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辣椒LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:4
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作者 马维 巩振辉 +1 位作者 李大伟 贾庆利 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第1期143-148,共6页
【目的】克隆和分析抗、感疫病辣椒材料的抗病基因同源序列,为辣椒抗疫病相关基因的克隆奠定基础。【方法】根据番茄抗叶霉病基因Cf2和Cf9C端的LRR类保守结构域设计简并引物,对6个不同抗、感疫病的辣椒种质材料基因组DNA进行抗病基因... 【目的】克隆和分析抗、感疫病辣椒材料的抗病基因同源序列,为辣椒抗疫病相关基因的克隆奠定基础。【方法】根据番茄抗叶霉病基因Cf2和Cf9C端的LRR类保守结构域设计简并引物,对6个不同抗、感疫病的辣椒种质材料基因组DNA进行抗病基因同源序列的PCR扩增。【结果】得到27个抗病基因同源序列(RGAs),其在GenBank中的登录号为EF064260~EF064286。其中,21个RGAs与番茄抗叶霉病基因Cf2和Cf9有较高的相似性。感病材料的辣椒基因组中也存在抗疫病相关RGAs。【结论】上述21个RGAs可能与辣椒抗疫病作用有关,可为辣椒抗疫病相关基因的克隆提供依据。 展开更多
关键词 辣椒 LRR 抗病基因克隆 同源序列分析
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马尾松4CL基因同源序列克隆与进化分析 被引量:5
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作者 刘希华 张丽 +1 位作者 邢建宏 梁一池 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第12期28-31,共4页
为了研究马尾松(Pinus massoniana Lamb.)4CL基因的遗传进化及系统发育情况,根据NCBI上已登录的4CL基因的序列,比对分析,利用同源序列设计引物,以马尾松基因组DNA为模板,扩增核酸序列,与其他21种松属植物4CL基因进行SNP对比分析。结果表... 为了研究马尾松(Pinus massoniana Lamb.)4CL基因的遗传进化及系统发育情况,根据NCBI上已登录的4CL基因的序列,比对分析,利用同源序列设计引物,以马尾松基因组DNA为模板,扩增核酸序列,与其他21种松属植物4CL基因进行SNP对比分析。结果表明:扩增出474bp核酸序列,松属植物4CL基因共存在28个SNP位点,总核苷酸多样性θw=0.034 83、πT=0.036 21,具较高的多态性。系统进化树聚类结果表明,22个松属植物均集中在第一、二大类,马尾松、火炬松、班克松和小干松聚为第一大类中的第二亚类,亲缘关系较近。 展开更多
关键词 马尾松 4CL基因 同源序列分析 进化分析
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盾叶薯蓣3-羟基,3-甲基戊二单酰辅酶A还原酶和环阿屯醇合成酶基因克隆及序列分析 被引量:2
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作者 秦玉芝 邓克勤 +1 位作者 林建中 刘选明 《湖南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第7期61-66,共6页
根据已报道的植物3-羟基,3-甲基戊二单酰辅酶A还原酶(HMGR)和环阿屯醇合成酶(CS)基因保守序列分别合成简并引物,先后从盾叶薯蓣(Dioscorea zingiberensis)幼苗中克隆了一段663bp(HMGR—DZh)和一段1245bp(CS—DZc)的cDNA片... 根据已报道的植物3-羟基,3-甲基戊二单酰辅酶A还原酶(HMGR)和环阿屯醇合成酶(CS)基因保守序列分别合成简并引物,先后从盾叶薯蓣(Dioscorea zingiberensis)幼苗中克隆了一段663bp(HMGR—DZh)和一段1245bp(CS—DZc)的cDNA片段,经NCBI和CLUSTALW在线序列同源分析,结果表明,由HMGR—DZh cDNA推导的蛋白质与已报道植物HMGR氨基酸序列相似性达到63%~70%.由CS—DZc cDNA推导的蛋白质氨基酸序列中具有环氧角鲨烯环化酶(OSCs)特异保守结构域:DCTAE结构域和C末端的2个QW高度保守区,并与已报道植物环阿屯合成酶氨基酸序列相似性达到80%以上.本实验还分别以HMGR—DZh和CS—DZc cDNA为探针进行了Southern和Northern杂交分析.Northern杂交分析表明,盾叶薯蓣HMGR—DZh基因的mRNA约为1.8~2kb.CS—DZc基因的mRNA约为2~2.5kb. 展开更多
