DOF(DNA binding with one zinc finger)是植物特异性转录因子,在植物抵御逆境胁迫过程中发挥着关键作用。通过生物信息学方法对藜麦DOF基因家族成员进行全基因组鉴定,并结合qRT-PCR技术解析该基因家族在外源NO调控干旱胁迫下的表达模...DOF(DNA binding with one zinc finger)是植物特异性转录因子,在植物抵御逆境胁迫过程中发挥着关键作用。通过生物信息学方法对藜麦DOF基因家族成员进行全基因组鉴定,并结合qRT-PCR技术解析该基因家族在外源NO调控干旱胁迫下的表达模式。结果表明,藜麦DOF基因家族共鉴定出25个家族成员,其氨基酸长度为143~558 aa,分子质量为16079.9~59102.2 Da,等电点介于4.52~9.60,疏水指数小于2,预测亚细胞定位均定位在细胞核;系统发育分析将DOF基因家族分为5个亚族,25个DOF基因均匀分布在13条染色体上,6对串联重复基因;启动子区共有31个与光响应、组织特异性、压力响应及植物激素相关的顺式作用元件;DOF5.3是蛋白互作网络的核心节点。不同组织器官表达分析表明,CqDOFs在藜麦各组织中均有表达且在花和叶中表达较强,在不同非生物胁迫条件下大部分CqDOFs基因在根中强烈响应;qRT-PCR分析表明,在NO调控的干旱胁迫条件下,16个CqDOFs基因的相对表达量均明显升高,其中CqDOF10在NO调控的干旱胁迫下表达量为干旱胁迫下该基因表达量的215.3倍,表明CqDOFs基因在藜麦响应干旱胁迫的调控机制中发挥着重要作用,外源NO能有效提高干旱胁迫下基因的表达。展开更多
文摘DOF(DNA binding with one zinc finger)是植物特异性转录因子,在植物抵御逆境胁迫过程中发挥着关键作用。通过生物信息学方法对藜麦DOF基因家族成员进行全基因组鉴定,并结合qRT-PCR技术解析该基因家族在外源NO调控干旱胁迫下的表达模式。结果表明,藜麦DOF基因家族共鉴定出25个家族成员,其氨基酸长度为143~558 aa,分子质量为16079.9~59102.2 Da,等电点介于4.52~9.60,疏水指数小于2,预测亚细胞定位均定位在细胞核;系统发育分析将DOF基因家族分为5个亚族,25个DOF基因均匀分布在13条染色体上,6对串联重复基因;启动子区共有31个与光响应、组织特异性、压力响应及植物激素相关的顺式作用元件;DOF5.3是蛋白互作网络的核心节点。不同组织器官表达分析表明,CqDOFs在藜麦各组织中均有表达且在花和叶中表达较强,在不同非生物胁迫条件下大部分CqDOFs基因在根中强烈响应;qRT-PCR分析表明,在NO调控的干旱胁迫条件下,16个CqDOFs基因的相对表达量均明显升高,其中CqDOF10在NO调控的干旱胁迫下表达量为干旱胁迫下该基因表达量的215.3倍,表明CqDOFs基因在藜麦响应干旱胁迫的调控机制中发挥着重要作用,外源NO能有效提高干旱胁迫下基因的表达。
