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带约束最长公共子序列快速算法 被引量:7
1
作者 业宁 朱大铭 +1 位作者 张倩倩 沈丽容 《南京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期576-584,共9页
带约束最长公共子序列(CLCS)问题有很深的生物学应用背景,常被用来表示同源基因序列相似性的度量,但计算CLCS时间代价很高,最早的CLCS算法的时间复杂度为O(rn4),目前,最快的CLCS算法的时间复杂性为O(rn2).运用对偶原理将带约束最长公共... 带约束最长公共子序列(CLCS)问题有很深的生物学应用背景,常被用来表示同源基因序列相似性的度量,但计算CLCS时间代价很高,最早的CLCS算法的时间复杂度为O(rn4),目前,最快的CLCS算法的时间复杂性为O(rn2).运用对偶原理将带约束最长公共子序列问题转换为带约束最小覆盖集问题,并建立带权的ref树结构,构造包含约束序列的约束覆盖子集,约简带约束覆盖子集并从中搜索关键路径,再通过关键路径构造CLCS,该算法将算法时间复杂度提升到O(nlogn+(q+r)L),r是约束序列的长度,q是两序列序偶的个数,L是两序列的最长公共子序列(LCS)长度. 展开更多
关键词 带约束最长公共子序列 快速算法 对偶算法
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一种带匹配路径约束的最长公共子序列长度算法 被引量:9
2
作者 王前东 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2017年第11期2615-2619,共5页
在带约束的最长公共子序列问题中提出一种特殊的新问题:假设有两序列Q和C,Q中指定的匹配位置序列I,计算两序列Q和C的最长公共子序列,且这个最长公共子序列的匹配路径必须经过位置序列I。针对此问题,该文提出一种带匹配路径约束的最长公... 在带约束的最长公共子序列问题中提出一种特殊的新问题:假设有两序列Q和C,Q中指定的匹配位置序列I,计算两序列Q和C的最长公共子序列,且这个最长公共子序列的匹配路径必须经过位置序列I。针对此问题,该文提出一种带匹配路径约束的最长公共子序列算法。首先定义带匹配路径约束的最长公共子序列模型,其次推出该序列的性质,最后求出带匹配路径约束的最长公共子序列长度的基础算法和快速算法。基础算法和快速算法时间复杂度分别为O(mnt)和O(mn),m,n,t分别为序列Q,C,I的长度。 展开更多
关键词 最长公共序列 匹配路径约束 约束最长公共序列 匹配路径约束最长公共序列
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一种最长扩展公共子序列新算法
3
作者 王前东 《电讯技术》 北大核心 2024年第8期1307-1314,共8页
在最长填充公共子序列问题中提出一种新问题:假设有一个完整序列C和一个不完整序列Q,长度分别为m和n,Q中丢失的元素为相邻的相同元素,要求寻找一个丢失前的序列Q,使得C和Q具有最长的公共子序列。针对此问题,首先将Q中每个元素复制m-1个... 在最长填充公共子序列问题中提出一种新问题:假设有一个完整序列C和一个不完整序列Q,长度分别为m和n,Q中丢失的元素为相邻的相同元素,要求寻找一个丢失前的序列Q,使得C和Q具有最长的公共子序列。针对此问题,首先将Q中每个元素复制m-1个并插入Q中原来的位置,生成长度为mn的扩展序列Q^(*),然后证明了C和Q的最长扩展公共子序列是两序列C和Q^(*)的最长公共子序列,最后提出一种时空复杂度为O(mn)的最长扩展公共子序列求解新算法,并用轨迹实验证明了该算法对强噪声干扰和轨迹点丢失的同时有效性。 展开更多
关键词 最长公共序列(LCS) 最长填充公共序列(LFCS) 扩展公共序列(ECS) 最长扩展公共序列(LECS)
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结合Hausdorff距离和最长公共子序列的轨迹分类 被引量:26
4
作者 魏龙翔 何小海 +1 位作者 滕奇志 高明亮 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2013年第4期784-790,共7页
