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苏云·稻纵颗与化学农药施用下稻田土壤微生物数量和代谢功能多样性的差异
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作者 陆玉荣 夏杨 +6 位作者 黄立鑫 张楠 林曼曼 李传明 韩光杰 刘琴 徐健 《中国生态农业学报(中英文)》 北大核心 2025年第6期1061-1070,共10页
为了明确长期使用微生物杀虫剂和化学农药对水稻田土壤微生物种群数量和代谢功能多样性的影响,本文采用分离培养技术和Biolog微平板法相结合对长期施用微生物农药苏云·稻纵颗(CnmeGV·Bt)和化学杀虫剂的稻田土壤微生物数量、... 为了明确长期使用微生物杀虫剂和化学农药对水稻田土壤微生物种群数量和代谢功能多样性的影响,本文采用分离培养技术和Biolog微平板法相结合对长期施用微生物农药苏云·稻纵颗(CnmeGV·Bt)和化学杀虫剂的稻田土壤微生物数量、代谢功能活性及碳源利用类型多样性等进行研究。结果表明:与常规化学杀虫剂相比较,施用CnmeGV·Bt后土壤中细菌、真菌、放线菌数量均显著增加,分别为化学杀虫剂处理的1.86倍、1.75倍和1.34倍。进一步筛选发现真菌中木霉菌数量高于化学杀虫剂处理,差异显著。细菌中芽孢杆菌、溶磷功能菌、解钾功能菌数量与化学杀虫剂处理无显著差异。不同处理后土壤微生物群落平均颜色变化率(AWCD值)随时间变化趋势基本一致,开始的48 h AWCD变化很小,48~144 h快速升高。CnmeGV·Bt处理后AWCD值在48~192 h均显著高于化学杀虫剂处理。CnmeGV·Bt处理后土壤微生物群落Shannon多样性指数之间无显著变化,Simpson指数和Invsimpson指数显著提高。CnmeGV·Bt处理后土壤微生物对多种类型碳源的利用发生变化。对7种糖类、2种氨基酸类、6种己糖酸类、7种羧酸、酯和脂肪酸类的利用强度显著高于化学杀虫剂处理。对4种糖类、3种羧酸、酯和脂肪酸类的利用强度显著低于化学杀虫剂处理。主成分分析表明,与CnmeGV·Bt处理相关的碳源主要是葡糖醛酰胺、粘液酸、果胶、L-鼠李糖、?-甲酰-D-葡糖苷等,与化学杀虫剂处理相关的碳源主要是龙胆二糖、L-岩藻糖、D-苹果酸等。研究结果说明稻田应用微生物杀虫剂替代化学杀虫剂能够促进土壤微生物数量及其代谢功能,对于Bt类生物农药应用的环境行为及生态效应评价具有重要意义。 展开更多
关键词 苏云金杆菌 稻纵卷叶螟颗粒体病毒 土壤微生物 Biolog微平板 代谢功能多样性
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新疆伊犁地区民族传统谷物发酵饮料的微生物多样性及功能预测 被引量:1
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作者 刘亚男 张龑 +8 位作者 吴江超 高雁 杨奕凡 林青 霍向东 胡有贞 娄恺 关波 曾军 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第7期150-158,共9页
为比较传统谷物发酵饮料玛格孜木和波杂的微生物群落组成和基因功能差异.使用宏基因组学对两种饮料中微生物群落组成进行分析;利用PICRUSt2和FUNGuild软件对两种饮料中基因功能进行预测。结果显示玛格孜木优势菌属有乳酸杆菌属(25.46%)... 为比较传统谷物发酵饮料玛格孜木和波杂的微生物群落组成和基因功能差异.使用宏基因组学对两种饮料中微生物群落组成进行分析;利用PICRUSt2和FUNGuild软件对两种饮料中基因功能进行预测。结果显示玛格孜木优势菌属有乳酸杆菌属(25.46%)、明串珠菌属(12.88%)、链球菌属(9.60%)、链格孢属(45.15%)、枝孢属(9.21%)、假丝酵母属(8.99%)和赤霉属(2.3%);波杂优势菌属为乳酸杆菌属(86.67%)、片球菌属(1.10%)、不动杆菌属(1.07%)、明串珠菌属(1.06%)、链球菌(1.01%)、毕氏酵母属(18.11%)、根霉属(16.41%)、链格孢属(10.9%)、伊萨酵母属(7.95%)、黑孢霉属(6.80%)、赤霉属(6.69%)和威克汉姆酵母属(4.37%)。功能预测分析显示,与细菌生长和繁殖代谢相关的基因,特别是碳水化合物和氨基酸代谢在微生物中起主导作用。综上所述,新疆伊犁地区不同类型民族传统谷物发酵饮料中微生物群落组成差异显著,但细菌在发酵中可能起主导作用。该研究为传统发酵食品中有益微生物资源的挖掘和利用提供参考。 展开更多
关键词 谷物饮料 自然发酵 微生物多样性 功能预测
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黑茶渥堆发酵中微生物多样性及功能活性研究进展 被引量:1
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作者 韦佳汝 聂凯丽 +1 位作者 陈小强 应苗苗 《食品工业科技》 北大核心 2025年第9期424-434,共11页
