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极端油藏微生物多样性分析 被引量：1
1
作者 徐海霞 孟祥娟 +5 位作者 袁泽波 王鹏 陈德飞 陈箐 程昉 赵静 《环境科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期32-37,共6页
文章通过对哈得油田超高温、超高盐油藏油水样品中微生物种类多样性和优势菌群的研究,考察极端油藏内源微生物的分布特征,探讨生物采油技术在超高温、超高盐油藏条件下的应用可行性。采集哈得油田HD1-1H、HD1-9H、HD1-15H、HD1-21H和HD1... 文章通过对哈得油田超高温、超高盐油藏油水样品中微生物种类多样性和优势菌群的研究,考察极端油藏内源微生物的分布特征,探讨生物采油技术在超高温、超高盐油藏条件下的应用可行性。采集哈得油田HD1-1H、HD1-9H、HD1-15H、HD1-21H和HD1-23H 5组水平井油水样,利用第二代高通量测序技术测定油水样品内微生物的16S rDNA V3-V4变异区序列,应用QIIME软件整理和统计样本序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和多样性,以及不同井微生物物种多样性丰度的差异。哈得油水样中内源微生物资源丰富,5组油水样属水平的微生物类群数分别为196、199、184、212和220,微生物在分类种类和所占比例上具有显著差异。优势菌群中有多种明确的采油功能微生物,如芽孢杆菌属、假单胞菌属、乳球菌属等。该研究明确了哈德油田具有较丰富的微生物采油物质基础,丰富了对超高温、超高盐极端油藏微生物多样性的认识,拓展了生物采油技术在极端油藏中的应用范围。 展开更多
关键词 哈得油田 极端油藏 第二代测序技术 微生物多样性分析 生物采油技术
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水果植物酵素微生物多样性分析及抗氧化能力测定 被引量：2
2
作者 张亚娟 李市场 +3 位作者 张自平 陈妍 杜莹瑞 龚明贵 《粮食与油脂》 北大核心 2022年第6期137-142,共6页
利用Illumina Miseq高通量测序技术对自然发酵的水果植物酵素原液进行宏基因组测序,采用比色法测定酵素对自由基的清除能力。在测序过程中细菌采用16SrDNA测序,真菌采用ITS1测序。结果表明:细菌的优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)和... 利用Illumina Miseq高通量测序技术对自然发酵的水果植物酵素原液进行宏基因组测序,采用比色法测定酵素对自由基的清除能力。在测序过程中细菌采用16SrDNA测序,真菌采用ITS1测序。结果表明:细菌的优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)和梭菌属(Clostridium),真菌的优势菌属为酵母属(Saccharomyces)。水果植物酵素对DPPH自由基、ABTS自由基、羟基自由基和超氧阴离子自由基的IC_(50)值分别为1.65、1.08、1.24和55.90 mg/mL。证明经过自然发酵的水果植物酵素在清除体内自由基方面有较大潜力,为其在抗氧化功能性食品的开发应用提供了基础。 展开更多
关键词 水果植物酵素 微生物多样性分析 DPPH自由基 ABTS自由基
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黄花菜茎叶与青贮玉米混合比例对青贮质量和微生物多样性的影响 被引量：1
3
作者 郑敏娜 康佳惠 +4 位作者 邹璨阳 侯向阳 梁秀芝 韩志顺 陈燕妮 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期3962-3972,共11页
