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布鲁氏菌A19疫苗株全基因组测序及比较基因组学分析
被引量：
7
1
作者
王姝懿
赵学亮
+2 位作者
孙柯
呼和巴特尔
王文龙
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期1002-1008,共7页
目的探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究。方法采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank上的8株菌进行比较基因组学解析。A19基因组3286167 bp,预测3371个基...
目的探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究。方法采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank上的8株菌进行比较基因组学解析。A19基因组3286167 bp,预测3371个基因,GC含量57.25%。通过注释COG库,对应基因有2560个,将其归入22类COG中;根据比对KEGG库,得到2544个基因,共参与33类代谢通路。结果综合两个数据库结果发现,大多数A19预测基因中的基因功能主要与膜运输、氨基酸转运及碳水化合物代谢有关。结论通过分析发现,A19和猪羊牛种布鲁氏菌之间存在一定差异,并找出牛种毒力基因。本实验通过测序A19全基因组,为布鲁菌疫苗的研究提供思路。
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关键词
布鲁
氏
菌
布鲁菌疫苗株a19
全基因组测序
比较基因组学研究
在线阅读
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职称材料
题名
布鲁氏菌A19疫苗株全基因组测序及比较基因组学分析
被引量：
7
1
作者
王姝懿
赵学亮
孙柯
呼和巴特尔
王文龙
机构
内蒙古农业大学兽医学院/农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室
内蒙古自治区综合疾病预防控制中心
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期1002-1008,共7页
基金
内蒙古科技厅农业资助项目(No.20120244)
内蒙古科技厅项目(No.201502071)
内蒙古高等教育研究院项目(No.NJZZ19041)共同资助~~
文摘
目的探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究。方法采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank上的8株菌进行比较基因组学解析。A19基因组3286167 bp,预测3371个基因,GC含量57.25%。通过注释COG库,对应基因有2560个,将其归入22类COG中;根据比对KEGG库,得到2544个基因,共参与33类代谢通路。结果综合两个数据库结果发现,大多数A19预测基因中的基因功能主要与膜运输、氨基酸转运及碳水化合物代谢有关。结论通过分析发现,A19和猪羊牛种布鲁氏菌之间存在一定差异,并找出牛种毒力基因。本实验通过测序A19全基因组,为布鲁菌疫苗的研究提供思路。
关键词
布鲁
氏
菌
布鲁菌疫苗株a19
全基因组测序
比较基因组学研究
Keywords
Brucella
Brucella vaccine strain
a19
whole-genome sequencing
comparative genomics analysis
分类号
R378.5 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
布鲁氏菌A19疫苗株全基因组测序及比较基因组学分析
王姝懿
赵学亮
孙柯
呼和巴特尔
王文龙
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
7
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