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活性流体流变行为的布朗动力学模拟研究 被引量:3
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作者 许晓飞 童松豪 +4 位作者 张达 董超 刘凤霞 魏炜 刘志军 《力学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第11期3071-3079,共9页
活性流体在用于开发新材料方面具有巨大潜力,满足这一需求就要定量掌握活性流体所表现的特殊力学行为,特别是流变行为.扩展布朗运动方程,建立自驱动活性粒子的运动模型,基于反向非平衡法确定活性流体的黏度,考察活性粒子体积分数、直行... 活性流体在用于开发新材料方面具有巨大潜力,满足这一需求就要定量掌握活性流体所表现的特殊力学行为,特别是流变行为.扩展布朗运动方程,建立自驱动活性粒子的运动模型,基于反向非平衡法确定活性流体的黏度,考察活性粒子体积分数、直行速度和转向扩散系数对活性流体流变行为的影响规律,确定活性流体特殊流变行为的形成机理.结果表明,活性流体的流变曲线可被划分为黏度下降区、过渡区和牛顿区;活性粒子体积分数越高,活性流体的非牛顿特性越显著,活性粒子的直行运动引起活性流体在低剪切速率区域黏度下降,直行运动和转向运动的耦合作用导致中剪切速率区域流变曲线非单调变化,活性粒子频繁发生转向运动会导致活性流体非牛顿特性受到抑制;活性流体的宏观流变学特性和粒子的涨落直接相关,活性粒子体积分数越高、直行速度越快和转向扩散系数越小,活性流体中活性粒子越容易产生显著的涨落;低剪切速率区域内活性粒子涨落明显,随着剪切速率增大,活性粒子的涨落逐渐被削弱,粒子的聚集结构不断被破坏,最终体系的流变行为类似一般被动流体. 展开更多
关键词 活性流体 流变学 布朗运动方程 黏度 布朗动力学模拟
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稀溶液中线形DNA分子链结构及扩散的布朗动力学模拟
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作者 张勇 田田 肖忠党 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1219-1224,共6页
通过构建全参数化的珠-弹簧分子链模型,并运用一种高效稳定的半隐式预测-校验积分算法求解描述稀溶液中DNA分子链结构演化的随机动力学方程组,系统研究了体积排斥作用、有限伸长弹性作用和涨落流体动力学作用对分子链的回旋半径、质心... 通过构建全参数化的珠-弹簧分子链模型,并运用一种高效稳定的半隐式预测-校验积分算法求解描述稀溶液中DNA分子链结构演化的随机动力学方程组,系统研究了体积排斥作用、有限伸长弹性作用和涨落流体动力学作用对分子链的回旋半径、质心扩散系数以及相应标度指数的影响.模拟结果能够验证良溶剂中分子链Zimm模型的标度规律,并揭示出3种非线性作用对稀溶液中分子链静态结构属性和动力学属性不同的影响程度和变化趋势.分子链柔性对稀溶液中DNA结构、扩散系数以及标度指数影响都很小.溶剂品质的提高可显著增大分子链的回旋半径,减小其扩散系数,并且使两者随链长的标度指数显著增加.流体动力学作用不改变分子链的结构,但显著影响其扩散系数.随着流体作用的增强,分子链的质心扩散系数增大,随链长变化的标度指数减小. 展开更多
关键词 线形DNA分子链 珠-弹簧模型 非线性作用 布朗动力学模拟 回旋半径 扩散系数
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全伸展DNA链折叠过程中三种非线性作用的布朗动力学模拟
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作者 张勇 肖忠党 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第11期2705-2710,共6页
