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海洋物质输运模拟中并行计算的应用比较研究 被引量:1
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作者 黄伟建 周伟 蔡忠亚 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2013年第8期2929-2933,共5页
为了找到一种更高效的并行计算方法以提高海洋物质输运模拟速度,将适用于分布式存储环境的消息传递接口(message passing interface,MPI)与适用于共享存储环境的开放式多处理(open multiple processing,OpenMP)两种海洋数值模拟领域常... 为了找到一种更高效的并行计算方法以提高海洋物质输运模拟速度,将适用于分布式存储环境的消息传递接口(message passing interface,MPI)与适用于共享存储环境的开放式多处理(open multiple processing,OpenMP)两种海洋数值模拟领域常用的并行计算技术分别应用于模拟海洋物质输运过程,并在多核心(chip muti-processors)集群系统上进行了对比实验研究。实验结果表明,与串行模拟方法相比MPI和OpenMP分别可以使计算速度提高6倍和4.2倍,在海洋物质输运模拟并行计算中MPI的加速效果明显优于OpenMP。 展开更多
关键词 物质输运 数值模拟 并行计算 消息传递接口 开放式多处理
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混合并行计算在海洋水龄谱模拟中的应用研究 被引量:1
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作者 黄伟建 周伟 李珍 《科学技术与工程》 北大核心 2013年第15期4207-4211,4222,共6页
在海洋水龄谱数值模拟过程中应用并行计算技术可以显著提高运算效率。将适用于分布式存储环境的消息传递接口(Message Passing Interface,MPI)与适用于共享存储环境的开放式多处理(Open Multi-Processing,OpenMP)两种并行计算技术相结合... 在海洋水龄谱数值模拟过程中应用并行计算技术可以显著提高运算效率。将适用于分布式存储环境的消息传递接口(Message Passing Interface,MPI)与适用于共享存储环境的开放式多处理(Open Multi-Processing,OpenMP)两种并行计算技术相结合,提出了一种适用于海洋水龄谱数值模拟的混合并行计算模型。对比了其与传统的纯MPI方式在多核心(Chip Muti-processors)集群上的运算效率,并在此基础上研究了混合模型的系统资源利用情况以进一步了解其扩展能力。实验结果表明,MPI+OpenMP混合并行水龄谱模型具有更高的运算效率,同时系统资源消耗明显低于纯MPI方式。 展开更多
关键词 混合并行 水龄谱 消息传递接口 开放式多处理 多核系统
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基于OpenMP的Multi-Critical分子动力学并行算法优化 被引量:4
3
作者 段振华 白明泽 豆育升 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2012年第7期2432-2434,共3页
为提高分子动力学模拟在多核共享内存式服务器上的运算速度,在现有的分子动力学并行算法基础上提出了Multi-Critical算法。该算法使用手动划分力矩阵的方法,使多个线程进入不同名的临界区,并使用分块叠加的方法优化了并行算法,提高了并... 为提高分子动力学模拟在多核共享内存式服务器上的运算速度,在现有的分子动力学并行算法基础上提出了Multi-Critical算法。该算法使用手动划分力矩阵的方法,使多个线程进入不同名的临界区,并使用分块叠加的方法优化了并行算法,提高了并行效率。实验结果表明,对比之前的Critical算法,该算法的加速比和并行效率均有较大幅度的提高。 展开更多
关键词 分子动力学 并行计算 多核处理 开放式多处理 临界区
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基于OpenMP的RPM的点集匹配的并行实现 被引量:1
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作者 曹军军 杨烜 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2013年第3期944-950,共7页
为了解决面向大规模数量点集时的RPM(robust point matching)收敛时间较长的问题,分析了RPM执行过程中各关键步骤的时间复杂度,针对算法中的矩阵求逆与矩阵相乘进行了基于OpenMP的并行实现;同时针对RPM算法中的运算关系分析了并行实现... 为了解决面向大规模数量点集时的RPM(robust point matching)收敛时间较长的问题,分析了RPM执行过程中各关键步骤的时间复杂度,针对算法中的矩阵求逆与矩阵相乘进行了基于OpenMP的并行实现;同时针对RPM算法中的运算关系分析了并行实现的可行性,得出它并不适合采用多线程并发以提高算法效率的结论。文中比对了MPI与OpenMP的并行实现效率,并详细分析了高速缓存干扰现象。实验结果表明,该方法可以快速实现点集的匹配,有效地提高了该算法的运行效率。 展开更多
关键词 健壮点集匹配 开放式多处理 消息传递接口 矩阵运算 并行 缓存干扰
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