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基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析丹阳黄酒酒曲中微生物菌群多样性 被引量:2
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作者 陈磊 戴亦军 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第6期141-145,共5页
该研究以江苏丹阳某黄酒酒曲为原料,利用Illumina Miseq高通量测序技术对其微生物菌群多样性进行研究。结果表明,该酒曲中真菌菌群的多样性高于细菌,而丰富度低于细菌。从样品中共注释到7个细菌门,10个细菌属;6个真菌门,14个真菌属。优... 该研究以江苏丹阳某黄酒酒曲为原料,利用Illumina Miseq高通量测序技术对其微生物菌群多样性进行研究。结果表明,该酒曲中真菌菌群的多样性高于细菌,而丰富度低于细菌。从样品中共注释到7个细菌门,10个细菌属;6个真菌门,14个真菌属。优势细菌属(相对丰度≥1%)为乳杆菌属(Lactobacillus)、魏斯氏菌属(Weissella)、肠杆菌属(Enterobacter)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、不动杆菌属(Acinetobacter)、泛菌属(Pantoea);优势真菌属(相对丰度≥1%)为曲霉属(Aspergillus)、短梗霉属(Aureobasidium)、芽枝霉属(Cladosporium)、威克汉姆酵母属(Wickerhamomyces)、青霉属(Penicillium)、木拉克酵母属(Mrakia)、根霉属(Rhizopus)、镰刀菌属(Fusarium)、帚枝霉属(Sarocladium)、篮状菌属(Talaromyces)。其中,短梗霉属(Aureobasidium)、篮状菌属(Talaromyces)均为酒曲微生物中报道较少的属,其特性和功能尚不清晰,有待进一步深入的研究。该研究结果为丹阳黄酒的发酵工艺改进和品质提升提供了理论依据。 展开更多
关键词 黄酒酒曲 微生物菌群多样性 高通量测序 落结构
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自然发酵酸面团发酵过程中微生物菌群多样性分析及细菌功能预测 被引量:2
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作者 杨文馨 安飞宇 +1 位作者 曹恺欣 乌日娜 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第2期43-47,共5页
该研究通过高通量测序技术研究不同发酵时期自然发酵酸面团的微生物菌群多样性,并利用PICRUSt对细菌群落进行基因功能预测分析。结果表明,对于细菌,共检测到5个细菌门,不同发酵时期绝对优势菌门不同,发酵前期(D1)为蓝藻细菌门(Cyanobact... 该研究通过高通量测序技术研究不同发酵时期自然发酵酸面团的微生物菌群多样性,并利用PICRUSt对细菌群落进行基因功能预测分析。结果表明,对于细菌,共检测到5个细菌门,不同发酵时期绝对优势菌门不同,发酵前期(D1)为蓝藻细菌门(Cyanobacteria),中期(D2~D3)为厚壁菌门(Firmicutes),后期(D4)为变形菌门(Proteobacteria);共检测到34个细菌属,发酵前期绝对优势菌属为未分类的蓝藻门(norank_c__Cyanobacteria),中期为乳球菌属(Lactococcus),后期为未分类的γ-变形菌纲(unclassified_c_Gammaproteobacteria)。对于真菌,共检测到13个真菌门,发酵过程中子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门;共检测到12个真菌属,未分类的酵母目(Saccharomycetales_unclassified)为绝对优势菌属,后期汉逊酵母属(Hanseniaspora)也被大量检出。通过PICRUSt进行分析预测,细菌群落在整个发酵过程中的基因功能主要有能量产生和转化、转录、无机离子转运和代谢等,该研究结果可为筛选酸面团内优良发酵功能菌种提供数据参考。 展开更多
关键词 自然发酵酸面团 微生物菌群多样性 高通量测序 功能预测
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不同工艺绍兴酒麦曲微生物菌群多样性分析 被引量:3
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作者 葛松涛 孙国昌 +7 位作者 寿泉洪 韩文凤 毛青钟 胡梦莎 沙如意 王珍珍 胡普信 毛建卫 《中国酿造》 CAS 北大核心 2023年第8期140-146,共7页
为研究不同培养环境、制曲工序、地理方位对绍兴酒麦曲微生物群落结构和多样性的影响,采用高通量测序技术对6种不同工艺绍兴酒麦曲样品的微生物菌群多样性进行分析。结果表明,从6种绍兴酒麦曲样品中共注释到30个细菌属和43个真菌属,其... 为研究不同培养环境、制曲工序、地理方位对绍兴酒麦曲微生物群落结构和多样性的影响,采用高通量测序技术对6种不同工艺绍兴酒麦曲样品的微生物菌群多样性进行分析。结果表明,从6种绍兴酒麦曲样品中共注释到30个细菌属和43个真菌属,其中共有的优势细菌属为糖多孢菌属(Saccharopolyspora)(69.16%)和芽孢杆菌属(Bacillus)(10.90%);共有的优势真菌属为根毛霉属(Rhizomucor)(50.37%)、曲霉属(Aspergillus)(28.32%)、横梗霉属(Lichtheimia)(12.66%)、镰刀菌属(Fusarium)(3.64%)。高温放线菌属(Thermoactinomyces)(4.81%)和伊萨琴基亚(Issatchenkia)(1.43%)仅在西路箱式麦曲样品中为优势菌属。综合无度量多维标定法(NMDS)和线性判别分析效应大小(LEfSe)分析发现,西路箱式麦曲样品与其他绍兴酒麦曲样品间细菌群落结构差异主要由优势菌群相对丰度的差别所致,真菌菌群结构差异主要由差异菌群复膜孢酵母科(Saccharomycopsidaceae)微生物所致。研究表明,培养环境对绍兴酒麦曲的微生物多样性影响较大,而制曲工序与市域内的地理方位对绍兴酒麦曲的微生物多样性影响较小。 展开更多
