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引物组合法在利用DNA指纹鉴定玉米自交系真伪中的应用研究
被引量：
24
1
作者
郭景伦
赵久然
+3 位作者
孔艳芳
尉德铭
卢柏山
王元东
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2000年第2期27-31,共5页
利用RAPD分子标记方法对我国 4 6个骨干玉米自交系进行了鉴定研究 ,结果表明 ,仅用A6 ,C6 ,D2 ,F10 ,H19,N19等 6个引物的指纹组合即可将这 4 6个自交系相互区分开来 ,不需要针对每个自交系筛选特异性标记 ,克服了利用特异性标记鉴定玉...
利用RAPD分子标记方法对我国 4 6个骨干玉米自交系进行了鉴定研究 ,结果表明 ,仅用A6 ,C6 ,D2 ,F10 ,H19,N19等 6个引物的指纹组合即可将这 4 6个自交系相互区分开来 ,不需要针对每个自交系筛选特异性标记 ,克服了利用特异性标记鉴定玉米自交系的局限性 ;研究出基于WINDOWS98操作平台的玉米DNA指纹数据库和指纹分析软件。并且该数据库和分析软件对自交系的数量和引物数量都是开放性的 ,如果要区分开m个自交系 ,最多只用n个引物即可 ,二者的关系是 :2 n≥m。
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关键词
引物组合法
玉米
DNA指纹鉴定
自交系
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职称材料
基于引物“随机组合”构建观赏桃SSR指纹图谱
被引量：
6
2
作者
王清明
程怡
+2 位作者
马建伟
张云婷
张勇
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期289-296,341,共9页
近年来，我国观赏桃新品种日渐繁多、名称混乱、市场难以监管。同时用以区分品种的SSR指纹图谱的构建方法在研究界无统一的科学标准，尤其是构成最终引物组合的核心引物的确定。具体操作流程层出不穷、五花八门。为探索筛选SSR指纹图谱...
近年来，我国观赏桃新品种日渐繁多、名称混乱、市场难以监管。同时用以区分品种的SSR指纹图谱的构建方法在研究界无统一的科学标准，尤其是构成最终引物组合的核心引物的确定。具体操作流程层出不穷、五花八门。为探索筛选SSR指纹图谱核心引物的科学方法，同时构建观赏桃SSR指纹图谱，该研究选用35对已报道的SSR引物对22份观赏桃种质进行试验。结果表明：通过PCR扩增与分析，多态性较高的8对引物——候选引物总共扩增出31个多态性条带，变幅为3～5个．PIC值变幅为0．458～0．668，MI值变幅为1．374～3.340。采用“随机组合”法对8对引物进行C18、C28、C38…依次分析，得到区分能力最强的3种不同的最少引物组合方式——候选组合，并能区分出18份种质．从中发现区分能力最强的3种引物组合方式并不都是由引物PIC值、alleles数量或MI值等多态性指标最高的引物组成，而是由互补性最强的引物组成。选用组合内各引物多态性条带总数最多的组合方式“4—3”（BPPCT001＋BPPCT015a＋BPPcT017＋BPPcT025）为22份观赏桃种质构建了指纹图谱。基于此，通过常规多态性指标筛选候选引物可以确定出单对引物鉴别能力最强的少量引物；通过“随机组合”筛选候选组合可以进一步确定出引物之间互补性最强的几种组合方式；根据组合内各引物的多态性条带总数确定最终核心引物可以确定出可扩容性最大的引物组合。该研究最终建立了候选引物——候选组合——核心引物组合“三步法”确定SSR指纹图谱核心引物组合的科学方法，不仅为22份供试观赏桃种质构建了SSR指纹图谱，也为其它作物SSR指纹图谱的构建提供了新的思路。
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关键词
观赏桃
种质
SSR标记
分子身份证
引物组合法
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职称材料
题名
引物组合法在利用DNA指纹鉴定玉米自交系真伪中的应用研究
被引量：
24
1
作者
郭景伦
赵久然
孔艳芳
尉德铭
卢柏山
王元东
机构
北京市农林科学院玉米研究中心
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2000年第2期27-31,共5页
文摘
利用RAPD分子标记方法对我国 4 6个骨干玉米自交系进行了鉴定研究 ,结果表明 ,仅用A6 ,C6 ,D2 ,F10 ,H19,N19等 6个引物的指纹组合即可将这 4 6个自交系相互区分开来 ,不需要针对每个自交系筛选特异性标记 ,克服了利用特异性标记鉴定玉米自交系的局限性 ;研究出基于WINDOWS98操作平台的玉米DNA指纹数据库和指纹分析软件。并且该数据库和分析软件对自交系的数量和引物数量都是开放性的 ,如果要区分开m个自交系 ,最多只用n个引物即可 ,二者的关系是 :2 n≥m。
关键词
引物组合法
玉米
DNA指纹鉴定
自交系
Keywords
Primer combination
Maize
DNA fingerprint
Identification
分类号
S513.033 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
基于引物“随机组合”构建观赏桃SSR指纹图谱
被引量：
6
2
作者
王清明
程怡
马建伟
张云婷
张勇
机构
四川农业大学园艺学院
广元市农业科学研究院
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期289-296,341,共9页
基金
四川省教育厅重点项目(12ZZ011)
四川农业大学学科建设"双支"计划项目
教育部留学归国人员资助项目~~
文摘
近年来，我国观赏桃新品种日渐繁多、名称混乱、市场难以监管。同时用以区分品种的SSR指纹图谱的构建方法在研究界无统一的科学标准，尤其是构成最终引物组合的核心引物的确定。具体操作流程层出不穷、五花八门。为探索筛选SSR指纹图谱核心引物的科学方法，同时构建观赏桃SSR指纹图谱，该研究选用35对已报道的SSR引物对22份观赏桃种质进行试验。结果表明：通过PCR扩增与分析，多态性较高的8对引物——候选引物总共扩增出31个多态性条带，变幅为3～5个．PIC值变幅为0．458～0．668，MI值变幅为1．374～3.340。采用“随机组合”法对8对引物进行C18、C28、C38…依次分析，得到区分能力最强的3种不同的最少引物组合方式——候选组合，并能区分出18份种质．从中发现区分能力最强的3种引物组合方式并不都是由引物PIC值、alleles数量或MI值等多态性指标最高的引物组成，而是由互补性最强的引物组成。选用组合内各引物多态性条带总数最多的组合方式“4—3”（BPPCT001＋BPPCT015a＋BPPcT017＋BPPcT025）为22份观赏桃种质构建了指纹图谱。基于此，通过常规多态性指标筛选候选引物可以确定出单对引物鉴别能力最强的少量引物；通过“随机组合”筛选候选组合可以进一步确定出引物之间互补性最强的几种组合方式；根据组合内各引物的多态性条带总数确定最终核心引物可以确定出可扩容性最大的引物组合。该研究最终建立了候选引物——候选组合——核心引物组合“三步法”确定SSR指纹图谱核心引物组合的科学方法，不仅为22份供试观赏桃种质构建了SSR指纹图谱，也为其它作物SSR指纹图谱的构建提供了新的思路。
关键词
观赏桃
种质
SSR标记
分子身份证
引物组合法
Keywords
ornamental peach, germplasm, SSR marker, molecular ID, primer combination method
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
引物组合法在利用DNA指纹鉴定玉米自交系真伪中的应用研究
郭景伦
赵久然
孔艳芳
尉德铭
卢柏山
王元东
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2000
24
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于引物“随机组合”构建观赏桃SSR指纹图谱
王清明
程怡
马建伟
张云婷
张勇
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016
6
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职称材料
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