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基于转录组学的粉葛葛根素生物合成相关基因挖掘
被引量：
1
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作者
周豪楠
马喜玲
+5 位作者
涂志伟
李林桐
胡远锋
肖旭峰
罗莎
范淑英
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第5期30-37,共8页
挖掘与粉葛葛根素生物合成的相关基因,为相关控制基因的验证及深入研究提供理论参考。对6个生长时期的粉葛块根进行转录组测序,在葛根素含量最高时期与最低时期初步筛选差异表达基因,对各时期葛根素及其上下游代谢物含量变化趋势与差异...
挖掘与粉葛葛根素生物合成的相关基因,为相关控制基因的验证及深入研究提供理论参考。对6个生长时期的粉葛块根进行转录组测序,在葛根素含量最高时期与最低时期初步筛选差异表达基因,对各时期葛根素及其上下游代谢物含量变化趋势与差异表达基因相对表达量进行相关性分析,最终挖掘出相关性较高的基因片段。结果表明,经2步筛选差异基因后,挖掘11个与粉葛葛根素生物合成相关的片段,共编码3个基因,分别为异黄酮羟化酶控制基因(I2′H)、异黄酮7-O-葡糖苷转移酶控制基因(IF7GT)和异黄酮合酶控制基因(IFS1),其中I2′H、IF7GT、IFS1均与葛根素的生物合成呈现正向相关,即均正向调控葛根素的生物合成。说明I2′H与IF7GT所编码的酶主要负责调控大豆苷元向芒柄花素和大豆苷的合成,两者同为葛根素上游代谢物的支链代谢物,因此与葛根素的含量呈正向相关,而IFS1则通过调控2,7,4′-3-羟基异黄酮的生物合成与异甘草素向葛根素的直接合成,最终调控葛根素生物合成进程。
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关键词
粉葛
葛根素
转录组
异
黄
酮
羟化
酶
控制
基因
异黄酮7-o-葡糖苷转移酶控制基因
异
黄
酮
合
酶
控制
基因
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题名
基于转录组学的粉葛葛根素生物合成相关基因挖掘
被引量：
1
1
作者
周豪楠
马喜玲
涂志伟
李林桐
胡远锋
肖旭峰
罗莎
范淑英
机构
江西农业大学农学院
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第5期30-37,共8页
基金
江西省现代农业产业技术体系-葛栽培岗资助项目(编号:050014-9021107274)。
文摘
挖掘与粉葛葛根素生物合成的相关基因,为相关控制基因的验证及深入研究提供理论参考。对6个生长时期的粉葛块根进行转录组测序,在葛根素含量最高时期与最低时期初步筛选差异表达基因,对各时期葛根素及其上下游代谢物含量变化趋势与差异表达基因相对表达量进行相关性分析,最终挖掘出相关性较高的基因片段。结果表明,经2步筛选差异基因后,挖掘11个与粉葛葛根素生物合成相关的片段,共编码3个基因,分别为异黄酮羟化酶控制基因(I2′H)、异黄酮7-O-葡糖苷转移酶控制基因(IF7GT)和异黄酮合酶控制基因(IFS1),其中I2′H、IF7GT、IFS1均与葛根素的生物合成呈现正向相关,即均正向调控葛根素的生物合成。说明I2′H与IF7GT所编码的酶主要负责调控大豆苷元向芒柄花素和大豆苷的合成,两者同为葛根素上游代谢物的支链代谢物,因此与葛根素的含量呈正向相关,而IFS1则通过调控2,7,4′-3-羟基异黄酮的生物合成与异甘草素向葛根素的直接合成,最终调控葛根素生物合成进程。
关键词
粉葛
葛根素
转录组
异
黄
酮
羟化
酶
控制
基因
异黄酮7-o-葡糖苷转移酶控制基因
异
黄
酮
合
酶
控制
基因
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组学的粉葛葛根素生物合成相关基因挖掘
周豪楠
马喜玲
涂志伟
李林桐
胡远锋
肖旭峰
罗莎
范淑英
《江苏农业科学》
北大核心
2023
1
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