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异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位
被引量：
3
1
作者
梁瑾
王靖飞
+1 位作者
吴春艳
冯宝龙
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期1-4,共4页
为了对异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位的可行性进行分析,本研究基于蛋白质相互作用界面的形状互补理论,使用异源抗体(来自于抗原抗体复合物1G9M、1RVF、1TPX、1NCA、1A2Y)的晶体结构同流感病毒血凝素(A/Aichi/2/68(H3...
为了对异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位的可行性进行分析,本研究基于蛋白质相互作用界面的形状互补理论,使用异源抗体(来自于抗原抗体复合物1G9M、1RVF、1TPX、1NCA、1A2Y)的晶体结构同流感病毒血凝素(A/Aichi/2/68(H3N2))的晶体结构进行刚性分子对接,通过计算B细胞表位的预测表面和实际表面C-α原子之间的RSMD以及表位氨基酸的准确率,分析用异源抗体探测出血凝素B细胞表位的可能性。结果表明,不同的异源抗体均可结合到A/Aichi/2/68(H3N2)的已知B细胞表位,最佳的对接构象与原晶体结构重叠后表位残基C-α原子的均方根偏差均小于0.6埃,表位氨基酸预测的准确性大于60%,说明异源抗体对接方法可以尝试用于B细胞构象表位的预测。
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关键词
构象表位预测
异源抗体
分子对接
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职称材料
异源性单、多克隆血型检测抗体对大熊猫红细胞检测的探索性研究
2
作者
赵俸涌
邓林华
+7 位作者
杨乾
李德生
魏荣平
黄山
魏明
李勤
钱旻
朱自严
《野生动物学报》
北大核心
2018年第3期471-475,共5页
大熊猫输血治疗中的关键环节是大熊猫血液配合性实验,由于国内外尚无专业试剂,本研究使用异源性单、多克隆抗体对大熊猫血液进行定型及相容性实验。使用人类ABO血型系统定型试剂,MN血型系统血型试剂及Rh血型系统的血型试剂对大熊猫红细...
大熊猫输血治疗中的关键环节是大熊猫血液配合性实验,由于国内外尚无专业试剂,本研究使用异源性单、多克隆抗体对大熊猫血液进行定型及相容性实验。使用人类ABO血型系统定型试剂,MN血型系统血型试剂及Rh血型系统的血型试剂对大熊猫红细胞进行检测;使用人类ABO系统标准试剂细胞对大熊猫血浆进行检测;使用小鼠、人类混合血浆及亚洲黑熊血浆与其中部分熊猫进行血液相容性检测。结果表明,多种人类血型定型单克隆抗体无法检出大熊猫红细胞抗原的存在,人类血型定型试剂红细胞及人类抗血清作为大熊猫红细胞血型试剂无法避免由种间抗体引发的凝集,故不可作为大熊猫血型定型试剂;亚洲黑熊中存在可以与大熊猫红细胞抗原发生反应的红细胞血型抗体。部分亚洲黑熊可以用于大熊猫输血异种血液来源。
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关键词
大熊猫
输血
异源
性
抗体
人类血型试剂
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职称材料
互补克隆法:利用酵母鉴定油菜基因
3
作者
孙雷心
《生物技术通报》
CAS
CSCD
1992年第12期7-7,共1页
克隆植物基因的一个重要方法是利用另一种生物的等效基因。不同真核生物间的基因杂交仅限于亲缘关系很近的品种。动物探针与植物DNA的杂交也仅限于在进化过程中高度保守的基因。另一种可能就是用异源抗体筛选表位的表达文库。该技术的...