为探索黄花菜(Hemerocallis citrina Baroni)茎叶饲料资源化利用的新途径,本试验将黄花菜茎叶与青贮玉米按质量比100∶0(T 1),80∶20(T 2),60∶40(T 3),40∶60(T 4),20∶80(T 5),0∶100(T 6)进行混合青贮,发酵70 d后,对各样品进行感官... 为探索黄花菜(Hemerocallis citrina Baroni)茎叶饲料资源化利用的新途径,本试验将黄花菜茎叶与青贮玉米按质量比100∶0(T 1),80∶20(T 2),60∶40(T 3),40∶60(T 4),20∶80(T 5),0∶100(T 6)进行混合青贮,发酵70 d后,对各样品进行感官鉴定、品质评价和微生物多样性分析。结果表明:与黄花菜茎叶单贮相比,黄花菜茎叶与青贮玉米混合青贮有利于改善青贮饲料的气味和结构,并且基于对16个青贮指标的灰色关联度分析发现,黄花菜茎叶与青贮玉米混合青贮品质优于黄花菜茎叶单贮。在细菌属水平上,共有1192个类群被分类,其中,植物乳杆菌属(Lactiplantibacillus)、泛菌属(Pantoea)、未分类的肠杆菌属(unclassified_Enterobacteriacea)是所有混合青贮模式中的优势属,结合冗余分析结果发现,氨态氮含量对各样品微生物群落组成影响更显著。综上考虑,从黄花菜茎叶利用最大化角度出发,以黄花菜茎叶与青贮玉米按质量比40∶60进行混合青贮为佳。 展开更多
关键词 黄花菜茎叶 青贮玉米 混合青贮 青贮质量评价 微生物多样性分析
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分子生物学技术在活性污泥微生物多样性研究中的应用 被引量：2
4
作者 余彬彬 李钧敏 金则新 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第5期313-315,共3页
对分子生物学技术在活性污泥微生物多样性研究中的应用情况进行了综述,重点对利用非培养方法直接分析活性污泥微生物多样性进行了较为全面的总结。其中就应用较多的RAPD、DGGE、T-RFLP、ER IC、SSCP、16SrDNA序列分析方法的优缺点进行... 对分子生物学技术在活性污泥微生物多样性研究中的应用情况进行了综述,重点对利用非培养方法直接分析活性污泥微生物多样性进行了较为全面的总结。其中就应用较多的RAPD、DGGE、T-RFLP、ER IC、SSCP、16SrDNA序列分析方法的优缺点进行了剖析,强调今后活性污泥微生物多样性研究应以多种分析方法综合应用为主。 展开更多
关键词 活性污泥 微生物多样性分析 分子生物学技术
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新疆传统发酵乳制品调研及其发酵微生物种质资源分析 被引量：3
5
作者 蔡扩军 妥彦峰 +7 位作者 徐敏 罗晓红 吴林英 尤宏 寇晓萌 牟光庆 郑志强 李新玲 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2024年第2期12-19,共8页
为挖掘新疆传统发酵乳制品的微生物菌种资源,对不同地区传统发酵乳的制作方式及其发酵微生物进行了调研。采集了全疆12个地州及乌鲁木齐周边共45个县165个乡村483份家庭作坊生产的传统发酵乳制品,并对其进行了发酵微生物筛选。从采集的... 为挖掘新疆传统发酵乳制品的微生物菌种资源,对不同地区传统发酵乳的制作方式及其发酵微生物进行了调研。采集了全疆12个地州及乌鲁木齐周边共45个县165个乡村483份家庭作坊生产的传统发酵乳制品,并对其进行了发酵微生物筛选。从采集的不涉及任何商品发酵剂的新疆传统发酵乳中,共筛选出497株乳酸菌和364株酵母菌,并首次发现了假肠膜明串珠菌、汉逊德巴利酵母和巴氏醋杆菌等菌。此研究成果可为开发新疆传统发酵乳制品的优质菌种资源提供基础。 展开更多
关键词 传统发酵乳制品 微生物多样性分析 乳酸菌 酵母菌 筛选
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基于深井原位采集技术的塔里木油田内源微生物多样性研究
6
作者 孟祥娟 欧阳国强 +2 位作者 曾有信 杨忠武 徐海霞 《生物学杂志》 CAS CSCD 2017年第4期82-87,共6页
