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题名基于转录组测序筛选康乐黄鸡开产相关基因和通路
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作者
马荆鄂
万淑敏
俞梓萱
许桥
李袁飞
许继国
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机构
南昌师范学院生物技术研究院
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出处
《中国家禽》
2025年第10期16-22,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(32160784)
江西省重点研发计划重点项目(20212BBF63028、20212BBF61011)。
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文摘
为了筛选康乐黄鸡开产日龄相关候选基因,试验选取154日龄已开产(H组)、即将开产(M组)、未开产(L组)各3个个体的下丘脑组织,利用Illumina测序平台进行转录组测序,筛选组间差异表达基因,并对其进行功能注释和蛋白互作分析,随机选取5个基因,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证其在3组个体下丘脑中的表达量。结果显示:在康乐黄鸡下丘脑中,一共检测到27943个基因表达;筛选出1104个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs);RT-qPCR结果显示,POMC、GRP、PRL、SOUL、ALB在3组个体中表达趋势与测序结果相符;综合GO、KEGG和蛋白互作网络分析,初步确定POMC、GRP、EPHA4、EPHA5和EPHA6为与康乐黄鸡开产日龄相关基因,神经活性配体-受体相互作用(Neuroactive ligand-receptor interaction)为关键信号通路。研究表明,候选基因POMC、GRP、EPHA4、EPHA5和EPHA6及神经活性配体-受体相互作用信号通路可调控康乐黄鸡开产日龄性状。
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关键词
康乐黄鸡
转录组测序
下丘脑
候选基因
开产日龄性状
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Keywords
Kangle Yellow chicken
transcriptome
hypothalamic
candidate gene
traits at first laying
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分类号
S831.2
[农业科学]
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