黑茶是一种具有独特感官特征的后发酵茶。黑茶一般采用鲜叶制成的毛茶作为原料,通常由杀青、揉捻、渥堆发酵和干燥四步完成。渥堆发酵是黑茶加工的关键工序,以湿热作用为基础,利用微生物新陈代谢产生胞外酶,促进黑茶内含成分转化,形成... 黑茶是一种具有独特感官特征的后发酵茶。黑茶一般采用鲜叶制成的毛茶作为原料,通常由杀青、揉捻、渥堆发酵和干燥四步完成。渥堆发酵是黑茶加工的关键工序,以湿热作用为基础,利用微生物新陈代谢产生胞外酶,促进黑茶内含成分转化,形成独特的风味。本文对主要参与黑茶发酵中的微生物进行了归纳,总结了微生物对黑茶中多酚类物质、游离氨基酸、生物碱类、茶褐素和挥发性成分的影响。此外还探究了黑茶的抗氧化、胃肠道保护、降血糖血脂等功能活性。研究结果将为今后黑茶的加工生产以及更好地利用黑茶中活性成分提供帮助。 展开更多
关键词 黑茶 加工工艺 渥堆发酵 微生物多样性 功能活性
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秸秆还田后效对土壤微生物群落功能多样性的影响 被引量:2
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作者 杨舒纯 严君 +5 位作者 高瑞敏 许梦琪 韩晓增 邹文秀 陈旭 陆欣春 《土壤与作物》 2025年第1期64-72,共9页
探讨秸秆还田后效对土壤微生物群落功能多样性的影响,为农业可持续发展提供理论支持。以2016年在黑龙江省海伦市胜利村设置免耕秸秆覆盖(D0)、秸秆均匀混于0~15 cm土层(D15)、0~35 cm土层(D35)和0~50 cm土层(D50)4个处理,2017年后不再... 探讨秸秆还田后效对土壤微生物群落功能多样性的影响,为农业可持续发展提供理论支持。以2016年在黑龙江省海伦市胜利村设置免耕秸秆覆盖(D0)、秸秆均匀混于0~15 cm土层(D15)、0~35 cm土层(D35)和0~50 cm土层(D50)4个处理,2017年后不再进行秸秆还田,研究不同秸秆还田4年后对黑土土壤微生物群落功能多样性的影响。结果表明,不同秸秆还田方式后效土壤微生物平均颜色变化率(AWCD)均随着土层深度的增加而下降。同一土层秸秆还田后效土壤微生物的AWCD值表现不同,0~15 cm土层中表现为D15>D35>D50>D0;15~35 cm土层表现为D35>D50>D15>D0;35~50 cm土层表现为D50>D35>D15>D0。不同秸秆还田方式后效均会提高全土层(0~50 cm)McIntosh指数,对Shannon和Simpson指数没有显著影响。秸秆还田后效土壤微生物对碳源的利用能力不同,0~50 cm土层土壤微生物对碳源总的利用能力均表现为:D35>D50>D15>D0,从上至下各土层碳源利用能力最高的处理分别是D15、D35和D50。不同秸秆还田方式后效微生物代谢碳源最多的是糖类、氨基酸类、羧酸类及多聚物类碳源。因此,在质地黏重的黑土中采用秸秆深混还田方式是提升微生物群落功能多样性和碳源利用能力的有效农田管理措施。 展开更多
关键词 秸秆还田 黑土 Biolog-Eco微平板法 微生物 功能多样性
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野生与栽培五味子叶际微生物群落多样性和结构差异及功能预测分析
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作者 吴宇彤 王若琳 +1 位作者 颜霞 黄丽丽 《西北农业学报》 北大核心 2025年第8期1491-1505,共15页
基于高通量测序明确野生五味子与栽培五味子叶际微生物群落丰富度、多样性、群落组成及结构差异,旨在对不同微生物群落进行功能预测,为后续探究野生品种与栽培品种五味子叶际微生物如何影响植物次生代谢提供参考。采用Illumina Novaseq... 基于高通量测序明确野生五味子与栽培五味子叶际微生物群落丰富度、多样性、群落组成及结构差异,旨在对不同微生物群落进行功能预测,为后续探究野生品种与栽培品种五味子叶际微生物如何影响植物次生代谢提供参考。采用Illumina Novaseq平台对野生与栽培五味子叶际微生物群落DNA片段进行测序,对获取的有效数据进行物种注释和丰度计算,揭示样本物种构成;进一步进行Alpha多样性和Beta多样性分类分析,挖掘样本间群落结构差异。扩增子的注释结果关联相应的功能数据库,采用PICRUSt2软件开展相关分析,并对样本中的微生物群落进行功能预测。结果表明:(1)野生品种与栽培品种叶际细菌扩增子序列变体(Amplicon Sequence Variants, ASVs)分别为2 525和1 516个,其中408个ASV为共有;叶际真菌ASVs分别为883和368个,其中105个ASV为共有。(2)叶际细菌野生品种中占比较高的菌属为甲基杆菌属(Methylobacterium-Methylorubrum)和鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas),栽培品种中占比较高的菌属为甲基杆菌属;叶际真菌野生品种中占比较高的菌属为枝孢属(Cladosporium),栽培品种中占比较高的菌属为外囊菌属(Taphrina)和枝孢属。(3)叶际微生物群落通过PICRUSt2分析及KEGG通路预测显示,野生品种在脂类运输与代谢、萜类化合物和聚酮类化合物代谢及能量产生类功能方面相对丰度占比显著高于栽培品种。可见:五味子野生品种叶际微生物群落丰富度和多样性高于栽培品种,与植株次级代谢产物合成及能量产生有关的微生物群落相对丰度占比野生品种高于栽培品种。 展开更多
