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哺乳动物抗凝血酶基因的分子特征、微共线性与适应性进化
1
作者
张国俊
胡利宗
+1 位作者
李书粉
宋向凤
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期104-110,共7页
抗凝血酶(AT)是哺乳动物体内重要的天然抗凝血因子之一,它隶属于丝氨酸蛋白酶抑制物家族,主要参与并调节复杂的血凝过程。基于比较基因组学手段,共挖掘出17个哺乳动物抗凝血酶基因(AT),并剖析了它们的基因结构、微共线性、保守基序、功...
抗凝血酶(AT)是哺乳动物体内重要的天然抗凝血因子之一,它隶属于丝氨酸蛋白酶抑制物家族,主要参与并调节复杂的血凝过程。基于比较基因组学手段,共挖掘出17个哺乳动物抗凝血酶基因(AT),并剖析了它们的基因结构、微共线性、保守基序、功能结构域、以及系统进化关系。基因结构与微共线分析表明,哺乳动物AT基因具有5-12个外显子,大多数是7个外显子;不同物种AT基因所处区段之间具有较好的共线性。哺乳动物AT蛋白特征分析显示,SERPIN功能结构域与保守基序1、2、3、4、5、8和9存在相互重叠的部分。AT基因进化树揭示基因进化和通常认为的物种进化几乎一致。同时,利用PAML中Codeml的位点特异模型在AT基因中发掘了1个正选择位点328D。
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关键词
哺乳动物
抗凝血酶
微共线性
保守基序
进化
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职称材料
主要禾谷类作物比较基因组学研究策略与进展
被引量：
8
2
作者
王磊
陈景堂
张祖新
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第9期1055-1060,共6页
随着拟南芥、水稻等模式植物基因组测序计划的完成,比较基因组学作为一门新兴学科,近年来发展迅速,为植物基因组的进化、结构和功能研究开辟了新的途径。文章综述了比较基因组学在作物比较遗传作图、基因结构区域的微共线性、ESTs和蛋...
随着拟南芥、水稻等模式植物基因组测序计划的完成,比较基因组学作为一门新兴学科,近年来发展迅速,为植物基因组的进化、结构和功能研究开辟了新的途径。文章综述了比较基因组学在作物比较遗传作图、基因结构区域的微共线性、ESTs和蛋白质水平的比较以及基于比较基因组学的基因和QTL的克隆等方面内容与研究进展,分析了不同水平上比较基因组学研究策略的原理、特点、可行性,以期为利用模式生物的基因和基因组数据、采用比较基因组学策略克隆作物重要性状功能基因、阐明基因组结构与进化提供帮助。
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关键词
比较遗传作图
同
线性
微共线性
基因组
数量性状位点(QTL)
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职称材料
林木比较基因组学研究进展
被引量：
4
3
作者
王源秀
徐立安
+1 位作者
黄敏仁
许远
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第10期1199-1206,共8页
比较基因组学是基因组学研究的重要内容。比较基因组学研究结果表明,有可能将近缘种统一起来建立超越物种界限的大遗传系统,这对于林木而言具有更重要的意义。有关林木比较基因组学研究主要集中在杨柳科、松科、蔷薇科、壳斗科和金缕梅...
