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当归挥发油对自发性高血压大鼠心肌组织中微小RNA差异表达谱的影响 被引量:12
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作者 伊琳 陈蓓蓓 +3 位作者 孙少伯 杨陇 纪禄风 石向慧 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期671-675,共5页
目的:探讨当归挥发油对自发性高血压大鼠(SHRs)心肌组织中微小RNA(miRNA)表达谱的影响,阐明当归挥发油发挥作用的可能机制。方法:将SHRs分为模型组、卡托普利组和当归组,取同周龄的正常Wistar大鼠作为对照组,采用无创套尾法测定... 目的:探讨当归挥发油对自发性高血压大鼠(SHRs)心肌组织中微小RNA(miRNA)表达谱的影响,阐明当归挥发油发挥作用的可能机制。方法:将SHRs分为模型组、卡托普利组和当归组,取同周龄的正常Wistar大鼠作为对照组,采用无创套尾法测定大鼠尾动脉收缩压,给药4周后,采用Affymetrix miRNA 4.0芯片测定心肌组织中miRNA表达谱,采用京东基因与基因组百科全书(KEGG)富集法分析差异表达的miRNA靶基因。结果:给药前模型组大鼠收缩压明显高于对照组(P〈0.05),连续服药1~4周后,卡托普利组和当归组大鼠收缩压明显低于模型组(P〈0.05)。与模型组比较,当归组大鼠差异表达的miRNA 29个,其中表达上调的miRNA 13个(Ratio〉2.0,P〈0.05),表达下调的miRNA 16个(Ratio〈0.5,P〈0.05)。KEGG富集分析,miR-19a、let-7i和miR-181c与胰岛素信号通路有关联(P〈0.05),let-7i、miR-181a和miR-455与血管内皮生长因子(VEGF)信号通路调控有关联(P〈0.05),miR-122、miR-181a、miR-200b、miR-181c、let-7i和miR-19a与细胞凋亡有关联(P〈0.05)。结论:当归挥发油可降低SHRs血压,对SHRs心肌组织中miRNA表达谱产生影响,可能通过调节胰岛素信号通路及VEGF信号通路相关miRNA发挥血压调节作用。 展开更多
关键词 当归挥发油 大鼠 近交SHR 微小rna表达谱
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高脂饮食诱导胰岛素抵抗小鼠血浆microRNA表达谱及其与TLR4的关系 被引量:3
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作者 马科 朱晓波 +1 位作者 徐志伟 常晓彤 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1745-1752,共8页
目的:筛选高脂饮食诱导的胰岛素抵抗小鼠,以及应用Toll样受体4(Toll-like receptor4,TLR4)抑制剂TAK-242干预的胰岛素抵抗小鼠血浆差异表达的微小RNA(microRNA,miRNA),探讨胰岛素抵抗、TLR4和差异表达miRNAs的关系。方法:血浆标本来自... 目的:筛选高脂饮食诱导的胰岛素抵抗小鼠,以及应用Toll样受体4(Toll-like receptor4,TLR4)抑制剂TAK-242干预的胰岛素抵抗小鼠血浆差异表达的微小RNA(microRNA,miRNA),探讨胰岛素抵抗、TLR4和差异表达miRNAs的关系。方法:血浆标本来自前期实验的3组小鼠,即以普通基础饲料喂养(Low fat diet,LFD)的正常对照组、给予TAK-242的高脂饮食组(Treated high fat diet,HFD-T)和单纯高脂饮食组HFD-C,应用小鼠miRNA芯片检测血浆miRNA表达谱,筛选差异表达的miRNAs;采用实时荧光定量PCR方法验证芯片结果。应用生物信息学方法,以TLR4及其信号传导通路为中心,预测差异表达miRNAs的靶基因,并对靶基因分别进行GO和KEGG富集分析,以判定差异miRNAs主要影响的生物学功能或者通路。结果:miRNA基因芯片筛查结果显示,单纯高脂饮食组与正常饮食组比对,筛选出差异显著的miRNAs共计185种,其中6种miRNAs表达上调,179种miRANs表达下调;给予TAK-242的高脂饮食组与正常饮食组比对,筛选出差异显著的miRANs共计171种,均表达下调;给予TAK-242的高脂饮食组与单纯高脂饮食组比对,筛选出差异表达的miRNAs共计13种,均为下调。生物信息学分析结果显示,以TLR4为中心挖掘与其互作的蛋白质,共发现有10种蛋白;在TAK-242给予的高脂饮食组与单纯高脂饮食组中差异表达倍数均在1 000以上的4种miRNAs(mmu-miR-3095-3p、mmu-miR-5113、mmu-miR-709和mmumiR-335-3p),可在TLR4的互作蛋白质或Toll样受体信号通路中找到其作用的靶基因,发现这些靶基因74%属于生物过程基因,其中转录调控因子占82%。实时荧光定量PCR检测mmu-miR-3095-3p、mmu-miR-5113、mmu-miR-709和mmu-miR-335-3p水平,变化趋势与芯片结果一致。结论:胰岛素抵抗发生时,血浆miRNAs表达谱存在改变,此变化与TLR4及其信号通路相关。该研究结果丰富了胰岛素抵抗发生的机制,为寻找胰岛素抵抗血浆miRNAs诊断标志物提供了实验依据。 展开更多
关键词 高脂饮食 胰岛素抵抗 Toll样受体4 微小rna表达谱
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血小板miRNA的表达谱分析