关键词 五味子 叶际微生物 次生代谢 群落多样性 结构分析 功能预测
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不同覆膜处理对晋南旱塬麦田土壤微生物功能多样性的影响
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作者 吴敏 任少聪 +5 位作者 尚妍萌 谢英荷 李廷亮 孟会生 郝鲜俊 张杰 《农业资源与环境学报》 北大核心 2025年第3期652-661,共10页
本文通过研究不同覆膜处理对晋南旱塬麦田土壤微生物的碳源利用差异,从微生物功能多样性角度探索当地最佳覆膜方式,为小麦增产提供理论依据。本研究在旱作小麦长期定位试验田中采集无膜(CK)、垄膜沟播(RMFS)和平膜穴播(FMD)3个处理的表... 本文通过研究不同覆膜处理对晋南旱塬麦田土壤微生物的碳源利用差异,从微生物功能多样性角度探索当地最佳覆膜方式,为小麦增产提供理论依据。本研究在旱作小麦长期定位试验田中采集无膜(CK)、垄膜沟播(RMFS)和平膜穴播(FMD)3个处理的表层土样(0~20 cm),采用Biolog-ECO微平板法测定微生物群落的碳源利用能力和功能多样性。结果表明:与CK相比,两种覆膜处理均能提高土壤微生物对碳水化合物、酚酸类、羧酸类和氨基酸类碳源的利用能力。其中,FMD处理下微生物对碳源利用的AWCD(平均颜色变化率)值、丰富度指数以及多样性指数分别为0.90,23.67和4.37,均显著高于其他处理(P<0.05);主成分分析和聚类热图表明土壤微生物对碳源的利用在各处理间发生明显分异;相关性网络图表明两种覆膜处理均促进了微生物对多种碳源的利用(共170个相关性事件,其中127个正相关事件);影响碳源利用的主控因素为积温(r=0.63,P=0.001)、产量(r=0.63,P=0.001)和硝态氮(r=0.37,P=0.047),且与吐温80、D-纤维二糖、D-葡萄糖胺酸和D-苹果酸的利用显著相关(P<0.05)。研究表明,覆膜处理有助于晋南旱塬麦田土壤微生物功能多样性的提升,尤其是平膜穴播,结合小麦增产效果来看,是一种适合在晋南黄土旱塬小麦种植区推广的覆膜方式。 展开更多
关键词 覆膜处理 土壤微生物 碳源利用 功能多样性 相关性网络
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基于宏基因组学技术的天祝藏酒大曲微生物群落多样性及功能解析
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作者 李亚萍 乔海军 +5 位作者 贾志龙 汪月 张忠明 刘琦 温得林 张卫兵 《轻工学报》 北大核心 2025年第2期31-40,共10页
为深入研究天祝藏酒大曲的特性及其在白酒酿造过程中发挥的作用,采用宏基因组学技术分析其微生物群落多样性,并对其功能基因进行注释。结果表明:从天祝藏酒大曲中鉴定出的微生物分别属于53个门和835个属,其中优势菌门包括厚壁菌门、放... 为深入研究天祝藏酒大曲的特性及其在白酒酿造过程中发挥的作用,采用宏基因组学技术分析其微生物群落多样性,并对其功能基因进行注释。结果表明:从天祝藏酒大曲中鉴定出的微生物分别属于53个门和835个属,其中优势菌门包括厚壁菌门、放线菌门和毛霉菌门,优势菌属包括糖多孢菌属、枝芽孢杆菌属、慢生芽胞杆菌属、横梗霉属、Desmospora、海洋芽孢杆菌属、芽孢杆菌属、Syncephalastrum和链霉菌属。在KEGG二级水平上共注释到22条代谢通路,其中碳水化合物代谢和氨基酸代谢功能较突出,且糖酵解/糖异生及甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢最旺盛;糖基转移酶和糖苷水解酶被CAZy数据库注释到的基因较多,分别占总基因数目的40.49%和39.09%。 展开更多
关键词 天祝藏酒大曲 宏基因组学技术 微生物群落 多样性 功能基因
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江西中低温温泉微生物多样性与功能特征研究
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作者 蔡森火 孙占学 +4 位作者 刘亚洁 陈功新 叶海龙 施兴华 何挺 《有色金属(冶炼部分)》 北大核心 2025年第12期172-183,共12页