关键词 序列同源分析 盾叶薯蓣 HMGR CS 基因克隆 杂交
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大豆品种RGA分析与疫霉根腐病抗性鉴定 被引量:9
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作者 孙石 赵晋铭 +5 位作者 武晓玲 郭娜 王源超 唐卿华 盖钧镒 邢邯 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1704-1711,共8页
采用7个具有不同毒性基因的大豆疫霉菌株,对黄淮地区48个优良大豆种质资源进行了苗期接种鉴定,筛选出一批具有不同抗性的优异抗源,说明黄淮地区蕴藏着丰富的大豆抗病资源。以相似系数0.682聚类,48个大豆品种可以分成8类。同时,根据抗病... 采用7个具有不同毒性基因的大豆疫霉菌株,对黄淮地区48个优良大豆种质资源进行了苗期接种鉴定,筛选出一批具有不同抗性的优异抗源,说明黄淮地区蕴藏着丰富的大豆抗病资源。以相似系数0.682聚类,48个大豆品种可以分成8类。同时,根据抗病基因在保守区域序列同源性的原理,利用RGA-PCR方法对48个品种的遗传多样性进行分析,从48个大豆品种的抗病基因同源序列中共扩增出53条谱带,各品种之间谱带较清晰且呈现明显的多态性,以相似系数0.746聚类,48个大豆品种可以分成7类。尽管抗性表型和RGA聚类的类与类之间没有一一对应关系,但抗谱广的品种,能较好地聚在一类,如丰收黄、科丰36、即墨油豆等。因此,综合利用抗性表型和RGA分析可以为大豆疫霉根腐病抗性基因鉴定、品种的培育和合理布局提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 大豆 抗病基因同源序列分析 多态性 抗性鉴定
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水稻品种RGA分析与抗瘟性鉴定 被引量:4
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作者 李晔 范静华 +1 位作者 何月秋 朱有勇 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期11-15,共5页
根据抗病基因在保守区域序列同源的原理,利用RGA方法对云南省主要栽培品种和地方资源品种的遗传多样性进行了分析。从22个水稻品种的抗病基因同源序列中,共扩增出155条谱带,各品种之间谱带较清晰呈现明显的多态性,聚类分析结果可以明显... 根据抗病基因在保守区域序列同源的原理,利用RGA方法对云南省主要栽培品种和地方资源品种的遗传多样性进行了分析。从22个水稻品种的抗病基因同源序列中,共扩增出155条谱带,各品种之间谱带较清晰呈现明显的多态性,聚类分析结果可以明显将品种的抗感水平分开,也与温室人工接种试验结果相似。因此,利用RGA分析可以为水稻品种抗瘟性鉴定提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 水稻 抗病基因同源序列分析 多态性 抗性鉴定
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蓝莓鲨烯合酶基因的克隆与表达分析
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作者 陈新 徐丽 +7 位作者 张力思 魏海蓉 宗晓娟 王甲威 谭钺 朱东姿 洪坡 刘庆忠 《山东农业科学》 2019年第5期1-6,共6页