关键词 绍兴酒麦曲 高通量测序 微生物菌群多样性 落结构
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酱香型白酒第四轮次堆积发酵醅堆腰线微生物菌群多样性解析 被引量:2
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作者 邓子文 贺子豪 +4 位作者 何梦雪 田龙新 周加平 刘菊珍 郭壮 《中国酿造》 CAS 北大核心 2023年第3期53-57,共5页
采用纯培养和Illumina MiSeq高通量测序技术对第四轮次堆积发酵正常和腰线酒醅中的微生物菌群多样性进行解析。通过纯培养计数发现,酒醅腰线处乳酸菌、细菌以及酵母和霉菌的数量均显著高于正常酒醅(P<0.05)。经α多样性分析发现,正... 采用纯培养和Illumina MiSeq高通量测序技术对第四轮次堆积发酵正常和腰线酒醅中的微生物菌群多样性进行解析。通过纯培养计数发现,酒醅腰线处乳酸菌、细菌以及酵母和霉菌的数量均显著高于正常酒醅(P<0.05)。经α多样性分析发现,正常和腰线部位酒醅细菌及真菌菌群的丰度和多样性差异均不显著(P>0.05)。经β多样性分析发现,两处酒醅中细菌类群差异不显著(P>0.05),而真菌类群差异显著(P<0.05)。经Wilcoxon test检验发现,酒醅腰线处芽孢杆菌(Bacillus)和丝衣霉属(Byssochlamys)的相对含量显著偏高(P<0.05),而毕赤酵母属(Pichia)、酵母属(Saccharomyces)、有孢圆酵母属(Torulaspora)和接合酵母属(Zygosaccharomyces)显著偏低(P<0.05)。相关性分析发现,腰线部位酒醅微生物菌群间相较于正常部位存在更加密切的联系。由此可见,腰线与正常部位酒醅的微生物类群差异主要体现在真菌类群上。 展开更多
关键词 酱香型白酒 微生物菌群多样性 腰线 第四轮次堆积发酵 酒醅
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鸡粪好氧堆肥腐熟度、重金属残留及微生物菌群分析 被引量:12
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作者 王秀红 史向远 +4 位作者 张纪涛 王豫霞 李欣欣 周静 赵红叶 《山西农业科学》 2021年第9期1094-1099,共6页
为了掌握鸡粪有机肥厂堆肥期间的鸡粪无害化处理情况,对鸡粪有机肥厂条垛式好氧堆肥过程中堆料的腐熟度指标及重金属含量进行了分析,并采用高通量测序技术研究了鸡粪好氧发酵过程微生物的表达丰度。结果表明,2个堆体在60 d的鸡粪条垛式... 为了掌握鸡粪有机肥厂堆肥期间的鸡粪无害化处理情况,对鸡粪有机肥厂条垛式好氧堆肥过程中堆料的腐熟度指标及重金属含量进行了分析,并采用高通量测序技术研究了鸡粪好氧发酵过程微生物的表达丰度。结果表明,2个堆体在60 d的鸡粪条垛式堆肥期间维持55℃以上温度的时间分别为37、27 d,含水率、EC值和有机质均呈显著下降趋势,pH和发芽指数(GI)呈显著上升趋势,堆1和堆2的pH值分别由发酵前的5.99和6.98上升至8.70和8.51,GI由发酵前的4.22%和5.06%分别上升至86.57%和111.91%。As、Pb、Cr和Hg含量在堆肥过程中均存在显著波动,腐熟后As、Hg、Pb、Cd和Cr的含量分别为4.92、0.20、12.08、0.09、23.67 mg/kg,均符合堆肥标准对重金属的要求范围。高通量测序结果得出,在真菌水平上,表达丰度较高的为子囊菌门、担子菌门、毛霉菌门和油壶菌门,建堆初期以念珠菌属、毕赤酵母属、曲霉属丰度较高,第60天后则以链格孢属和Sodiomyces表达最为丰富;在细菌水平上,表达丰度较高的为厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和变形菌门,在建堆初期,以厚壁菌门的梭菌属和Caldicoprobacter的丰度较高,60 d后则以厚壁菌门的Bacillus和Gracilibacillus、变形菌门的Alcanivorax和粪产碱菌属较高。2种堆肥均达到畜禽粪便堆肥技术规范要求,鸡粪堆肥中微生物菌群存在多样性,真菌和细菌的表达丰度存在波动,细菌常见病原菌属未检测到,真菌病原微生物念珠菌属表达丰度由66.9%下降至5.5%。 展开更多
关键词 鸡粪 好氧堆肥 高通量测序技术 腐熟度 重金属残留 微生物菌群多样性
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Variations of phyllosphere microorganisms in asymptomatic and tobacco brown spot leaves before and after spraying 12% difenoconazole + fluxapyroxad SC
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作者 LI Tong WANG Hancheng +6 位作者 YE Guo WANG Qing NGANGUEM NZALLE Yranney Brice WANG Feng CAI Liuti FENG Ruichao ZHANG Songbai 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期932-948,共17页