温泉微生物群落结构与功能研究对地热资源开发至关重要。基于宏基因组测序,分析了江西修水白岭、宁都蓝田等5处中低温温泉的微生物多样性与功能特征。结果表明,温度是塑造微生物群落的关键因子。细菌群落中,优势菌属随温度升高从低温菌(... 温泉微生物群落结构与功能研究对地热资源开发至关重要。基于宏基因组测序,分析了江西修水白岭、宁都蓝田等5处中低温温泉的微生物多样性与功能特征。结果表明,温度是塑造微生物群落的关键因子。细菌群落中,优势菌属随温度升高从低温菌(Pseudomonas,Novosphingobium)向中温菌(Tepidimonas)及嗜热菌(Thermus,Hydrogenobacter)演替,细菌多样性(Shannon指数)显著降低;古菌群落中,低温样(<40℃)以氨氧化古菌(Nitrososphaerales,Nitrosopumilales)为主,中温样和高温样(60~70℃和<70℃)则以极端嗜热类群(Pyrobaculum)占优,古菌多样性(丰富度与均匀度)亦随温度上升而下降。微生物功能基因分析指示介导反硝化过程的功能基因在低温样温泉中丰度较高,中温样固碳作用更显著。微生物群落结构与功能基因特征的变化与温泉水化学参数变化一致,揭示了江西中低温温泉微生物多样性与功能对温度的响应及其与碳、氮元素地球化学循环的紧密关联,为温泉微生物资源挖掘及地热微生物指示研究提供了数据支撑和依据。 展开更多
关键词 温泉微生物 宏基因组测序 微生物多样性 功能潜力
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南海海马冷泉沉积物中微生物多样性测定及其功能特征分析
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作者 李若林 徐小芳 +5 位作者 熊颖涵 吴畏 周智威 吴饶 段佳丽 孙群 《中国测试》 北大核心 2025年第9期91-101,共11页
为探究南海海马冷泉沉积物中微生物群落结构和功能基因特征,采用分离培养法在4℃与37℃培养需氧和厌氧菌,采用宏基因组测序技术分析微生物多样性和KEGG代谢通路,以及甲烷代谢和抗生素耐药基因丰度。结果显示,在沉积物中分离培养得到细菌... 为探究南海海马冷泉沉积物中微生物群落结构和功能基因特征,采用分离培养法在4℃与37℃培养需氧和厌氧菌,采用宏基因组测序技术分析微生物多样性和KEGG代谢通路,以及甲烷代谢和抗生素耐药基因丰度。结果显示,在沉积物中分离培养得到细菌103株,分属3个门(Proteobacteria、Firmicutes和Actinobacteria)、29个属,其中优势属为Pseudoalteromonas、Bacillus和Pseudomonas;还获得了低温菌属Shewanella和厌氧菌属Clostridium。宏基因组测序显示,冷泉沉积物中细菌分属34个门1033个属,在微生物群落中占主导地位(92.22%),主要为Proteobacteria和Firmicutes;古菌分属5个门91个属,主要为Euryarchaeota和Thaumarchaeota;真菌分属2个门17个属,为Apicomplexa和Bacillariophyta。与同海域非冷泉沉积物相比,冷泉沉积物中微生物更丰富,特别是产甲烷古菌Methanosarcina和Methanococcoides;85%的KEGG二级代谢通路丰度更低,特别是与营养趋化性和信号转导相关的细胞运动代谢;冷泉沉积物中70%甲烷代谢基因丰度更高,特别是参与甲烷合成代谢的基因fwdE和hdrA2;71%的抗生素耐药基因丰度也更高,但恶唑烷酮类和酰胺醇类耐药基因仅在非冷泉沉积物中被注释到。综上,海马冷泉沉积物中的细菌、古菌和真菌更为丰富,在沉积物中获得了产甲烷代谢基因以及在酶和生物能源开发领域具有应用潜力的多属细菌分离株。 展开更多
关键词 海马冷泉沉积物 微生物多样性 甲烷代谢
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干法和湿法对咖啡加工初期微生物多样性的影响及功能预测分析
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作者 方红丽 杨跃梅 +3 位作者 廖海鹰 李紫伊 郭磊 韩龙 《保鲜与加工》 北大核心 2025年第7期72-79,共8页
为了揭示干法和湿法加工对咖啡中的微生物群落结构及功能特点,采用高通量扩增子测序技术对干法和湿法加工初期不同阶段咖啡中微生物的多样性和功能进行分析。结果表明:从全部样品中共获得1313个细菌和1366个真菌分类操作单元。干法加工... 为了揭示干法和湿法加工对咖啡中的微生物群落结构及功能特点,采用高通量扩增子测序技术对干法和湿法加工初期不同阶段咖啡中微生物的多样性和功能进行分析。结果表明:从全部样品中共获得1313个细菌和1366个真菌分类操作单元。干法加工中的优势细菌为泛菌属(Pantoea),优势真菌为镰刀菌属(Fusarium)和枝孢属(Cladosporium);湿法加工中的优势细菌为泛菌属(Pantoea)和葡糖杆菌属(Gluconobacter),优势真菌为有孢汉逊酵母属(Hanseniaspora)和镰刀菌属(Fusarium)。研究表明,干法加工的样品中微生物多样性高于湿法加工;湿法加工样品中微生物群落结构变化及样品间群落差异大于干法加工;两种加工方法的样品细菌功能相似,但真菌功能差异较大。该研究为探索干法和湿法加工的咖啡所呈现不同风味特征的微生物学机理奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 咖啡 干法加工 湿法加工 微生物多样性 功能预测