鲨烯合酶基因(SQS)在植物三萜类化合物合成途径中起着重要作用,是上游代谢通路中的关键基因。本研究采用RT-PCR技术从‘喜来’蓝莓根中克隆得到VcSQS基因,序列全长1489bp,序列分析结果表明,其含有1242bp的开放阅读框,编码413个氨基酸。... 鲨烯合酶基因(SQS)在植物三萜类化合物合成途径中起着重要作用,是上游代谢通路中的关键基因。本研究采用RT-PCR技术从‘喜来’蓝莓根中克隆得到VcSQS基因,序列全长1489bp,序列分析结果表明,其含有1242bp的开放阅读框,编码413个氨基酸。氨基酸同源序列分析表明,蓝莓与其它物种SQS蛋白氨基酸序列相似性很高,与山茶科的茶相似性最高,达90.58%,与葡萄相似性达87.92%。荧光定量试验结果表明,SQS基因在蓝莓叶中的表达量最高,芽中的最低。 展开更多
关键词 蓝莓 角鲨烯合酶基因 同源序列分析 荧光定量
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昆虫质多角体病毒研究的若干新进展 被引量:9
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作者 洪靖君 彭辉银 段家龙 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期815-821,共7页
质多角体病毒隶属呼肠孤病毒科质多角体病毒属 ,病毒粒子为二十面体球形颗粒 ,具有 3~ 5种结构蛋白 ,基因组由10或 11个节段双链RNA构成。按病毒基因组RNA片段在聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶中电泳图谱的差异 ,将质多角体病毒分为 15个电泳... 质多角体病毒隶属呼肠孤病毒科质多角体病毒属 ,病毒粒子为二十面体球形颗粒 ,具有 3~ 5种结构蛋白 ,基因组由10或 11个节段双链RNA构成。按病毒基因组RNA片段在聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶中电泳图谱的差异 ,将质多角体病毒分为 15个电泳型。随着RNA病毒序列测定策略的逐步成熟与完善 ,质多角体病毒的序列测定方面取得一定的进展 ,家蚕质多角体病毒 1的两个毒株 (H株和I株 ) ,舞毒蛾质多角体病毒 1和 14 ,及粉纹夜蛾质多角体病毒 15的基因组全序列得到了测定 ,但质多角体病毒的进化与起源的研究因缺乏足够的遗传信息仍受到限制。 展开更多
关键词 昆虫质多角体病毒 双链RNA 电泳型 序列同源分析 研究进展
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朱砂叶螨HSP90基因克隆及原核表达 被引量:2
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作者 冯宏祖 刘映红 +3 位作者 何林 李明 卢文才 薛传华 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期845-851,共7页
采用RT-PCR及RACE技术克隆朱砂叶螨Tetranychus cinnabarinus的热激蛋白90(HSP90)基因,并进行序列分析,得到一条长2595bp的cDNA序列,该序列开放阅读框(open reading frame,ORF)为2169bp,编码722个氨基酸,分子量约为83.45kDa,理论等电点... 采用RT-PCR及RACE技术克隆朱砂叶螨Tetranychus cinnabarinus的热激蛋白90(HSP90)基因,并进行序列分析,得到一条长2595bp的cDNA序列,该序列开放阅读框(open reading frame,ORF)为2169bp,编码722个氨基酸,分子量约为83.45kDa,理论等电点为4.81,3′非编码区(untranslated region,UTR)为249bp,5′UTR为177bp。通过Antheprot分析发现5个HSP90家族的签名序列及胞质HSP90特征序列MEEVD。同源性分析表明,朱砂叶螨HSP90编码区核苷酸序列和其他已知的HSP90,尤其是节肢动物昆虫的HSP90,具有很高的相似性。将鉴定正确的原核重组表达质粒pET43a-TcHSP90,转化大肠杆菌Escherichia coli BL21(origami)进行原核表达,应用SDS-PAGE和Western blotting技术分离并检测融合蛋白,结果表明构建的原核表达质粒可以在宿主菌中稳定、正确表达。朱砂叶螨TcHSP90基因的克隆、原核表达,为进一步研究HSP90的性质和功能的研究提供有用的实验材料。 展开更多
关键词 朱砂叶螨 热激蛋白90 基因克隆 序列同源分析 原核表达
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