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基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因
被引量:
2
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作者
王子渲
王巧
+8 位作者
张锦
Astrid Lissette Barreto Sanchez
郑麦青
李庆贺
崔焕先
安炳星
赵桂苹
文杰
李和刚
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1905-1914,共10页
旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条...
旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡,测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据,采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据,结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明,热应激组相比于对照组,北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因,其中169个上调表达,144个下调表达;广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因,其中152个上调表达,83个下调表达。利用WGCNA分析,在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块,在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因,发现两品种中均存在TRIM 29基因,说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析,揭示了不同鸡种在热应激下基因的表达差异规律,并鉴定到与耐热相关的候选基因,为进一步研究鸡的耐热机制提供了新的思路和线索。
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关键词
北京油
鸡
广明白鸡
热应激
差异表达基因
加权基因共表达网络分析
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职称材料
题名
基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因
被引量:
2
1
作者
王子渲
王巧
张锦
Astrid Lissette Barreto Sanchez
郑麦青
李庆贺
崔焕先
安炳星
赵桂苹
文杰
李和刚
机构
青岛农业大学动物科技学院
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1905-1914,共10页
基金
国家重点研发计划(2018YFE0128000)
国家自然科学基金(32072708)
+1 种基金
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-41)
农业科技创新计划(ASTIP-IAS04,CAASZDRW202005)。
文摘
旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡,测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据,采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据,结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明,热应激组相比于对照组,北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因,其中169个上调表达,144个下调表达;广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因,其中152个上调表达,83个下调表达。利用WGCNA分析,在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块,在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因,发现两品种中均存在TRIM 29基因,说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析,揭示了不同鸡种在热应激下基因的表达差异规律,并鉴定到与耐热相关的候选基因,为进一步研究鸡的耐热机制提供了新的思路和线索。
关键词
北京油
鸡
广明白鸡
热应激
差异表达基因
加权基因共表达网络分析
Keywords
Beijing You chicken
Guangming broiler
heat stress
differentially expressed genes
WGCNA
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
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1
基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因
王子渲
王巧
张锦
Astrid Lissette Barreto Sanchez
郑麦青
李庆贺
崔焕先
安炳星
赵桂苹
文杰
李和刚
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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职称材料
已选择
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引证文献
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