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白芨滩两种沙生植物根际与非根际土壤微生物群落功能多样性比较
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作者 黄晶晶 段晓敏 +3 位作者 李佳佳 何王平 熊婉湘 李靖宇 《生态科学》 北大核心 2025年第4期254-263,共10页
白芨滩国家级自然保护区植被恢复显著改善了区域生态环境,植物-土壤-微生物之间的相互作用对于植物健康、适应环境等至关重要,深入了解植物根际和非根际土壤微生物群落代谢功能多样性,可为评价荒漠生态系统植物适应极端环境提供理论依... 白芨滩国家级自然保护区植被恢复显著改善了区域生态环境,植物-土壤-微生物之间的相互作用对于植物健康、适应环境等至关重要,深入了解植物根际和非根际土壤微生物群落代谢功能多样性,可为评价荒漠生态系统植物适应极端环境提供理论依据。选择两种沙生植物作为研究对象,对其根际和非根际土壤微生物功能多样性进行分析,以揭示不同植物根际和非根际土壤微生物群落结构的异同及其在碳源利用方面的差异。研究采用Biolog-ECO生态板对白芨滩地区花棒和沙生针茅两种沙生植物根际与非根际土壤样品进行碳源利用分析。两种植物根际和非根际土壤微生物的平均颜色变化率大小关系为花棒非根际土<沙生针茅非根际土<花棒根际土<沙生针茅根际土。连续培养288 h后的沙生针茅非根际土的Shannon指数显著低于花棒根际土(P<0.05),而四种土壤的Simpson指数、丰富度指数和均匀度指数无显著差异。两种植物以糖类化合物和氨基酸为敏感碳源。主成分分析表明,花棒非根际与其他三种土壤碳源利用差异较大,沙生针茅非根际土样地间的碳源利用差异较大;六大类碳源对四种土壤主成分分离的贡献作用相近,起主要作用的是氨基酸类、糖类化合物、羧酸类和聚合物。花棒和沙生针茅两种植物根际和非根际土壤微生物的群落结构和多样性基本一致,花棒根际与非根际土壤微生物群落的组成和分布差异最大。花棒和沙生针茅根际微生物能够提高土壤碳源的利用情况,改善土壤环境,对荒漠生态系统的恢复具有一定意义。 展开更多
关键词 根际土 非根际土 Biolog-ECO 土壤微生物 群落功能多样性
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陈化阶段六堡茶微生物多样性及品质成分变化研究 被引量:1
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作者 甘亮成 韦云伊 +4 位作者 何娇 陈伟恒 程忠 康超 朱婧 《保鲜与加工》 北大核心 2025年第7期96-107,共12页
为探讨陈化阶段六堡茶微生物群落变化对茶品质及风味的影响,以广西梧州天然陈化阶段的六堡茶为研究对象,运用宏基因组技术解析六堡茶自然陈化阶段的微生物群落演替,结合Evolutionary genealogy of genes:Non-supervised Orthologous Gro... 为探讨陈化阶段六堡茶微生物群落变化对茶品质及风味的影响,以广西梧州天然陈化阶段的六堡茶为研究对象,运用宏基因组技术解析六堡茶自然陈化阶段的微生物群落演替,结合Evolutionary genealogy of genes:Non-supervised Orthologous Groups(eggNOG)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)和Carbohydrate-Active enZYmes(CAZy)数据库,对物质代谢途径、相关微生物及代谢酶进行功能注释与系统分析。同时通过理化性质测定,深入探讨微生物菌群及其代谢途径对茶汤品质的影响。结果表明:不同陈化阶段的六堡茶样品共注释得到细菌基因2114299个、真菌基因3066435个、古菌基因1833个、病毒基因9473个,属于107个门、155个纲、322个目、773个科、2345个属的9482种微生物。陈化阶段的优势微生物变化趋势表现为由细菌向真菌转变,随后再由真菌回转为细菌的动态过程,其主要优势菌为谢瓦氏曲霉(Aspergillus chevalieri)、冠突曲霉(Aspergillus cristatus)、灰绿曲霉(Aspergillus griseus)、鸡葡萄球菌(Staphylococcus gallinarum)、糖多孢菌属菌株HNM0986(Saccharopolyspora sp.HNM0986)等。此外,在6个六堡茶样品中共鉴定出966551个基因,这些基因被注释到6个功能单元,其中以氨基酸的转运和代谢功能为主。研究发现,陈化中期曲霉属菌群的丰度及其能量转化代谢途径与六堡茶的理化指标和色泽呈显著正相关,微生物群落代谢中复杂的酶体系被认为是驱动六堡茶风味和色泽变化的关键因素。本研究揭示了六堡茶陈化过程中微生物的多样性及其功能基因,并初步探讨了微生物群体对化学成分的影响,为解析六堡茶微生物动态和茶汤成分形成提供了重要参考。 展开更多