为深入了解塔里木油田高温高压环境中内源微生物的群落组成及潜在功能,利用原油高压物性仪在轮南和塔中区块分别选择LN-A井和TZ-B井进行深井原位采样和井口采样,比较油水样品中微生物群落多样性的差异。环境基因组技术分析结果显示:在... 为深入了解塔里木油田高温高压环境中内源微生物的群落组成及潜在功能,利用原油高压物性仪在轮南和塔中区块分别选择LN-A井和TZ-B井进行深井原位采样和井口采样,比较油水样品中微生物群落多样性的差异。环境基因组技术分析结果显示:在深井原位采集样品中,LN-A井优势菌群为Bacillus(芽孢杆菌属,56%),TZB井为Pseudomonas(假单胞菌属,50%);井口样品中优势菌群与原位样品一致,但比例偏高。原位采集组的样品中微生物群落结构更为丰富(LN-A井原位和井口采集样品中分别为14种和3种;TZ-B井分别为12种和3种),优势菌群分散,同时还发现多种新型功能微生物。深井原位采集技术、环境基因组技术和微生物群落分析技术的有机结合,对于充分认识并深度挖掘高温高压油藏中功能微生物资源,并应用于微生物采油技术中具有现实的指导意义和推广价值。 展开更多
关键词 塔里木油田 深井原位采集技术 环境基因组学 微生物多样性分析 微生物采油
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烟台市区河流入海口微生物群落的分析 被引量：3
7
作者 蒲洋 李文军 +2 位作者 王凯 赵彦宏 秦松 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期9-15,共7页
2015年4月在烟台市区4条主要河流(辛安河、逛荡河、鱼鸟河和夹河)入海口处采集12个样品,利用PCR-DGGE方法分析了此区域的细菌群落组成和优势菌群。通过统计学手段对DGGE图谱进行分析,结果表明4条河流入海口细菌群落丰富度都较高,12个取... 2015年4月在烟台市区4条主要河流(辛安河、逛荡河、鱼鸟河和夹河)入海口处采集12个样品,利用PCR-DGGE方法分析了此区域的细菌群落组成和优势菌群。通过统计学手段对DGGE图谱进行分析,结果表明4条河流入海口细菌群落丰富度都较高,12个取样点扩增的DGGE条带数都在30以上,样品的Shannon指数均高于3.3,个别甚至可达3.61。其中,辛安河和逛荡河的Shannon指数平均值均高于鱼鸟河和夹河,夹河多样性最低;而且UPGMA聚类分析结果显示地理位置越接近,其细菌组成的相似度越高。在DGGE电泳条带中选取14条主要条带进行扩增和序列测定,所得到的序列进行了系统进化分析发现4条河流入海口的优势菌群主要为变形杆菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)。这与近年来关于山东近岸海域细菌多样性的研究结果相符合,为研究和保护烟台市区河口处环境提供科学依据。 展开更多
关键词 烟台 河流入海口 PCR-DGGE 微生物多样性分析
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低氧训练对大鼠小肠微生物的影响 被引量：1
8
作者 韩天雨 胡扬 于加倍 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期784-792,共9页
目的:研究低氧应激及低氧和运动复合应激对大鼠肠道微生物的影响。方法:雄性8周龄SD大鼠120只,适应性饲养1周后,用分层随机抽样法按体重随机分为常氧安静组(normal oxygen sedentary,NOS组)、常氧运动组(normal oxygen exercise,NOE组)... 目的:研究低氧应激及低氧和运动复合应激对大鼠肠道微生物的影响。方法:雄性8周龄SD大鼠120只,适应性饲养1周后,用分层随机抽样法按体重随机分为常氧安静组(normal oxygen sedentary,NOS组)、常氧运动组(normal oxygen exercise,NOE组)、低氧安静组(low oxygen sedentary,LOS组)、低氧运动组(low oxygen exercise,LOE组),每组30只。