含有 40 96条人类全长基因的 c DNA表达谱芯片 ,对 3例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。 结果 :在 3例胰腺癌和正常胰腺组织中均有差异表达的基因 398条 ,其中新基因 2 89条 ,老基因 10 9条。从老基因中筛选出有显著表达差异基因 37条 ,其中在胰腺癌组织中上调基因 2 0条 ,下调基因 17条。 结论 :运用本基因表达谱芯片对基因表达谱进行分析 ,能够有效筛查出新的胰腺癌相关基因。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 基因表达谱 胰腺肿瘤 基因筛选

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ARP-SRP基因表达谱芯片对脑损伤的初步研究 被引量：4

8

作者 周亦武 张益鹄 +2 位作者 邓伟年 刘艳 胡志红 《法医学杂志》 CAS CSCD 2002年第3期146-149,共4页

目的研究脑挫伤后ARP-SRP基因表达谱差异及其法医学意义。方法从脑组织提取mRNA,应用ARP-SRP-1.0S基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞凋亡蛋白和应激反应蛋白相关基因特异性表达差异。结果基因芯片杂交结果中,发现人类溶酶体的胃... 目的研究脑挫伤后ARP-SRP基因表达谱差异及其法医学意义。方法从脑组织提取mRNA,应用ARP-SRP-1.0S基因芯片,研究脑挫伤组织与对照脑组织细胞凋亡蛋白和应激反应蛋白相关基因特异性表达差异。结果基因芯片杂交结果中,发现人类溶酶体的胃蛋白酶抑制剂不敏感蛋白酶基因(CLN2)表达水平显著下降。结论CLN2基因与一种婴儿致死性神经变性疾病LINCL有关,但CLN2基因在脑损伤中的作用尚有待进一步研究;基因芯片在研究脑损伤后相关基因的改变具有快速、高通量、高敏度等特点。 展开更多

关键词 基因芯片 微矩阵基因芯片 基因表达谱 差异表达 脑损伤 法医鉴定学

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基因表达谱芯片筛选成釉细胞瘤相关基因的研究 被引量：3

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作者 刘进忠 汪说之 《口腔医学纵横》 CSCD 2002年第2期86-88,I002-1,共4页

目的 :研究成釉细胞瘤和正常口腔粘膜组织中差异表达的基因。方法 :分别从成釉细胞瘤及正常口腔粘膜组织中提取总RNA并纯化为mRNA ,两种不同组织的mRNA分别逆转录合成有荧光分子标记的探针 ,然后与含有 70 0种人类基因的芯片进行杂交 ,... 目的 :研究成釉细胞瘤和正常口腔粘膜组织中差异表达的基因。方法 :分别从成釉细胞瘤及正常口腔粘膜组织中提取总RNA并纯化为mRNA ,两种不同组织的mRNA分别逆转录合成有荧光分子标记的探针 ,然后与含有 70 0种人类基因的芯片进行杂交 ,杂交信号用ScanArray30 0 0扫描 ,结果用ImgGene3.0软件分析。 结果 :成釉细胞瘤和正常口腔粘膜有差异表达的基因 32个 ,其中表达上调基因 5个、下调 2 7个。结论 展开更多

关键词 成釉细胞瘤 微矩阵基因芯片 基因表达 肿瘤相关基因 口腔粘膜

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肿瘤转移相关基因的表达谱研究(英文) 被引量：2

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作者 陈菊祥 唐榕 +9 位作者 应康 金刚 李瑶 杨泉胜 付志仁 范静平 梅举 谢毅 卢亦成 毛裕民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第9期806-811,F003,共7页

目的 :运用基因表达谱芯片技术对肿瘤转移相关基因的表达谱进行研究。方法 :对临床切除的肝癌和胰腺癌组织及相应的对照正常组织进行总 RNA抽提 ,纯化后的 m RNA进行逆转录制备杂交探针 ,应用 Bio Door40 96和 Bio Door12 80 0的全长基... 目的 :运用基因表达谱芯片技术对肿瘤转移相关基因的表达谱进行研究。方法 :对临床切除的肝癌和胰腺癌组织及相应的对照正常组织进行总 RNA抽提 ,纯化后的 m RNA进行逆转录制备杂交探针 ,应用 Bio Door40 96和 Bio Door12 80 0的全长基因 DNA芯片筛选与肝癌和胰腺癌转移相关的基因。杂交后的信号用 Scan Array30 0 0扫描 ,结果用 Ima Gene3.0软件分析。结果 :对肝癌和胰腺癌基因表达谱进行分析 ,发现两种肿瘤中存在相同的差异表达基因 ,其中有 15条基因与肝癌、胰腺癌转移密切相关。 结论 :通过对肝癌、胰腺癌的肿瘤表达谱芯片研究 ,尤其是与转移相关基因的分析 ,对了解肿瘤的发病机制和转移发生情况及其肿瘤的预后有重要意义。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 肿瘤转移相关基因 基因表达谱

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小鼠暴发型病毒性肝炎肝组织基因表达谱的分析

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作者 王洪武 周耀勇 +3 位作者 邹勇 严伟明 罗小平 宁琴 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期6-10,共5页