关键词 六堡茶 宏基因组学 微生物多样性 化学成分 功能基因 代谢途径
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低钠腊肉风干贮藏期间微生物多样性变化
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作者 姚哲渊 顾仁勇 杨万根 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第18期61-68,共8页
为探究低钠腊肉在风干贮藏过程中微生物多样性和菌群结构变化,该文利用宏基因组学研究低钠腊肉在不同贮藏阶段(0~4个月)时微生物的多样性变化。宏基因组测序结果显示,腊肉样品包含7界、15门、28纲、46目、75科、121属和412种微生物。主... 为探究低钠腊肉在风干贮藏过程中微生物多样性和菌群结构变化,该文利用宏基因组学研究低钠腊肉在不同贮藏阶段(0~4个月)时微生物的多样性变化。宏基因组测序结果显示,腊肉样品包含7界、15门、28纲、46目、75科、121属和412种微生物。主要的优势菌属包括广布乳杆菌属、葡萄球菌属、拟梭菌属和曲霉属,而主要的优势种包括清酒广布乳杆菌、艰难拟梭菌、腐生葡萄球菌、弯曲广布乳杆菌、葡萄球菌、密歇根克雷伯氏菌、广布乳杆菌、脓肿拟分枝杆菌、科氏葡萄球菌和鸡葡萄球菌。直系同源基因簇(database of clusters of orthologous genes,COG)功能注释揭示,主要的代谢功能包括J类(翻译、核糖体结构和生物合成)、G类(碳水化合物转运和代谢)和E类(氨基酸转运和代谢)。与KEGG数据库比对后发现,主要的一级代谢通路包括“新陈代谢”和“人类疾病”,其相关的二级代谢通路分别是“碳水化合物代谢”、“氨基酸代谢”和“神经退行性疾病”。在低钠腊肉中,存在着丰富的微生物,尤其在贮藏的第2个月和第4个月,微生物活动活跃。随着贮藏时间的延长,低钠腊肉中出现了大量的致病菌和与人类疾病相关的代谢通路,这表明在腊肉的风干贮藏过程中,微生物群落会发生显著的变化,可能导致潜在风险。 展开更多
关键词 低钠腊肉 风干贮藏 微生物多样性 宏基因组学 代谢途径
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大庆龙凤湿地生物结皮对土壤理化性质及微生物多样性的影响 被引量:1
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作者 朱恩慈 刘涛 +4 位作者 孙新迪 杨佳霓 郑安旺 张爽 晏磊 《生态学报》 北大核心 2025年第15期7645-7659,共15页
生物结皮能对土壤的理化性质以及微生物多样性产生影响,目前缺乏对内陆盐碱湿地生态系统中生物土壤结皮的发育对其下层土壤作用的探究。对黑龙江省大庆市内龙凤湿地结皮发育前后的土壤以及结皮层的理化性质和酶活性进行了检测与分析,利... 生物结皮能对土壤的理化性质以及微生物多样性产生影响,目前缺乏对内陆盐碱湿地生态系统中生物土壤结皮的发育对其下层土壤作用的探究。对黑龙江省大庆市内龙凤湿地结皮发育前后的土壤以及结皮层的理化性质和酶活性进行了检测与分析,利用高通量测序技术、RDA分析细菌及真菌的丰度、群落结构及环境影响因子,利用PICRUSt、FUNguild探究具有显著丰度物种的功能。结果表明,结皮发育后大庆龙凤湿地下层土壤的盐碱度明显降低,有机碳、全磷、有机磷、速效钾的含量以及蔗糖酶、脲酶、碱性磷酸酶、过氧化氢酶的活性均显著提高,砂粒及粉粒的含量增高,结皮的发育能显著富集养分,改善土壤质地。微生物多样性分析显示,细菌群落多样性远高于真菌,结皮层及其下方土壤中的优势细菌、真菌丰度显著高于裸土。门水平上细菌主要以变形菌门、放线菌门和拟杆菌门为优势类群,真菌主要以子囊菌门和担子菌门为优势类群。属水平上优势细菌为Anditalea、Egicoccus、Mongoliibacter,优势真菌为Verticillium、Neocamarosporium、Fusarium。土壤养分对微生物丰富度的影响最大,其中,速效钾、碱解氮、有机碳、盐度和酸碱度是影响微生物群落组成的重要环境因子。研究还发现,真菌中内生菌-地衣寄生虫-植物病原体-未定义的腐生菌类群功能丰度最高;细菌主要注释到代谢功能集,其中丰度较高的为氨基酸代谢、糖代谢和辅助因子及维生素的代谢。丰度较高的细菌类群能有效稳土固沙,提高土壤养分含量,促进荒漠化土壤的修复。本研究结果为解析生物土壤结皮发育对湿地生态的修复作用提供了重要的微生物学理论依据。 展开更多
关键词 生物土壤结皮 理化性质 微生物多样性 功能 湿地
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基于高通量测序的城市绿地土壤微生物多样性评价
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作者 石兴宇 杨新建 +2 位作者 田璐 王伟青 张阳 《现代园艺》 2025年第10期172-174,共3页