为了提高运动目标轨迹分类的准确性,该文综合考虑了轨迹的位置信息和方向信息,提出了一种结合Hausdorff距离和最长公共子序列(Longest Common SubSequence,LCSS)的轨迹分类算法。该算法首先采用改进的Hausdorff距离对轨迹的位置信息进... 为了提高运动目标轨迹分类的准确性,该文综合考虑了轨迹的位置信息和方向信息,提出了一种结合Hausdorff距离和最长公共子序列(Longest Common SubSequence,LCSS)的轨迹分类算法。该算法首先采用改进的Hausdorff距离对轨迹的位置信息进行相似性测量,然后采用改进的LCSS算法对轨迹的方向信息进行相似性测量。与其他轨迹聚类算法不同,该算法融合了Hausdorff距离和LCSS两种算法的优点,提高了轨迹分类的准确性。此外,为了进一步降低计算复杂度,该文还实现了一种基于插值的保距变换算法和一种LCSS快速算法。实验结果表明,该轨迹分类算法可以明显提高轨迹的聚类准确率,聚类准确率可达到96%;基于插值的保距变换算法和LCSS快速算法可以很大程度上降低算法的计算复杂度,下降幅度最大可达到80%。该方法可以同时满足轨迹分类对精确度、实时性和鲁棒性的要求。 展开更多
关键词 图像处理 轨迹分类 HAUSDORFF距离 最长公共序列(LCSS) 保距变换 LCSS快速算法
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基于滑动窗口最长公共子序列Wi-Fi指纹定位算法 被引量:4
5
作者 张明洋 陈剑 +1 位作者 闻英友 赵宏 《东北大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1390-1394,共5页
针对基于Wi-Fi瞬时指纹定位算法中由于RSS信号的时变特性引起的Wi-Fi定位精度差问题,提出了一种基于滑动窗口最长公共子序列指纹定位算法.该算法将时间序列的RSS信号指纹转化为基于滑动窗口的数据模型,增加了指纹特征信息,提高比对准确... 针对基于Wi-Fi瞬时指纹定位算法中由于RSS信号的时变特性引起的Wi-Fi定位精度差问题,提出了一种基于滑动窗口最长公共子序列指纹定位算法.该算法将时间序列的RSS信号指纹转化为基于滑动窗口的数据模型,增加了指纹特征信息,提高比对准确性.通过计算请求定位数据与样本的最长公共子序列来获得样本点的相似性,解决由于窗口伸缩或滑动窗口中个别采样点无信号引起的比对不准确问题,从而提高了定位的精确性和鲁棒性.实验结果表明,所提定位算法的结果明显优于瞬时指纹定位算法. 展开更多
关键词 室内定位 指纹 滑动窗口 时间序列 最长公共序列
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基于最长公共子序列的非同步相似轨迹判断 被引量:11
6
作者 刘宇 王前东 《电讯技术》 北大核心 2017年第10期1165-1170,共6页
针对非同步相似轨迹判断问题,提出了一种基于最长公共子序列理论的相似轨迹判断新算法。首先,求出查询轨迹线段与候选轨迹线段之间的距离;其次,利用最长公共子序列算法,计算两轨迹的最长公共子轨迹长度;最后,根据相似度门限,判断轨迹是... 针对非同步相似轨迹判断问题,提出了一种基于最长公共子序列理论的相似轨迹判断新算法。首先,求出查询轨迹线段与候选轨迹线段之间的距离;其次,利用最长公共子序列算法,计算两轨迹的最长公共子轨迹长度;最后,根据相似度门限,判断轨迹是否相似。数值实例验证了所提算法能够提高非同步轨迹的相似度。 展开更多
关键词 侦察监视 最长公共序列 非同步相似轨迹 最长公共轨迹
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基于格代数的最长公共子序列近似求解 被引量:2
7
作者 孙焘 朱晓明 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2017年第2期270-274,共5页
多条序列的最长公共子序列可以代表多条序列的公共信息,其在诸多领域里有着重要的应用,如信息检索、基因序列匹配等。求解多条序列的最长公共子序列是著名的NP难问题,本质为多解问题。一些近似算法虽然时间复杂度较低,但只能求出单解,... 多条序列的最长公共子序列可以代表多条序列的公共信息,其在诸多领域里有着重要的应用,如信息检索、基因序列匹配等。求解多条序列的最长公共子序列是著名的NP难问题,本质为多解问题。一些近似算法虽然时间复杂度较低,但只能求出单解,对于有多解的序列集合,求得的结果信息量损失较大。因此提出一个新的近似算法来解决最长公共子序列问题。算法引入了代数结构"格",通过动态规划求解出两条序列的公共格,并递归求解当前格与当前序列的公共格。公共格中的路径保存了多条公共子序列使得最终求解出的最长公共子序列为多个。对算法的相关定理给出了理论证明,并通过实验验证了算法的正确性。 展开更多
关键词 最长公共序列 近似算法 贪心算法
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基于最长公共子序列的随机路径选择算法设计 被引量:2
8
作者 王防修 周康 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2014年第6期2170-2173,共4页