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作者 王玉青 庄云龙 谯铭铭 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期256-263,共8页
目的:研究在体外常规储存1、3和5 d血小板微小RNA(mi RNA)的表达谱,探讨mi RNA在血小板储存期的变化。方法:留取来自无偿献血捐献者单采血小板20份,摇匀后等量混合,贮存于(22±2)℃恒温血小板振荡保存箱中。分别在d 1、3和5取样(分... 目的:研究在体外常规储存1、3和5 d血小板微小RNA(mi RNA)的表达谱,探讨mi RNA在血小板储存期的变化。方法:留取来自无偿献血捐献者单采血小板20份,摇匀后等量混合,贮存于(22±2)℃恒温血小板振荡保存箱中。分别在d 1、3和5取样(分别命名为C_1、C_3和C_5),应用DNA纳米球(DNB)测序技术对血小板mi RNA组进行测序,采用每千百万碱基的转录本(TPM)算法标准化mi RNA的表达水平,组间mi RNA表达差异>2倍(P<0.001)认为表达差异具有统计学意义。采用实时荧光定量PCR方法验证mi RNA的表达。结果:通过DNB测序,分别获得C_1、C_3和C_5组688、730和679个表达的血小板mi RNA,聚类分析表明其表达谱发生明显变化。在C_1、C_3和C_5组中前20个高表达mi RNA的表达量约占各组mi RNA总表达量的4/5,各组前5位的mi RNA均为mi R-21-5p、mi R-26a-5p、mi R-199a-3p、mi R-126-3p和let-7f-5p。C_1、C_3和C_5组血小板高表达的55个mi RNA(>1000 TPM)组间表达模式高度相似,其差异无统计学意义(P>0.05)。通过对高表达mi RNA(>1000 TPM)在各组中的差异表达分析发现,与C_1组相比,C_3组共有6个mi RNA显著差异表达,其中表达上调的是mi R-146a-5p、mi R-379-5p和mi R-486-5p,表达下调的是mi R-652-3p、mi R-142-5p和mi R-7-5p;C_5组共有4个mi RNA显著差异表达,表达上调的是mi R-146a-5p和let-7b-5p,表达下调的是mi R-30d-5p和mi R-142-5p。对表达量为1-1000 TPM之间mi RNA差异表达分析发现,与C_1组相比,C_3组有133个显著差异表达的mi RNA,其中表达上调是99个,表达下调是34个;C_5组中有77个显著差异表达的mi RNA,其中表达上调是31个,表达下调是46个。检测的6个差异表达mi RNA的荧光定量PCR结果与测序结果基本一致。结论:通过对储存1、3和5 d血小板mi RNA组进行测序,发现随着血小板体外储存时间的延长,mi RNA表达谱发生明显改变。 展开更多
关键词 血小板 微小rna表达谱 测序 表达分析 荧光定量PCR
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宫颈鳞癌MicroRNA差异表达的研究 被引量:10
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作者 陈军莹 姚德生 +2 位作者 贺婵娟 卢艳 欧婷瑜 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2014年第1期83-87,共5页
目的:利用杂交芯片技术筛选宫颈鳞癌发病相关微小RNA(miRNA)。方法:本研究为双盲实验,选择2011年10月在广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科接受检查、治疗的9例患者为研究对象,其中,晚期宫颈浸润癌(A组)3例,中早期浸润癌(B组)3例,正常对照(... 目的:利用杂交芯片技术筛选宫颈鳞癌发病相关微小RNA(miRNA)。方法:本研究为双盲实验,选择2011年10月在广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科接受检查、治疗的9例患者为研究对象,其中,晚期宫颈浸润癌(A组)3例,中早期浸润癌(B组)3例,正常对照(C组)3例。留取治疗前宫颈组织,分组用杂交芯片检查1 450种miRNA,分析组间差异表达的miRNA。采用实时荧光定量PCR测定miR-16、miR-21、miR-34a水平,对芯片结果进行初步验证。结果:(1)在表达水平较高的miRNA中,共有90种miRNA在三组间存在差异表达,其中,在癌组织中高表达的有miR-1275、hsa-miR-1290、miR-2392、miR-3149、miR-3934、miR-3945、miR-4299、miR-4455、miR-4484、miR-4653-3p、miR-4667-5p、miR-4725-3p、miR-4792、miR-513a-5p、miR-574-5p、miR-765等;低表达的有:miR-100、miR-125a-5p、miR-125b、miR-126、miR-143、miR-145、miR-203、miR-26a、miR-3185、miR-4324、miR-4467等。(2)实时荧光定量PCR检测miR-21、miR-34a相对表达水平(内参miR-16),结果与杂交芯片一致,两种检测方法无统计学差别。结论:miRNA在宫颈鳞癌组织与正常宫颈组织间存在差异表达,miRNA表达谱分析将为宫颈癌的诊断和治疗提供新的依据。 展开更多
关键词 宫颈肿瘤 微小rna 微小rna表达谱
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