目的分析小鼠暴发型病毒性肝炎肝组织基因表达谱,初步确定参与暴发型病毒性肝炎发病分子机制的相关基因。方法100 PFU3型鼠肝炎病毒(MHV-3)感染Balb/cJ小鼠,建立了暴发型病毒性肝炎模型,同等量病毒感染A/J小鼠后24 h取肝组织作为对比分... 目的分析小鼠暴发型病毒性肝炎肝组织基因表达谱,初步确定参与暴发型病毒性肝炎发病分子机制的相关基因。方法100 PFU3型鼠肝炎病毒(MHV-3)感染Balb/cJ小鼠,建立了暴发型病毒性肝炎模型,同等量病毒感染A/J小鼠后24 h取肝组织作为对比分析标本。应用含有16 463条Oligo DNA的小鼠基因表达芯片,检测两组小鼠间的基因差异表达谱。荧光定量逆转录聚合酶链反应法检测目标基因H2-EA的表达变化,验证芯片分析的初步结果。结果MHV-3感染Balb/cJ小鼠和A/J小鼠后其肝组织差异表达基因共140条,包括细胞代谢、细胞信号、细胞运输、转录调控以及免疫相关类等基因。其中2倍以上差异表达基因中与免疫功能密切相关的基因22条。结论暴发型肝炎过程中宿主基因表达谱发生了变化,共同参与了免疫致病机制,其中主要为细胞代谢和免疫相关类基因。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 免疫 基因表达 暴发型肝炎

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肺癌相关基因的表达谱研究 被引量：31

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作者 黄达蔷 戴建凉 +6 位作者 陈菊祥 田立峰 金杨晟 沈娴 应康 谢毅 毛裕民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第9期827-830,I001,共5页

目的 :通过研究人肺癌组织和正常组织中差异表达的基因 ,寻找肺癌相关基因以用于肺癌的诊断和治疗。 方法 :以包含 40 96个 c DNA基因表达谱芯片研究一组肺癌组织样本的基因表达谱。 结果 :共筛选出差异表达的基因 370条 ,包含已知基因 ... 目的 :通过研究人肺癌组织和正常组织中差异表达的基因 ,寻找肺癌相关基因以用于肺癌的诊断和治疗。 方法 :以包含 40 96个 c DNA基因表达谱芯片研究一组肺癌组织样本的基因表达谱。 结果 :共筛选出差异表达的基因 370条 ,包含已知基因 146条 ,未知基因 2 2 4条 ,其中 10 7条表达增加 ,2 6 3条表达降低。 结论 :基于 c DNA微矩阵技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选与肺癌发生密切相关的基因。 展开更多

关键词 微矩阵基因芯片 基因表达谱 肺肿瘤

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长链非编码RNA AC002454.1在急性白血病患儿中的表达及临床意义

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作者 曹岚 胡绍燕 +7 位作者 潘健 王易 何海龙 卢俊 肖佩芳 古桂雄 杜智卓 柴忆欢 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1433-1439,共7页

目的:研究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在急性白血病(acute leukemia,AL)患儿和骨髓正常的其它血液病患儿(作为对照)标本中的表达谱的差异,筛选与AL患儿相关的lnc RNA,探讨lnc RNA AC002454.1在AL患儿中的表达及临床意义... 目的:研究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在急性白血病(acute leukemia,AL)患儿和骨髓正常的其它血液病患儿(作为对照)标本中的表达谱的差异,筛选与AL患儿相关的lnc RNA,探讨lnc RNA AC002454.1在AL患儿中的表达及临床意义。方法:采用Microarray基因芯片技术对初诊AL儿童和对照儿童骨髓细胞的lnc RNA进行统计分析。选取差异表达显著的lnc RNA 97个,对急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)患儿(21例)、急性髓细胞白血病(acute myelocytic leukemia,AML)患儿(22例)和对照儿童(21例)样本采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术进行验证并比较。并选择其中差异最大的lncRNA AC002454.1分析其相对表达量与临床指标的关系。结果:经Microarray基因芯片检测,ALL患儿差异表达的lncRNA 1884个、AML患儿差异表达的lncRNA 4289个。采用qRT-PCR对异常表达lncRNA进行验证的结果显示,ALL组中表达显著上调9例、AML组中表达显著上调12例,其中AC002454.1在ALL、AML患儿表达差异最显著(P<0.05,P<0.01)。AC002454.1的相对表达量在初诊ALL免疫分型T系与B系中有显著差异(P<0.01)、ALL和AML组有显著差异(P<0.05),AC002454.1相对表达量在患儿性别、年龄、初诊时WBC计数、染色体、融合基因、危险度分层之间无显著差异(P值均>0.05)。结论:用长链非编码RNA芯片分析获得了AL患儿的lncRNA表达谱,AC002454.1在AL患儿中异常高表达,其表达量与AL患儿的免疫分型及判断患者预后有一定相关性。 展开更多

关键词 长链非编码RNA 儿童急性白血病 微矩阵基因芯片 实时荧光定量PCR AC002454.1

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