针对传统算法只能求出一个最长公共子序列而无法求出多个最长公共子序列,设计了一种可求多个最长公共子序列的算法。简述了最长公共子序列的算法原理,描述了求最长公共子序列长度的动态规划算法,在此基础上求出一个最长公共子序列,通过... 针对传统算法只能求出一个最长公共子序列而无法求出多个最长公共子序列,设计了一种可求多个最长公共子序列的算法。简述了最长公共子序列的算法原理,描述了求最长公共子序列长度的动态规划算法,在此基础上求出一个最长公共子序列,通过对算法改进得到可求多个最长公共子序列的随机路径选择算法。该算法具有计算速度快、占用内存小、计算机易于实现等优点。其核心是寻优路径的选择,提出了寻找最优解的路径选择问题,讨论并给出了搜索多个可行解的快速算法,该算法充分利用了动态规划算法计算过程中提供的寻优方向信息得到最优路径的随机选择算法,与传统算法相比可求多个最长公共子序列。 展开更多
关键词 最长公共序列 最优结构 动态规划 随机路径选择 最优解
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最长公共子序列问题的改进快速算法 被引量:9
9
作者 李欣 舒风笛 《计算机应用研究》 CSCD 2000年第2期28-30,共3页
现在几个最常用的解决最长公共子序列(LCS)问题的算法的时间复杂度分别是O(pn),O(n(m-p)).这里m、n两个待比较字符串的长度,p是最长公共子串的长度.给出一种时间复杂度为O(p(m-p));空间复杂度为O(... 现在几个最常用的解决最长公共子序列(LCS)问题的算法的时间复杂度分别是O(pn),O(n(m-p)).这里m、n两个待比较字符串的长度,p是最长公共子串的长度.给出一种时间复杂度为O(p(m-p));空间复杂度为O(m+n)的算法.与以前的算法相比;不管在p<<m的情况下,还是在p接近m时,这种算法都有更快的速度. 展开更多
关键词 最长公共序列 算法 差分压缩算法 字符串
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最长公共子序列的量子算法 被引量:3
10
作者 徐文旭 廖明宏 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第B12期99-103,共5页
本文给出了求给定两个序列最长公共子序列(Longest Common Subsequence,LCS)问题的量子算法,能在O(n)时间内求解两个长为n字符序列的最长公共子序列.算法在分析传统动态规划填表过程潜在并行性的基础上,对填表过程进行量子化,... 本文给出了求给定两个序列最长公共子序列(Longest Common Subsequence,LCS)问题的量子算法,能在O(n)时间内求解两个长为n字符序列的最长公共子序列.算法在分析传统动态规划填表过程潜在并行性的基础上,对填表过程进行量子化,并通过带有量子存储器的量子Oracle,完成量子并行填表的计算.算法最后对前面计算获得的所有局部LCS的均匀叠加态应用Grover搜索,找出最终解,相对于经典动态规划实现了二次加速. 展开更多
关键词 算法 最长公共序列 Oracle
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求解最长循环公共子序列问题的两个算法 被引量:3
11
作者 郑子君 王洪 余成 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2020年第11期3334-3337,3358,共5页
最长循环公共子序列(LCCS)是两个字符串在所有可能的循环移位操作下能得到的最长公共子序列(LCS)。针对穷举移位量求解LCCS效率过低的问题,设法对候选移位量进行筛选。通过证明循环移位操作对两字符串间LCS长度增量影响的上下限,得到最... 最长循环公共子序列(LCCS)是两个字符串在所有可能的循环移位操作下能得到的最长公共子序列(LCS)。针对穷举移位量求解LCCS效率过低的问题,设法对候选移位量进行筛选。通过证明循环移位操作对两字符串间LCS长度增量影响的上下限,得到最优移位量的必要条件,从而减小了求解LCCS的枚举量;在此基础上,建立了求解LCCS的迭代方法,只经过少数几次迭代便可消除绝大部分无效候选移位量;此外,还提出一个可在O(mn)时间复杂度下快速估算LCCS长度的近似算法。大量随机模拟表明,当两字符串间的相似度明显高于随机字符串的相似度时,提出的两种算法表现良好。 展开更多
关键词 最长公共序列 循环字符串 文本相似度 动态规划
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求最长公共子序列长度的一个新方法 被引量:1
12
作者 林清波 吴锤红 《福建农业大学学报》 CSCD 1998年第4期505-509,共5页