克隆植物基因的一个重要方法是利用另一种生物的等效基因。不同真核生物间的基因杂交仅限于亲缘关系很近的品种。动物探针与植物DNA的杂交也仅限于在进化过程中高度保守的基因。另一种可能就是用异源抗体筛选表位的表达文库。该技术的问题在于保守性表位因其在被免疫动物中的保守性而常常是非致免疫的。基因互补是依据两种生物基因间的功能相似性而非序列相似性发展起来的第三种技术。其基本思想是制备一种生物的基因序列文库并将之插入缺乏某种基因功能的另一种生物中。
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关键词
克隆法
表达文库
克隆植物
异源抗体
真核生物
序列相似性
保守性
免疫动物
启动子
亲缘关系
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职称材料
题名
异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位
被引量：
3
1
作者
梁瑾
王靖飞
吴春艳
冯宝龙
机构
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
东北农业大学继续教育中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期1-4,共4页
基金
院所长基金(2008-17)
文摘
为了对异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位的可行性进行分析,本研究基于蛋白质相互作用界面的形状互补理论,使用异源抗体(来自于抗原抗体复合物1G9M、1RVF、1TPX、1NCA、1A2Y)的晶体结构同流感病毒血凝素(A/Aichi/2/68(H3N2))的晶体结构进行刚性分子对接,通过计算B细胞表位的预测表面和实际表面C-α原子之间的RSMD以及表位氨基酸的准确率,分析用异源抗体探测出血凝素B细胞表位的可能性。结果表明,不同的异源抗体均可结合到A/Aichi/2/68(H3N2)的已知B细胞表位,最佳的对接构象与原晶体结构重叠后表位残基C-α原子的均方根偏差均小于0.6埃,表位氨基酸预测的准确性大于60%,说明异源抗体对接方法可以尝试用于B细胞构象表位的预测。
关键词
构象表位预测
异源抗体
分子对接
Keywords
discontinuous epitopes prediction
heterogenous antibody
molecular docking
分类号
S852.4 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
异源性单、多克隆血型检测抗体对大熊猫红细胞检测的探索性研究
2
作者
赵俸涌
邓林华
杨乾
李德生
魏荣平
黄山
魏明
李勤
钱旻
朱自严
机构
华东师范大学生命科学学院
上海市血液中心
中国大熊猫保护研究中心
出处
《野生动物学报》
北大核心
2018年第3期471-475,共5页
基金
香港海洋公园保育基金大熊猫输血基础研究课题(GP01_1617)
上海市血液中心研究基金大熊猫输血基础研究课题(01j1702-04)支持
+1 种基金
中国国家自然科学基金青年项目(81400151)
上海市公共卫生重点学科(输血)项目(02x162-03(01))支持
文摘
大熊猫输血治疗中的关键环节是大熊猫血液配合性实验,由于国内外尚无专业试剂,本研究使用异源性单、多克隆抗体对大熊猫血液进行定型及相容性实验。使用人类ABO血型系统定型试剂,MN血型系统血型试剂及Rh血型系统的血型试剂对大熊猫红细胞进行检测;使用人类ABO系统标准试剂细胞对大熊猫血浆进行检测;使用小鼠、人类混合血浆及亚洲黑熊血浆与其中部分熊猫进行血液相容性检测。结果表明,多种人类血型定型单克隆抗体无法检出大熊猫红细胞抗原的存在,人类血型定型试剂红细胞及人类抗血清作为大熊猫红细胞血型试剂无法避免由种间抗体引发的凝集,故不可作为大熊猫血型定型试剂;亚洲黑熊中存在可以与大熊猫红细胞抗原发生反应的红细胞血型抗体。部分亚洲黑熊可以用于大熊猫输血异种血液来源。
关键词
大熊猫
输血
异源
性
抗体
人类血型试剂
Keywords
Giant panda
Transfusion
Heterologous antibodies
Blood group typing reagents
分类号
S852.5 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
互补克隆法:利用酵母鉴定油菜基因
3
作者
孙雷心
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
1992年第12期7-7,共1页
文摘
克隆植物基因的一个重要方法是利用另一种生物的等效基因。不同真核生物间的基因杂交仅限于亲缘关系很近的品种。动物探针与植物DNA的杂交也仅限于在进化过程中高度保守的基因。另一种可能就是用异源抗体筛选表位的表达文库。该技术的问题在于保守性表位因其在被免疫动物中的保守性而常常是非致免疫的。基因互补是依据两种生物基因间的功能相似性而非序列相似性发展起来的第三种技术。其基本思想是制备一种生物的基因序列文库并将之插入缺乏某种基因功能的另一种生物中。
关键词
克隆法
表达文库
克隆植物
异源抗体
真核生物
序列相似性
保守性
免疫动物
启动子
亲缘关系
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位
梁瑾
王靖飞
吴春艳
冯宝龙
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
在线阅读
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职称材料
2
异源性单、多克隆血型检测抗体对大熊猫红细胞检测的探索性研究
赵俸涌
邓林华
杨乾
李德生
魏荣平
黄山
魏明
李勤
钱旻
朱自严
《野生动物学报》
北大核心
2018
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
互补克隆法:利用酵母鉴定油菜基因
孙雷心
《生物技术通报》
CAS
CSCD
1992
0
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