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苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 赵海霞 李成磊 +2 位作者 白悦辰 陈惠 吴琦 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第11期210-214,共5页
利用RT-PCR技术,从苦荞(Fagopyrum tatarium)中克隆得到类异黄酮还原酶基因(IRL)的开放阅读框序列(ORF),命名为FtIRL。序列分析表明:FtIRL含一个长942bp的ORF,编码313个氨基酸,其氨基酸序列与金荞异黄酮还原酶FcIFR(GenBank登录号ABV020... 利用RT-PCR技术,从苦荞(Fagopyrum tatarium)中克隆得到类异黄酮还原酶基因(IRL)的开放阅读框序列(ORF),命名为FtIRL。序列分析表明:FtIRL含一个长942bp的ORF,编码313个氨基酸,其氨基酸序列与金荞异黄酮还原酶FcIFR(GenBank登录号ABV02071)同源性最高,达到97%;与其他植物IRL同源性为44%~73%。生物信息学分析表明:FtIRL推导的蛋白质含有典型的底物结合口袋和保守的NADPH结合位点,符合短链脱氢酶家族的结构特征。构建基于氨基酸的系统发育树表明,苦荞FcIFR虽然在氨基酸序列上与其他植物的异黄酮还原酶(IFR)有较高的同源性,但其生物学功能可能更接近落叶松脂醇还原酶(PLR)。 展开更多
关键词 苦荞 异黄酮还原酶 基因克隆 序列分析
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甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析 被引量:3
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作者 谢晓娜 张小秋 +3 位作者 邵敏 朱惠 杨丽涛 李杨瑞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期130-137,共8页
采用RT-PCR技术从甘蔗中克隆So IRL基因,用生物信息学方法对获得的氨基酸序列进行分析,利用荧光定量PCR技术研究So IRL基因在甘蔗不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。结果表明,克隆获得甘蔗So IRL,Gen Bank登录号为KF808324。该c DNA... 采用RT-PCR技术从甘蔗中克隆So IRL基因,用生物信息学方法对获得的氨基酸序列进行分析,利用荧光定量PCR技术研究So IRL基因在甘蔗不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。结果表明,克隆获得甘蔗So IRL,Gen Bank登录号为KF808324。该c DNA全长1 169 bp,含有1个927 bp的完整开放阅读框(ORF),编码309个氨基酸。系统进化树分析显示,甘蔗So IRL与玉米的IRL蛋白亲缘关系较近。q RT-PCR分析表明So IRL在甘蔗根、茎、叶中均有表达;在RSD病菌及低温(4℃)、聚乙二醇(PEG)、Na Cl和脱落酸(ABA)4种非生物胁迫下均被诱导表达,但表达模式不同。说明该基因可能参与甘蔗应答RSD过程,并可能在非生物胁迫中也发挥了作用。 展开更多
关键词 甘蔗 异黄酮还原酶 基因克隆 表达分析
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大豆异黄酮还原酶基因的鉴定及生物信息学分析 被引量:2
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作者 张古文 刘娜 +3 位作者 冯志娟 徐盛春 胡齐赞 龚亚明 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期911-918,共8页
异黄酮是大豆生长过程中形成的一类次级代谢产物,是大豆主要的功能活性成分之一。异黄酮还原酶(isoflavone reductase,IFR)是异黄酮分解途径的关键酶之一,在调控异黄酮含量及成分方面起着重要作用。本研究基于大豆全基因组测序数... 异黄酮是大豆生长过程中形成的一类次级代谢产物,是大豆主要的功能活性成分之一。异黄酮还原酶(isoflavone reductase,IFR)是异黄酮分解途径的关键酶之一,在调控异黄酮含量及成分方面起着重要作用。本研究基于大豆全基因组测序数据,利用生物信息学方法鉴定了大豆异黄酮还原酶基因家族成员,并对其基因的序列特征、结构特征和遗传多样性进行了分析。结果表明:大豆异黄酮还原酶(GmIFR)家族含有17个成员,蛋白序列介于191(GmIFR07)和376(GmIFR11)个氨基酸之间,序列相似性为19.59%(GmIFR07和GmIFR11)-98.43%(GmIFR12和GmIFR17),结构分析表明这些基因内含子数目差异较大,2—6个不等,不均匀的分布在大豆的1、4、6、9、11、12和16号染色体上。 展开更多
关键词 大豆 异黄酮还原酶 基因家族
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普通烟草IRL基因反义植物表达载体的构建
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作者 陈伟 马建光 +1 位作者 李红勋 潘文杰 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第19期4730-4733,共4页
异黄酮还原酶相似蛋白(IRL)是与异黄酮还原酶具有高度序列同源一致性而功能不同的一类蛋白。通过PCR扩增普通烟草(Nicotiana tabacum)品种龙里红花烟IRL基因的一段特异保守片段Nt IRLA,并将其亚克隆到中间载体p CAMBIA2301G中,构建了IR... 异黄酮还原酶相似蛋白(IRL)是与异黄酮还原酶具有高度序列同源一致性而功能不同的一类蛋白。通过PCR扩增普通烟草(Nicotiana tabacum)品种龙里红花烟IRL基因的一段特异保守片段Nt IRLA,并将其亚克隆到中间载体p CAMBIA2301G中,构建了IRL反义植物表达载体p CAMBIA2301G-IRLA。通过PCR鉴定、酶切鉴定证实载体构建成功,并转化到根癌农杆菌LBA4404菌株中形成工程菌株,为进一步利用转基因手段明确IRL基因在烟草次生代谢中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 异黄酮还原酶基因 反义表达载体 普通烟草
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