基于城市绿地中土壤微生物多样性的重要性及其面临的挑战,探讨了高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的应用,分析了其在揭示土壤微生物群落结构与功能中的潜力。以期为城市绿地土壤管理提供参考。
关键词 高通量测序 城市绿地 土壤微生物多样性 生态功能
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不同间作模式对胶园土壤微生物功能多样性的影响 被引量:3
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作者 赵春梅 王文斌 +4 位作者 薛欣欣 张永发 任常琦 罗雪华 吴晓霜 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期286-293,共8页
【目的】研究不同间作模式对胶园土壤微生物群落功能多样性的影响,为今后橡胶林下间作模式优化和间作栽培管理提供科学依据。【方法】运用Biolog⁃ECO技术研究土壤微生物代谢功能特征,分析不同间作胶园土壤微生物碳源代谢活性和多样性的... 【目的】研究不同间作模式对胶园土壤微生物群落功能多样性的影响,为今后橡胶林下间作模式优化和间作栽培管理提供科学依据。【方法】运用Biolog⁃ECO技术研究土壤微生物代谢功能特征,分析不同间作胶园土壤微生物碳源代谢活性和多样性的差异。【结果】土壤微生物对碳源利用在培养216 h时达到稳定,不同处理的平均吸光值AWCD依次为橡胶/王草间作>橡胶/咖啡间作>橡胶/益智间作>纯林胶园。间作模式不仅增加了土壤微生物利用的碳源种类,还增强了碳源代谢活性,橡胶/王草间作土壤微生物对碳水化合物类、氨基酸类、酚酸类、羧酸类、多聚物类的代谢能力较强,橡胶/咖啡间作土壤微生物对胺类的代谢能力较强。主成分分析表明,间作胶园与纯林胶园之间土壤微生物碳源利用特征差异显著,橡胶/王草与橡胶/咖啡、橡胶/益智间作之间差异显著,橡胶/咖啡与橡胶/益智间作二者之间无显著差异。不同间作模式提高了胶园土壤微生物多样性指数,各处理之间的AWCD值和McIntosh指数差异显著,Shannon指数、Simpson指数无显著差异。相关性分析表明,胶园土壤微生物碳源代谢功能与土壤环境因子密切相关,土壤含水量、pH、有机质是影响胶园土壤碳源代谢差异的主要因子。【结论】橡胶林下间作王草、益智和咖啡作物有利于改善土壤生态环境,促进土壤碳源利用,提高土壤微生物群落功能多样性。 展开更多
关键词 间作 胶园 土壤微生物 碳源代谢 功能多样性
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废弃矿井环境中微生物多样性与代谢功能预测 被引量:1
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作者 杨启林 杨爱江 +2 位作者 李彦澄 张玉多 廖珣 《微生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期40-48,共9页
矿山废水已成为主要的环境污染问题之一,为探究废弃矿井排水生态环境中的微生物群落多样性和功能,选取贵州省遵义市某废弃煤矿,采用16S rRNA基因高通量测序技术研究矿井巷道表层沉积物的细菌和古菌群落组成。结果表明,所有样品中细菌多... 矿山废水已成为主要的环境污染问题之一,为探究废弃矿井排水生态环境中的微生物群落多样性和功能,选取贵州省遵义市某废弃煤矿,采用16S rRNA基因高通量测序技术研究矿井巷道表层沉积物的细菌和古菌群落组成。结果表明,所有样品中细菌多样性和丰度均高于古菌,细菌群落由52个门820个属组成,其优势菌属主要为A4b科中属水平的未定细菌、SBR1031目中属水平的未定细菌和KD4-96纲中属水平的未定细菌;古菌群落由12个门58个属组成,优势菌门为泉古菌门(Crenarchaeota),优势菌属主要为暂定属Candidatus_Nitrocosmicus和暂定属Candidatus_Nitrsosphaera。PICRUSt2功能预测表明,细菌中包含3条硫代谢循环途径,分别为同化硫酸盐还原、异化硫酸盐氧化/还原和SOX络合物氧化硫代硫酸盐,古菌中包含2条硫代谢循环途径,分别为同化硫酸盐还原和SOX络合物氧化硫代硫酸盐,共检测到18个细菌硫代谢基因和13个古菌硫代谢基因。关于废弃矿井环境中的微生物及其代谢功能分析,能进一步拓展对矿山环境微生物系统的认识。 展开更多
关键词 矿山环境 细菌与古菌群落 多样性 功能预测 代谢循环
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棕榈科植物根内生细菌的分离及根际土微生物多样性分析
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作者 谢晓铃 李维波 +4 位作者 陈帅 王欣玥 王贺 余代杨 叶文雨 《青海农林科技》 2025年第3期8-12,41,共6页