比较基因组学是基因组学研究的重要内容。比较基因组学研究结果表明,有可能将近缘种统一起来建立超越物种界限的大遗传系统,这对于林木而言具有更重要的意义。有关林木比较基因组学研究主要集中在杨柳科、松科、蔷薇科、壳斗科和金缕梅科的一些树种中。研究发现林木近缘种基因组中存在广泛的共线性或同线性及微共线性,在进化过程中呈现高度保守性;通过双向比对发现:杨树和拟南芥基因组中有13 019对同源基因的序列一致性平均达93%,其中11 654对同源基因的序列一致性超过基因长度的90%。文章概述了林木比较基因组学研究的进展状况,探讨了该领域的发展趋势,以期为我国林木基因组学研究提供有益的参考。
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关键词
林木
比较基因组学
共线性
或同
线性
微共线性
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职称材料
题名
哺乳动物抗凝血酶基因的分子特征、微共线性与适应性进化
1
作者
张国俊
胡利宗
李书粉
宋向凤
机构
新乡医学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期104-110,共7页
基金
河南省教育厅骨干教师资助项目(2009年度)
文摘
抗凝血酶(AT)是哺乳动物体内重要的天然抗凝血因子之一,它隶属于丝氨酸蛋白酶抑制物家族,主要参与并调节复杂的血凝过程。基于比较基因组学手段,共挖掘出17个哺乳动物抗凝血酶基因(AT),并剖析了它们的基因结构、微共线性、保守基序、功能结构域、以及系统进化关系。基因结构与微共线分析表明,哺乳动物AT基因具有5-12个外显子,大多数是7个外显子;不同物种AT基因所处区段之间具有较好的共线性。哺乳动物AT蛋白特征分析显示,SERPIN功能结构域与保守基序1、2、3、4、5、8和9存在相互重叠的部分。AT基因进化树揭示基因进化和通常认为的物种进化几乎一致。同时,利用PAML中Codeml的位点特异模型在AT基因中发掘了1个正选择位点328D。
关键词
哺乳动物
抗凝血酶
微共线性
保守基序
进化
Keywords
Mammals Antithrombin Microsynteny Conserved motif Evolution
分类号
R392.1 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
主要禾谷类作物比较基因组学研究策略与进展
被引量：
8
2
作者
王磊
陈景堂
张祖新
机构
河北农业大学作物遗传育种系
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第9期1055-1060,共6页
基金
国家重点基础研究发展规划项目资助(编号:2006CB101705)~~
文摘
随着拟南芥、水稻等模式植物基因组测序计划的完成,比较基因组学作为一门新兴学科,近年来发展迅速,为植物基因组的进化、结构和功能研究开辟了新的途径。文章综述了比较基因组学在作物比较遗传作图、基因结构区域的微共线性、ESTs和蛋白质水平的比较以及基于比较基因组学的基因和QTL的克隆等方面内容与研究进展,分析了不同水平上比较基因组学研究策略的原理、特点、可行性,以期为利用模式生物的基因和基因组数据、采用比较基因组学策略克隆作物重要性状功能基因、阐明基因组结构与进化提供帮助。
关键词
比较遗传作图
同
线性
微共线性
基因组
数量性状位点(QTL)
Keywords
comparative genetic mapping
synteny
microcollinearity
genome
quantitative trait locus
分类号
S33 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
林木比较基因组学研究进展
被引量：
4
3
作者
王源秀
徐立安
黄敏仁
许远
机构
国家林业局江苏省林木遗传与基因工程重点实验室南京林业大学
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第10期1199-1206,共8页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30230300)资助~~
文摘
比较基因组学是基因组学研究的重要内容。比较基因组学研究结果表明,有可能将近缘种统一起来建立超越物种界限的大遗传系统,这对于林木而言具有更重要的意义。有关林木比较基因组学研究主要集中在杨柳科、松科、蔷薇科、壳斗科和金缕梅科的一些树种中。研究发现林木近缘种基因组中存在广泛的共线性或同线性及微共线性,在进化过程中呈现高度保守性;通过双向比对发现:杨树和拟南芥基因组中有13 019对同源基因的序列一致性平均达93%,其中11 654对同源基因的序列一致性超过基因长度的90%。文章概述了林木比较基因组学研究的进展状况,探讨了该领域的发展趋势,以期为我国林木基因组学研究提供有益的参考。
关键词
林木
比较基因组学
共线性
或同
线性
微共线性
Keywords
forest tree
comparative genomics
synteny or collinarity
microsynteny
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
哺乳动物抗凝血酶基因的分子特征、微共线性与适应性进化
张国俊
胡利宗
李书粉
宋向凤
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
主要禾谷类作物比较基因组学研究策略与进展
王磊
陈景堂
张祖新
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
林木比较基因组学研究进展
王源秀
徐立安
黄敏仁
许远
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007
4
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职称材料
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