递增强度适应性训练1周后开始正式干预,低氧组大鼠入驻常压低氧动物房(氧浓度12.7%,对应4000 m海拔)进行低氧干预,运动组大鼠进行每天24 m/min、45 min的中等强度跑台运动干预。分别在开始干预后第3、6、9天的末次训练后24 h取材,收集大鼠空肠内容物,提取全基因组DNA,用NanoDrop2000进行DNA质控,质控合格样品用Illumina HiSeq 2500型测序仪对16SrRNA的V3-V4可变区进行测序,得到结果用生物信息学手段进行微生物多样性分析。结果:(1)测序总共得到2697529条16SrRNA序列(Reads),双端Reads拼接、过滤后共产生2206002条高质量测序标签(Clean tags),平均每个样品产生73533条Clean tags。(2)在门分类学水平上,优势物种分别是,厚壁菌门、变形菌门、放线菌门;同时,属水平上具有较高丰度的物种主要集中于厚壁菌门、放线菌门及变形菌门中。厚壁菌门中,属水平上丰度最高的是乳酸菌属,变形菌门中Pannonibacter菌属、假单细胞菌属丰度较高;放线菌门中,节细菌属相对丰度较高。(3)干预后3天时,NOS组厚壁菌门相对丰度显著低于LOS组(P<0.05),NOS组假单胞菌属相对丰度显著高于LOE组(P<0.01);干预后第6天时,NOS组厚壁菌门相对丰度仍显著低于LOS组(P<0.05),NOS组变形菌门及放线菌门相对丰富显著低于LOE组(P<0.05,P<0.01),NOS组节杆菌属相对丰度显著低于LOE组(P<0.05);干预后9天时,NOS组假单胞菌属相对丰度显著高于LOS组(P<0.05)。结论:低氧或低氧训练作为唯一变量,导致大鼠肠道微生物构成发生显著变化。低氧干预导致大鼠肠道微生物中厚壁菌门相对丰度显著升高,低氧训练导致大鼠肠道微生物中放线菌门、变形菌门相对丰度显著下降;这可能导致肠道微生物失调,宿主肠黏膜屏障功能受损。 展开更多
关键词 低氧 低氧训练 肠道微生物 微生物多样性分析 SD大鼠
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高通量测序分析混合菌群中的呕吐毒素降解菌 被引量：2
9
作者 高慧 牛家峰 +3 位作者 杨华 陆兆新 陈美容 吕凤霞 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第24期123-130,共8页
为筛选具有降解脱氧雪腐镰刀菌烯醇(deoxynivalenol,DON)能力的微生物,利用高通量测序方法分析混合菌群中的DON降解菌。从土壤中获得具有DON降解能力的混合菌群LG-6,并发现不同梯度稀释倍数的混合菌群之间DON降解效果具有明显差异。稀释... 为筛选具有降解脱氧雪腐镰刀菌烯醇(deoxynivalenol,DON)能力的微生物,利用高通量测序方法分析混合菌群中的DON降解菌。从土壤中获得具有DON降解能力的混合菌群LG-6,并发现不同梯度稀释倍数的混合菌群之间DON降解效果具有明显差异。稀释至10^(-7)时混合菌群LG-6-7能完全降解DON,而稀释至10^(-8)时混合菌群LG-6-8不能降解DON。对这2个混合菌群的微生物多样性进行分析,发现混合菌群LG-6-7包括假苍白杆菌属、节细菌属、假单胞菌属、代尔夫特菌属和德沃斯氏菌属,而混合菌群LG-6-8包括假苍白杆菌属和节细菌属。故推测假单胞菌属、德沃斯氏菌属和代尔夫特菌属在降解DON的过程中必不可少。此外,假单胞菌B6-24和德沃斯氏菌A6-243混合培养时,48 h内完全降解DON。该混合菌群培养温度为37℃、pH 7.0,培养基为MMT培养基,并发现该混合菌群是通过微生物代谢产生的酶对DON进行降解。本研究发现能完全降解DON的假单胞菌B6-24和德沃斯氏菌A6-243混合菌群,为呕吐毒素生物脱毒剂的研发提供一定理论依据。 展开更多
关键词 呕吐毒素 降解 微生物多样性分析 假单胞菌属 德沃斯氏菌属
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