为深入探究棕榈科三种植物根际土壤微生物群落的功能特征,本研究首先运用Biolog-ECO技术,选取蛇皮果、狐尾椰等三种棕榈科植物作为研究对象,分析其土壤微生物群落代谢活性的变化、碳源的利用情况。基于试验培养120 h根际土壤微生物的AWC... 为深入探究棕榈科三种植物根际土壤微生物群落的功能特征,本研究首先运用Biolog-ECO技术,选取蛇皮果、狐尾椰等三种棕榈科植物作为研究对象,分析其土壤微生物群落代谢活性的变化、碳源的利用情况。基于试验培养120 h根际土壤微生物的AWCD值综合分析得,香棕对多聚物类碳源的利用率最高,AWCD值为1.44,蛇皮果最低,为0.97。其次,采用培养基培养法从狐尾椰根部分离出阿耶波多杆菌(Bacillus aryabhata),从蛇皮果根部分离出巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)。并对两种内生菌进行理化性质的测定,结果表明,双氧水、甲基红均为阳性,油脂水解均为阴性。该研究明晰棕榈科三种植物根际土壤微生物群落对不同碳源的利用差异,同时挖掘根际效应对土壤微生物群落功能的潜在影响。 展开更多
关键词 棕榈科植物 根际土壤 Biolog-ECO技术 代谢功能多样性 内生细菌
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基于宏基因组技术分析自然发酵羊肉香肠中微生物多样性及挥发性风味功能基因 被引量:6
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作者 牛茵 吴双慧 +3 位作者 何济坤 蔡自建 尤天棋 陈娟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第2期139-148,共10页
利用宏基因组技术测定自然发酵过程中羊肉香肠的微生物群落演替,并运用直系同源蛋白分组比对、京都基因与基因组百科全书和碳水化合物活性酶数据库对挥发性风味物质代谢途径、参与代谢的微生物和酶进行注释与分析。结果发现,羊肉香肠样... 利用宏基因组技术测定自然发酵过程中羊肉香肠的微生物群落演替,并运用直系同源蛋白分组比对、京都基因与基因组百科全书和碳水化合物活性酶数据库对挥发性风味物质代谢途径、参与代谢的微生物和酶进行注释与分析。结果发现,羊肉香肠样品中流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、酒类酒球菌等是发酵过程的优势菌种,样品发酵至14d腐生葡萄球菌与马胃葡萄球菌相对丰度达到最大值(16.52%与10.53%)。在发酵0、5、14d和26d样品中,发酵5d样品注释到的基因数最多,发酵过程中碳水化合物代谢和氨基酸代谢是注释最多的代谢途径,糖苷水解酶与糖基转移酶是数量最多的碳水化合物酶。有167个基因参与氨基酸代谢所需酶的编码,碳水化合物代谢途径所需酶由217个基因编码,脂肪酸代谢途径中共有92个基因参与了相关酶的编码,参与3条代谢途径的酶注释到的微生物主要是葡萄球菌属、明串珠菌属、假单胞菌属、嗜冷杆菌属、弧菌属等,发酵14d样品中3条代谢途径的大部分酶丰度达到最大值。研究结果对于解析羊肉香肠中微生物的动态变化以及挥发性风味物质的形成机理具有重要的参考价值。 展开更多
关键词 羊肉香肠 宏基因组学 微生物多样性 挥发性风味物质 代谢途径 功能基因
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微生物次级代谢产物多样性发掘方法 被引量:2
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作者 方岫琴 王文璟 +5 位作者 李华东 张晓婷 朱天骄 车茜 李德海 张国建 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期415-426,共12页
微生物次级代谢产物是微生物在生长过程中产生的非必需性代谢产物,其往往具有独特的生物活性。随着对微生物次级代谢产物多样性研究的不断深入开展,研究者逐渐发现在实验室的常规培养条件下微生物的代谢潜能不能完全被激发,从中可获得... 微生物次级代谢产物是微生物在生长过程中产生的非必需性代谢产物,其往往具有独特的生物活性。随着对微生物次级代谢产物多样性研究的不断深入开展,研究者逐渐发现在实验室的常规培养条件下微生物的代谢潜能不能完全被激发,从中可获得的天然产物结构类型远远少于其代谢潜能所决定的数量。近年来,随着基因组技术、分子生物学技术特别是合成生物学相关技术的发展,研究人员开发了如OSMAC、表观遗传、异源表达等多种方法,从多个角度多层次地发掘次级代谢产物多样性。这些方法有效激活潜在的生物合成基因簇、提高了微生物次级代谢产物多样性,加之与高通量筛选方法联合应用,能够显著改善了微生物活性天然产物的发现效率。本文综述了微生物次级代谢潜能的激活以及代谢产物高效筛选的方法和技术,为提高微生物次级代谢产物多样性发掘,加快先导化合物的发现提供参考。 展开更多
关键词 微生物次级代谢产物 沉默基因簇 代谢潜能 激活 结构多样性
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