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序列上下文氨基酸与其蛋白质二级结构的关系
被引量:
4
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作者
马寿勇
王联结
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第30期18414-18416,共3页
按照蛋白质二级结构的连续性和二级结构多样性提取序列片段,通过用自编的计算机软件在967条非冗余蛋白质数据库中按照氨基酸残基的极性逐个对提取出的序列片段在其原蛋白质中的上下文中的氨基酸残基对目标序列的二级结构的影响概率进行...
按照蛋白质二级结构的连续性和二级结构多样性提取序列片段,通过用自编的计算机软件在967条非冗余蛋白质数据库中按照氨基酸残基的极性逐个对提取出的序列片段在其原蛋白质中的上下文中的氨基酸残基对目标序列的二级结构的影响概率进行分析,并给出其影响概率的平均值。最后发现,序列上下文中的氨基酸残基的极性对目标序列片段的蛋白质二级结构具有较为明显的影响。
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关键词
二级结构多样性
氨基酸残基极性
序列上下文
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职称材料
面向波动复杂性的上下文预测
2
作者
丁春
冯志勇
《浙江大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期220-224,共5页
针对普适计算环境中上下文变化存在的复杂情况,提出面向波动复杂性的上下文预测方法,在分析上下文波动变化的影响因素的基础上,提出相似上下文序列的概念,给出了上下文序列相对距离和相似上下文序列的定义,以及相关的上下文预测推理算...
针对普适计算环境中上下文变化存在的复杂情况,提出面向波动复杂性的上下文预测方法,在分析上下文波动变化的影响因素的基础上,提出相似上下文序列的概念,给出了上下文序列相对距离和相似上下文序列的定义,以及相关的上下文预测推理算法和架构.通过计算上下文序列之间的相对距离,确定相似的上下文序列,根据相似的上下文序列进行上下文预测.该预测方法不仅提供了一种度量上下文序列的新方法,而且解决了传统精确匹配预测方法的局限性问题,有效地提高了普适计算中上下文预测的能力,使其具有更强的适应性和实用性.
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关键词
波动复杂性
相似
上下文
序列
上下文
序列
相对距离
上下文
预测
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职称材料
题名
序列上下文氨基酸与其蛋白质二级结构的关系
被引量:
4
1
作者
马寿勇
王联结
机构
陕西科技大学生命科学与工程学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第30期18414-18416,共3页
文摘
按照蛋白质二级结构的连续性和二级结构多样性提取序列片段,通过用自编的计算机软件在967条非冗余蛋白质数据库中按照氨基酸残基的极性逐个对提取出的序列片段在其原蛋白质中的上下文中的氨基酸残基对目标序列的二级结构的影响概率进行分析,并给出其影响概率的平均值。最后发现,序列上下文中的氨基酸残基的极性对目标序列片段的蛋白质二级结构具有较为明显的影响。
关键词
二级结构多样性
氨基酸残基极性
序列上下文
Keywords
Diversity of secondary structure
Amino acid residues polarity
Sequence context
分类号
S132 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
面向波动复杂性的上下文预测
2
作者
丁春
冯志勇
机构
天津大学计算机科学与技术学院
出处
《浙江大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期220-224,共5页
基金
国家"863"高技术研究发展计划资助项目(2007AA01Z130)
文摘
针对普适计算环境中上下文变化存在的复杂情况,提出面向波动复杂性的上下文预测方法,在分析上下文波动变化的影响因素的基础上,提出相似上下文序列的概念,给出了上下文序列相对距离和相似上下文序列的定义,以及相关的上下文预测推理算法和架构.通过计算上下文序列之间的相对距离,确定相似的上下文序列,根据相似的上下文序列进行上下文预测.该预测方法不仅提供了一种度量上下文序列的新方法,而且解决了传统精确匹配预测方法的局限性问题,有效地提高了普适计算中上下文预测的能力,使其具有更强的适应性和实用性.
关键词
波动复杂性
相似
上下文
序列
上下文
序列
相对距离
上下文
预测
Keywords
fluctuation complexity
similarity context sequence
context sequence relative distance
context prediction
分类号
TP301 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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作者
出处
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1
序列上下文氨基酸与其蛋白质二级结构的关系
马寿勇
王联结
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
4
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职称材料
2
面向波动复杂性的上下文预测
丁春
冯志勇
《浙江大学学报(工学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
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职称材料
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