12%difenoconazole+fluxapyroxad SC(commercial name:Jiangong)was first released by BASF in China in 2016.It has been registered to control many diseases,including pear scab,apple Alternaria leaf spot,tomato early blight... 12%difenoconazole+fluxapyroxad SC(commercial name:Jiangong)was first released by BASF in China in 2016.It has been registered to control many diseases,including pear scab,apple Alternaria leaf spot,tomato early blight,cucumber powdery mildew,etc.This study evaluated the bioactivity of Jiangong against Alternaria alternata and explored variations of phyllosphere microorganisms in both asymptomatic and tobacco brown spot leaves at different persistence periods(0,5,10,and 15 days post-fungicide application)using high-throughput sequencing technology.The results indicated that Jiangong effectively inhibited mycelial growth(average EC_(50) value of 0.51μg/mL),conidia germination(average EC_(50) value of 3.47μg/mL),and the carbon metabolism of A.alternata.Both asymptomatic and symptomatic leaves presented complex microbial communities.Higher fungal diversity was noted in asymptomatic leaves,while higher bacterial diversity was found in symptomatic leaves.After application,the diversity and abundance of microbial community structures in both types of leaves changed over time.Fungal microbiome communities showed greater sensitivity than bacterial groups,with the microbiome communities of asymptomatic leaves being more affected than those of symptomatic leaves.Fungal community diversity decreased for both symptomatic and asymptomatic leaves after 5 days of application,while the diversity of fungal community in symptomatic leaves showed an upward trend after 10 days of application.Meanwhile,bacterial community diversity increased in both symptomatic and asymptomatic leaves after 5 days of application but then declined in asymptomatic leaves after 15 days.The abundance of the dominant function group of phyllosphere bacteria(metabolism,genetic information processing,environmental information processing)was not affected by the application of Jiangong.However,the abundance of the dominant function group of phyllosphere fungi(animal pathogen-endophyte-wood saprotroph,endophyte-plant pathogen,plant pathogen-undefined saprotroph)was significantly affected by the application of Jiangong,and high variation was found in symptomatic leaves than that of asymptomatic leaves.The application of Jiangong-induced alterations in the community structure of the tobacco phyllosphere microbiome provides a basis for future tobacco brown spot control strategies based on phyllospheric microecology. 展开更多
关键词 tobacco brown spot DIFENOCONAZOLE fluxapyroxad microorganism communities diversity high-throughput sequencing
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