提出了一个求序列X最长单调子序列的方法,若X的长度为n,则此方法所需时间为O(nlogn),空间占用为O(n).利用该方法可有效地求出X,Y两序列最长公共子序列的长度.如果X的长度为m,Y的长度为n,此时空间占用为O... 提出了一个求序列X最长单调子序列的方法,若X的长度为n,则此方法所需时间为O(nlogn),空间占用为O(n).利用该方法可有效地求出X,Y两序列最长公共子序列的长度.如果X的长度为m,Y的长度为n,此时空间占用为O(m+n);若Y中的各个元素在X中平均重复出现至多常数次,则所需时间为O(m+nlogn).作为应用之一,该方法可以用于文本的比较、等级考试录入文本的评测等. 展开更多
关键词 最长单调序列 最长公共序列 动态选择树
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异构机群系统上并行计算双序列的最长公共子序列
13
作者 许莉莉 魏鹰 +1 位作者 罗海鹏 张林才 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2010年第5期1669-1671,1682,共4页
针对处理机节点具有不同计算速度、不同通信能力的情况,考虑计算和通信启动开销,给定处理机分配顺序,基于可分负载理论,提出一种存储受限异构机群系统的序列串最优分配线性规划模型,给出相应的序列串最优分配方法。实验结果表明,基于最... 针对处理机节点具有不同计算速度、不同通信能力的情况,考虑计算和通信启动开销,给定处理机分配顺序,基于可分负载理论,提出一种存储受限异构机群系统的序列串最优分配线性规划模型,给出相应的序列串最优分配方法。实验结果表明,基于最优序列串分配方法的双序列最长公共子序列并行算法优于平均分配序列串算法,获得了较好的加速,并具有良好的可扩展性。 展开更多
关键词 序列最长公共序列 并行算法 异构机群系统 可分负载 分配策略
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带重要点约束的经典轨迹相似度量新算法 被引量:1
14
作者 王前东 谢卫 《电讯技术》 北大核心 2022年第9期1301-1308,共8页
在经典轨迹的相似度量问题中提出一个新问题:假设有待相似度量的经典轨迹和实时轨迹,在经典轨迹中存在部分点为重要点,实时轨迹受这些重要点约束。针对此问题,将经典轨迹和实时轨迹作为相似度量的两序列,重要点作为实时轨迹的约束序列,... 在经典轨迹的相似度量问题中提出一个新问题:假设有待相似度量的经典轨迹和实时轨迹,在经典轨迹中存在部分点为重要点,实时轨迹受这些重要点约束。针对此问题,将经典轨迹和实时轨迹作为相似度量的两序列,重要点作为实时轨迹的约束序列,利用带约束的最长公共子序列理论提出带重要点约束的经典轨迹相似度量基础算法和快速算法。实验结果表明,快速算法比基础算法的计算时间减少了36%以上。 展开更多
关键词 目标监视 经典轨迹 轨迹相似度量 最长公共序列 约束序列
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基因序列相似程度的LCS算法研究 被引量:14
15
作者 王映龙 杨炳儒 +2 位作者 宋泽锋 陈卓 唐建军 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2007年第31期45-47,共3页
首先重新审视了采用穷举法求解LCS问题的困难,以及对应的优点;随后针对穷举法的优点进行了两类优化;最后给出了算法实现的图示以及算法的结论。通过实验证明,算法的效率较传统的动态规划的LCS算法有了很大的提升。
关键词 最长公共序列 穷举法 基因序列排比
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基于句子相似度的论文抄袭检测模型研究 被引量:10
16
作者 冷强奎 秦玉平 王春立 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2011年第24期199-201,共3页
提出一种基于句子相似度的论文抄袭检测模型。利用局部词频指纹算法对大规模文档进行快速检测,找出疑似抄袭文档。根据最长有序公共子序列算法计算句子间的相似度,并标注抄袭细节,给出抄袭依据。在标准中文数据集SOGOU-T上进行的实验表... 提出一种基于句子相似度的论文抄袭检测模型。利用局部词频指纹算法对大规模文档进行快速检测,找出疑似抄袭文档。根据最长有序公共子序列算法计算句子间的相似度,并标注抄袭细节,给出抄袭依据。在标准中文数据集SOGOU-T上进行的实验表明,该模型具有较强的局部信息挖掘能力,在一定程度上克服了现有的论文抄袭检测算法精度不高的缺点。 展开更多
关键词 相似度 抄袭检测 局部词频 最长有序公共序列
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面向地形等高线匹配的三重约束LCSS算法 被引量:4
17
作者 王华夏 程咏梅 +1 位作者 刘楠 李松 《西北工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第1期38-42,共5页
