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基于ITS序列分析鉴别酸枣仁及其混伪品
1
作者
张凤
台晶杰
+1 位作者
牛四坤
田艳花
《种子科技》
2025年第3期7-9,共3页
为探究基于ITS序列建立酸枣仁及其市场混伪品的分子鉴定方法,收集了酸枣仁及其常见混伪品理枣仁、枳椇子,提取了DNA,建立ITS序列设计引物并进行PCR扩增,测序扩增产物序列进行对比,并成功建立了基于ITS序列的酸枣仁及其混伪品的分子鉴定...
为探究基于ITS序列建立酸枣仁及其市场混伪品的分子鉴定方法,收集了酸枣仁及其常见混伪品理枣仁、枳椇子,提取了DNA,建立ITS序列设计引物并进行PCR扩增,测序扩增产物序列进行对比,并成功建立了基于ITS序列的酸枣仁及其混伪品的分子鉴定方法。通过对10个样品的ITS序列进行PCR扩增和测序,结果表明,所有酸枣仁样品与Ziziphus jujuba的序列相似性均在99%以上,而混伪品枳椇子和理枣仁的序列相似性分别为97.26%和99.26%。结果表明,ITS序列分析是一种有效的分子鉴定工具,能够准确区分酸枣仁及其常见的混伪品。
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关键词
酸枣仁
ITS
DNA提取
PCR扩增
序列测定和分析
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职称材料
猪繁殖与呼吸综合征病毒BJ株、GD株全基因组序列测定与分析
2
作者
罗俊
刘业兵
+1 位作者
宁宜宝
陈坚
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期17-21,共5页
利用RT-PCR方法分别扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)北京分离株(BJ株)、广东分离株(GD株)各9条基因片段,并将这9个片段分别克隆于PGEM-T-easy质粒载体上进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到PRRSVBJ株和GD株的全基因组cDNA(GenBa...
利用RT-PCR方法分别扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)北京分离株(BJ株)、广东分离株(GD株)各9条基因片段,并将这9个片段分别克隆于PGEM-T-easy质粒载体上进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到PRRSVBJ株和GD株的全基因组cDNA(GenBank:EU825723,EU825724)。测序结果表明,BJ株和GD株基因组全长分别为15340和15336bp,各包含9个开放式阅读框,5′UTR都含有189nt,3′端URT分别含有170nt、166nt,其中各包含20ntPoly(A)、16ntPoly(A)。基因组序列分析结果显示,BJ株和GD株与ATCCVR-2332的核苷酸同源性分别为88.9%和89.0%,与高致病性PRRSV毒株JXA1的核苷酸同源性分别为99.0%和99.4%,与PRRSV毒株HuN的核苷酸同源性分别为98.8%和98.9%。
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关键词
PRRSV
基因组
序列测定和分析
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职称材料
两株猪繁殖与呼吸征病毒的分离鉴定及遗传变异分析
被引量：
2
3
作者
张超轶
吴欣伟
+7 位作者
闫明菲
张亮权
郭泗虎
黄昌力
黄震
张民泽
赵付荣
张桂红
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2012年第4期82-86,共5页
从广东省发病猪场采集的组织和血清中分离到两株PRRSV,病料经RT-PCR检测为阳性,通过Marc-145细胞进行传代,可产生明显细胞病变,通过间接免疫荧光可检测到荧光信号,两株病毒分别命名为ZH-GD株和ZS-GD株。对两株病毒的ORF5和Nsp2高变区进...