脱氧核精核酸(DNA)单分子链从完全拉伸状态折叠到平衡状态的动力学过程是溶液中DNA单分子力学的重要特征之一.通过构建全参数化的珠子-弹簧分子链模型,并运用一种高效平衡的半隐式预测——校验积分算法,系统研究了体积排斥作用、有限伸... 脱氧核精核酸(DNA)单分子链从完全拉伸状态折叠到平衡状态的动力学过程是溶液中DNA单分子力学的重要特征之一.通过构建全参数化的珠子-弹簧分子链模型,并运用一种高效平衡的半隐式预测——校验积分算法,系统研究了体积排斥作用、有限伸长弹性作用和涨落流体动力学作用等三种非线性作用对稀溶液中DNA分子链折叠过程朾对回旋半径和驰豫时间的影响程度和变化趋势.模拟结果发现:体积排斥作用不影响分子链的折叠驰豫时间,但能显著碱小平衡时的相对回旋半径;流体动力学作用不影响分子链的相对回旋半径,但明显缩短折叠过程的驰豫时间;有限伸长弹性作用能明显减小短链的相对回旋半径,能显著延长长链的折叠驰豫时间.模拟数据进步表明:完全伸展的DNA分子链在折叠过程中的相对回旋半径随时间平滑变化,且折叠驰豫时间随长度的标度指数对上述三种非线性作用都具有两种不同的长度依赖性. 展开更多
关键词 DNA 单分子链 珠子-弹簧模型 非线性作用 布朗动力学模拟 折叠过程
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电解质溶液自扩散系数的布朗动力学模拟 被引量:2
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作者 史红兵 于养信 高光华 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2004年第12期2317-2321,共5页
采用布朗动力学方法对电解质溶液进行了模拟 ,在传统布朗动力学的基础上综合考虑了流体力学的影响 ,并且引入 Smart Monte Carlo方法的接受概率 ,避免了离子不现实的移动和位型重叠 ,这样不仅可以将模拟过程中的时间步长大幅度提高 ,而... 采用布朗动力学方法对电解质溶液进行了模拟 ,在传统布朗动力学的基础上综合考虑了流体力学的影响 ,并且引入 Smart Monte Carlo方法的接受概率 ,避免了离子不现实的移动和位型重叠 ,这样不仅可以将模拟过程中的时间步长大幅度提高 ,而且还可使溶质在相空间的演化过程更接近实际 .模拟过程以电解质溶液的原始模型为基础 ,将溶剂看作连续介质 ,溶质分子之间的相互作用采用软核加静电的势能函数模型 ,长程静电力采用 Ewald加和的处理方法 .模拟得到 KCl和 Na Cl溶液的径向分布函数 g+ - ( r) ,g+ + ( r)和 g- - ( r) ,并与文献中 HNC计算以及模拟的结果进行比较 ,使用推广的 Green-Kubo公式模拟计算溶液中各种离子的自扩散性质 。 展开更多
关键词 布朗动力学模拟 电解质溶液 径向分布函数 自扩散系数
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良溶剂中接枝型聚两性电解质单链构象的布朗动力学模拟
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作者 浦彬彬 陈涛 +1 位作者 王立权 朱莎莎 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第3期587-594,共8页
采用布朗动力学研究了在良溶剂中荷电平衡的接枝聚两性电解质(GPA)的单链构象转变行为,讨论了主链链长、支链数及电荷密度对GPA分子链构象转变的影响.研究发现,随着静电相互作用的增强,GPA分子链构象转变过程由线团、主链与支链间的折... 采用布朗动力学研究了在良溶剂中荷电平衡的接枝聚两性电解质(GPA)的单链构象转变行为,讨论了主链链长、支链数及电荷密度对GPA分子链构象转变的影响.研究发现,随着静电相互作用的增强,GPA分子链构象转变过程由线团、主链与支链间的折叠、链段塌缩和电荷配对形成偶极子与四极子等4个阶段构成.与线型聚两性电解质不同,GPA存在的额外支链间空间排斥与静电排斥作用随着分子结构的变化而改变,并影响构象转变行为.在强静电相互作用下,良溶剂中的GPA链由于溶剂化作用会再伸展,以保证偶极子完全配对成四极子.减小主链长度或电荷密度或增加支链数目都会增大体系的排斥力和主链的刚性,阻滞分子链的塌缩,并使得分子链再伸展的幅度增大. 展开更多
关键词 布朗动力学模拟 接枝聚两性电解质 构象 良溶剂 分子结构
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