针对地形匹配中数据简化表示以及匹配的问题,提出一种基于等高线特征序列的三重约束LCSS地形匹配方法。首先将基准地形数据用等高线表示,对等高线进行多边形分割逼近,选取分割点作为等高线特征点,然后构造具有平移旋转不变性的弦长夹角... 针对地形匹配中数据简化表示以及匹配的问题,提出一种基于等高线特征序列的三重约束LCSS地形匹配方法。首先将基准地形数据用等高线表示,对等高线进行多边形分割逼近,选取分割点作为等高线特征点,然后构造具有平移旋转不变性的弦长夹角特征描述子,对等高线特征点序列进行描述;其次,对实时地形数据以相同的方式构造等高线特征描述子与基准信息匹配;在特征匹配的过程中,针对LCSS算法生成匹配点的外点较多的问题,提出候选集约束、回溯路径同列最小约束、相对位置偏移方差约束的三重约束LCSS方法;最后,采用RANSAC算法对旋转平移参数进行解算,实现地形匹配导航定位。采用秦岭地区ASTER-GTM地形数据验证该地形匹配方法的性能,结果表明文中方法在噪声与几何变换下鲁棒性好,可以显著减少误匹配点数量,提高地形匹配的可靠性,能够有效应用于山区地形匹配导航。 展开更多
关键词 地形匹配 多边形分割逼近 形状描述 局部匹配 最长公共序列
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强力输送带接头识别算法 被引量:6
18
作者 洪留荣 《工矿自动化》 北大核心 2012年第4期9-12,共4页
针对现有的强力输送带故障实时检测方法存在故障定位困难的问题,以接头为基准参考点,提出了一种基于图像处理技术的强力输送带接头识别算法。该算法根据接头点的特征,把接头点用一个数值表示出来,并根据这个数值,以一种简单的方式区分... 针对现有的强力输送带故障实时检测方法存在故障定位困难的问题,以接头为基准参考点,提出了一种基于图像处理技术的强力输送带接头识别算法。该算法根据接头点的特征,把接头点用一个数值表示出来,并根据这个数值,以一种简单的方式区分出上、下接头点;然后根据接头的特征,并通过修改最长公共子序列算法的匹配方式,对接头进行识别。实际应用表明,该算法精度高、速度快,可有效识别强力输送带的接头,满足了强力输送带故障检测中接头定位的要求。 展开更多
关键词 强力输送 图像处理 接头识别 故障定位 最长公共序列
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多序列的近似LCS改进算法 被引量:4
19
作者 胡婕 业宁 +2 位作者 罗晓波 崔静 董程玲 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期166-168,171,共4页
提出2种针对3条源序列的近似LCS算法,近似因子均为1/|∑|。其中,线性近似LCS算法的时空复杂度均为O(n),n为最长源序列的长度,适于解决大规模问题。递归近似LCS算法时空复杂度均为O(nlogn),适于要求高精度问题。同时,这2种算法都能用于... 提出2种针对3条源序列的近似LCS算法,近似因子均为1/|∑|。其中,线性近似LCS算法的时空复杂度均为O(n),n为最长源序列的长度,适于解决大规模问题。递归近似LCS算法时空复杂度均为O(nlogn),适于要求高精度问题。同时,这2种算法都能用于解决多序列的LCS和CLCS问题。实验验证了这2种算法的有效性。 展开更多
关键词 生物信息学 最长公共序列 近似因 约束
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改进的LCS方法在测试脚本序列比对中的应用 被引量:6
20
作者 曾波 潘少彬 陆璐 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2011年第35期71-76,共6页
在自动化测试中,需要对录制和回放过程中的请求序列进行解析和比对,帮助用户进行脚本的修正和完善。为了实现请求序列的比对,采用最长公共子序列(LCS)算法对录制和回放的序列进行比较,其核心思想是把序列对比转化成图论问题,通过二维矩... 在自动化测试中,需要对录制和回放过程中的请求序列进行解析和比对,帮助用户进行脚本的修正和完善。为了实现请求序列的比对,采用最长公共子序列(LCS)算法对录制和回放的序列进行比较,其核心思想是把序列对比转化成图论问题,通过二维矩阵寻路来找到最优的匹配方式。文中对算法的原理和实现做了详细描述,并对算法的性能进行测试和分析,最后将算法应用到软件脚本修改器中,验证算法在自动化测试实际应用中的效果。结果表明,LCS算法可以高效地对序列进行解析和比对,提高了自动化测试的效率。 展开更多
关键词 软件测试 脚本修改 序列比对 最长公共序列算法(LCS)
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