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河南省2株牛肠道病毒全基因组序列测定与分析
1
作者
钱明珠
王申锋
+3 位作者
常晓冉
胡俊英
朱红标
王新平
《浙江农业学报》
北大核心
2025年第3期548-558,共11页
为了解牛肠道病毒(bovine enteroviruses,BEV)的分子特征和遗传特性,进一步研究病毒的毒株差异与分子流行病学,设计5对特异性引物,应用PCR扩增与序列测定技术,对BEVHeN-B78株(EV-E)和HeN-YR91株(EV-F)的全长基因组序列进行扩增、序列测...
为了解牛肠道病毒(bovine enteroviruses,BEV)的分子特征和遗传特性,进一步研究病毒的毒株差异与分子流行病学,设计5对特异性引物,应用PCR扩增与序列测定技术,对BEVHeN-B78株(EV-E)和HeN-YR91株(EV-F)的全长基因组序列进行扩增、序列测定,将序列拼接校对后获得2株BEV的全基因组序列,并分析其同源性。结果表明,BEV HeN-B78株(登录号MN598013)基因组序列全长为7453 nt,其中编码区全长6523 nt,5′UTR长812 nt,3′UTR长118 nt。BEV HeN-YR91(登录号MN598018)株基因组序列全长为7460 nt,其中编码区全长6502 nt,5′UTR长825 nt,3′UTR长133 nt。全基因组序列的同源性分析显示,HeN-B78株与其他EV-E参考株的相似性为75.9%~88.0%;HeN-YR91株与其他EV-F参考株的同源性为74.6%~82.4%。病毒分离株的全基因组、VP1~VP4、2B、2C、3A~3D基因的系统进化树分析结果均显示,HeN-B78株与其他EV-E处于同一分支,而HeN-YR91株与EV-F处于同一分支。综上,河南省牛场存在E种和F种两种肠道病毒感染,丰富了国内牛肠道病毒的基因库。
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关键词
河南省
牛肠道病毒
全基因组
序列测定与分析
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职称材料
1株H12N7亚型禽流感病毒全基因组测定及遗传演化分析
被引量：
1
2
作者
谭丹
崔鹏飞
+8 位作者
黄建龙
王昌建
李文辉
范仲鑫
张芳
何世成
唐小明
刘道新
邓国华
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1844-1850,共7页
2011年冬对湖南环洞庭湖地区散养鸭群进行禽流感病毒(AIV)感染情况调查时从一鸭场环境粪便拭子中分离一株H12N7亚型AIV,命名为A/Environment/Hunan/S4484/2011(H12N7),对其进行全基因序列测定及分析。结果显示该毒株HA基因裂解位点无多...
2011年冬对湖南环洞庭湖地区散养鸭群进行禽流感病毒(AIV)感染情况调查时从一鸭场环境粪便拭子中分离一株H12N7亚型AIV,命名为A/Environment/Hunan/S4484/2011(H12N7),对其进行全基因序列测定及分析。结果显示该毒株HA基因裂解位点无多个连续的碱性氨基酸(PQAQDR↓GLF),具有低致病性AIV的特征,对其全基因进行遗传进化分析表明8个基因片段来源非常复杂,与周边国家野禽中分离的毒株相似性很高,可能有共同的祖先来源,同时提示该毒株可能是不同亚型禽流感毒株之间基因交换所形成的重组体。
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关键词
禽流感病毒
H12N7亚型
序列测定与分析
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职称材料
题名
河南省2株牛肠道病毒全基因组序列测定与分析
1
作者
钱明珠
王申锋
常晓冉
胡俊英
朱红标
王新平
机构
河南农业职业学院
吉林大学动物医学学院
河南健恒动物药业有限公司
出处
《浙江农业学报》
北大核心
2025年第3期548-558,共11页
基金
2022年度河南省重点研发与推广专项(科技攻关)项目(222102110318)
2022年度河南省高等学校重点科研项目(22A230014)。
文摘
为了解牛肠道病毒(bovine enteroviruses,BEV)的分子特征和遗传特性,进一步研究病毒的毒株差异与分子流行病学,设计5对特异性引物,应用PCR扩增与序列测定技术,对BEVHeN-B78株(EV-E)和HeN-YR91株(EV-F)的全长基因组序列进行扩增、序列测定,将序列拼接校对后获得2株BEV的全基因组序列,并分析其同源性。结果表明,BEV HeN-B78株(登录号MN598013)基因组序列全长为7453 nt,其中编码区全长6523 nt,5′UTR长812 nt,3′UTR长118 nt。BEV HeN-YR91(登录号MN598018)株基因组序列全长为7460 nt,其中编码区全长6502 nt,5′UTR长825 nt,3′UTR长133 nt。全基因组序列的同源性分析显示,HeN-B78株与其他EV-E参考株的相似性为75.9%~88.0%;HeN-YR91株与其他EV-F参考株的同源性为74.6%~82.4%。病毒分离株的全基因组、VP1~VP4、2B、2C、3A~3D基因的系统进化树分析结果均显示,HeN-B78株与其他EV-E处于同一分支,而HeN-YR91株与EV-F处于同一分支。综上,河南省牛场存在E种和F种两种肠道病毒感染,丰富了国内牛肠道病毒的基因库。
关键词
河南省
牛肠道病毒
全基因组
序列测定与分析
Keywords
Henan Province
bovine enterovirus
whole genome sequence
characterization and analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
1株H12N7亚型禽流感病毒全基因组测定及遗传演化分析
被引量：
1
2
作者
谭丹
崔鹏飞
黄建龙
王昌建
李文辉
范仲鑫
张芳
何世成
唐小明
刘道新
邓国华
机构
湖南省动物疫病预防控制中心
长沙市动物疫病预防控制中心
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室/兽医生物技术国家重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1844-1850,共7页
基金
科技部专项
文摘
2011年冬对湖南环洞庭湖地区散养鸭群进行禽流感病毒(AIV)感染情况调查时从一鸭场环境粪便拭子中分离一株H12N7亚型AIV,命名为A/Environment/Hunan/S4484/2011(H12N7),对其进行全基因序列测定及分析。结果显示该毒株HA基因裂解位点无多个连续的碱性氨基酸(PQAQDR↓GLF),具有低致病性AIV的特征,对其全基因进行遗传进化分析表明8个基因片段来源非常复杂,与周边国家野禽中分离的毒株相似性很高,可能有共同的祖先来源,同时提示该毒株可能是不同亚型禽流感毒株之间基因交换所形成的重组体。
关键词
禽流感病毒
H12N7亚型
序列测定与分析
Keywords
avian influenza virus
H12N7 subtype
phylogenetic analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
河南省2株牛肠道病毒全基因组序列测定与分析
钱明珠
王申锋
常晓冉
胡俊英
朱红标
王新平
《浙江农业学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
1株H12N7亚型禽流感病毒全基因组测定及遗传演化分析
谭丹
崔鹏飞
黄建龙
王昌建
李文辉
范仲鑫
张芳
何世成
唐小明
刘道新
邓国华
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
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