从广东省发病猪场采集的组织和血清中分离到两株PRRSV,病料经RT-PCR检测为阳性,通过Marc-145细胞进行传代,可产生明显细胞病变,通过间接免疫荧光可检测到荧光信号,两株病毒分别命名为ZH-GD株和ZS-GD株。对两株病毒的ORF5和Nsp2高变区进行序列测定和分析,结果表明,PRRSV ZH-GD株和ZS-GD株的核苷酸序列与欧洲型代表株LV株间的相似性相对较远,与美洲株经典毒株VR-2332间的相似性分别为88.6%和88.1%,与中国经典美洲毒株CH-1a间的相似性分别为94.4%和93.0%。在Nsp2上有30个氨基酸的缺失,与JXA1、XH-GD等高致病性变异株的Nsp2缺失位置一致。分离的两株PRRSV均属于美洲型的变异株PRRSV。
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关键词
PRRSV
分离鉴定
序列测定和分析
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职称材料
题名
基于ITS序列分析鉴别酸枣仁及其混伪品
1
作者
张凤
台晶杰
牛四坤
田艳花
机构
山西药科职业学院
出处
《种子科技》
2025年第3期7-9,共3页
基金
2023年度山西药科职业学院院级课题(2023128)。
文摘
为探究基于ITS序列建立酸枣仁及其市场混伪品的分子鉴定方法,收集了酸枣仁及其常见混伪品理枣仁、枳椇子,提取了DNA,建立ITS序列设计引物并进行PCR扩增,测序扩增产物序列进行对比,并成功建立了基于ITS序列的酸枣仁及其混伪品的分子鉴定方法。通过对10个样品的ITS序列进行PCR扩增和测序,结果表明,所有酸枣仁样品与Ziziphus jujuba的序列相似性均在99%以上,而混伪品枳椇子和理枣仁的序列相似性分别为97.26%和99.26%。结果表明,ITS序列分析是一种有效的分子鉴定工具,能够准确区分酸枣仁及其常见的混伪品。
关键词
酸枣仁
ITS
DNA提取
PCR扩增
序列测定和分析
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
猪繁殖与呼吸综合征病毒BJ株、GD株全基因组序列测定与分析
2
作者
罗俊
刘业兵
宁宜宝
陈坚
机构
中国兽医药品监察所
北京信得威特科技有限公司
广东永顺生物制药有限公司
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期17-21,共5页
基金
"十一五"国家科技支撑计划(2007BAD86B01
2007BAD86B04-4)
文摘
利用RT-PCR方法分别扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)北京分离株(BJ株)、广东分离株(GD株)各9条基因片段,并将这9个片段分别克隆于PGEM-T-easy质粒载体上进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到PRRSVBJ株和GD株的全基因组cDNA(GenBank:EU825723,EU825724)。测序结果表明,BJ株和GD株基因组全长分别为15340和15336bp,各包含9个开放式阅读框,5′UTR都含有189nt,3′端URT分别含有170nt、166nt,其中各包含20ntPoly(A)、16ntPoly(A)。基因组序列分析结果显示,BJ株和GD株与ATCCVR-2332的核苷酸同源性分别为88.9%和89.0%,与高致病性PRRSV毒株JXA1的核苷酸同源性分别为99.0%和99.4%,与PRRSV毒株HuN的核苷酸同源性分别为98.8%和98.9%。
关键词
PRRSV
基因组
序列测定和分析
Keywords
PRRSV
Genome
Sequencing and analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
两株猪繁殖与呼吸征病毒的分离鉴定及遗传变异分析
被引量：
2
3
作者
张超轶
吴欣伟
闫明菲
张亮权
郭泗虎
黄昌力
黄震
张民泽
赵付荣
张桂红
机构
华南农业大学兽医学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2012年第4期82-86,共5页
基金
国家自然科学基金会(NSFC)-广东联合基金项目(U0931003)
国家生猪现代农业产业技术体系(NYCYTX009)
文摘
从广东省发病猪场采集的组织和血清中分离到两株PRRSV,病料经RT-PCR检测为阳性,通过Marc-145细胞进行传代,可产生明显细胞病变,通过间接免疫荧光可检测到荧光信号,两株病毒分别命名为ZH-GD株和ZS-GD株。对两株病毒的ORF5和Nsp2高变区进行序列测定和分析,结果表明,PRRSV ZH-GD株和ZS-GD株的核苷酸序列与欧洲型代表株LV株间的相似性相对较远,与美洲株经典毒株VR-2332间的相似性分别为88.6%和88.1%,与中国经典美洲毒株CH-1a间的相似性分别为94.4%和93.0%。在Nsp2上有30个氨基酸的缺失,与JXA1、XH-GD等高致病性变异株的Nsp2缺失位置一致。分离的两株PRRSV均属于美洲型的变异株PRRSV。
关键词
PRRSV
分离鉴定
序列测定和分析
Keywords
PRRSV
isolation and identification
sequencing and analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于ITS序列分析鉴别酸枣仁及其混伪品
张凤
台晶杰
牛四坤
田艳花
《种子科技》
2025
0
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职称材料
2
猪繁殖与呼吸综合征病毒BJ株、GD株全基因组序列测定与分析
罗俊
刘业兵
宁宜宝
陈坚
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
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下载PDF
职称材料
3
两株猪繁殖与呼吸征病毒的分离鉴定及遗传变异分析
张超轶
吴欣伟
闫明菲
张亮权
郭泗虎
黄昌力
黄震
张民泽
赵付荣
张桂红
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2012
2
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职称材料
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